Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195

Home About Browser Genes Download Publications

Amino acid alignment: BSNT_00094 and BSU00550

See DNA alignment / Visit BSNT_00094 in genome browser / Return to Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon  8 Mar 2010 06:15:58
# Commandline: needle
#    -asequence pep-align/BSNT_00094___mfd.1.22522.seq
#    -bsequence pep-align/BSU00550___mfd.2.22522.seq
#    -gapopen 10
#    -gapextend 0.5
#    -outfile pep-align/BSNT_00094___mfd-BSU00550___mfd.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: pep-align/BSNT_00094___mfd-BSU00550___mfd.aln
########################################

#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_00094___mfd
# 2: BSU00550___mfd
# Matrix: EBLOSUM62
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1177
# Identity:    1176/1177 (99.9%)
# Similarity:  1177/1177 (100.0%)
# Gaps:           0/1177 ( 0.0%)
# Score: 5919.0
# 
#
#=======================================

BSNT_00094___      1 MDNIQTFIKESDDFKSIINGLHEGLKEQLLAGLSGSARSVFTSALANETN     50
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00550___mf      1 MDNIQTFIKESDDFKSIINGLHEGLKEQLLAGLSGSARSVFTSALANETN     50

BSNT_00094___     51 KPIFLITHNLYQAQKVTDDLTSLLEDRSVLLYPVNELISSEIAVASPELR    100
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00550___mf     51 KPIFLITHNLYQAQKVTDDLTSLLEDRSVLLYPVNELISSEIAVASPELR    100

BSNT_00094___    101 AQRLDVINRLTNGEAPIVVAPVAAIRRMLPPVEVWKSSQMLIQVGHDIEP    150
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00550___mf    101 AQRLDVINRLTNGEAPIVVAPVAAIRRMLPPVEVWKSSQMLIQVGHDIEP    150

BSNT_00094___    151 DQLASRLVEVGYERSDMVSAPGEFSIRGGIIDIYPLTSENPVRIELFDTE    200
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00550___mf    151 DQLASRLVEVGYERSDMVSAPGEFSIRGGIIDIYPLTSENPVRIELFDTE    200

BSNT_00094___    201 VDSIRSFNSDDQRSIETLTSINIGPAKELIIRPEEKARAMEKIDSGLAAS    250
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00550___mf    201 VDSIRSFNSDDQRSIETLTSINIGPAKELIIRPEEKARAMEKIDSGLAAS    250

BSNT_00094___    251 LKKLKADKQKEILHANISHDKERLSEGQTDQELVKYLSYFYEKPASLLDY    300
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00550___mf    251 LKKLKADKQKEILHANISHDKERLSEGQTDQELVKYLSYFYEKPASLLDY    300

BSNT_00094___    301 TPDNTLLILDEVSRIHEMEEQLQKEEAEFITNLLEEGKILHDIRLSFSFQ    350
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00550___mf    301 TPDNTLLILDEVSRIHEMEEQLQKEEAEFITNLLEEGKILHDIRLSFSFQ    350

BSNT_00094___    351 KIVAEQKRPLLYYSLFLRHVHHTSPQNIVNVSGRQMQSFHGQMNVLAGEM    400
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00550___mf    351 KIVAEQKRPLLYYSLFLRHVHHTSPQNIVNVSGRQMQSFHGQMNVLAGEM    400

BSNT_00094___    401 ERFKKSNFTVVFLGANKERTQKLSSVLADYDIEAAVTDSKKALVQGQVYI    450
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||
BSU00550___mf    401 ERFKKSNFTVVFLGANKERTQKLSSVLADYDIEAAMTDSKKALVQGQVYI    450

BSNT_00094___    451 MEGELQSGFELPLMKLAVITEEELFKNRVKKKPRKQKLTNAERIKSYSEL    500
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00550___mf    451 MEGELQSGFELPLMKLAVITEEELFKNRVKKKPRKQKLTNAERIKSYSEL    500

