Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_04770 and BSU32230
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_04770 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:24:54
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_04770___yuxL.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU32230___yuxL.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_04770___yuxL-BSU32230___yuxL.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_04770___yuxL-BSU32230___yuxL.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_04770___yuxL
# 2: BSU32230___yuxL
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1975
# Identity: 1954/1975 (98.9%)
# Similarity: 1954/1975 (98.9%)
# Gaps: 2/1975 ( 0.1%)
# Score: 9674.0
#
#
#=======================================
BSNT_04770___ 1 ATGAAAAAGCTGATAACCGCAGACGACATCACAGCGATTGTCTCTGTGAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu 1 ATGAAAAAGCTGATAACCGCAGACGACATCACAGCGATTGTCTCTGTGAC 50
BSNT_04770___ 51 AGATCCTCAATACGCCCCAGACGGCACCCGTGCCGCATATGTAAAATCAC 100
.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu 51 CGATCCTCAATACGCCCCAGACGGTACCCGTGCCGCATATGTAAAATCAC 100
BSNT_04770___ 101 AAGTGAATCAAGAGAAAGATTCGTATACATCAAATATATGGATCTATGAA 150
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu 101 AAGTAAATCAAGAGAAAGATTCGTATACATCAAATATATGGATCTATGAA 150
BSNT_04770___ 151 ACGAAAACGGGCGGGTCTGTTCCTTGGACACATGGAGAAAAGCGAAGCAC 200
|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu 151 ACGAAAACGGGAGGATCTGTTCCTTGGACACATGGAGAAAAGCGAAGCAC 200
BSNT_04770___ 201 CGACCCAAGATGGTCTCCGGACGGGTGCACGCTTGCCTTTATTTCTGATC 250
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu 201 CGACCCAAGATGGTCTCCGGACGGGCGCACGCTTGCCTTTATTTCTGATC 250
BSNT_04770___ 251 GAGAAGGCGATGCGGCACAGCTGTATATGATGAGCGCTGAAGGCGGAGAA 300
||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.||||||||||||||
BSU32230___yu 251 GAGAAGGCGATGCGGCACAGCTTTATATCATGAGCACTGAAGGCGGAGAA 300
BSNT_04770___ 301 GCGAGAAAACTGACTGATATCCCGTATGGCGTGTCAAAGCCAATATGGTC 350
||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||
BSU32230___yu 301 GCAAGAAAACTGACTGATATCCCATATGGCGTGTCAAAGCCGCTATGGTC 350
BSNT_04770___ 351 CCCGGATGGCGAATCGATTCTGGTCACTGTCAGTTTGGGAGAGGGAGGAA 400
||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
BSU32230___yu 351 CCCGGACGGTGAATCGATTCTGGTCACTGTCAGTTTGGGAGAGGG-GGAA 399
BSNT_04770___ 401 A-CATTGATGACCGAGAAAAAACAGAGCAGGACAGCTATGAACCTGTTGA 449
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu 400 AGCATTGATGACCGAGAAAAAACAGAGCAGGACAGCTATGAACCTGTTGA 449
BSNT_04770___ 450 AGTGCAAGGCCTCTCCTACAAACGGGACGGCAAAGGGCTGACGAGAGGTG 499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu 450 AGTGCAAGGCCTCTCCTACAAACGGGACGGCAAAGGGCTGACGAGAGGTG 499
BSNT_04770___ 500 CGTATGCCCAGCTTGTGCTTGTCAGCGTAAAGTCGGGTGAGATGAAAGAG 549
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu 500 CGTATGCCCAGCTTGTGCTTGTCAGCGTAAAGTCGGGTGAGATGAAAGAG 549
BSNT_04770___ 550 CTGACAAGTCACAAAGCTGATCATGGTGATCCTGCTTTTTCTCCTGACGG 599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu 550 CTGACAAGTCACAAAGCTGATCATGGTGATCCTGCTTTTTCTCCTGACGG 599
BSNT_04770___ 600 CAAATGGCTTGTTTTCTCAGCTAATTTAACTGAAACAGATGATGCCAGCA 649
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu 600 CAAATGGCTTGTTTTCTCAGCTAATTTAACTGAAACAGATGATGCCAGCA 649
BSNT_04770___ 650 AGCCGCATGATGTTTACATAATGTCACTGGAGTCTGGAGATCTTAAGCAG 699
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu 650 AGCCGCATGATGTTTACATAATGTCACTGGAGTCTGGAGATCTTAAGCAG 699
BSNT_04770___ 700 GTTACACCTCATCGCGGCTCATTCGGATCAAGCTCATTTTCACCAGACGG 749
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu 700 GTTACACCTCATCGCGGCTCATTCGGATCAAGCTCATTTTCACCAGACGG 749
BSNT_04770___ 750 AAGGTATCTTGCTTTGCTTGGAAATGAAAAGGAATATAAGAATGCTACGC 799
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu 750 AAGGTATCTTGCTTTGCTTGGAAATGAAAAGGAATATAAGAATGCTACGC 799
BSNT_04770___ 800 TCTCAAAGGCGTGGCTCTATGATATCGAACAAGGCCGCCTCACATGTCTT 849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu 800 TCTCAAAGGCGTGGCTCTATGATATCGAACAAGGCCGCCTCACATGTCTT 849
