Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
Amino acid alignment: BSNT_00209 and BPUM_0094
See
DNA alignment /
Visit
BSNT_00209 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:21:09
# Commandline: needle
# -asequence pep-align/BSNT_00209___rpoC.1.24716.seq
# -bsequence pep-align/BPUM_0094___rpoC.2.24716.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile pep-align/BSNT_00209___rpoC-BPUM_0094___rpoC.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: pep-align/BSNT_00209___rpoC-BPUM_0094___rpoC.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_00209___rpoC
# 2: BPUM_0094___rpoC
# Matrix: EBLOSUM62
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1199
# Identity: 1141/1199 (95.2%)
# Similarity: 1171/1199 (97.7%)
# Gaps: 0/1199 ( 0.0%)
# Score: 5877.0
#
#
#=======================================
BSNT_00209___ 1 MLDVNNFEYMNIGLASPDKIRSWSFGEVKKPETINYRTLKPEKDGLFCER 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BPUM_0094___r 1 MLDVNNFEYMNIGLASPDKIRSWSFGEVKKPETINYRTLKPEKDGLFCER 50
BSNT_00209___ 51 IFGPTKDWECHCGKYKRVRYKGVVCDRCGVEVTRAKVRRERMGHIELAAP 100
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BPUM_0094___r 51 IFGPQKDWECHCGKYKRVRYKGVVCDRCGVEVTRAKVRRERMGHIELAAP 100
BSNT_00209___ 101 VSHIWYFKGIPSRMGLVLDMSPRALEEVIYFASYVVTDPANTPLEKKQLL 150
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
BPUM_0094___r 101 VSHIWYFKGIPSRMGLVLDMSPRALEEVIYFASYVVTDPGNTPLEKKQLL 150
BSNT_00209___ 151 SEKEYRAYLDKYGNKFQASMGAEAIHKLLQDIDLVKEVDMLKEELKTSQG 200
||||:|||||||||.|.|:||||||:|||||||||||||.|||||||:||
BPUM_0094___r 151 SEKEFRAYLDKYGNTFSAAMGAEAINKLLQDIDLVKEVDTLKEELKTAQG 200
BSNT_00209___ 201 QRRTRAIKRLEVLEAFRNSGNKPSWMILDVLPVIPPELRPMVQLDGGRFA 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BPUM_0094___r 201 QRRTRAIKRLEVLEAFRNSGNKPSWMILDVLPVIPPELRPMVQLDGGRFA 250
BSNT_00209___ 251 TSDLNDLYRRVINRNNRLKRLLDLGAPSIIVQNEKRMLQEAVDALIDNGR 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BPUM_0094___r 251 TSDLNDLYRRVINRNNRLKRLLDLGAPSIIVQNEKRMLQEAVDALIDNGR 300
BSNT_00209___ 301 RGRPVTGPGNRPLKSLSHMLKGKQGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIVVGPHL 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BPUM_0094___r 301 RGRPVTGPGNRPLKSLSHMLKGKQGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIVVGPHL 350
BSNT_00209___ 351 KMYQCGLPKEMALELFKPFVMKELVEKGLAHNIKSAKRKIERVQPEVWDV 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BPUM_0094___r 351 KMYQCGLPKEMALELFKPFVMKELVEKGLAHNIKSAKRKIERVQPEVWDV 400
BSNT_00209___ 401 LESVIKEHPVLLNRAPTLHRLGIQAFEPTLVEGRAIRLHPLVCTAYNADF 450
|||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BPUM_0094___r 401 LESVIREHPVLLNRAPTLHRLGIQAFEPTLVEGRAIRLHPLVCTAYNADF 450
BSNT_00209___ 451 DGDQMAVHVPLSAEAQAEARILMLAAQNILNPKDGKPVVTPSQDMVLGNY 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BPUM_0094___r 451 DGDQMAVHVPLSAEAQAEARILMLAAQNILNPKDGKPVVTPSQDMVLGNY 500
BSNT_00209___ 501 YLTLERAGAVGEGMVFKNTDEALLAYQNGYVHLHTRVAVAANSLKNVTFT 550
||||||.||:|||||||:|:||||||||||||||||||||||||||||||
BPUM_0094___r 501 YLTLERKGAIGEGMVFKDTNEALLAYQNGYVHLHTRVAVAANSLKNVTFT 550
BSNT_00209___ 551 EEQRSKLLITTVGKLVFNEILPESFPYMNEPTKSNIEEKTPDRFFLEKGA 600
:||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||.
