Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_05205 and BSU34460
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_05205 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:25:53
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_05205___yveB.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU34460___levB.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_05205___yveB-BSU34460___levB.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_05205___yveB-BSU34460___levB.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_05205___yveB
# 2: BSU34460___levB
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1551
# Identity: 1535/1551 (99.0%)
# Similarity: 1535/1551 (99.0%)
# Gaps: 0/1551 ( 0.0%)
# Score: 7611.0
#
#
#=======================================
BSNT_05205___ 1 ATGAACTATATAAAAGCAGGCAAATGGCTAACCGTATTCCTAACCTTTTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU34460___le 1 ATGAACTATATAAAAGCAGGCAAATGGCTAACCGTATTCCTAACCTTTTT 50
BSNT_05205___ 51 AGAAATATTGCTGTTTATCGACTTATTTCCAAAAGAAGAACATGACCAAA 100
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU34460___le 51 AGGAATATTGCTGTTTATCGACTTATTTCCAAAAGAAGAACATGACCAAA 100
BSNT_05205___ 101 AAATAAAATCAAAACAGAAGCCGGACTACCGGGCGGCATATCATTTTACG 150
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU34460___le 101 AAACAAAATCAAAACAGAAGCCGGACTACCGGGCGGCATATCATTTTACG 150
BSNT_05205___ 151 ACGCCGGATAAATGGAAAAATGACCCTCAAAAACCGATCTATTTTGATGG 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU34460___le 151 ACGCCGGATAAATGGAAAAATGACCCTCAAAAACCGATCTATTTTGATGG 200
BSNT_05205___ 201 CAAGTATCATTATTTCTATCTATATAACCGGGATTACCCAAAAGGCAACG 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU34460___le 201 CAAGTATCATTATTTCTATCTATATAACCGGGATTACCCAAAAGGCAACG 250
BSNT_05205___ 251 GCACAGAATGGCGCCATGCCGTCTCAGAGGATTTGGTGCACTGGACCGAT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU34460___le 251 GCACAGAATGGCGCCATGCCGTCTCAGAGGATTTGGTGCACTGGACCGAT 300
BSNT_05205___ 301 GAAGGCGTGGCGATTCCGAAATATACAAATCCGGACGGTGACATTTGGAC 350
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
BSU34460___le 301 GAAGGCGTGGCGATTCCGAAATATACAAACCCGGACGGTGATATTTGGAC 350
BSNT_05205___ 351 CGGTTCCGTCGTAGTTGATAAAGAGAACACAGCCGGCTTCGGGAAAAATG 400
||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU34460___le 351 CGGTTCCGTCGTGGTGGATAAAGAGAACACAGCCGGCTTCGGGAAAAATG 400
BSNT_05205___ 401 CGCTTGTCGCGATTGTGACACAGCCCTCAGCCAAAGACAAAAAACAGGAG 450
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
BSU34460___le 401 CGCTTGTCGCGATTGTGACACAGCCCTCAGCCAAAGACAAAAAACAGGAA 450
BSNT_05205___ 451 CAATATTTGTGGTACAGCACAGATAAAGGAAAATCATTCAAATTCTACAG 500
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
BSU34460___le 451 CAATATTTGTGGTACAGCACAGATAAGGGAAAATCATTCAAATTCTACAG 500
BSNT_05205___ 501 TGGCAACCCCGTTATGCCTAATCCGGGCACAGACGATTTCAGAGATCCGA 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU34460___le 501 TGGCAACCCCGTTATGCCTAATCCGGGCACAGACGATTTCAGAGATCCGA 550
BSNT_05205___ 551 AAGTCATATGGGATGACCAGGATAACAAATGGGTCATGGTCATGGCTGAA 600
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
BSU34460___le 551 AAGTCATATGGGATGACCAAGATAACAAATGGGTCATGGTCATGGCTGAA 600
BSNT_05205___ 601 GGATCAAAAATCGGCTTTTATGAATCCGATAATCTTAAGGACTGGCATTA 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU34460___le 601 GGATCAAAAATCGGCTTTTATGAATCCGATAATCTTAAGGACTGGCATTA 650
BSNT_05205___ 651 CACAAGCGGATTCTTCCCAGAACAGGCGGGAATGGTGGAATGTCCCGACC 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU34460___le 651 CACAAGCGGATTCTTCCCAGAACAGGCGGGAATGGTGGAATGTCCCGACC 700
