Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195

Home About Browser Genes Download Publications

Amino acid alignment: BSNT_06019 and BSU39230

See DNA alignment / Visit BSNT_06019 in genome browser / Return to Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon  8 Mar 2010 06:27:24
# Commandline: needle
#    -asequence pep-align/BSNT_06019___wapA.1.22522.seq
#    -bsequence pep-align/BSU39230___wapA.2.22522.seq
#    -gapopen 10
#    -gapextend 0.5
#    -outfile pep-align/BSNT_06019___wapA-BSU39230___wapA.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: pep-align/BSNT_06019___wapA-BSU39230___wapA.aln
########################################

#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_06019___wapA
# 2: BSU39230___wapA
# Matrix: EBLOSUM62
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 2354
# Identity:    2223/2354 (94.4%)
# Similarity:  2253/2354 (95.7%)
# Gaps:          40/2354 ( 1.7%)
# Score: 11674.0
# 
#
#=======================================

BSNT_06019___      1 MKKRKRRNFKRFIAAFLVLALIISLVPADVLAKTTEEENGNRIVADDPEE     50
                     |||||||||||||||||||||:|||||||||||:|||||||||.||||||
BSU39230___wa      1 MKKRKRRNFKRFIAAFLVLALMISLVPADVLAKSTEEENGNRIAADDPEE     50

BSNT_06019___     51 TLQKEQTEEAVPFDPKDINKEGEITSERTENTKLYYEGDGVYKQEVYLDP    100
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU39230___wa     51 TLQKEQTEEAVPFDPKDINKEGEITSERTENTKLYYEGDGVYKQEVYLDP    100

BSNT_06019___    101 IHTKETPDADWEDISPELKESTSKQVETENAILNSDFQKQMKNGLYATFE    150
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU39230___wa    101 IHTKETPDADWEDISPELKESTSKQVETENAILNSDFQKQMKNGLYATFE    150

BSNT_06019___    151 HNDHKVTYSLVEAKAPNKTSLTPKDTSADYKTDSNEIVYPDVFPNIDLQT    200
                     ||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU39230___wa    151 HNDHKVTYSLAEAKGPNKTSLTPKDTSADYKTDSNEIVYPDVFPNIDLQT    200

BSNT_06019___    201 FTFNENIKEDLVLHQYDGYNTFTFQLKTDLQAKEQEDGSIDFSDEKGKVV    250
                     ||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU39230___wa    201 FTFNENIKEDLVLHQYNGYNTFTFQLKTDLQAKEQEDGSIDFSDEKGKVV    250

BSNT_06019___    251 FSVPKPFMTDSKLDELSGEVERSDKVSYKLEKNEEGYLLHLTADENWLKD    300
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU39230___wa    251 FSVPKPFMTDSKLDELSGEVERSDKVSYKLEKNEEGYLLHLTADENWLKD    300

BSNT_06019___    301 PERVYPVSIDPSTSLSVSSDTFVMSAYPTTNYSASSQKWDANLKAYVLKT    350
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU39230___wa    301 PERVYPVSIDPSTSLSVSSDTFVMSAYPTTNYSASSQKWDANLKAYVLKT    350

BSNT_06019___    351 GYYDKTTGTNYAFMKFNNLKPIQNMTVTKATLKTYVAHSYYGTKATGLWL    400
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU39230___wa    351 GYYDKTTGTNYAFMKFNNLKPIQNMTVTKATLKTYVAHSYYGTKATGLWL    400

BSNT_06019___    401 DTVNSNYDNAKVTWNTKPASKNIGKADVHKGQWASYDVTAAVKSWNSGGA    450
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU39230___wa    401 DTVNSNYDNAKVTWNTKPASKNIGKADVHKGQWASYDVTAAVKSWNSGGA    450

BSNT_06019___    451 NYGFKLHTNGNGKEYWKKLISSANSANKPYIEVTYTIPKGNTPTIKAYHN    500
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU39230___wa    451 NYGFKLHTNGNGKEYWKKLISSANSANKPYIEVTYTIPKGNTPTIKAYHN    500

