Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_05656 and BSU37050
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_05656 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:26:42
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_05656___ywkA.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU37050___ywkA.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_05656___ywkA-BSU37050___ywkA.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_05656___ywkA-BSU37050___ywkA.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_05656___ywkA
# 2: BSU37050___ywkA
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1749
# Identity: 1687/1749 (96.5%)
# Similarity: 1687/1749 (96.5%)
# Gaps: 51/1749 ( 2.9%)
# Score: 8391.0
#
#
#=======================================
BSNT_05656___ 0 -------------------------------------------------- 0
BSU37050___yw 1 ATGGGTTATTACTTAACTTGGTTAACTATTTCAAGAAAGAAGGAGATTTG 50
BSNT_05656___ 1 -TTGAATAACATAAAAAAAACGAAAGAAGGCCACTTAGAAACAACTCTTA 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37050___yw 51 CTTGAATAACATAAAAAAAACGAAAGAAGGCCACTTAGAAACAACTCTTA 100
BSNT_05656___ 50 GAGGAAAAGAAGTTTTATCTATTCCTACTTTAAATAAAGGCGTTGCTTTT 99
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37050___yw 101 GAGGAAAAGAAGTTTTATCTATTCCTACTTTAAATAAAGGCGTTGCTTTT 150
BSNT_05656___ 100 TCAATAGAAGAAAGACAAGAACTCGGCTTAGAAGGGCTTCTGCCGCCAAC 149
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37050___yw 151 TCACTAGAAGAAAGACAAGAACTCGGCTTAGAAGGGCTTCTGCCGCCAAC 200
BSNT_05656___ 150 TGTACTTTCTCTTGATCAACAAGCACAACGCGCGTACGAGCAATTCCAAG 199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37050___yw 201 TGTACTTTCTCTTGATCAACAAGCACAACGCGCGTACGAGCAATTCCAAG 250
BSNT_05656___ 200 CGCAGCCTGACCGCCTTCGTCAAAATGTTTACTTAAGTGATCTTGCAAAC 249
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37050___yw 251 CGCAGCCTGACCGCCTTCGTCAAAATGTTTACTTAAGTGATCTTGCAAAC 300
BSNT_05656___ 250 CGTAACGAAGTTCTTTTCTATAAATTGCTGAAAAACCATCTTCGCGAAAT 299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37050___yw 301 CGTAACGAAGTTCTTTTCTATAAATTGCTGAAAAACCATCTTCGCGAAAT 350
BSNT_05656___ 300 GCTTCCTGTTGTGTACACGCCAACAGTTGGTGAAGCGATTCAGGAATACA 349
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37050___yw 351 GCTTCCTGTTGTGTACACGCCAACAGTTGGTGAAGCGATTCAGGAATACA 400
BSNT_05656___ 350 GCCATGAATATAGAAGACCTCAAGGAATCTACTTGTCAATCGACAACATT 399
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
BSU37050___yw 401 GCCATGAATATAGAAGACCTCAAGGAATCTACTTGTCAATCGATAACATT 450
BSNT_05656___ 400 GACGGTATTGAAAAAGCGTTTGAAAACCTTCACGCGACAGCAGGCGATAT 449
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
BSU37050___yw 451 GACGGTATTGAAAAAGCGTTTGAAAACCTTCATGCGACAGCAGGCGATAT 500
BSNT_05656___ 450 TGATCTTATCGTTGCTACTGACTCCGAAAGCATTCTCGGTATCGGTGACT 499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37050___yw 501 TGATCTTATCGTTGCTACTGACTCCGAAAGCATTCTCGGTATCGGTGACT 550
BSNT_05656___ 500 GGGGTGTAGGCGGTATTAATATCGCAATCGGTAAATTGGCTGTTTACACT 549
||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
BSU37050___yw 551 GGGGTGTAGGCGGTATTAATATTGCAATCGGTAAATTGGCTGTCTACACT 600
BSNT_05656___ 550 GCTGCAGCTGGTATTGACCCTAGCCGTGTTATCCCGGTTGTGCTTGATGT 599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37050___yw 601 GCTGCAGCTGGTATTGACCCTAGCCGTGTTATCCCGGTTGTGCTTGATGT 650
BSNT_05656___ 600 CGGTACGAACAACGAAAAACTTCTAAACGATCCTTTATATATTGGTAACA 649
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37050___yw 651 CGGTACGAACAACGAAAAACTTCTAAACGATCCTTTATATATTGGTAACA 700
BSNT_05656___ 650 AGCATGAACGTGTTCAAGGTGAACGCTACGAAGCTTTCATTGACGCTTAT 699
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37050___yw 701 AGCATGAACGTGTTCAAGGTGAACGCTACGAAGCTTTCATTGACGCTTAT 750
BSNT_05656___ 700 GTAAAAGCTGCATTGAAATTCTTCCCTAAAGCGCTTCTTCACTGGGAAGA 749
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37050___yw 751 GTAAAAGCTGCATTGAAATTCTTCCCTAAAGCGCTTCTTCACTGGGAAGA 800
