Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_05348 and BSU35160
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_05348 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:26:07
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_05348___uvrA.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU35160___uvrA.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_05348___uvrA-BSU35160___uvrA.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_05348___uvrA-BSU35160___uvrA.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_05348___uvrA
# 2: BSU35160___uvrA
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 2874
# Identity: 2841/2874 (98.9%)
# Similarity: 2841/2874 (98.9%)
# Gaps: 0/2874 ( 0.0%)
# Score: 14073.0
#
#
#=======================================
BSNT_05348___ 1 ATGGCTATGGATCGGATAGAGGTGAAGGGAGCCAGGGCGCATAACCTGAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 1 ATGGCTATGGATCGGATAGAGGTGAAGGGAGCCAGGGCGCATAACCTGAA 50
BSNT_05348___ 51 AAATATAGATGTGACGATTCCGAGAGATCAGCTTGTCGTTGTCACGGGTT 100
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 51 AAATATAGATGTAACGATTCCGAGAGATCAGCTTGTCGTTGTCACGGGTT 100
BSNT_05348___ 101 TGTCCGGATCAGGTAAATCCTCCCTTGCCTTTGACACGATATATGCTGAA 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 101 TGTCCGGATCAGGTAAATCCTCCCTTGCCTTTGACACGATATATGCTGAA 150
BSNT_05348___ 151 GGACAGAGACGGTATGTCGAGTCGCTGTCTGCCTATGCCCGCCAGTTTTT 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 151 GGACAGAGACGGTATGTCGAGTCGCTGTCTGCCTATGCCCGCCAGTTTTT 200
BSNT_05348___ 201 AGGGCAAATGGATAAGCCGGATGTGGATGCAATTGAGGGGCTCTCTCCCG 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 201 AGGGCAAATGGATAAGCCGGATGTGGATGCAATTGAGGGGCTCTCTCCCG 250
BSNT_05348___ 251 CCATCAGCATTGATCAGAAAACAACGAGCCGCAATCCGAGGTCTACTGTC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 251 CCATCAGCATTGATCAGAAAACAACGAGCCGCAATCCGAGGTCTACTGTC 300
BSNT_05348___ 301 GGTACGGTAACTGAGATTTATGATTATCTGCGTCTTTTATATGCGAGAGT 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 301 GGTACGGTAACTGAGATTTATGATTATCTGCGTCTTTTATATGCGAGAGT 350
BSNT_05348___ 351 AGGGAAGCCTCATTGTCCGGAACACGGAATTGAGATTACATCCCAGACCA 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 351 AGGGAAGCCTCATTGTCCGGAACACGGAATTGAGATTACATCCCAGACCA 400
BSNT_05348___ 401 TCGAGCAAATGGTGGACAGAATTCTGGAATACCCGGAACGGACGAAGCTT 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 401 TCGAGCAAATGGTGGACAGAATTCTGGAATACCCGGAACGGACGAAGCTT 450
BSNT_05348___ 451 CAGGTGCTGGCGCCGATTGTATCGGGCCGAAAAGGCGCTCATGTCAAAGT 500
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 451 CAGGTGCTGGCGCCGATTGTCTCGGGCCGAAAAGGCGCTCATGTCAAAGT 500
BSNT_05348___ 501 GCTTGAACAGATTAGGAAACAAGGCTATGTCAGAGTCAGAATTGACGGCG 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 501 GCTTGAACAGATTAGGAAACAAGGCTATGTCAGAGTCAGAATTGACGGCG 550
BSNT_05348___ 551 AGATGGCTGAGCTTTCCGACGATATCGAATTAGAAAAGAACAAGAAGCAT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 551 AGATGGCTGAGCTTTCCGACGATATCGAATTAGAAAAGAACAAGAAGCAT 600