BSNT_00094___    501 QIGDYVVHINHGIGKYLGIETLEINGIHKDYLNIHYQGSDKLYVPVEQID    550
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00550___mf    501 QIGDYVVHINHGIGKYLGIETLEINGIHKDYLNIHYQGSDKLYVPVEQID    550

BSNT_00094___    551 QVQKYVGSEGKEPKLYKLGGSEWKRVKKKVETSVQDIADDLIKLYAEREA    600
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00550___mf    551 QVQKYVGSEGKEPKLYKLGGSEWKRVKKKVETSVQDIADDLIKLYAEREA    600

BSNT_00094___    601 SKGYAFSPDHEMQREFESAFPYQETEDQLRSIHEIKKDMERERPMDRLLC    650
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00550___mf    601 SKGYAFSPDHEMQREFESAFPYQETEDQLRSIHEIKKDMERERPMDRLLC    650

BSNT_00094___    651 GDVGYGKTEVAIRAAFKAIGDGKQVALLVPTTILAQQHYETIKERFQDYP    700
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00550___mf    651 GDVGYGKTEVAIRAAFKAIGDGKQVALLVPTTILAQQHYETIKERFQDYP    700

BSNT_00094___    701 INIGLLSRFRTRKEANETIKGLKNGTVDIVIGTHRLLSKDVVYKDLGLLI    750
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00550___mf    701 INIGLLSRFRTRKEANETIKGLKNGTVDIVIGTHRLLSKDVVYKDLGLLI    750

BSNT_00094___    751 IDEEQRFGVTHKEKIKQIKANVDVLTLTATPIPRTLHMSMLGVRDLSVIE    800
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00550___mf    751 IDEEQRFGVTHKEKIKQIKANVDVLTLTATPIPRTLHMSMLGVRDLSVIE    800

BSNT_00094___    801 TPPENRFPVQTYVVEYNGALVREAIERELARGGQVYFLYNRVEDIERKAD    850
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00550___mf    801 TPPENRFPVQTYVVEYNGALVREAIERELARGGQVYFLYNRVEDIERKAD    850

BSNT_00094___    851 EISMLVPDAKVAYAHGKMTENELETVMLSFLEGESDVLVSTTIIETGVDI    900
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00550___mf    851 EISMLVPDAKVAYAHGKMTENELETVMLSFLEGESDVLVSTTIIETGVDI    900

BSNT_00094___    901 PNVNTLIVFDADKMGLSQLYQLRGRVGRSNRVAYAYFTYRRDKVLTEVAE    950
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00550___mf    901 PNVNTLIVFDADKMGLSQLYQLRGRVGRSNRVAYAYFTYRRDKVLTEVAE    950

BSNT_00094___    951 KRLQAIKEFTELGSGFKIAMRDLTIRGAGNLLGAQQHGFIDSVGFDLYSQ   1000
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00550___mf    951 KRLQAIKEFTELGSGFKIAMRDLTIRGAGNLLGAQQHGFIDSVGFDLYSQ   1000

BSNT_00094___   1001 MLKEAIEERKGDTAKTEQFETEIDVELDAYIPETYIQDGKQKIDMYKRFR   1050
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00550___mf   1001 MLKEAIEERKGDTAKTEQFETEIDVELDAYIPETYIQDGKQKIDMYKRFR   1050

BSNT_00094___   1051 SVATIEEKNELQDEMIDRFGNYPKEVEYLFTVAEMKVYARQERVELIKQD   1100
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00550___mf   1051 SVATIEEKNELQDEMIDRFGNYPKEVEYLFTVAEMKVYARQERVELIKQD   1100

BSNT_00094___   1101 KDAVRLTISEEASAEIDGQKLFELGNQYGRQIGLGMEGKKLKISIQTKGR   1150
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU00550___mf   1101 KDAVRLTISEEASAEIDGQKLFELGNQYGRQIGLGMEGKKLKISIQTKGR   1150

BSNT_00094___   1151 SADEWLDTVLGMLKGLKDVKKQTISST   1177
                     |||||||||||||||||||||||||||
BSU00550___mf   1151 SADEWLDTVLGMLKGLKDVKKQTISST   1177


#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.