Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_05932 and BSU38760
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_05932 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:27:17
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_05932___cydA.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU38760___cydA.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_05932___cydA-BSU38760___cydA.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_05932___cydA-BSU38760___cydA.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_05932___cydA
# 2: BSU38760___cydA
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1407
# Identity: 1393/1407 (99.0%)
# Similarity: 1393/1407 (99.0%)
# Gaps: 0/1407 ( 0.0%)
# Score: 6909.0
#
#
#=======================================
BSNT_05932___ 1 ATGAGTGAATTGGTATTAGCCCGCATACAATTTGCATCAACAACGTTGTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU38760___cy 1 ATGAGTGAATTGGTATTAGCCCGCATACAATTTGCATCAACAACGTTGTT 50
BSNT_05932___ 51 TCACTTCTTGTTTGTGCCGATGTCTATCGGGCTTGTGTTTATGGTTGCGT 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU38760___cy 51 TCACTTCTTGTTTGTGCCGATGTCTATCGGGCTTGTGTTTATGGTTGCGT 100
BSNT_05932___ 101 TGATGGAGACTCTTTATCTTGTAAAGAAAAATGAGCTGTATCTCAAAATG 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU38760___cy 101 TGATGGAGACTCTTTATCTTGTAAAGAAAAATGAGCTGTATCTCAAAATG 150
BSNT_05932___ 151 GCAAAGTTTTGGGGACACTTATTCTTAATAAATTTCGCAGTCGGTGTTGT 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU38760___cy 151 GCAAAGTTTTGGGGACACTTATTCTTAATAAATTTCGCAGTCGGTGTTGT 200
BSNT_05932___ 201 AACGGGGATTTTGCAAGAATTCCAGTTTGGACTGAACTGGTCTGATTACT 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
BSU38760___cy 201 AACGGGGATTTTGCAAGAATTCCAGTTTGGACTGAACTGGTCAGATTACT 250
BSNT_05932___ 251 CCCGTTTTGTCGGAGATGTATTTGGCGCTCCCCTTGCGATTGAAGCATTA 300
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
BSU38760___cy 251 CCCGTTTTGTCGGAGATGTATTTGGCGCTCCGCTTGCGATTGAAGCATTA 300
BSNT_05932___ 301 TTGGCGTTTTTCATGGAATCTATTTTTATCGGATTATGGATTTTTGGCTG 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU38760___cy 301 TTGGCGTTTTTCATGGAATCTATTTTTATCGGATTATGGATTTTTGGCTG 350
BSNT_05932___ 351 GGACCGCCTGCCGAAGAAAATTCACGCTCTCTGCATATGGCTCGTATCAT 400
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
BSU38760___cy 351 GGACCGCCTGCCGAAGAAAATTCACGCGCTCTGCATATGGCTCGTATCAT 400
BSNT_05932___ 401 TCGGAACGATCATGTCATCTTTCTGGATTTTAACAGCAAACTCCTTTATG 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU38760___cy 401 TCGGAACGATCATGTCATCTTTCTGGATTTTAACAGCAAACTCCTTTATG 450
BSNT_05932___ 451 CAGGAGCCGGTCGGTTTTACGATCAAAAACGGCCGCGCGGAAATGAATGA 500
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU38760___cy 451 CAGGAGCCGGTCGGCTTTACGATCAAAAACGGCCGCGCGGAAATGAATGA 500
BSNT_05932___ 501 TTTTGGCGCGTTGATTACAAACCCTCAGCTTTGGGTTGAATTCCCGCACG 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU38760___cy 501 TTTTGGCGCGTTGATTACAAACCCTCAGCTTTGGGTTGAATTCCCGCACG 550
BSNT_05932___ 551 TTATTTTCGGTGCGCTTGCCACTGGAGCTTTCTTTATTGCCGGAGTGAGT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU38760___cy 551 TTATTTTCGGTGCGCTTGCCACTGGAGCTTTCTTTATTGCCGGAGTGAGT 600
BSNT_05932___ 601 GCTTTTAAACTGCTGAAGAAAAAAGAAGTGCCGTTCTTTAAGCAATCTTT 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU38760___cy 601 GCTTTTAAACTGCTGAAGAAAAAAGAAGTGCCGTTCTTTAAGCAATCTTT 650