BSNT_05348___ 601 TCCATTGAGGTAGTCATTGACCGGATTGTCGTGAAAGAAGGCGTGGCAGC 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 601 TCCATTGAGGTAGTCATTGACCGGATTGTCGTGAAAGAAGGCGTGGCAGC 650
BSNT_05348___ 651 CCGGCTGTCAGATTCATTGGAAACGGCGCTTCGTTTAAGTGAAGGACGGG 700
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
BSU35160___uv 651 CCGGCTGTCAGATTCATTGGAAACGGCGCTTCGTTTAGGTGAAGGACGGG 700
BSNT_05348___ 701 TTATGATCGATGTCATCGGTGAGGAAGAGCTGATGTTCAGCGAGCATCAT 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 701 TTATGATCGATGTCATCGGTGAGGAAGAGCTGATGTTCAGCGAGCATCAT 750
BSNT_05348___ 751 GCCTGTCCGCACTGCGGATTTTCAATTGGTGAACTTGAGCCGCGTCTGTT 800
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
BSU35160___uv 751 GCCTGTCCGCACTGCGGATTTTCAATTGGTGAGCTTGAGCCGCGTCTGTT 800
BSNT_05348___ 801 TTCGTTTAACAGTCCGTTCGGGGCGTGTCCGACGTGTGACGGTCTCGGAA 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 801 TTCGTTTAACAGTCCGTTCGGGGCGTGTCCGACGTGTGACGGTCTCGGAA 850
BSNT_05348___ 851 TGAAGCTTGAAGTGGATGCCGATCTTGTCATCCCCAATCAAGATTTGTCA 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 851 TGAAGCTTGAAGTGGATGCCGATCTTGTCATCCCCAATCAAGATTTGTCA 900
BSNT_05348___ 901 TTGAAGGAGAATGCGGTCGCCCCTTGGACACCGATCAGCTCACAATATTA 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 901 TTGAAGGAGAATGCGGTCGCCCCTTGGACACCGATCAGCTCACAATATTA 950
BSNT_05348___ 951 TCCTCAGCTGCTTGAGGCAGCCTGCACCCACTACGGGATTGATATGGATG 1000
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 951 TCCTCAGCTGCTTGAGGCAGTCTGCACCCACTACGGGATTGATATGGATG 1000
BSNT_05348___ 1001 TGCCGGTCAAAGATTTGCCGAAGCATCAACTGGATAAAGTGCTGTACGGC 1050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 1001 TGCCGGTCAAAGATTTGCCGAAGCATCAACTGGATAAAGTGCTGTACGGC 1050
BSNT_05348___ 1051 AGCGGAGATGACCTGATTTATTTCAGATATGAAAATGATTTTGGACAAAT 1100
|||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 1051 AGCGGGGATGACCTGATTTATTTCCGATATGAAAATGATTTTGGACAAAT 1100
BSNT_05348___ 1101 CCGTGAAGGTGAAATTCAATTTGAAGGCGTATTGCGCAACATTGAAAGAC 1150
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 1101 CCGCGAAGGTGAAATTCAATTTGAAGGCGTATTGCGCAACATTGAAAGAC 1150
BSNT_05348___ 1151 GCTATAAGGAGACAGGCTCTGATTTCATCCGTGAGCAGATGGAGCAGTAT 1200
|||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||
BSU35160___uv 1151 GCTATAAGGAGACAGGCTCCGATTTCATACGTGAGCAAATGGAGCAGTAT 1200
BSNT_05348___ 1201 ATGTCTCAGAAGTCTTGTCCGACGTGCAAAGGCTATCGGTTAAAGAAAGA 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 1201 ATGTCTCAGAAGTCTTGTCCGACGTGCAAAGGCTATCGGTTAAAGAAAGA 1250
BSNT_05348___ 1251 GGCGCTTGCCGTACTGATTGACGGCCGCCACATCGGAAAAATTACCGAGC 1300
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
BSU35160___uv 1251 GGCGCTTGCCGTACTGATTGACGGCCGCCACATTGGGAAAATTACCGAGC 1300
BSNT_05348___ 1301 TGTCTGTCGCCGACGCACTTGCCTTCTTTAAAAACCTTACCCTTTCTGAG 1350
||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||
BSU35160___uv 1301 TGTCTGTCGCCGACGCACTTGCCTTCTTTAAAGATCTTACCCTTTCTGAG 1350
