Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195

Home About Browser Genes Download Publications

Amino acid alignment: BSNT_00209 and BL02626

See DNA alignment / Visit BSNT_00209 in genome browser / Return to Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon  8 Mar 2010 06:21:52
# Commandline: needle
#    -asequence pep-align/BSNT_00209___rpoC.1.5803.seq
#    -bsequence pep-align/BL02626___rpoC.2.5803.seq
#    -gapopen 10
#    -gapextend 0.5
#    -outfile pep-align/BSNT_00209___rpoC-BL02626___rpoC.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: pep-align/BSNT_00209___rpoC-BL02626___rpoC.aln
########################################

#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_00209___rpoC
# 2: BL02626___rpoC
# Matrix: EBLOSUM62
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1199
# Identity:    1147/1199 (95.7%)
# Similarity:  1168/1199 (97.4%)
# Gaps:           0/1199 ( 0.0%)
# Score: 5883.0
# 
#
#=======================================

BSNT_00209___      1 MLDVNNFEYMNIGLASPDKIRSWSFGEVKKPETINYRTLKPEKDGLFCER     50
                     ||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||
BL02626___rpo      1 MLDVNNFEYMNIGLASPDKIRSWSYGEVKKPETINYRTLKPEKDGLFCER     50

BSNT_00209___     51 IFGPTKDWECHCGKYKRVRYKGVVCDRCGVEVTRAKVRRERMGHIELAAP    100
                     ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL02626___rpo     51 IFGPQKDWECHCGKYKRVRYKGVVCDRCGVEVTRAKVRRERMGHIELAAP    100

BSNT_00209___    101 VSHIWYFKGIPSRMGLVLDMSPRALEEVIYFASYVVTDPANTPLEKKQLL    150
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL02626___rpo    101 VSHIWYFKGIPSRMGLVLDMSPRALEEVIYFASYVVTDPANTPLEKKQLL    150

BSNT_00209___    151 SEKEYRAYLDKYGNKFQASMGAEAIHKLLQDIDLVKEVDMLKEELKTSQG    200
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
BL02626___rpo    151 SEKEYRAYLDKYGNKFQASMGAEAIHKLLQDIDLDKEVDMLKEELKTSQG    200

BSNT_00209___    201 QRRTRAIKRLEVLEAFRNSGNKPSWMILDVLPVIPPELRPMVQLDGGRFA    250
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL02626___rpo    201 QRRTRAIKRLEVLEAFRNSGNKPSWMILDVLPVIPPELRPMVQLDGGRFA    250

BSNT_00209___    251 TSDLNDLYRRVINRNNRLKRLLDLGAPSIIVQNEKRMLQEAVDALIDNGR    300
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL02626___rpo    251 TSDLNDLYRRVINRNNRLKRLLDLGAPSIIVQNEKRMLQEAVDALIDNGR    300

BSNT_00209___    301 RGRPVTGPGNRPLKSLSHMLKGKQGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIVVGPHL    350
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|
BL02626___rpo    301 RGRPVTGPGNRPLKSLSHMLKGKQGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIVVGPNL    350

BSNT_00209___    351 KMYQCGLPKEMALELFKPFVMKELVEKGLAHNIKSAKRKIERVQPEVWDV    400
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL02626___rpo    351 KMYQCGLPKEMALELFKPFVMKELVEKGLAHNIKSAKRKIERVQPEVWDV    400

BSNT_00209___    401 LESVIKEHPVLLNRAPTLHRLGIQAFEPTLVEGRAIRLHPLVCTAYNADF    450
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL02626___rpo    401 LESVIKEHPVLLNRAPTLHRLGIQAFEPTLVEGRAIRLHPLVCTAYNADF    450

BSNT_00209___    451 DGDQMAVHVPLSAEAQAEARILMLAAQNILNPKDGKPVVTPSQDMVLGNY    500
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL02626___rpo    451 DGDQMAVHVPLSAEAQAEARILMLAAQNILNPKDGKPVVTPSQDMVLGNY    500

BSNT_00209___    501 YLTLERAGAVGEGMVFKNTDEALLAYQNGYVHLHTRVAVAANSLKNVTFT    550
                     ||||||.|||||||:||:||||||||||||||||||||||.|||||.|||
BL02626___rpo    501 YLTLERPGAVGEGMIFKDTDEALLAYQNGYVHLHTRVAVAVNSLKNETFT    550

