Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_00934 and BL03936
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_00934 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:22:29
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_00934___ydfJ.1.5803.seq
# -bsequence dna-align/BL03936___ydfJ.2.5803.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_00934___ydfJ-BL03936___ydfJ.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_00934___ydfJ-BL03936___ydfJ.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_00934___ydfJ
# 2: BL03936___ydfJ
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 2176
# Identity: 1908/2176 (87.7%)
# Similarity: 1908/2176 (87.7%)
# Gaps: 110/2176 ( 5.1%)
# Score: 8888.0
#
#
#=======================================
BSNT_00934___ 0 -------------------------------------------------- 0
BL03936___ydf 1 ATGTCAAAAATGTTATATAAATTAGGAGGATGGGTTGCTCGCAATCGCAT 50
BSNT_00934___ 0 -------------------------------------------------- 0
BL03936___ydf 51 AAAAGTAATATGCGCATGGATCGTTGTGCTAGTTGCTTCGATAGGCCTTG 100
BSNT_00934___ 1 --------TTGAAACCAAGTTTTTCTGAGGATATGTCCATACCTGACACA 42
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL03936___ydf 101 CAATCACGTTAAAACCAAGTTTTTCTGAGGATATGTCCATACCTGACACA 150
BSNT_00934___ 43 CCTTCGGAAAAAGCGATGGATGTGATTCAAAAAGAATTTCCTCACGGTCC 92
|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||
BL03936___ydf 151 CCTTCGGAAAAAGCGATGGATGTCATTCAAAAAGAATTTCCCCACGGTCC 200
BSNT_00934___ 93 TGATAAAGGGAGCATACGGGTTATTTTCGGTGCTGGTGATGGGGAGAAAC 142
|||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||
BL03936___ydf 201 TGATAAAGGGAGCATACGGGTTATTTTCGGTGCTGAAGATGGGGAGAAAC 250
BSNT_00934___ 143 TTACTGGGAAGCCAGCAAAAAAAGCAATAGAAGATACGCTCAAAGAAATC 192
|.|||..||||.||||..||||||||||||||.|||||.|.||.||||||
BL03936___ydf 251 TGACTTCGAAGTCAGCGGAAAAAGCAATAGAAAATACGTTAAAGGAAATC 300
BSNT_00934___ 193 AGTAAAGATGATTCTGTTGACTCGATTGCAAGTCCTTTTGTGACAGGGAC 242
..||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
BL03936___ydf 301 GATAAAGATGGTTCCGTTGACTCGATTGCAAGTCCTTTTGTGACAGGAAC 350
BSNT_00934___ 243 AATCGCGAAAGATGGCACAGTTGCCTATGCTGATATCAAGTATAAATCAT 292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL03936___ydf 351 AATCGCGAAAGATGGCACAGTTGCCTATGCTGATATCAAGTATAAATCAT 400
BSNT_00934___ 293 CAGCAGATGATATAAAGGATTATTCTATCAAACACTTAAAAGACAGTTTG 342
|||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||
BL03936___ydf 401 CAGCAGATGATATTAAAGATTACTCTATCAAACACTTAAAAGACAGTTTG 450
BSNT_00934___ 343 AAACTGGTTGATGATGAAGGATTGCAAACTGAGCTAAGCGGAGATGTACC 392
|||.|||.||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
BL03936___ydf 451 AAAATGGCTGATTATGAAGGATTGCAAACTGAACTAAGCGGAGATGTACC 500
BSNT_00934___ 393 GGGAGCCGAGATGGAGATAGGCAGTGTCTCTGAAATTGTCGGCATTATCT 442
.|||||.|||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||.|
BL03936___ydf 501 AGGAGCTGAGATGGAGATAGGCGGTATCTCTGAAATTGTCGGCATTATTT 550
BSNT_00934___ 443 TGGCTTTTGTCGTTTTAGCCATTACATTGGGTTCTTTATTAATAGCAGGT 492
||||.|||.|||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||
