Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_04879 and BSU32880
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_04879 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:25:22
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_04879___yusP.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU32880___yusP.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_04879___yusP-BSU32880___yusP.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_04879___yusP-BSU32880___yusP.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_04879___yusP
# 2: BSU32880___yusP
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1626
# Identity: 1616/1626 (99.4%)
# Similarity: 1616/1626 (99.4%)
# Gaps: 0/1626 ( 0.0%)
# Score: 8040.0
#
#
#=======================================
BSNT_04879___ 1 ATGAAAATGAGTAAAGAAGGCAAACAATCAAAACGAACGTTATTAATAAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32880___yu 1 ATGAAAATGAGTAAAGAAGGCAAACAATCAAAACGAACGTTATTAATAAC 50
BSNT_04879___ 51 AGGCTTAATTATTGCCATGTTTTTTTCAGCCCTTGACGGTACCATTGTCG 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32880___yu 51 AGGCTTAATTATTGCCATGTTTTTTTCAGCCCTTGACGGTACCATTGTCG 100
BSNT_04879___ 101 GAACGGCCATGCCGAAAATTGTCGGTGATCTGGGCGGTTTGAGCATGATG 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32880___yu 101 GAACGGCCATGCCGAAAATTGTCGGTGATCTGGGCGGTTTGAGCATGATG 150
BSNT_04879___ 151 ACCTGGCTGACAACTGCATATTTGTTAACATCAACAACCATTGTTCCAAT 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32880___yu 151 ACCTGGCTGACAACTGCATATTTGTTAACATCAACAACCATTGTTCCAAT 200
BSNT_04879___ 201 TGCCGGTAAACTGGCTGATTTATTGGGACGCCGCATTGTCTATGTATCAG 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32880___yu 201 TGCCGGTAAACTGGCTGATTTATTGGGACGCCGCATTGTCTATGTATCAG 250
BSNT_04879___ 251 GTTTGATTATTTTCATGGCCGCTTCTGCTTTGTGCGGAATGGCCAACAAC 300
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32880___yu 251 GTTTGATTATTTTTATGGCCGCTTCTGCTTTGTGCGGAATGGCCAACAAC 300
BSNT_04879___ 301 ATGACGGAATTGATTATCTTCCGTGGACTGCAGGGAATCGGCGGAGGCAT 350
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
BSU32880___yu 301 ATGACGGAATTGATTATCTTCCGTGGACTGCAGGGCATCGGCGGAGGCAT 350
BSNT_04879___ 351 CATGATGCCGATGGCGATGATTGTCATCGGTGACTTGTTCACAGGAAAAC 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32880___yu 351 CATGATGCCGATGGCGATGATTGTCATCGGTGACTTGTTCACAGGAAAAC 400
BSNT_04879___ 401 AGCGTGCTAAATTCCAAGGTGTCTTTGGCGCAATTTACGGGCTGGCTTCA 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32880___yu 401 AGCGTGCTAAATTCCAAGGTGTCTTTGGCGCAATTTACGGGCTGGCTTCA 450
BSNT_04879___ 451 GTGATTGGGCCGCAAATCGGCGGCTGGATTGTAGACTCGTTAAACTGGAA 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32880___yu 451 GTGATTGGGCCGCAAATCGGCGGCTGGATTGTAGACTCGTTAAACTGGAA 500
BSNT_04879___ 501 ATGGGTTTTCTATATTAATCTGCCAGTCGGAATTATTGCGGTTATTTTTA 550
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32880___yu 501 ATGGGTTTTCTATATTAACCTGCCAGTCGGAATTATTGCGGTTATTTTTA 550
BSNT_04879___ 551 TTGCCAGGGGATTACAGGGACGCCAGCAGACTGGGCCGATCAACTTCGAT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
BSU32880___yu 551 TTGCCAGGGGATTACAGGGACGCCAGCAGACTGGTCCGATCAACTTCGAT 600
BSNT_04879___ 601 ATCGCTGGTATTTTCACAATGATTGTGGGTGTGGTCAGCCTCCTGCTCGC 650
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
BSU32880___yu 601 ATCGCTGGTATTTTCACAATGATTGTCGGTGTGGTCAGCCTCCTGCTCGC 650
BSNT_04879___ 651 CTTAAGCTTTGGCGGAAAAGATTATGCATGGGATTCATGGCAGATTCTTG 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32880___yu 651 CTTAAGCTTTGGCGGAAAAGATTATGCATGGGATTCATGGCAGATTCTTG 700
BSNT_04879___ 701 GGTTGTTCGCTCTCGCACTGATCGGCATTGTCAGCTTTATCATCGTAGAA 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32880___yu 701 GGTTGTTCGCTCTCGCACTGATCGGCATTGTCAGCTTTATCATCGTAGAA 750