BSNT_06019___    501 GDSTGYFDISWKKVEGAKGYKVWIYNGKEYQAISAGNVTSWSTKGKKIWP    550
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU39230___wa    501 GDSTGYFDISWKKVEGAKGYKVWIYNGKEYQAISAGNVTSWSTKGKKIWP    550

BSNT_06019___    551 TSAEIASKRYKLHLDGKDGAELALDPSPVYKNSGGSYATSKNYWIGVSAI    600
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU39230___wa    551 TSAEIASKRYKLHLDGKDGAELALDPSPVYKNSGGSYATSKNYWIGVSAI    600

BSNT_06019___    601 FDQGEGAMSAPAKPVIPNVGKAQAPSAKGYNNGNATGYFDLSWKAVSGAT    650
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU39230___wa    601 FDQGEGAMSAPAKPVIPNVGKAQAPSAKGYNNGNATGYFDLSWKAVSGAT    650

BSNT_06019___    651 GYKVQVFNGKGFETLDLGNQTSWTTKGKKIWPTSAEIKAGKYALHLKDGS    700
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU39230___wa    651 GYKVQVFNGKGFETLDLGNQTSWTTKGKKIWPTSAEIKAGKYALHLKDGS    700

BSNT_06019___    701 GAELPINPGPTYKNAGGDGAKKNYSFKIIAYNKDGEAIASPAANPALPDI    750
                     |||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||.||||||
BSU39230___wa    701 GAELPINPGPTYKNAGGDGAKRNYSFKIIAYNKDGEAIASPAATPALPDI    750

BSNT_06019___    751 ARPKNLTGYLYTNTKSSQTGYVNLIWEKVQNAKGYKVNIYNGKEYQSFDV    800
                     |||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU39230___wa    751 ARPKNVTGYLYTNTKSSQTGYVNLIWEKVQNAKGYKVNIYNGKEYQSFDV    800

BSNT_06019___    801 GDADHWTTQNKNIWPTSEEIKAGSYKLHTDGKGGELALDPSPVYNNANGN    850
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU39230___wa    801 GDADHWTTQNKNIWPTSEEIKAGSYKLHTDGKGGELALDPSPVYNNANGN    850

BSNT_06019___    851 YKGKKNYSFTLVAYDANGETIPTAPFNPTFHEGAEFLGTEEYWSIIDIPS    900
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU39230___wa    851 YKGKKNYSFTLVAYDANGETIPTAPFNPTFHEGAEFLGTEEYWSIIDIPS    900

BSNT_06019___    901 GQLNGATGNVIVNEEDLSIDGRGPGLGLSRTYNSLDSSDHLFGQGWYADA    950
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU39230___wa    901 GQLNGATGNVIVNEEDLSIDGRGPGLGLSRTYNSLDSSDHLFGQGWYADA    950

BSNT_06019___    951 ETSVISTDGGAMYIDEDATTHRFTKKADGTYQPPTGVYLELTETADQFIL   1000
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU39230___wa    951 ETSVISTDGGAMYIDEDATTHRFTKKADGTYQPPTGVYLELTETADQFIL   1000

BSNT_06019___   1001 KTKDQTNAYFNKKGGKLQKVVDGHNNATVYTYNDKNQLTAITDASGRKLT   1050
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU39230___wa   1001 KTKDQTNAYFNKKGGKLQKVVDGHNNATVYTYNDKNQLTAITDASGRKLT   1050

BSNT_06019___   1051 FTYDENGHVTSITGPKNKKVTYSYENDLLKKVTDTDGTVTSYDYDGEGRL   1100
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
BSU39230___wa   1051 FTYDENGHVTSITGPKNKKVTYSYENDLLKKVTDTDGTVTSYDYDSEGRL   1100

BSNT_06019___   1101 VKQYSANSTEAKPVFTEYQYSGHRLEKAINAKKETYVYSYDADKKTLLMT   1150
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU39230___wa   1101 VKQYSANSTEAKPVFTEYQYSGHRLEKAINAKKETYVYSYDADKKTLLMT   1150

