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Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195

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Amino acid alignment: BSNT_05986 and BL03578

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# Program: needle
# Rundate: Mon  8 Mar 2010 06:28:02
# Commandline: needle
#    -asequence pep-align/BSNT_05986___yxiO.1.5803.seq
#    -bsequence pep-align/BL03578___yxiO.2.5803.seq
#    -gapopen 10
#    -gapextend 0.5
#    -outfile pep-align/BSNT_05986___yxiO-BL03578___yxiO.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: pep-align/BSNT_05986___yxiO-BL03578___yxiO.aln
########################################

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#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_05986___yxiO
# 2: BL03578___yxiO
# Matrix: EBLOSUM62
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 469
# Identity:     118/469 (25.2%)
# Similarity:   205/469 (43.7%)
# Gaps:          71/469 (15.1%)
# Score: 433.0
# 
#
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BSNT_05986___      1 -----------------MMKRF-TKQENSWVLYDWANSAYSIVVTTAVFP     32
                                      .:|.| |....||.|||:||:.:|..:.|..||
BL03578___yxi      1 MDTQPEREQAVKRAQRTGIKLFLTLPILSWALYDFANTIFSSNIVTIFFP     50

BSNT_05986___     33 LFYKSAAAESGVSAAQSTAYLGYTIAISTFILAMLGPILGTIADYEGCKK     82
                     .:.:.|..|:......::.::.|:.|.::|:|.:..|:.|.:.|..|.||
BL03578___yxi     51 FYLQEAVGENASMNQVASTFISYSNAAASFLLVIFTPLFGVLIDRTGRKK    100

BSNT_05986___     83 KFFGFFVSAGVASTAMLAF------------IPSEHWLLLLLFYTISAIG    120
                     |:.|.|....|:.|.::..            :|....|::::|.| :...
BL03578___yxi    101 KYIGLFTMICVSCTILMGVFAGASFQKDIYGLPLSLILVVIMFVT-AKFF    149

BSNT_05986___    121 FSGANVFYDAFLVDVTPEKRMNLVSARGFGLGYIGSTIPFIISIAVILLA    170
                     :..:.||||..|.|:..::.:.|:|..|..:||||:    :..:.|.||.
BL03578___yxi    150 YHSSLVFYDTILADLGTKEEIPLLSGFGIAIGYIGT----LAGLTVYLLV    195

BSNT_05986___    171 QAETIPVSVSAASQLSFFITAAWWGLFTIPMIKHVHQRYYIKREPH----    216
                     ..:..        ..:|..:|..:..|::|.:....:    ||:|.    
BL03578___yxi    196 GNQDF--------HRAFIPSALLFLFFSLPYLLFTKE----KRKPEPKEK    233

BSNT_05986___    217 -IVINSFKRLGQTMKRIRQYRALFLFLLAYFFYIDGVGTIITMSTSYGSD    265
                      ...:.:..:.||.|.||.|:.:|||::||||..|.:.|.|.|...|...
BL03578___yxi    234 KSFFSGYWEIVQTFKDIRLYKPVFLFMIAYFFLNDALATAIAMMAVYSKT    283

BSNT_05986___    266 -LGIGSSSLLIILFVTQVVAAPFSIVYGKLAERFTGKTMLYVGIVIYMIV    314
                      :|..:...:::..|:.|.:...|.:.|.:.:|...|..:.:...|.:..
BL03578___yxi    284 VIGFTTGQFVLLYLVSTVSSIIGSFLLGFVTKRIGAKHAVSLVAAIMITA    333

BSNT_05986___    315 CVYAYFMKTTIDFWILAMLVATSQGGIQALSRSYFAKLVPKRHANEFFGF    364
                     ........:|:.|||...|...|.||....||:...:|.|:....||||.
BL03578___yxi    334 LTIGACTTSTLLFWIAGSLFGISLGGTWVASRTLIIELTPEHKRGEFFGL    383

BSNT_05986___    365 YNIFGKFASIMGPLLI-AVT---AQLTGKSSTAVF-SLIILFVIGIVILA    409
                     :.:.||.:||.||:|. ::|   ..|...:|...| ||::|..||::|..
BL03578___yxi    384 FALSGKISSIFGPVLYGSITLLFRDLGNMASRMAFGSLVLLAAIGLIIHQ    433

BSNT_05986___    410 FVPEETSTDVSQQQNDLPL    428
                     .|..:.             
BL03578___yxi    434 NVKAKA-------------    439


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