BSNT_04879___ 751 TCAAAAGCAAAAGAGCCAATCCTGCCAATGTATTTATTTAAAAACAGAAC 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32880___yu 751 TCAAAAGCAAAAGAGCCAATCCTGCCAATGTATTTATTTAAAAACAGAAC 800
BSNT_04879___ 801 ATTTACATTTCTAAACTTGATCGGCTTCTTTATGAGTATCGGTATGTTTG 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32880___yu 801 ATTTACATTTCTAAACTTGATCGGCTTCTTTATGAGTATCGGTATGTTTG 850
BSNT_04879___ 851 GCGCCATTACATTTGTTCCTTTCTTTATGCAGGGAATTGTCGGTGTAAGT 900
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32880___yu 851 GCGCCATTACGTTTGTTCCTTTCTTTATGCAGGGAATTGTCGGTGTAAGT 900
BSNT_04879___ 901 GCGTCTGAATCGGGTACAATTATGACACCGATGATGATTTCTATGATTAT 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32880___yu 901 GCGTCTGAATCGGGTACAATTATGACACCGATGATGATTTCTATGATTAT 950
BSNT_04879___ 951 CACAAGTATCATCGGCGGACAGCTTGTTTATAAAATCGGGATTAAACCGC 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
BSU32880___yu 951 CACAAGTATCATCGGCGGACAGCTTGTTTATAAAATTGGGATTAAACCGC 1000
BSNT_04879___ 1001 AAATCATTGCAGGCATGCTGGTTATGGCCGGCGGATTCCTGCTGTTAACG 1050
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32880___yu 1001 AAATCATTACAGGCATGCTGGTTATGGCCGGCGGATTCCTGCTGTTAACG 1050
BSNT_04879___ 1051 ACATTGGATCTCGACACGAGCAAGCTTGTCGCTACATCTTTTATGGCGAT 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32880___yu 1051 ACATTGGATCTCGACACGAGCAAGCTTGTCGCTACATCTTTTATGGCGAT 1100
BSNT_04879___ 1101 TATTGGTCTGGGAATGGGTCTTGTTATGCCGATTCTGACATTGGCTTTAC 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32880___yu 1101 TATTGGTCTGGGAATGGGTCTTGTTATGCCGATTCTGACATTGGCTTTAC 1150
BSNT_04879___ 1151 AGGAAAGCTTTTCGAAGGAGGAGCTTGGAGTTGTCACTTCATCCAGCCAA 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32880___yu 1151 AGGAAAGCTTTTCGAAGGAGGAGCTTGGAGTTGTCACTTCATCCAGCCAA 1200
BSNT_04879___ 1201 TTCTTCCGTTCTATCGGCGGAACATTCGGCATTACCATGCTGGGAGCCGT 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32880___yu 1201 TTCTTCCGTTCTATCGGCGGAACATTCGGCATTACCATGCTGGGAGCCGT 1250
BSNT_04879___ 1251 AATGAATGCGAGATCAGGAAATCTATTAACAGATAAATTGGTTCCATATT 1300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32880___yu 1251 AATGAATGCGAGATCAGGAAATCTATTAACAGATAAATTGGTTCCATATT 1300
BSNT_04879___ 1301 TAGACTCTCTTCCGGCACAGGCAAGCTCGTTTGCCGCCCAGCTAAAGGGT 1350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32880___yu 1301 TAGACTCTCTTCCGGCACAGGCAAGCTCGTTTGCCGCCCAGCTAAAGGGT 1350
BSNT_04879___ 1351 ATGATTGATACAAATCCGCAAGGGCTGCTGCAATCACTGTTCAGTCCGGA 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32880___yu 1351 ATGATTGATACAAATCCGCAAGGGCTGCTGCAATCACTGTTCAGTCCGGA 1400
BSNT_04879___ 1401 CGCGGTCAAACAAATCCCTGCGGCTTTCTCATCCCATATTGTGCCGATTT 1450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32880___yu 1401 CGCGGTCAAACAAATCCCTGCGGCTTTCTCATCCCATATTGTGCCGATTT 1450
BSNT_04879___ 1451 TAAAAACATCGTTGATGGATTCGCTCCACAGCGTGTTTTATACGGGCCTG 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32880___yu 1451 TAAAAACATCGTTGATGGATTCGCTCCACAGCGTGTTTTATACGGGCCTG 1500
BSNT_04879___ 1501 ATCTTTATCGCAGTCGGAGCCGTATTCACCTTGTTCTTAAAACCTATCAA 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32880___yu 1501 ATCTTTATCGCAGTCGGAGCCGTATTCACCTTGTTCTTAAAACCTATCAA 1550
BSNT_04879___ 1551 GCTATCAAATAAGAAAACGGAAGACCAACAAGAAAAAGAGAAAGCGGCAA 1600
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||
BSU32880___yu 1551 GCTATCAAATAAGAAAGCGGAAGACCAACAAGAAAAAGAGAAGGCGGCAA 1600
BSNT_04879___ 1601 AAGCCGTTGAATCACCTTCCCATTAA 1626
||||||||||||||||||||||||||
BSU32880___yu 1601 AAGCCGTTGAATCACCTTCCCATTAA 1626
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.