Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
Amino acid alignment: BSNT_00209 and BL02626
See
DNA alignment /
Visit
BSNT_00209 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:21:52
# Commandline: needle
# -asequence pep-align/BSNT_00209___rpoC.1.5803.seq
# -bsequence pep-align/BL02626___rpoC.2.5803.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile pep-align/BSNT_00209___rpoC-BL02626___rpoC.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: pep-align/BSNT_00209___rpoC-BL02626___rpoC.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_00209___rpoC
# 2: BL02626___rpoC
# Matrix: EBLOSUM62
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1199
# Identity: 1147/1199 (95.7%)
# Similarity: 1168/1199 (97.4%)
# Gaps: 0/1199 ( 0.0%)
# Score: 5883.0
#
#
#=======================================
BSNT_00209___ 1 MLDVNNFEYMNIGLASPDKIRSWSFGEVKKPETINYRTLKPEKDGLFCER 50
||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||
BL02626___rpo 1 MLDVNNFEYMNIGLASPDKIRSWSYGEVKKPETINYRTLKPEKDGLFCER 50
BSNT_00209___ 51 IFGPTKDWECHCGKYKRVRYKGVVCDRCGVEVTRAKVRRERMGHIELAAP 100
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL02626___rpo 51 IFGPQKDWECHCGKYKRVRYKGVVCDRCGVEVTRAKVRRERMGHIELAAP 100
BSNT_00209___ 101 VSHIWYFKGIPSRMGLVLDMSPRALEEVIYFASYVVTDPANTPLEKKQLL 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL02626___rpo 101 VSHIWYFKGIPSRMGLVLDMSPRALEEVIYFASYVVTDPANTPLEKKQLL 150
BSNT_00209___ 151 SEKEYRAYLDKYGNKFQASMGAEAIHKLLQDIDLVKEVDMLKEELKTSQG 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
BL02626___rpo 151 SEKEYRAYLDKYGNKFQASMGAEAIHKLLQDIDLDKEVDMLKEELKTSQG 200
BSNT_00209___ 201 QRRTRAIKRLEVLEAFRNSGNKPSWMILDVLPVIPPELRPMVQLDGGRFA 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL02626___rpo 201 QRRTRAIKRLEVLEAFRNSGNKPSWMILDVLPVIPPELRPMVQLDGGRFA 250
BSNT_00209___ 251 TSDLNDLYRRVINRNNRLKRLLDLGAPSIIVQNEKRMLQEAVDALIDNGR 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL02626___rpo 251 TSDLNDLYRRVINRNNRLKRLLDLGAPSIIVQNEKRMLQEAVDALIDNGR 300
BSNT_00209___ 301 RGRPVTGPGNRPLKSLSHMLKGKQGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIVVGPHL 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|
BL02626___rpo 301 RGRPVTGPGNRPLKSLSHMLKGKQGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIVVGPNL 350
BSNT_00209___ 351 KMYQCGLPKEMALELFKPFVMKELVEKGLAHNIKSAKRKIERVQPEVWDV 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL02626___rpo 351 KMYQCGLPKEMALELFKPFVMKELVEKGLAHNIKSAKRKIERVQPEVWDV 400
BSNT_00209___ 401 LESVIKEHPVLLNRAPTLHRLGIQAFEPTLVEGRAIRLHPLVCTAYNADF 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL02626___rpo 401 LESVIKEHPVLLNRAPTLHRLGIQAFEPTLVEGRAIRLHPLVCTAYNADF 450
BSNT_00209___ 451 DGDQMAVHVPLSAEAQAEARILMLAAQNILNPKDGKPVVTPSQDMVLGNY 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL02626___rpo 451 DGDQMAVHVPLSAEAQAEARILMLAAQNILNPKDGKPVVTPSQDMVLGNY 500
BSNT_00209___ 501 YLTLERAGAVGEGMVFKNTDEALLAYQNGYVHLHTRVAVAANSLKNVTFT 550