BSNT_05205___ 701 TCTACATGATGCGGGCAAGCGACGGAACGAATAAGTGGGTTCTCGGTGCC 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU34460___le 701 TCTACATGATGCGGGCAAGCGACGGAACGAATAAGTGGGTTCTCGGTGCC 750
BSNT_05205___ 751 AGCGCGAATGGCAAACCGTGGGGCAAACCAAATACGTACGCCTACTGGAC 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU34460___le 751 AGCGCGAATGGCAAACCGTGGGGCAAACCAAATACGTACGCCTACTGGAC 800
BSNT_05205___ 801 CGGAAGCTTCGACGGAAAAGAATTCAAAGCGGATCAGACTGAAGCCCAAT 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU34460___le 801 CGGAAGCTTCGACGGAAAAGAATTCAAAGCGGATCAGACTGAAGCCCAAT 850
BSNT_05205___ 851 GGCTTGACTATGGCTTCGACTGGTATGGCGGTGTGACGTTCGAAGACAGC 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU34460___le 851 GGCTTGACTATGGCTTCGACTGGTATGGCGGTGTGACGTTCGAAGACAGC 900
BSNT_05205___ 901 AAAAGCACAGATCCATTAGAAAAGCGGTATGCGCTTGCCTGGATGAACAA 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU34460___le 901 AAAAGCACAGATCCATTAGAAAAGCGGTATGCGCTTGCCTGGATGAACAA 950
BSNT_05205___ 951 TTGGGATTATGCCAACAACACCCCGACAATGAAGAACGGCTTTAACGGCA 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU34460___le 951 TTGGGATTATGCCAACAACACCCCGACAATGAAGAACGGCTTTAACGGCA 1000
BSNT_05205___ 1001 CAGATTCTGTCATACGCAAACTCCGGCTGAAGGAGCAGGATGGAACATAC 1050
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU34460___le 1001 CAGATTCTGTCATACGCGAACTCCGGCTGAAGGAGCAGGATGGAACATAC 1050
BSNT_05205___ 1051 AGCCTCGTCTCACAGCCGATTGAAGCTTTGGAGCAGCTGACTGTTTCAAC 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU34460___le 1051 AGCCTCGTCTCACAGCCGATTGAAGCTTTGGAGCAGCTGACTGTTTCAAC 1100
BSNT_05205___ 1101 TGACGAAATAGAGGATCAGGATGTGAACGGATCAAAAACATTGTCGATAA 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU34460___le 1101 TGACGAAATAGAGGATCAGGATGTGAACGGATCAAAAACATTGTCGATAA 1150
BSNT_05205___ 1151 CAGGTGATACGTACCAGCTTGATACGGATCTTTCTTGGTCAGAGCTAAAG 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU34460___le 1151 CAGGTGATACGTACCAGCTTGATACGGATCTTTCTTGGTCAGAGCTAAAG 1200
BSNT_05205___ 1201 AATGCAGGCGTCAGGCTCAGAGAATCAGAAGACCAAAAACGCCATATTGA 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU34460___le 1201 AATGCAGGCGTCAGGCTCAGAGAATCAGAAGACCAAAAACGCCATATTGA 1250
BSNT_05205___ 1251 TGTCGGCATTTTCGCCGAAGGCGGCTATGCATATGTCAATAGAGCAGCCA 1300
|||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||
BSU34460___le 1251 TGTCGGCATTTTCGCTGAAGGCGGCTATGCTTATGTCAATAGAGCAGCCA 1300
BSNT_05205___ 1301 CAAATCAGCCTGACAAAAGCAATACCTTTGTCGAAAGCAAAGCTCCTTAT 1350
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
BSU34460___le 1301 CAAATCAGCCTGACAAAAGCAATACCTATGTCGAAAGCAAAGCTCCTTAT 1350
BSNT_05205___ 1351 GATGTAAGCAAACGTAAGGTGCATTTGAAAATACTTGTCGATAAAACAAC 1400
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU34460___le 1351 GATGTAAACAAACGTAAGGTGCATTTGAAAATACTTGTCGATAAAACAAC 1400
BSNT_05205___ 1401 GATAGAAGTATTTGTTGGCGACGGGAAAACCGTTTTTTCAAATGAAGTCT 1450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU34460___le 1401 GATAGAAGTATTTGTTGGCGACGGGAAAACCGTTTTTTCAAATGAAGTCT 1450
BSNT_05205___ 1451 TCCCAAAGCCTGAAGATAAAGGAATTACCCTTTATTCTGACGGCGGCACA 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU34460___le 1451 TCCCAAAGCCTGAAGATAAAGGAATTACCCTTTATTCTGACGGCGGCACA 1500
BSNT_05205___ 1501 GCCTCCTTCAAAAATATAACAGTGAAACACTTTGATTCGGTTCACGAATA 1550
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||
BSU34460___le 1501 GCCTCCTTCAAAAATATAACAGTGAAACACTTTGATTCGATTCATGAATA 1550
BSNT_05205___ 1551 A 1551
|
BSU34460___le 1551 A 1551
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.