Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
Amino acid alignment: BSNT_00209 and BSU01080
See
DNA alignment /
Visit
BSNT_00209 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:16:10
# Commandline: needle
# -asequence pep-align/BSNT_00209___rpoC.1.22522.seq
# -bsequence pep-align/BSU01080___rpoC.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile pep-align/BSNT_00209___rpoC-BSU01080___rpoC.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: pep-align/BSNT_00209___rpoC-BSU01080___rpoC.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_00209___rpoC
# 2: BSU01080___rpoC
# Matrix: EBLOSUM62
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1199
# Identity: 1198/1199 (99.9%)
# Similarity: 1198/1199 (99.9%)
# Gaps: 0/1199 ( 0.0%)
# Score: 6114.0
#
#
#=======================================
BSNT_00209___ 1 MLDVNNFEYMNIGLASPDKIRSWSFGEVKKPETINYRTLKPEKDGLFCER 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01080___rp 1 MLDVNNFEYMNIGLASPDKIRSWSFGEVKKPETINYRTLKPEKDGLFCER 50
BSNT_00209___ 51 IFGPTKDWECHCGKYKRVRYKGVVCDRCGVEVTRAKVRRERMGHIELAAP 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01080___rp 51 IFGPTKDWECHCGKYKRVRYKGVVCDRCGVEVTRAKVRRERMGHIELAAP 100
BSNT_00209___ 101 VSHIWYFKGIPSRMGLVLDMSPRALEEVIYFASYVVTDPANTPLEKKQLL 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01080___rp 101 VSHIWYFKGIPSRMGLVLDMSPRALEEVIYFASYVVTDPANTPLEKKQLL 150
BSNT_00209___ 151 SEKEYRAYLDKYGNKFQASMGAEAIHKLLQDIDLVKEVDMLKEELKTSQG 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01080___rp 151 SEKEYRAYLDKYGNKFQASMGAEAIHKLLQDIDLVKEVDMLKEELKTSQG 200
BSNT_00209___ 201 QRRTRAIKRLEVLEAFRNSGNKPSWMILDVLPVIPPELRPMVQLDGGRFA 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01080___rp 201 QRRTRAIKRLEVLEAFRNSGNKPSWMILDVLPVIPPELRPMVQLDGGRFA 250
BSNT_00209___ 251 TSDLNDLYRRVINRNNRLKRLLDLGAPSIIVQNEKRMLQEAVDALIDNGR 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01080___rp 251 TSDLNDLYRRVINRNNRLKRLLDLGAPSIIVQNEKRMLQEAVDALIDNGR 300
BSNT_00209___ 301 RGRPVTGPGNRPLKSLSHMLKGKQGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIVVGPHL 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01080___rp 301 RGRPVTGPGNRPLKSLSHMLKGKQGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIVVGPHL 350
BSNT_00209___ 351 KMYQCGLPKEMALELFKPFVMKELVEKGLAHNIKSAKRKIERVQPEVWDV 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01080___rp 351 KMYQCGLPKEMALELFKPFVMKELVEKGLAHNIKSAKRKIERVQPEVWDV 400
BSNT_00209___ 401 LESVIKEHPVLLNRAPTLHRLGIQAFEPTLVEGRAIRLHPLVCTAYNADF 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01080___rp 401 LESVIKEHPVLLNRAPTLHRLGIQAFEPTLVEGRAIRLHPLVCTAYNADF 450
BSNT_00209___ 451 DGDQMAVHVPLSAEAQAEARILMLAAQNILNPKDGKPVVTPSQDMVLGNY 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01080___rp 451 DGDQMAVHVPLSAEAQAEARILMLAAQNILNPKDGKPVVTPSQDMVLGNY 500