||||||.|||||||:||:||||||||||||||||||||||.|||||.|||
BL02626___rpo 501 YLTLERPGAVGEGMIFKDTDEALLAYQNGYVHLHTRVAVAVNSLKNETFT 550
BSNT_00209___ 551 EEQRSKLLITTVGKLVFNEILPESFPYMNEPTKSNIEEKTPDRFFLEKGA 600
|||||||||||||||:||||||.|||||||||||||||||||||||:.||
BL02626___rpo 551 EEQRSKLLITTVGKLIFNEILPPSFPYMNEPTKSNIEEKTPDRFFLDYGA 600
BSNT_00209___ 601 DVKAVIAQQPINAPFKKGILGKIIAEIFKRFHITETSKMLDRMKNLGFKY 650
|||..|..|.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL02626___rpo 601 DVKEAIKNQEINPPFKKGILGKIIAEIFKRFHITETSKMLDRMKNLGFKY 650
BSNT_00209___ 651 STKAGITVGVSDIVVLDDKQEILEEAQSKVDNVMKQFRRGLITEEERYER 700
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
BL02626___rpo 651 STKAGITVGVSDIVVLDDKQEILEEAQGKVDNVMKQFRRGLITEEERYER 700
BSNT_00209___ 701 VISIWSAAKDVIQGKLMKSLDELNPIYMMSDSGARGNASNFTQLAGMRGL 750
||||||||||.|||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||
BL02626___rpo 701 VISIWSAAKDTIQGKLMKSLDEINPIYMMSDSGARGNASNFTQLAGMRGL 750
BSNT_00209___ 751 MANPAGRIIELPIKSSFREGLTVLEYFISTHGARKGLADTALKTADSGYL 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL02626___rpo 751 MANPAGRIIELPIKSSFREGLTVLEYFISTHGARKGLADTALKTADSGYL 800
BSNT_00209___ 801 TRRLVDVAQDVIIRETDCGTDRGILAKPLKEGTETIERLEERLIGRFARK 850
|||||||||||||||||||||||||||.:.||||.||||||||:||||||
BL02626___rpo 801 TRRLVDVAQDVIIRETDCGTDRGILAKAITEGTEVIERLEERLVGRFARK 850
BSNT_00209___ 851 QVKHPETGEVLVNENELIDEDKALEIVEAGIEEVWIRSAFTCNTPHGVCK 900
.||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||.|||||
BL02626___rpo 851 PVKHPETGEVLVNENELIDEDKAIEIVEAGIEEVWIRSAFTCNTSHGVCK 900
BSNT_00209___ 901 RCYGRNLATGSDVEVGEAVGIIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVAGDDIT 950
||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL02626___rpo 901 RCYGRNLATGTDVEVGEAVGIIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVAGDDIT 950
BSNT_00209___ 951 QGLPRIQELFEARNPKGQATITEIDGTVVEINEVRDKQQEIVVQGAVETR 1000
|||||||||||||||||||||:||||.|.||||||||||||||||.||:|
BL02626___rpo 951 QGLPRIQELFEARNPKGQATISEIDGVVAEINEVRDKQQEIVVQGEVESR 1000
BSNT_00209___ 1001 SYTAPYNSRLKVAEGDKIIRGQVLTEGSIDPKELLKVTDLTTVQEYLLHE 1050
|||||||:||||.||:||.|||||||||:||||||||||:||||||||||
BL02626___rpo 1001 SYTAPYNARLKVTEGEKISRGQVLTEGSVDPKELLKVTDITTVQEYLLHE 1050
BSNT_00209___ 1051 VQKVYRMQGVEIGDKHVEVMVRQMLRKVRVIDAGDTDVLPGTLLDIHQFT 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||
BL02626___rpo 1051 VQKVYRMQGVEIGDKHVEVMVRQMLRKVRVIDAGDTEVLPGTLLDIHQFT 1100
BSNT_00209___ 1101 EANKKVLLEGNRPATGRPVLLGITKASLETDSFLSAASFQETTRVLTDAA 1150
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL02626___rpo 1101 EANKKVLLEGKRPATGRPVLLGITKASLETDSFLSAASFQETTRVLTDAA 1150
BSNT_00209___ 1151 IKGKRDELLGLKENVIIGKLVPAGTGMMKYRKVKPVSNVQPTDDMVPVE 1199
|||||||||||||||||||||||||||:.|||||||..||.:|:|||.|
BL02626___rpo 1151 IKGKRDELLGLKENVIIGKLVPAGTGMLNYRKVKPVLQVQSSDEMVPAE 1199
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.