BSNT_06019___   1151 QPNGRKVQYGYNEAGNPIQVIDDAEGLKITTNTKYEGNNVVEDVDPNDVG   1200
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU39230___wa   1151 QPNGRKVQYGYNEAGNPIQVIDDAEGLKITTNTKYEGNNVVEDVDPNDVG   1200

BSNT_06019___   1201 TGKATESYQYDKDGNVTSVKDAYGTETYEYNKNNDVTKMKDTEGNVTDIA   1250
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU39230___wa   1201 TGKATESYQYDKDGNVTSVKDAYGTETYEYNKNNDVTKMKDTEGNVTDIA   1250

BSNT_06019___   1251 YDGLDAVSETDQSGKSSSAAVYDKYGNQIQSSKDLSASTNILKDGSFEAQ   1300
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU39230___wa   1251 YDGLDAVSETDQSGKSSSAAVYDKYGNQIQSSKDLSASTNILKDGSFEAQ   1300

BSNT_06019___   1301 KSGWNLTASKDSGKISIITDKSGVLSGSKALEILSQSTSAGTDHGFSSAT   1350
                     ||||||||||||||||:|.|||||||||||||:||||||||||||:||||
BSU39230___wa   1301 KSGWNLTASKDSGKISVIADKSGVLSGSKALEVLSQSTSAGTDHGYSSAT   1350

BSNT_06019___   1351 QTVELEPNTTYTLSGKIKTDLAKTRAYFNIDLRDKDQKRIQWIHNEYSAL   1400
                     |||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||
BSU39230___wa   1351 QTVELEPNTTYTLSGKIKTDLAKSRAYFNIDLRDKDQKRIQWIHNEYSAL   1400

BSNT_06019___   1401 AGKNDWTKRQITFTTPANAGKAVVYMEVDHNDKDGKGKAWFDEVQLEKGE   1450
                     ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
BSU39230___wa   1401 AGKNDWTKRQITFTTPANAGKAVVYMEVDHKDKDGKGKAWFDEVQLEKGE   1450

BSNT_06019___   1451 VSSSYNPVQNSSFTSATENWNVSGASVDSEEGFNDDVSLKAARTSASQAG   1500
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU39230___wa   1451 VSSSYNPVQNSSFTSATENWNVSGASVDSEEGFNDDVSLKAARTSASQAG   1500

BSNT_06019___   1501 SVTKQTVVLGQSANDKPVYLTLTGMSKASSVKFTDEKDYSLQANVTYADG   1550
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU39230___wa   1501 SVTKQTVVLGQSANDKPVYLTLTGMSKASSVKFTDEKDYSLQANVTYADG   1550

BSNT_06019___   1551 STGVYNAKFPSGTQEWNRAAVVIPKTKPINKVDISILFQKSATGTVWFDD   1600
                     |||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU39230___wa   1551 STGIYNAKFPSGTQEWNRAAVVIPKTKPINKVDISILFQKSATGTVWFDD   1600

BSNT_06019___   1601 IRLIEGSLLTKSTYDSNGNYVTKEEDELGYATSTDYDETGKKTAETDAKG   1650
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||
BSU39230___wa   1601 IRLIEGSLLTKSTYDSNGNYVTKEEDELGYATSTDYDETGKKTSETDAKG   1650

BSNT_06019___   1651 EKTTYTYDQADQLTNMTLSNGTSILHSYDKEGNEVSKTIRAGADQTYKYE   1700
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|
BSU39230___wa   1651 EKTTYTYDQADQLTNMTLSNGTSILHSYDKEGNEVSKTIRAGADQTYKFE   1700

BSNT_06019___   1701 YDVMGKLVKTTDPLGNVLASEYDANSNLTKTISPNGNEVSLSYDGTDRVK   1750
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU39230___wa   1701 YDVMGKLVKTTDPLGNVLASEYDANSNLTKTISPNGNEVSLSYDGTDRVK   1750

