Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195

Home About Browser Genes Download Publications

Amino acid alignment: BSNT_02697 and BSU16580

See DNA alignment / Visit BSNT_02697 in genome browser / Return to Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon  8 Mar 2010 06:20:55
# Commandline: needle
#    -asequence pep-align/BSNT_02697___polC.1.22522.seq
#    -bsequence pep-align/BSU16580___polC.2.22522.seq
#    -gapopen 10
#    -gapextend 0.5
#    -outfile pep-align/BSNT_02697___polC-BSU16580___polC.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: pep-align/BSNT_02697___polC-BSU16580___polC.aln
########################################

#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_02697___polC
# 2: BSU16580___polC
# Matrix: EBLOSUM62
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1437
# Identity:    1434/1437 (99.8%)
# Similarity:  1436/1437 (99.9%)
# Gaps:           0/1437 ( 0.0%)
# Score: 7436.0
# 
#
#=======================================

BSNT_02697___      1 MEQLSVNRRQFQILLQQINMTDDTFMTYFEHGEIKKLTIHKASKSWHFHF     50
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU16580___po      1 MEQLSVNRRQFQILLQQINMTDDTFMTYFEHGEIKKLTIHKASKSWHFHF     50

BSNT_02697___     51 QFKSLLPFQIYDTLTTRLTQSFAHIAKVTSSIEVQDAEVSESIVQDYWSR    100
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU16580___po     51 QFKSLLPFQIYDTLTTRLTQSFAHIAKVTSSIEVQDAEVSESIVQDYWSR    100

BSNT_02697___    101 CIEELQGISPPIISLLNQQKPKLKGNKLIVKTKTDTEAAALKNKYSSMIQ    150
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU16580___po    101 CIEELQGISPPIISLLNQQKPKLKGNKLIVKTKTDTEAAALKNKYSSMIQ    150

BSNT_02697___    151 AGYRQFGFPDLQLDAEIFVSEQEVQKFREQKLAEDQERAMQALIEMEKKD    200
                     |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU16580___po    151 AEYRQFGFPDLQLDAEIFVSEQEVQKFREQKLAEDQERAMQALIEMEKKD    200

BSNT_02697___    201 KESDEDQAPSGPLVIGYQIKDNEEIRTLDSIMDEERRITVQGYVFDVETR    250
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU16580___po    201 KESDEDQAPSGPLVIGYQIKDNEEIRTLDSIMDEERRITVQGYVFDVETR    250

BSNT_02697___    251 ELKSGRTLCIFKITDYTNSILIKMFAREKEDAALMKSLKKGMWVKARGSI    300
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU16580___po    251 ELKSGRTLCIFKITDYTNSILIKMFAREKEDAALMKSLKKGMWVKARGSI    300

BSNT_02697___    301 QNDTFVRDLVMIANDVNEIKAKTREDSAPEGEKRVELHLHSPMSQMDAVT    350
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU16580___po    301 QNDTFVRDLVMIANDVNEIKAKTREDSAPEGEKRVELHLHSPMSQMDAVT    350

BSNT_02697___    351 GIGKLVEQAKKWGHEAIALTDHAVVQSFPDAYSAAKKHGIKMIYGMEANL    400
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU16580___po    351 GIGKLVEQAKKWGHEAIALTDHAVVQSFPDAYSAAKKHGIKMIYGMEANL    400

BSNT_02697___    401 VDDGVPIAYNAAHRLLEEETYVVFDVETTGLSAVYDTIIELAAVKVKGGE    450
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU16580___po    401 VDDGVPIAYNAAHRLLEEETYVVFDVETTGLSAVYDTIIELAAVKVKGGE    450

BSNT_02697___    451 IIDKFEAFANPHRPLSATIIELTGITDDMLQDAPDVVDVIRDFREWIGDD    500
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU16580___po    451 IIDKFEAFANPHRPLSATIIELTGITDDMLQDAPDVVDVIRDFREWIGDD    500

BSNT_02697___    501 ILVAHNASFDMGFLNVAYKKLLEVDKAKNPVIDTLELGRFLYPEFKNHRL    550
                     ||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||
BSU16580___po    501 ILVAHNASFDMGFLNVAYKKLLEVEKAKNPVIDTLELGRFLYPEFKNHRL    550

BSNT_02697___    551 NTLCKKFDIELTQHHRAIYDTEATAYLLLKMLKDAAEKGIQYHDELNENM    600
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU16580___po    551 NTLCKKFDIELTQHHRAIYDTEATAYLLLKMLKDAAEKGIQYHDELNENM    600

BSNT_02697___    601 GQSNAYQRSRPYHATLLAVNSTGLKNLFKLVSLSHIHYFYRVPRIPRSQL    650
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU16580___po    601 GQSNAYQRSRPYHATLLAVNSTGLKNLFKLVSLSHIHYFYRVPRIPRSQL    650