BSNT_00209___ 501 YLTLERAGAVGEGMVFKNTDEALLAYQNGYVHLHTRVAVAANSLKNVTFT 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01080___rp 501 YLTLERAGAVGEGMVFKNTDEALLAYQNGYVHLHTRVAVAANSLKNVTFT 550
BSNT_00209___ 551 EEQRSKLLITTVGKLVFNEILPESFPYMNEPTKSNIEEKTPDRFFLEKGA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01080___rp 551 EEQRSKLLITTVGKLVFNEILPESFPYMNEPTKSNIEEKTPDRFFLEKGA 600
BSNT_00209___ 601 DVKAVIAQQPINAPFKKGILGKIIAEIFKRFHITETSKMLDRMKNLGFKY 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01080___rp 601 DVKAVIAQQPINAPFKKGILGKIIAEIFKRFHITETSKMLDRMKNLGFKY 650
BSNT_00209___ 651 STKAGITVGVSDIVVLDDKQEILEEAQSKVDNVMKQFRRGLITEEERYER 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01080___rp 651 STKAGITVGVSDIVVLDDKQEILEEAQSKVDNVMKQFRRGLITEEERYER 700
BSNT_00209___ 701 VISIWSAAKDVIQGKLMKSLDELNPIYMMSDSGARGNASNFTQLAGMRGL 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01080___rp 701 VISIWSAAKDVIQGKLMKSLDELNPIYMMSDSGARGNASNFTQLAGMRGL 750
BSNT_00209___ 751 MANPAGRIIELPIKSSFREGLTVLEYFISTHGARKGLADTALKTADSGYL 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01080___rp 751 MANPAGRIIELPIKSSFREGLTVLEYFISTHGARKGLADTALKTADSGYL 800
BSNT_00209___ 801 TRRLVDVAQDVIIRETDCGTDRGILAKPLKEGTETIERLEERLIGRFARK 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01080___rp 801 TRRLVDVAQDVIIRETDCGTDRGILAKPLKEGTETIERLEERLIGRFARK 850
BSNT_00209___ 851 QVKHPETGEVLVNENELIDEDKALEIVEAGIEEVWIRSAFTCNTPHGVCK 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01080___rp 851 QVKHPETGEVLVNENELIDEDKALEIVEAGIEEVWIRSAFTCNTPHGVCK 900
BSNT_00209___ 901 RCYGRNLATGSDVEVGEAVGIIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVAGDDIT 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01080___rp 901 RCYGRNLATGSDVEVGEAVGIIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVAGDDIT 950
BSNT_00209___ 951 QGLPRIQELFEARNPKGQATITEIDGTVVEINEVRDKQQEIVVQGAVETR 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01080___rp 951 QGLPRIQELFEARNPKGQATITEIDGTVVEINEVRDKQQEIVVQGAVETR 1000
BSNT_00209___ 1001 SYTAPYNSRLKVAEGDKIIRGQVLTEGSIDPKELLKVTDLTTVQEYLLHE 1050
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01080___rp 1001 SYTAPYNSRLKVAEGDKITRGQVLTEGSIDPKELLKVTDLTTVQEYLLHE 1050
BSNT_00209___ 1051 VQKVYRMQGVEIGDKHVEVMVRQMLRKVRVIDAGDTDVLPGTLLDIHQFT 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01080___rp 1051 VQKVYRMQGVEIGDKHVEVMVRQMLRKVRVIDAGDTDVLPGTLLDIHQFT 1100
BSNT_00209___ 1101 EANKKVLLEGNRPATGRPVLLGITKASLETDSFLSAASFQETTRVLTDAA 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01080___rp 1101 EANKKVLLEGNRPATGRPVLLGITKASLETDSFLSAASFQETTRVLTDAA 1150
BSNT_00209___ 1151 IKGKRDELLGLKENVIIGKLVPAGTGMMKYRKVKPVSNVQPTDDMVPVE 1199
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU01080___rp 1151 IKGKRDELLGLKENVIIGKLVPAGTGMMKYRKVKPVSNVQPTDDMVPVE 1199
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.