BSNT_06019___   1751 SKSYNGTEKYNFTYDKNGNETSVVNKEQNTTKKRTFDNKNRLTELTDRGG   1800
                     ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU39230___wa   1751 SKSYNGTEKYIFTYDKNGNETSVVNKEQNTTKKRTFDNKNRLTELTDRGG   1800

BSNT_06019___   1801 SQTWTYPSDSDKLKTFSWTHGDQKGTNQFTYNKLDQMIEMKDSTSSYSFD   1850
                     ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
BSU39230___wa   1801 SQTWTYPSDSDKLKTFSWIHGDQKGTNQFTYNKLDQMIEMKDSTSSYSFD   1850

BSNT_06019___   1851 YDENGNVQTFITGNGGGTSFSYDERNLVSSLHIGDKNGGSILTESYEYDA   1900
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
BSU39230___wa   1851 YDENGNVQTFITGNGGGTSFSYDERNLVSSLHIGDKNGGDILTESYEYDA   1900

BSNT_06019___   1901 NGNRTTINSSASGKVKYEYGKLNQLVKETHEDGTVIEYTYDGFGNRKTVT   1950
                     |||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU39230___wa   1901 NGNRTTINSSASGKVQYEYGKLNQLVKETHEDGTVIEYTYDGFGNRKTVT   1950

BSNT_06019___   1951 TVKDGSSKTVNASFNIMNQLTKVNDESISYDKNGNRTSDGKFTYTWDAED   2000
                     |:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU39230___wa   1951 TIKDGSSKTVNASFNIMNQLTKVNDESISYDKNGNRTSDGKFTYTWDAED   2000

BSNT_06019___   2001 NLTAVTKKGEDKPFATYKYDEKGNRIQKTVNGKVTNYFYDGDSLNVLYET   2050
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU39230___wa   2001 NLTAVTKKGEDKPFATYKYDEKGNRIQKTVNGKVTNYFYDGDSLNVLYET   2050

BSNT_06019___   2051 DADNNVTKSYTYGDSGQLLSYTENGKKYFYHYNAHGDVIAISDSTGKTVA   2100
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||
BSU39230___wa   2051 DADNNVTKSYTYGDSGQLLSYTENGKKYFYHYNAHGDIIAISDSTGKTVA   2100

BSNT_06019___   2101 KYQYDAWGNPTKTEASDEVKDNRYRYAGYQYDEETGLYYLMARYYEPRNG   2150
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU39230___wa   2101 KYQYDAWGNPTKTEASDEVKDNRYRYAGYQYDEETGLYYLMARYYEPRNG   2150

BSNT_06019___   2151 VFLSLDPDPGSDGDSLDQNGYTYGNNNPVMNVDPDGHWVWFVVNAGFAVY   2200
                     |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.|
BSU39230___wa   2151 VFLSLDPDPGSDGDSLDQNGYAYGNNNPVMNVDPDGHWVWLVVNAGFAAY   2200

BSNT_06019___   2201 DGYKAYKSGKGWKGVAVAAASGFVGGGKL--------KLTKKIGKWATSR   2242
                     ||||||||||||||.|.||||.| |.||:        |.|||..|  .:.
BSU39230___wa   2201 DGYKAYKSGKGWKGAAWAAASNF-GPGKIFKGASRAYKFTKKAVK--ITG   2247

BSNT_06019___   2243 HWYKGTFKTKRKSLDYHHNKHIVRNG--------KSYSKKRYTKVARAFY   2284
                     |...|.            |:.|.|||        |..:.:...||.:...
BSU39230___wa   2248 HTRHGL------------NQSIGRNGGRGVNLRAKLNAVRSPKKVIKQPN   2285

BSNT_06019___   2285 RSNKHLREKVILATGKKGYRIKNGKRTGY---YTRSGKVVTFVNNKWKKK   2331
                     .:.|::.:|..:...|:|..|     |.|   ..:..|.|...:.|..|.
BSU39230___wa   2286 GATKYVGKKATVVLNKRGKVI-----TAYGSSRAKGSKHVFHTHGKGNKS   2330

BSNT_06019___   2332 KKR-   2334
                     |:| 
BSU39230___wa   2331 KRRR   2334


#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.