BSNT_05348___ 1351 AAGGATATGCAGATCGCCAATTTGATTTTGCGCGAAATTGTGGAGCGCTT 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 1351 AAGGATATGCAGATCGCCAATTTGATTTTGCGCGAAATTGTGGAGCGCTT 1400
BSNT_05348___ 1401 AAGCTTTCTGGACAAAGTCGGCCTCGATTACCTGACATTGAGCAGGGCAG 1450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 1401 AAGCTTTCTGGACAAAGTCGGCCTCGATTACCTGACATTGAGCAGGGCAG 1450
BSNT_05348___ 1451 CGGGTACATTGTCCGGGGGAGAGGCGCAGCGCATCAGGCTGGCGACTCAA 1500
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 1451 CGGGTACATTGTCCGGAGGAGAGGCGCAGCGCATCAGGCTGGCGACTCAA 1500
BSNT_05348___ 1501 ATTGGCTCGCGCTTATCCGGTGTGCTTTATATTTTAGATGAGCCGTCTAT 1550
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 1501 ATTGGCTCGCGTTTATCCGGTGTGCTTTATATTTTAGATGAGCCGTCTAT 1550
BSNT_05348___ 1551 CGGTCTGCATCAGCGTGATAACGACCGCTTGATCAGCGCTCTGAAAAATA 1600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 1551 CGGTCTGCATCAGCGTGATAACGACCGCTTGATCAGCGCTCTGAAAAATA 1600
BSNT_05348___ 1601 TGAGAGACCTCGGGAACACGCTGATTGTTGTCGAACATGATGAGGACACG 1650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 1601 TGAGAGACCTCGGGAACACGCTGATTGTTGTCGAACATGATGAGGACACG 1650
BSNT_05348___ 1651 ATGATGGCAGCAGATTATTTAATAGATATTGGACCGGGAGCCGGTATTCA 1700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
BSU35160___uv 1651 ATGATGGCAGCAGATTATTTAATAGATATTGGACCGGGAGCCGGCATTCA 1700
BSNT_05348___ 1701 CGGCGGACAGGTGATATCTGCGGGTACGCCGGAAGAAGTGATGGAAGATC 1750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 1701 CGGCGGACAGGTGATATCTGCGGGTACGCCGGAAGAAGTGATGGAAGATC 1750
BSNT_05348___ 1751 CAAACTCATTAACGGGCAGCTATTTATCAGGGGAAAAGTTTATCCCATTG 1800
||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
BSU35160___uv 1751 CAAATTCATTAACGGGCAGCTATTTATCAGGGAAAAAGTTTATCCCATTG 1800
BSNT_05348___ 1801 CCTCCTGAAAGAAGAAAGCCGGACGGACGTTACATTGAAATTAAAGGTGC 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 1801 CCTCCTGAAAGAAGAAAGCCGGACGGACGTTACATTGAAATTAAAGGTGC 1850
BSNT_05348___ 1851 TTCAGAAAACAACTTGAAAAAAGTGAATGCCAAGTTCCCGCTTGGGACGT 1900
.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 1851 ATCAGAAAACAACCTGAAAAAAGTGAATGCCAAGTTCCCGCTTGGGACGT 1900
BSNT_05348___ 1901 TTACAGCAGTTACAGGTGTTTCCGGTTCAGGGAAGAGTACACTCGTTAAT 1950
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
BSU35160___uv 1901 TTACAGCAGTTACAGGTGTTTCCGGTTCAGGAAAGAGTACACTCGTTAAT 1950
BSNT_05348___ 1951 GAAATTTTGCATAAGGCGCTGGCGCAAAAGCTTCATAAAGCGAAAGCGAA 2000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 1951 GAAATTTTGCATAAGGCGCTGGCGCAAAAGCTTCATAAAGCGAAAGCGAA 2000
BSNT_05348___ 2001 GCCCGGCAGCCATAAAGAGATTAAAGGTTTGGATCATTTAGACAAAGTCA 2050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
BSU35160___uv 2001 GCCCGGCAGCCATAAAGAGATTAAAGGTTTGGATCATTTAGATAAAGTCA 2050
BSNT_05348___ 2051 TTGACATTGACCAGGCGCCAATTGGAAGAACGCCGAGATCCAACCCTGCG 2100
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 2051 TTGACATTGACCAGGCGCCAATCGGAAGAACGCCGAGATCCAACCCTGCG 2100
BSNT_05348___ 2101 ACATACACCGGTGTATTTGATGACATTCGTGATGTATTCGCGCAGACAAA 2150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 2101 ACATACACCGGTGTATTTGATGACATTCGTGATGTATTCGCGCAGACAAA 2150