BSNT_00209___    551 EEQRSKLLITTVGKLVFNEILPESFPYMNEPTKSNIEEKTPDRFFLEKGA    600
                     |||||||||||||||:||||||.|||||||||||||||||||||||:.||
BL02626___rpo    551 EEQRSKLLITTVGKLIFNEILPPSFPYMNEPTKSNIEEKTPDRFFLDYGA    600

BSNT_00209___    601 DVKAVIAQQPINAPFKKGILGKIIAEIFKRFHITETSKMLDRMKNLGFKY    650
                     |||..|..|.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL02626___rpo    601 DVKEAIKNQEINPPFKKGILGKIIAEIFKRFHITETSKMLDRMKNLGFKY    650

BSNT_00209___    651 STKAGITVGVSDIVVLDDKQEILEEAQSKVDNVMKQFRRGLITEEERYER    700
                     |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
BL02626___rpo    651 STKAGITVGVSDIVVLDDKQEILEEAQGKVDNVMKQFRRGLITEEERYER    700

BSNT_00209___    701 VISIWSAAKDVIQGKLMKSLDELNPIYMMSDSGARGNASNFTQLAGMRGL    750
                     ||||||||||.|||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||
BL02626___rpo    701 VISIWSAAKDTIQGKLMKSLDEINPIYMMSDSGARGNASNFTQLAGMRGL    750

BSNT_00209___    751 MANPAGRIIELPIKSSFREGLTVLEYFISTHGARKGLADTALKTADSGYL    800
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL02626___rpo    751 MANPAGRIIELPIKSSFREGLTVLEYFISTHGARKGLADTALKTADSGYL    800

BSNT_00209___    801 TRRLVDVAQDVIIRETDCGTDRGILAKPLKEGTETIERLEERLIGRFARK    850
                     |||||||||||||||||||||||||||.:.||||.||||||||:||||||
BL02626___rpo    801 TRRLVDVAQDVIIRETDCGTDRGILAKAITEGTEVIERLEERLVGRFARK    850

BSNT_00209___    851 QVKHPETGEVLVNENELIDEDKALEIVEAGIEEVWIRSAFTCNTPHGVCK    900
                     .||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||.|||||
BL02626___rpo    851 PVKHPETGEVLVNENELIDEDKAIEIVEAGIEEVWIRSAFTCNTSHGVCK    900

BSNT_00209___    901 RCYGRNLATGSDVEVGEAVGIIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVAGDDIT    950
                     ||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL02626___rpo    901 RCYGRNLATGTDVEVGEAVGIIAAQSIGEPGTQLTMRTFHTGGVAGDDIT    950

BSNT_00209___    951 QGLPRIQELFEARNPKGQATITEIDGTVVEINEVRDKQQEIVVQGAVETR   1000
                     |||||||||||||||||||||:||||.|.||||||||||||||||.||:|
BL02626___rpo    951 QGLPRIQELFEARNPKGQATISEIDGVVAEINEVRDKQQEIVVQGEVESR   1000

BSNT_00209___   1001 SYTAPYNSRLKVAEGDKIIRGQVLTEGSIDPKELLKVTDLTTVQEYLLHE   1050
                     |||||||:||||.||:||.|||||||||:||||||||||:||||||||||
BL02626___rpo   1001 SYTAPYNARLKVTEGEKISRGQVLTEGSVDPKELLKVTDITTVQEYLLHE   1050

BSNT_00209___   1051 VQKVYRMQGVEIGDKHVEVMVRQMLRKVRVIDAGDTDVLPGTLLDIHQFT   1100
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||
BL02626___rpo   1051 VQKVYRMQGVEIGDKHVEVMVRQMLRKVRVIDAGDTEVLPGTLLDIHQFT   1100

BSNT_00209___   1101 EANKKVLLEGNRPATGRPVLLGITKASLETDSFLSAASFQETTRVLTDAA   1150
                     ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL02626___rpo   1101 EANKKVLLEGKRPATGRPVLLGITKASLETDSFLSAASFQETTRVLTDAA   1150

BSNT_00209___   1151 IKGKRDELLGLKENVIIGKLVPAGTGMMKYRKVKPVSNVQPTDDMVPVE   1199
                     |||||||||||||||||||||||||||:.|||||||..||.:|:|||.|
BL02626___rpo   1151 IKGKRDELLGLKENVIIGKLVPAGTGMLNYRKVKPVLQVQSSDEMVPAE   1199


#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.