BSNT_05656___ 750 CCTTGGCAACAAAAATGCACGCAACATCATGAAAAAATACAATCATGAAA 799
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37050___yw 801 CCTTGGCAACAAAAATGCACGCAACATCATGAAAAAATACAATCATGAAA 850
BSNT_05656___ 800 TCCTGACATTTAATGATGATATTCAAGGTACTGGCGCGATTACACTTGCT 849
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
BSU37050___yw 851 TCCTGACATTTAATGATGATATTCAAGGTACTGGCGCGATTACACTTGCA 900
BSNT_05656___ 850 GGTGTGCTTGCCGCTATGAAGAAAACAGGCGCTTCTATTAAAGATCAGCG 899
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
BSU37050___yw 901 GGTGTGCTTGCCGCTATGAAGAAAACCGGCGCTTCTATTAAAGATCAGCG 950
BSNT_05656___ 900 TGTTGTTATCTTCGGTGCCGGTTCTGCTGGTATCGGTATTGCTGACCAAA 949
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37050___yw 951 TGTTGTTATCTTCGGTGCTGGTTCTGCTGGTATCGGTATTGCTGACCAAA 1000
BSNT_05656___ 950 TCCGTGACACAATGGTGCTAGCCGGATTATCTGAAGAAGAAGCTAACAAA 999
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37050___yw 1001 TCCGTGACACAATGGTGCTAGCCGGATTATCTGAAGAAGAAGCTAACAAA 1050
BSNT_05656___ 1000 CGTTTCTACACACTTGATTACAGAGGCTTGCTGACTGAAGACATCGAAGG 1049
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37050___yw 1051 CGTTTCTACACACTTGATTACAGAGGCTTGCTGACTGAAGACATCGAAGG 1100
BSNT_05656___ 1050 CATCCTTGATTTCCAAAGACCTTACCTTCGCAATGCGGATGAAGTGAAAG 1099
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37050___yw 1101 CATCCTTGATTTCCAAAAACCTTACCTTCGCAATGCGGATGAAGTGAAAG 1150
BSNT_05656___ 1100 ACTGGAAGCGTGATGAAAAAGGTCAAATTCCATTCGATGAAGTTGTTCGT 1149
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37050___yw 1151 ACTGGAAGCGCGATGAAAAAGGTCAAATTCCATTCGATGAAGTTGTTCGT 1200
BSNT_05656___ 1150 CAAGCGAAACCAACAATCTTGATTGGTACTTCAGGGGTTTCAGGTGCATT 1199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37050___yw 1201 CAAGCGAAACCAACAATCTTGATTGGTACTTCAGGGGTTTCAGGTGCATT 1250
BSNT_05656___ 1200 CACAGAGGAAATTGTAAAAGAAATGGCATCTCACGTAGACCGTCCGGTTA 1249
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37050___yw 1251 CACAGAGGAAATTGTAAAAGAAATGGCATCTCACGTAGACCGTCCGGTTA 1300
BSNT_05656___ 1250 TCATGCCGATGTCTAACCCGACTCACCTTGCTGAAGCTGTTCCTGAAGAT 1299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37050___yw 1301 TCATGCCGATGTCTAACCCGACTCACCTTGCTGAAGCTGTTCCTGAAGAT 1350
BSNT_05656___ 1300 CTGTTCAAATGGACTGACGGAAAAGTGCTTATTGCAACAGGAAGCCCATT 1349
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37050___yw 1351 CTGTTCAAATGGACTGACGGAAAAGTGCTTATTGCAACAGGAAGCCCATT 1400
BSNT_05656___ 1350 TGACAATGTAGAATACAACGGTGTTTCTTATGAAATCGGACAATCTAACA 1399
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37050___yw 1401 TGACAATGTAGAATACAACGGTGTTTCTTATGAAATCGGACAATCTAACA 1450
BSNT_05656___ 1400 ACGCATTCGCGTTCCCTGGTCTTGGACTTGGTTCAATTGTAGCTGAAGCG 1449
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37050___yw 1451 ACGCATTCGCGTTCCCTGGTCTTGGACTTGGTTCAATTGTAGCTGAAGCG 1500
BSNT_05656___ 1450 CGTATCATTACACCTGCTATGTTTGCTGCAACTGCTGATGCGATTGCTGA 1499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37050___yw 1501 CGTATCATTACACCTGCTATGTTTGCTGCAACTGCTGATGCGATTGCTGA 1550
BSNT_05656___ 1500 AATGGTTGATTTTGAAACACCTGGAGCAGGATTGCTTCCAAGCATTGATA 1549
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37050___yw 1551 AATGGTTGATCTTGAAACACCTGGAGCAGGATTGCTTCCAAGCATTGATA 1600
BSNT_05656___ 1550 AGCTTCAAGAGGTTTCTATCCAAGTTGCGATTGCCGTTGCTGAAGCAGCA 1599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37050___yw 1601 AGCTTCAAGAGGTTTCTATCCAAGTTGCGATTGCCGTTGCTGAAGCAGCA 1650
BSNT_05656___ 1600 ATTAAAGACGGCGTGGCAAATCGTCAGCCTGAAGATGTGAAACAAGCGGT 1649
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37050___yw 1651 ATTAAAGACGGCGTGGCAAATCGTCAGCCTGAAGATGTGAAACAAGCGGT 1700
BSNT_05656___ 1650 ACTTGATGCAATGTGGACACCTGAATACAAAAAAGTCATCGCGAAATAA 1698
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU37050___yw 1701 ACTTGATGCAATGTGGACACCTGAATACAAAAAAGTCATCGCGAAATAA 1749
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.