BSNT_05348___ 2151 TGAAGCGAAGGTCCGCGGCTATAAAAAAGGCCGTTTCAGCTTCAACGTGA 2200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 2151 TGAAGCGAAGGTCCGCGGCTATAAAAAAGGCCGTTTCAGCTTCAACGTGA 2200
BSNT_05348___ 2201 AGGGCGGACGATGTGAAGCCTGCCGCGGAGACGGGATTATTAAAATTGAA 2250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 2201 AGGGCGGACGATGTGAAGCCTGCCGCGGAGACGGGATTATTAAAATTGAA 2250
BSNT_05348___ 2251 ATGCACTTCCTTCCTGACGTATACGTTCCATGCGAGGTGTGTCACGGCAA 2300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 2251 ATGCACTTCCTTCCTGACGTATACGTTCCATGCGAGGTGTGTCACGGCAA 2300
BSNT_05348___ 2301 ACGCTATAACCGTGAAACGCTTGAAGTGACGTACAAAGGAAAAAGCATCT 2350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 2301 ACGCTATAACCGTGAAACGCTTGAAGTGACGTACAAAGGAAAAAGCATCT 2350
BSNT_05348___ 2351 CTGATGTGCTTGATATGACGGTTGAAGATGCTCTTCCTTTCTTTGAAAAT 2400
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
BSU35160___uv 2351 CTGATGTGCTTGATATGACGGTTGAAGATGCTCTTTCTTTCTTTGAAAAT 2400
BSNT_05348___ 2401 ATCCCGAAAATCAAACGCAAGCTCCAAACCCTTTATGATGTTGGTTTAGG 2450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 2401 ATCCCGAAAATCAAACGCAAGCTCCAAACCCTTTATGATGTTGGTTTAGG 2450
BSNT_05348___ 2451 TTATATTACGCTCGGCCAGCCGGCGACGACCTTGTCAGGCGGAGAAGCGC 2500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 2451 TTATATTACGCTCGGCCAGCCGGCGACGACCTTGTCAGGCGGAGAAGCGC 2500
BSNT_05348___ 2501 AGCGCGTGAAGCTCGCGTCAGAGCTGCACAAACGCTCGACCGGACGCACG 2550
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
BSU35160___uv 2501 AGCGCGTGAAGCTCGCGTCAGAGCTGCACAAACGCTCAACCGGACGTACG 2550
BSNT_05348___ 2551 CTCTACATTTTAGATGAGCCGACGACAGGTTTGCATGTCGACGATATCGC 2600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 2551 CTCTACATTTTAGATGAGCCGACGACAGGTTTGCATGTCGACGATATCGC 2600
BSNT_05348___ 2601 CAGGCTTCTTGTCGTGCTGCAACGGTTGGTAGACAACGGAGACACTGTAC 2650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 2601 CAGGCTTCTTGTCGTGCTGCAACGGTTGGTAGACAACGGAGACACTGTAC 2650
BSNT_05348___ 2651 TGGTTATTGAGCACAACCTTGATATCATTAAGACGGCCGATTACATTGTG 2700
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 2651 TGGTTATTGAGCACAATCTTGATATCATTAAGACGGCCGATTACATTGTG 2700
BSNT_05348___ 2701 GATTTGGGCCCGGAAGGCGGAGCCGGGGGCGGAACCATTGTCGCGTCTGG 2750
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 2701 GATTTGGGCCCGGAAGGCGGAGCCGGAGGCGGAACCATTGTCGCGTCTGG 2750
BSNT_05348___ 2751 AACGCCTGAGGAAATCACTGAAGTTGAAGAATCGTATACAGGCCGTTATT 2800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 2751 AACGCCTGAGGAAATCACTGAAGTTGAAGAATCGTATACAGGCCGTTATT 2800
BSNT_05348___ 2801 TGAAGCCTGTTATCGAACGTGACAAAGCACGCATGAAATCGCTCTTGAAA 2850
|.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 2801 TAAAGCCTGTTATCGAACGTGACAAAACACGCATGAAATCGCTCTTGAAA 2850
BSNT_05348___ 2851 GCGAAAGAAACAGCTACATCTTAA 2874
||.|||||||||||||||||||||
BSU35160___uv 2851 GCAAAAGAAACAGCTACATCTTAA 2874
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.