BPUM_0094___r 551 DEQRSKLLITTVGKLIFNEILPESFPYMNEPTKSNIEEKTPDRFFLEKGE 600
BSNT_00209___ 601 DVKAVIAQQPINAPFKKGILGKIIAEIFKRFHITETSKMLDRMKNLGFKY 650
||||.|.:|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BPUM_0094___r 601 DVKATIEKQEINAPFKKGILGKIIAEIFKRFHITETSKMLDRMKNLGFKY 650
BSNT_00209___ 651 STKAGITVGVSDIVVLDDKQEILEEAQSKVDNVMKQFRRGLITEEERYER 700
||||||||||||||||||||:||||||:||||||||||||||||||||||
BPUM_0094___r 651 STKAGITVGVSDIVVLDDKQKILEEAQAKVDNVMKQFRRGLITEEERYER 700
BSNT_00209___ 701 VISIWSAAKDVIQGKLMKSLDELNPIYMMSDSGARGNASNFTQLAGMRGL 750
||||||::||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||
BPUM_0094___r 701 VISIWSSSKDVIQGKLMKSLDEVNPIYMMSDSGARGNASNFTQLAGMRGL 750
BSNT_00209___ 751 MANPAGRIIELPIKSSFREGLTVLEYFISTHGARKGLADTALKTADSGYL 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BPUM_0094___r 751 MANPAGRIIELPIKSSFREGLTVLEYFISTHGARKGLADTALKTADSGYL 800
BSNT_00209___ 801 TRRLVDVAQDVIIRETDCGTDRGILAKPLKEGTETIERLEERLIGRFARK 850
|||||||||||||||||||||||||||.::||.|.||:||||||||||||
BPUM_0094___r 801 TRRLVDVAQDVIIRETDCGTDRGILAKSIREGNEIIEKLEERLIGRFARK 850
BSNT_00209___ 851 QVKHPETGEVLVNENELIDEDKALEIVEAGIEEVWIRSAFTCNTPHGVCK 900
.:.|||||||:|.||||||||||||:||||||||||||||||||||||||
BPUM_0094___r 851 PIVHPETGEVIVGENELIDEDKALEVVEAGIEEVWIRSAFTCNTPHGVCK 900
BSNT_00209___ 901 RCYGRNLATGSDVEVGEAVGIIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVAGDDIT 950
||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BPUM_0094___r 901 RCYGRNLATGTDVEVGEAVGIIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVAGDDIT 950
BSNT_00209___ 951 QGLPRIQELFEARNPKGQATITEIDGTVVEINEVRDKQQEIVVQGAVETR 1000
|||||||||||||||||||||:||||.|.|||:||||||||||||.||||
BPUM_0094___r 951 QGLPRIQELFEARNPKGQATISEIDGVVAEINDVRDKQQEIVVQGDVETR 1000
BSNT_00209___ 1001 SYTAPYNSRLKVAEGDKIIRGQVLTEGSIDPKELLKVTDLTTVQEYLLHE 1050
|||||||:||||.||||:.||||||||||||||||||||:|.||||||||
BPUM_0094___r 1001 SYTAPYNARLKVVEGDKVTRGQVLTEGSIDPKELLKVTDMTAVQEYLLHE 1050
BSNT_00209___ 1051 VQKVYRMQGVEIGDKHVEVMVRQMLRKVRVIDAGDTDVLPGTLLDIHQFT 1100
||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||:||||
BPUM_0094___r 1051 VQKVYRMQGVEIGDKHVEVMVRQMLRKVRVADAGDTDVLPGTLLDVHQFT 1100
BSNT_00209___ 1101 EANKKVLLEGNRPATGRPVLLGITKASLETDSFLSAASFQETTRVLTDAA 1150
|||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BPUM_0094___r 1101 EANKKVLFEGKRPATGRPVLLGITKASLETDSFLSAASFQETTRVLTDAA 1150
BSNT_00209___ 1151 IKGKRDELLGLKENVIIGKLVPAGTGMMKYRKVKPVSNVQPTDDMVPVE 1199
|||||||||||||||||||||||||||..||||||||.|||:|||||||
BPUM_0094___r 1151 IKGKRDELLGLKENVIIGKLVPAGTGMPNYRKVKPVSQVQPSDDMVPVE 1199
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.