Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_05370 and BSU35300
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_05370 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:26:11
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_05370___secA.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU35300___secA.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_05370___secA-BSU35300___secA.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_05370___secA-BSU35300___secA.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_05370___secA
# 2: BSU35300___secA
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 2526
# Identity: 2492/2526 (98.7%)
# Similarity: 2492/2526 (98.7%)
# Gaps: 0/2526 ( 0.0%)
# Score: 12324.0
#
#
#=======================================
BSNT_05370___ 1 ATGCTTGGAATTTTAAATAAAATGTTTGATCCAACAAAACGTACGCTGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 1 ATGCTTGGAATTTTAAATAAAATGTTTGATCCAACAAAACGTACGCTGAA 50
BSNT_05370___ 51 TAGATACGAAAAAATTGCTAACGATATTGATGCGATTCGCGGAGACTATG 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 51 TAGATACGAAAAAATTGCTAACGATATTGATGCGATTCGCGGAGACTATG 100
BSNT_05370___ 101 AAAATCTCTCTGACGACGCGTTGAAACATAAAACAATTGAATTTAAAGAG 150
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 101 AAAATCTCTCTGACGACGCATTGAAACATAAAACAATTGAATTTAAAGAG 150
BSNT_05370___ 151 CGTCTTGAAAAAGGGGCGACAACGGATGATCTTCTTGTTGAAGCTTTCGC 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 151 CGTCTTGAAAAAGGGGCGACAACGGATGATCTTCTTGTTGAAGCTTTCGC 200
BSNT_05370___ 201 TGTTGTTCGAGAAGCTTCACGCCGCGTAACAGGTATGTTTCCGTTTAAAG 250
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
BSU35300___se 201 TGTTGTTCGAGAAGCTTCACGCCGCGTAACAGGCATGTTTCCGTTTAAAG 250
BSNT_05370___ 251 TCCAGCTCATGGGGGGCGTAGCGCTTCATGACGGAAATATCGCGGAAATG 300
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||
BSU35300___se 251 TCCAGCTCATGGGGGGCGTGGCGCTTCATGACGGAAATATAGCGGAAATG 300
BSNT_05370___ 301 AAAACAGGGGAAGGGAAAACATTAACGTCTACTCTGCCTGTTTATTTAAA 350
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
BSU35300___se 301 AAAACAGGGGAAGGGAAAACATTAACGTCTACCCTGCCTGTTTATTTAAA 350
BSNT_05370___ 351 TGCGTTAACAGGTAAAGGCGTACACGTCGTGACTGTCAACGAATACTTGG 400
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 351 TGCGTTAACCGGTAAAGGCGTACACGTCGTGACTGTCAACGAATACTTGG 400
BSNT_05370___ 401 CAAGCCGTGACGCTGAACAAATGGGGAAAATTTTCGAGTTTCTCGGTCTG 450
||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||
BSU35300___se 401 CAAGCCGTGACGCTGAGCAAATGGGGAAAATTTTCGAGTTTCTCGGTTTG 450
BSNT_05370___ 451 ACTGTCGGCTTGAATTTAAACTCAATGTCAAAAGACGAAAAACGGGAAGC 500
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 451 ACTGTCGGTTTGAATTTAAACTCAATGTCAAAAGACGAAAAACGGGAAGC 500
BSNT_05370___ 501 TTATGCAGCTGACATTACTTACTCTACAAACAATGAGCTTGGCTTCGACT 550
||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||
BSU35300___se 501 TTATGCCGCTGATATTACTTACTCCACAAACAACGAGCTTGGCTTCGACT 550
BSNT_05370___ 551 ATTTGCGTGACAATATGGTTCTTTATAAAGAGCAGATGGTTCAGCGCCCG 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 551 ATTTGCGTGACAATATGGTTCTTTATAAAGAGCAGATGGTTCAGCGCCCG 600
BSNT_05370___ 601 CTTCATTTTGCGGTAATAGATGAAGTTGACTCTATTTTAATTGATGAAGC 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 601 CTTCATTTTGCGGTAATAGATGAAGTTGACTCTATTTTAATTGATGAAGC 650
BSNT_05370___ 651 GAGAACACCTCTTATCATTTCTGGACAAGCTGCCAAATCCACTAAGCTGT 700
.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
BSU35300___se 651 AAGAACACCGCTTATCATTTCTGGACAAGCTGCAAAATCCACTAAGCTGT 700