BSNT_05932___ 651 TAAACTCGCAATGATCGTCGGCCTTTGTGCCGGTCTTGGCGTCGGCCTTA 700
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
BSU38760___cy 651 TAAACTCGCAATGATCGTCGGTCTTTGTGCCGGTCTTGGCGTCGGCCTTA 700
BSNT_05932___ 701 GCGGACACATGCAGGCTGAGCACTTGATGGAATCACAGCCGATGAAAATG 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU38760___cy 701 GCGGACACATGCAGGCTGAGCACTTGATGGAATCACAGCCGATGAAAATG 750
BSNT_05932___ 751 GCTGCCAGTGAAGGTCTATGGGAAGACAGCGGTGACCCTGCTGCTTGGAC 800
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU38760___cy 751 GCTGCCAGTGAAGGCCTATGGGAAGACAGCGGTGACCCTGCTGCTTGGAC 800
BSNT_05932___ 801 CGCTTTTGCGACGATCGATACAAAAAATGAAAAAAGCTCAAATGAAATCA 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU38760___cy 801 CGCTTTTGCGACGATCGATACAAAAAATGAAAAAAGCTCAAATGAAATCA 850
BSNT_05932___ 851 AAGTTCCTTATGCCTTGAGCTACTTGGCTTATCAGAAATTCAGCGGAAGT 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU38760___cy 851 AAGTTCCTTATGCCTTGAGCTACTTGGCTTATCAGAAATTCAGCGGAAGT 900
BSNT_05932___ 901 GTCAAAGGGATGAAAACCCTTCAGGCTGAGTACGAAAAAATATACGGAAA 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU38760___cy 901 GTCAAAGGGATGAAAACCCTTCAGGCTGAGTACGAAAAAATATACGGAAA 950
BSNT_05932___ 951 AGGCGACTACATTCCGCCAGTGAAAACGACATTCTGGAGCTTCCGCATCA 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU38760___cy 951 AGGCGACTACATTCCGCCAGTGAAAACGACATTCTGGAGCTTCCGCATCA 1000
BSNT_05932___ 1001 TGGTAGGAGCAGGTGTTGTCATGATTCTTGCTGCGTTAGGCGGCCTTTGG 1050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU38760___cy 1001 TGGTAGGAGCAGGTGTTGTCATGATTCTTGCTGCGTTAGGCGGCCTTTGG 1050
BSNT_05932___ 1051 TTAAACCGCCGCAAAAAGCTTGAAAACAGCAAATGGTATTTGCGCATCAT 1100
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU38760___cy 1051 TTAAACCGCCGTAAAAAGCTTGAAAACAGCAAATGGTATTTGCGCATCAT 1100
BSNT_05932___ 1101 GATCGCGTTGATTTCCTTCCCGTTTCTTGCGAACTCCGCGGGCTGGATTA 1150
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
BSU38760___cy 1101 GATCGCGTTGATTTCCTTCCCGTTTCTTGCAAACTCCGCGGGCTGGATTA 1150
BSNT_05932___ 1151 TGACAGAAATCGGACGTCAGCCTTGGACGGTTATGGGGTTAATGACAACC 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU38760___cy 1151 TGACAGAAATCGGACGTCAGCCTTGGACGGTTATGGGGTTAATGACAACC 1200
BSNT_05932___ 1201 GCTCAATCTGTGTCACCTAACGTAACAGCGGGCTCCTTGTTATTCTCAAT 1250
||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||
BSU38760___cy 1201 GCTCAATCTGTGTCGCCTAACGTAACAGCGGGTTCCTTGTTATTCTCAAT 1250
BSNT_05932___ 1251 CATCGCATTCGGTGTGATGTACATGATTCTTGGTGCACTGCTTGTCTTCT 1300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU38760___cy 1251 CATCGCATTCGGTGTGATGTACATGATTCTTGGTGCACTGCTTGTCTTCT 1300
BSNT_05932___ 1301 TGTTTATCCGTGAGATTAAAAAAGGTGCGGAGCATAGTGATCATCATGAT 1350
|||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.|||||||||||
BSU38760___cy 1301 TGTTTATCCGTGAGATTAAAAAAGGTGCGGAGCATGATAATCATCATGAT 1350
BSNT_05932___ 1351 GTTCCTGTATCAACAGATCCATTTAGTCAGGAGGTATACCATGGCATCTC 1400
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU38760___cy 1351 GTGCCTGTATCAACAGATCCATTTAGTCAGGAGGTATACCATGGCATCTC 1400
BSNT_05932___ 1401 TTCATGA 1407
|||||||
BSU38760___cy 1401 TTCATGA 1407
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.