BL03936___ydf 551 TGGCCTTTATCGTTTTGGCCATTACGTTTGGCTCTTTATTAATAGCAGGT 600
BSNT_00934___ 493 TTGCCGATTTTAACTGCACTGATTGGTTTAGGTGTAAGTATTGGACTGGT 542
||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||
BL03936___ydf 601 TTGCCGATTTTAACAGCACTGATTGGATTAGGTGTAAGTATTGGGCTTGT 650
BSNT_00934___ 543 TTTGATTGGGACACAAGTATTTGATATTGCTTCCGTCAGTCTTTCATTAG 592
|||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||
BL03936___ydf 651 TTTGATTGGGACACAAGTATTCGATATCGCTTCCGTCAGTCTATCATTAG 700
BSNT_00934___ 593 CCGGAATGATTGGCCTTGCTGTTGGTATTGATTATGCTTTATTTATTTTT 642
|||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
BL03936___ydf 701 CCGGAATGATTGGCCTTGCAGTTGGAATTGATTATGCTTTATTTATTTTT 750
BSNT_00934___ 643 ACGAAACACCGCCAGTTTTTAGGCGAAGGCATACAAAAGAATGAATCAAT 692
|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
BL03936___ydf 751 ACGAAGCACCGCCAGTTTTTAGGCGAAGGTATACAAAAAAATGAATCAAT 800
BSNT_00934___ 693 TGCGAGAGCCGTGGGAACAGCGGGAAGCGCAGTCGTTTTTGCCGGACTTA 742
|||||||||....||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||
BL03936___ydf 801 TGCGAGAGCTACAGGAACAGCCGGGAGTGCAGTCGTTTTTGCCGGACTTA 850
BSNT_00934___ 743 CTGTTATCGTTGCACTTTGCGGATTAACTGTCGTTAACATTCCTTTTATG 792
||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
BL03936___ydf 851 CTGTTATCGTAGCACTTTGCGGATTGACTGTCGTTAACATTCCTTTTATG 900
BSNT_00934___ 793 TCTGCGATGGGGCTGACAGCAGGGCTTAGTGTACTGATGGCTGTTTTGGC 842
|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|.||
BL03936___ydf 901 TCTGCAATGGGGCTGACAGCAGGACTTAGTGTACTGATGGCTGTTCTCGC 950
BSNT_00934___ 843 TTCCATCACACTTGTGCCTGCGGTCTTATCGATTGCAGGGAAGCGGATGA 892
|||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||.
BL03936___ydf 951 TTCAATCACGCTTGTGCCTGCCGTCTTGTCGATAGCGGGGAAACGGATGG 1000
BSNT_00934___ 893 TTCCGAAATCAAACAAGAAAATAGAAAAACAAAGCACTGAAACAAATGTC 942
||||||||.||||||||||||.|||||||||||||.|.||||||||||||
BL03936___ydf 1001 TTCCGAAAGCAAACAAGAAAAAAGAAAAACAAAGCGCGGAAACAAATGTC 1050
BSNT_00934___ 943 TGGGGACGCTTTGTCACCAAAAATCCTATCATTCTAAGTGTATGCAGCAT 992
|||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||
BL03936___ydf 1051 TGGGGACGCTTTGTCACAAAGAATCCTATCATGCTAAGTGTATGCAGCAT 1100
BSNT_00934___ 993 TCTGATTTTGATCGTCATTAGTATCCCATCTATGCATTTGGAACTGGGCT 1042
||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||
BL03936___ydf 1101 TCTGATTTTGCTCGTTATTAGTATCCCATCTATGCATTTGGAGCTGGGCT 1150
BSNT_00934___ 1043 TGCCTGATGCTGGGATGAAAGCTAAGGATAATCCGGATCGCCGGGCATAT 1092
||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||
BL03936___ydf 1151 TGCCTGATGCAGGGATGAAAGCGAAGGATAACCCGGATCGCCGGGCTTAT 1200
BSNT_00934___ 1093 GCCTTGCTTGCCGAAGGCTTTGGAGAAGGATTTAATGGCCAATTAACAAT 1142
|.||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
BL03936___ydf 1201 GACTTGCTTGCCGACGGTTTTGGAGAAGGATTTAATGGTCAATTAACAAT 1250
BSNT_00934___ 1143 CGTAGCGGATGCCACAAATGCTACAGAAAATAAGGCGGAGGCTTTCGCAG 1192
|||||||||||||.|||.||..|||||||||||||||||.||.|||||||
BL03936___ydf 1251 CGTAGCGGATGCCGCAAGTGTAACAGAAAATAAGGCGGAAGCCTTCGCAG 1300
BSNT_00934___ 1193 ATGCAGTGAAAGAAATAAAGGGCTTAGACCATGTAGCAAGTGTCACCCCT 1242
|||||||||||||||||||||...|.|||||||||||.||||||||.||.