BSNT_05370___ 701 ACGTACAGGCAAATGCTTTTGTCCGTACGTTAAAAGCGGAGAAGGATTAC 750
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 701 ACGTACAGGCAAATGCTTTTGTCCGCACGTTAAAAGCGGAGAAGGATTAC 750
BSNT_05370___ 751 ACGTACGATATCAAAACAAAAGCTGTACAGCTTACTGAAGAAGGAATGAC 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 751 ACGTACGATATCAAAACAAAAGCTGTACAGCTTACTGAAGAAGGAATGAC 800
BSNT_05370___ 801 GAAGGCGGAAAAAGCGTTCGGCATCGATAACCTCTTTGATGTGAAGCATG 850
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 801 GAAGGCGGAAAAAGCATTCGGCATCGATAACCTCTTTGATGTGAAGCATG 850
BSNT_05370___ 851 TCGCGCTCAACCACCATATCAACCAGGCCTTAAAAGCTCACGTTGCGATG 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 851 TCGCGCTCAACCACCATATCAACCAGGCCTTAAAAGCTCACGTTGCGATG 900
BSNT_05370___ 901 CAAAAGGACGTTGACTATGTAGTGGAAGACGGACAGGTTGTTATTGTTGA 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 901 CAAAAGGACGTTGACTATGTAGTGGAAGACGGACAGGTTGTTATTGTTGA 950
BSNT_05370___ 951 TTCCTTCACGGGACGTCTGATGAAAGGCCGCCGCTACAGTGAGGGGCTTC 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 951 TTCCTTCACGGGACGTCTGATGAAAGGCCGCCGCTACAGTGAGGGGCTTC 1000
BSNT_05370___ 1001 ACCAAGCGATTGAAGCGAAGGAAGGGCTTGAGATTCAAAACGAAAGCATG 1050
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 1001 ACCAAGCGATTGAAGCAAAGGAAGGGCTTGAGATTCAAAACGAAAGCATG 1050
BSNT_05370___ 1051 ACCTTGGCGACGATTACGTTCCAAAACTACTTCCGAATGTACCAAAAACT 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
BSU35300___se 1051 ACCTTGGCGACGATTACGTTCCAAAACTACTTCCGAATGTACGAAAAACT 1100
BSNT_05370___ 1101 TGCCGGTATGACGGGTACAGCTAAGACAGAGGAAGAAGAATTCCGCAACA 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 1101 TGCCGGTATGACGGGTACAGCTAAGACAGAGGAAGAAGAATTCCGCAACA 1150
BSNT_05370___ 1151 TCTACAACATGCAGGTTGTCACGATCCCTACCAACAGGCCTGTTGTCCGT 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 1151 TCTACAACATGCAGGTTGTCACGATCCCTACCAACAGGCCTGTTGTCCGT 1200
BSNT_05370___ 1201 GATGACCGTCCTGATTTAATTTACCGCACGATGGAAGGAAAGTTTAAGGC 1250
||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 1201 GATGACCGCCCGGATTTAATTTACCGCACGATGGAAGGAAAGTTTAAGGC 1250
BSNT_05370___ 1251 AGTTGCGGAGGATGTCGCACAGCGTTACATGACGGGACAGCCTGTTCTAG 1300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 1251 AGTTGCGGAGGATGTCGCACAGCGTTACATGACGGGACAGCCTGTTCTAG 1300
BSNT_05370___ 1301 TCGGTACGGTTGCCGTTGAAACATCTGAATTGATTTCTAAGCTGCTTAAA 1350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 1301 TCGGTACGGTTGCCGTTGAAACATCTGAATTGATTTCTAAGCTGCTTAAA 1350
BSNT_05370___ 1351 AACAAAGGAATTCCGCATCAAGTGTTAAATGCCAAAAACCATGAACGTGA 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 1351 AACAAAGGAATTCCGCATCAAGTGTTAAATGCCAAAAACCATGAACGTGA 1400
BSNT_05370___ 1401 AGCGCAGATCATTGAAGAGGCCGGCCAAAAAGGCGCAGTTACGATTGCGA 1450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 1401 AGCGCAGATCATTGAAGAGGCCGGCCAAAAAGGCGCAGTTACGATTGCGA 1450
BSNT_05370___ 1451 CTAACATGGCGGGGCGCGGAACGGACATTAAGCTTGGCGAAGGTGTAAAA 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 1451 CTAACATGGCGGGGCGCGGAACGGACATTAAGCTTGGCGAAGGTGTAAAA 1500
BSNT_05370___ 1501 GAGCTTGGCGGACTCGCTGTTGTCGGAACAGAACGACATGAATCACGCCG 1550
|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 1501 GAGCTTGGCGGGCTCGCTGTAGTCGGAACAGAACGACATGAATCACGCCG 1550
BSNT_05370___ 1551 GATTGACAATCAGCTTCGAGGTCGTTCCGGACGTCAGGGAGACCCGGGGA 1600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 1551 GATTGACAATCAGCTTCGAGGTCGTTCCGGACGTCAGGGAGACCCGGGGA 1600
BSNT_05370___ 1601 TTACTCAATTTTATCTTTCTATGGAAGATGAATTGATGCGCAGATTCGGA 1650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 1601 TTACTCAATTTTATCTTTCTATGGAAGATGAATTGATGCGCAGATTCGGA 1650