BSNT_02697___    651 EKYREGLLIGSACDRGEVFEGMMQKSPEEVEDIASFYDYLEVQPPEVYRH    700
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU16580___po    651 EKYREGLLIGSACDRGEVFEGMMQKSPEEVEDIASFYDYLEVQPPEVYRH    700

BSNT_02697___    701 LLELELVRDEKALKEIIANITKLGEKLNKPVVATGNVHYLNDEDKIYRKI    750
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU16580___po    701 LLELELVRDEKALKEIIANITKLGEKLNKPVVATGNVHYLNDEDKIYRKI    750

BSNT_02697___    751 LISSQGGANPLNRHELPKVHFRTTDEMLEAFSFLGEEKAKEIVVTNTQKV    800
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU16580___po    751 LISSQGGANPLNRHELPKVHFRTTDEMLEAFSFLGEEKAKEIVVTNTQKV    800

BSNT_02697___    801 ASLVDDIKPIKDDLYTPKIEGADEEIREMSYQRARSIYGEELPEIVEARI    850
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU16580___po    801 ASLVDDIKPIKDDLYTPKIEGADEEIREMSYQRARSIYGEELPEIVEARI    850

BSNT_02697___    851 EKELKSIIGHGFAVIYLISHKLVKRSLDDGYLVGSRGSVGSSLVATLTEI    900
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU16580___po    851 EKELKSIIGHGFAVIYLISHKLVKRSLDDGYLVGSRGSVGSSLVATLTEI    900

BSNT_02697___    901 TEVNPLPPHYVCPECQHSEFFNDGSVGSGFDLPDKTCPHCGTPLKKEGHD    950
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||
BSU16580___po    901 TEVNPLPPHYVCPECQHSEFFNDGSVGSGFDLPDKTCPHCGTPLKKDGHD    950

BSNT_02697___    951 IPFETFLGFKGDKVPDIDLNFSGEYQPQAHNYTKVLFGEDNVYRAGTIGT   1000
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU16580___po    951 IPFETFLGFKGDKVPDIDLNFSGEYQPQAHNYTKVLFGEDNVYRAGTIGT   1000

BSNT_02697___   1001 VAEKTAYGYVKGYAGDNNLHMRGAEIDRLVQGCTGVKRTTGQHPGGIIVV   1050
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU16580___po   1001 VAEKTAYGYVKGYAGDNNLHMRGAEIDRLVQGCTGVKRTTGQHPGGIIVV   1050

BSNT_02697___   1051 PDYMDIYDFSPIQFPADATGSEWKTTHFDFHSIHDNLLKLDILGHDDPTV   1100
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU16580___po   1051 PDYMDIYDFSPIQFPADATGSEWKTTHFDFHSIHDNLLKLDILGHDDPTV   1100

BSNT_02697___   1101 IRMLQDLSGIDPKTIPTDDPEVMKIFQGTESLGVTEEQIGCKTGTLGIPE   1150
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU16580___po   1101 IRMLQDLSGIDPKTIPTDDPEVMKIFQGTESLGVTEEQIGCKTGTLGIPE   1150

BSNT_02697___   1151 FGTRFVRQMLEDTKPTTFSELVQISGLSHGTDVWLGNAQELIHNNICELS   1200
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU16580___po   1151 FGTRFVRQMLEDTKPTTFSELVQISGLSHGTDVWLGNAQELIHNNICELS   1200

BSNT_02697___   1201 EVIGCRDDIMVYLIYQGLEPSLAFKIMEFVRKGKGLTPEWEEEMKNNNVP   1250
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU16580___po   1201 EVIGCRDDIMVYLIYQGLEPSLAFKIMEFVRKGKGLTPEWEEEMKNNNVP   1250

BSNT_02697___   1251 DWYIDSCKKIKYMFPKAHAAAYVLMAVRIAYFKVHHALLYYAAYFTVRAD   1300
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU16580___po   1251 DWYIDSCKKIKYMFPKAHAAAYVLMAVRIAYFKVHHALLYYAAYFTVRAD   1300

BSNT_02697___   1301 DFDIDTMIKGSTAIRAVMEDINAKGLDASPKEKNLLTVLELALEMCERGY   1350
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU16580___po   1301 DFDIDTMIKGSTAIRAVMEDINAKGLDASPKEKNLLTVLELALEMCERGY   1350

BSNT_02697___   1351 SFQKVDLYRSSATEFIIDGNSLIPPFNSIPGLGTNAALNIVKAREEGEFL   1400
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU16580___po   1351 SFQKVDLYRSSATEFIIDGNSLIPPFNSIPGLGTNAALNIVKAREEGEFL   1400

BSNT_02697___   1401 SKEDLQKRGKVSKTILEYLDRHGCLESLPDQNQLSLF   1437
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU16580___po   1401 SKEDLQKRGKVSKTILEYLDRHGCLESLPDQNQLSLF   1437


#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.