BL03936___ydf 1301 ATGCAGTGAAAGAAATAAAGGAACTGGACCATGTAGCGAGTGTCACTCCG 1350
BSNT_00934___ 1243 GCAATGCCTAATAAAGAAGGGAACTTTGCCATCATTACGGTCGTTCCAGA 1292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||
BL03936___ydf 1351 GCAATGCCTAATAAAGAAGGGAACTTTGCCATCATTACAGTAGTTCCTGA 1400
BSNT_00934___ 1293 AACAGGTCCAAATGATGTCA-CAACGAAAGATTTGGTACACGATGTACGC 1341
||||||||||||||||| || |||||||.|||||||||.|.|||||||||
BL03936___ydf 1401 AACAGGTCCAAATGATG-CAGCAACGAAGGATTTGGTAAAGGATGTACGC 1449
BSNT_00934___ 1342 AGTTTATCAGATAAAAACGGAGTAGATTTGCTTGTTACTGGATCGACTGC 1391
||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||
BL03936___ydf 1450 AGCTTATCAGATAAAAACGGAGTAGATTTGCTCGTTACTGGATCAACCGC 1499
BSNT_00934___ 1392 AGTGAATATTGACATTTCAGATCGCCTCAATGATGCGATACCGGTGTTTG 1441
||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
BL03936___ydf 1500 AGTGAATATTGATATTTCAGATCGCCTTAATGATGCGATACCGGTGTTTG 1549
BSNT_00934___ 1442 CTGTACTTATTGTGGGCTTTGCGTTTGTATTGCTGACCATCGTTTTCCGT 1491
|||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||
BL03936___ydf 1550 CTGTACTCATTGTTGGTTTTGCGTTTGTATTGCTGACAATCGTATTCCGT 1599
BSNT_00934___ 1492 TCGCTGCTTGTGCCGCTTGTTGCTGTTGCAGGTTTCATGTTGACGATGAC 1541
|||.||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
BL03936___ydf 1600 TCGTTGCTTGTGCCTCTTGTTGCTGTCGCAGGTTTCATATTGACGATGAC 1649
BSNT_00934___ 1542 AGCCACTCTTGGGATTTGTGTATTTGTCTTGCAAGACGGGAATCTCATCG 1591
||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||
BL03936___ydf 1650 AGCCACTCTTGGAATCTGTGTATTTGTTTTACAAGACGGGAATCTCATCG 1699
BSNT_00934___ 1592 ACTTTTTCAAAATACCTGAAAAAGGGCCGATACTCGCGTTCCTGCCGATT 1641
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL03936___ydf 1700 ACTTTTTCAAAATACCTGAAAAAGGGCCGATACTCGCGTTCCTGCCGATT 1749
BSNT_00934___ 1642 TTATCGATTGGGATTCTGTTCGGGTTAGCCATGGATTATCAAGTATTCCT 1691
|||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
BL03936___ydf 1750 TTATCCATTGGGATTCTGTTCGGATTAGCGATGGATTATCAAGTATTCCT 1799
BSNT_00934___ 1692 TGTCAGCAGAATGCGTGAAGAATATGTAAAAACAAAGAATCCAGTACAAG 1741
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL03936___ydf 1800 TGTAAGCAGAATGCGTGAAGAATATGTAAAAACAAAGAATCCAGTACAAG 1849
BSNT_00934___ 1742 CCATTCAGGCTGGATTAAAACACAGTGGTCCTGTTGTTACAGCAGCCGGC 1791
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||
BL03936___ydf 1850 CCATTCAGGCTGGATTAAAACACAGCGGTCCTGTTGTCACCGCAGCCGGC 1899
BSNT_00934___ 1792 TTGATCATGATCTTCGTTTTTGCAGGATTTATCTTTGCAGGCGAAGCTTC 1841
.||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||
BL03936___ydf 1900 CTGATCATGATATTCGTTTTTGCAGGGTTTATCTTTGCTGGTGAAGCTTC 1949
BSNT_00934___ 1842 TATTAAAGCCAACGGATTAGCACTTTCCTTTGGTGTGCTCTTTGATGCCT 1891
|||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|
BL03936___ydf 1950 TATTAAAGCCAACGGGTTGGCTCTTTCCTTTGGTGTGCTCTTTGATGCAT 1999
BSNT_00934___ 1892 TTATTGTAAGAATGACACTGATTCCAAGTGTCATGAAGCTGATGGGGAAT 1941
||||||||.||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||
BL03936___ydf 2000 TTATTGTACGAATGACACTGATTCCAAGTCTGATGAAGCTGATGGGGAAT 2049
BSNT_00934___ 1942 GCAGCCTGGTATTTGCCGAAATGGTTAGACAAGATTATTCCGAACGTGGA 1991
|||||||||||||||||.||||||.|.||||||||.||||||||.||.||
BL03936___ydf 2050 GCAGCCTGGTATTTGCCAAAATGGCTGGACAAGATCATTCCGAATGTAGA 2099
BSNT_00934___ 1992 TATAGAAGGGCATCAACTGACAAAGGAAATACAGCCAGAAATAGATCATG 2041
.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||.||.|||||
BL03936___ydf 2100 CATAGAAGGGCATCAACTCACGAAGGAAATACAGCCAGAAACAGCTCATG 2149
BSNT_00934___ 2042 AACAAAAGAAACAAATCAGTGTGTAA 2067
||||||||||||||||||||.|||||
BL03936___ydf 2150 AACAAAAGAAACAAATCAGTATGTAA 2175
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.