BSNT_05370___ 1651 GCTGAGCGGACAATGGCGATGCTGGACCGCTTCGGCATGGACGACTCTAC 1700
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 1651 GCTGAGCGGACAATGGCGATGCTTGACCGCTTCGGCATGGACGACTCTAC 1700
BSNT_05370___ 1701 TCCAATCCAAAGCAAAATGGTATCTCGCGCGGTTGAATCGTCTCAAAAAC 1750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 1701 TCCAATCCAAAGCAAAATGGTATCTCGCGCGGTTGAATCGTCTCAAAAAC 1750
BSNT_05370___ 1751 GAGTCGAAGGCAATAACTTCGATTCTCGTAAACAGCTTCTGCAATATGAT 1800
|.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 1751 GCGTCGAAGGCAATAACTTCGATTCGCGTAAACAGCTTCTGCAATATGAT 1800
BSNT_05370___ 1801 GATGTTCTCCGCCAGCAGCGTGAGGTCATTTATAAGCAGCGCTTTGAAGT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 1801 GATGTTCTCCGCCAGCAGCGTGAGGTCATTTATAAGCAGCGCTTTGAAGT 1850
BSNT_05370___ 1851 CATTGACTCTGAAAACCTGCGTGAAATCGTTGAAAATATGATCAAGTCTT 1900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 1851 CATTGACTCTGAAAACCTGCGTGAAATCGTTGAAAATATGATCAAGTCTT 1900
BSNT_05370___ 1901 CTCTCGAACGCGCAATTGCAGCCTATACGCCAAGAGAAGAGCTTCCTGAG 1950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 1901 CTCTCGAACGCGCAATTGCAGCCTATACGCCAAGAGAAGAGCTTCCTGAG 1950
BSNT_05370___ 1951 GAGTGGAAGCTTGACGGTCTAGTTGATCTTATCAACACAACTTATCTTGA 2000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 1951 GAGTGGAAGCTTGACGGTCTAGTTGATCTTATCAACACAACTTATCTTGA 2000
BSNT_05370___ 2001 TGAAGGTGCGCTTGAGAAGAGCGATATCTTCGGGAAAGAACCGGATGAAA 2050
|||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
BSU35300___se 2001 TGAAGGTGCACTTGAGAAGAGCGATATCTTCGGCAAAGAACCGGATGAAA 2050
BSNT_05370___ 2051 TGCTTGAGCTCATTATGGATCGCATCATCACAAAATATAATGAGAAGGAA 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 2051 TGCTTGAGCTCATTATGGATCGCATCATCACAAAATATAATGAGAAGGAA 2100
BSNT_05370___ 2101 GAGCAATTCGGCAAAGAGCAAATGCGCGAATTCGAAAAAGTTATCGTTCT 2150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 2101 GAGCAATTCGGCAAAGAGCAAATGCGCGAATTCGAAAAAGTTATCGTTCT 2150
BSNT_05370___ 2151 TCGTGCCGTTGATTCTAAATGGATGGATCATATTGATGCGATGGATCAGC 2200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 2151 TCGTGCCGTTGATTCTAAATGGATGGATCATATTGATGCGATGGATCAGC 2200
BSNT_05370___ 2201 TTCGCCAAGGGATTCACCTTCGTGCTTACGCGCAGACGAACCCTCTTCGT 2250
|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
BSU35300___se 2201 TCCGCCAAGGGATTCACCTTCGTGCTTACGCGCAGACGAACCCGCTTCGT 2250
BSNT_05370___ 2251 GAGTATCAAATGGAAGGTTTTGCGATGTTTGAGCATATGATTGAATCAAT 2300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 2251 GAGTATCAAATGGAAGGTTTTGCGATGTTTGAGCATATGATTGAATCAAT 2300
BSNT_05370___ 2301 TGAGGACGAGGTCGCAAAATTTGTGATGAAAGCTGAGATTGAAAACAATC 2350
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 2301 TGAGGACGAAGTCGCAAAATTTGTGATGAAAGCTGAGATTGAAAACAATC 2350
BSNT_05370___ 2351 TGGAGCGTGAAGAGGTTGTACAAGGCCAAACAACAGCTCATCAGCCGCAA 2400
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 2351 TGGAGCGTGAAGAGGTTGTACAAGGTCAAACAACAGCTCATCAGCCGCAA 2400
BSNT_05370___ 2401 GAAGGCGACGATAACAAAAAAGCAAAGAAAGCACCGGTTCGCAAAGTGGT 2450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 2401 GAAGGCGACGATAACAAAAAAGCAAAGAAAGCACCGGTTCGCAAAGTGGT 2450
BSNT_05370___ 2451 TGATATCGGCCGAAATGCCCCATGCCACTGCGGAAGCGGGAAAAAATATA 2500
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 2451 TGATATCGGACGAAATGCCCCATGCCACTGCGGAAGCGGGAAAAAATATA 2500
BSNT_05370___ 2501 AAAATTGCTGCGGCCGTACTGAATAG 2526
||||||||||||||||||||||||||
BSU35300___se 2501 AAAATTGCTGCGGCCGTACTGAATAG 2526
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.