BSNT_04770___ 850 ACTGAGATGCTGGACGTTCATTTAGCGGATGCGCTGATTGGAGATTCATT 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu 850 ACTGAGATGCTGGACGTTCATTTAGCGGATGCGCTGATTGGAGATTCATT 899
BSNT_04770___ 900 GATCGGTGGTGCTGAACAGCGCCCGATTTGGACAAAGGACAGCCAAGGGT 949
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu 900 GATCGGTGGTGCTGAACAGCGCCCGATTTGGACAAAGGACAGCCAAGGGT 949
BSNT_04770___ 950 TTTATGTCATCGGCACAGATCAAGGCAGTACGGGCATCTATTATATTTCG 999
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu 950 TTTATGTCATCGGCACAGATCAAGGCAGTACGGGCATCTATTATATTTCG 999
BSNT_04770___ 1000 ATTGAAGGCCTTGTGTATCCGATTCGTCTGGAAAAAGAGTACATCAATAG 1049
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu 1000 ATTGAAGGCCTTGTGTATCCGATTCGTCTGGAAAAAGAGTACATCAATAG 1049
BSNT_04770___ 1050 CTTTTCTCTTTCACCTGATGAACAGCACTTTATTGCCAGTGTGACAAAGC 1099
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu 1050 CTTTTCTCTTTCACCTGATGAACAGCACTTTATTGCCAGTGTGACAAAGC 1099
BSNT_04770___ 1100 CGGACAGACCGAGTGAGCTTTACAGTATCCCGCTTGGACAGGAAGAGAAA 1149
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu 1100 CGGACAGACCGAGTGAGCTTTACAGTATCCCGCTTGGACAGGAAGAGAAA 1149
BSNT_04770___ 1150 CAGCTGACTGGCGCGAATGACAAGTTTGTCAGGGAGCATACGATATCAAT 1199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu 1150 CAGCTGACTGGCGCGAATGACAAGTTTGTCAGGGAGCATACGATATCAAT 1199
BSNT_04770___ 1200 ACCTGAAGAGATTCAATATGCTACAGAAGACGGCGTGATGGTGAACGGCT 1249
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu 1200 ACCTGAAGAGATTCAATATGCTACAGAAGACGGCGTGATGGTGAACGGCT 1249
BSNT_04770___ 1250 GGCTGATGAGGCCTGCACAAATGGAAGGTGAGACAACATATCCACTTATT 1299
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu 1250 GGCTGATGAGGCCTGCACAAATGGAAGGTGAGACAACATATCCACTTATT 1299
BSNT_04770___ 1300 CTTAACATACACGGCGGTCCGCATATGATGTACGGACATACATATTTTCA 1349
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu 1300 CTTAACATACACGGCGGTCCGCATATGATGTACGGACATACATATTTTCA 1349
BSNT_04770___ 1350 TGAGTTTCAGGTGCTGGCGGCGAAAGGATACGCGGTCGTTTATATCAATC 1399
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu 1350 TGAGTTTCAGGTGCTGGCGGCGAAAGGATACGCGGTCGTTTATATCAATC 1399
BSNT_04770___ 1400 CGAGAGGAAGCCACGGCTACGGGCAGGAATTTGTGAATGCGGTCAGAGGA 1449
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu 1400 CGAGAGGAAGCCACGGCTACGGGCAGGAATTTGTGAATGCGGTCAGAGGA 1449
BSNT_04770___ 1450 GATTATGGGGGAAAGGATTATGACGATGTGATGCAGGCTGTGGATGAGGC 1499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu 1450 GATTATGGGGGAAAGGATTATGACGATGTGATGCAGGCTGTGGATGAGGC 1499
BSNT_04770___ 1500 TATCAAACGAGATCCGCATATTGATCCTAAGCGGCTCGGTGTCACGGGCG 1549
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu 1500 TATCAAACGAGATCCGCATATTGATCCTAAGCGGCTCGGTGTCACGGGCG 1549
BSNT_04770___ 1550 GAAGCTACGGAGGTTTTATGACCAACTGGATCGTCGGGCAGACGAACCGC 1599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu 1550 GAAGCTACGGAGGTTTTATGACCAACTGGATCGTCGGGCAGACGAACCGC 1599
BSNT_04770___ 1600 TTTAAAGCTGCCGTTACCCAGCGCTCGATATCAAATTGGATCAGCTTTCA 1649
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu 1600 TTTAAAGCTGCCGTTACCCAGCGCTCGATATCAAATTGGATCAGCTTTCA 1649
BSNT_04770___ 1650 CGGCGTCAGTGATATCGGCTATTTCTTTACAGACTGGCAGCTTGAGCATG 1699
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu 1650 CGGCGTCAGTGATATCGGCTATTTCTTTACAGACTGGCAGCTTGAGCATG 1699
BSNT_04770___ 1700 ACATGTTTGAGGACACAGAAAAGCTCTGGGACCGGTCTCCTTTAAAATAC 1749
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu 1700 ACATGTTTGAGGACACAGAAAAGCTCTGGGACCGGTCTCCTTTAAAATAC 1749
BSNT_04770___ 1750 GCAGCAAACGTGGAGACACCGCTTTTGATACTGCATGGCGAGCGGGATGA 1799
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu 1750 GCAGCAAACGTGGAGACACCGCTTTTGATACTGCATGGCGAGCGGGATGA 1799
BSNT_04770___ 1800 CCGATGTCCGATCGAGCAGGCGGAGCAGCTGTTTATCGCTCTGAAAAAAA 1849
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu 1800 CCGATGCCCGATCGAGCAGGCGGAGCAGCTGTTTATCGCTCTGAAAAAAA 1849
BSNT_04770___ 1850 TGGGCAAGGAAACCAAGCTTGTCCGTTTTCCGAATGCATCGCACAATTTG 1899
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
BSU32230___yu 1850 TGGGCAAGGAAACCAAGCTTGTCCGTTTTCCGAATGCATCGCACAATTTA 1899
BSNT_04770___ 1900 TCACGCACCGGACACCCAAGACAGCGGATCAAGCGCCTGAATTATATCAG 1949
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu 1900 TCACGCACCGGACACCCAAGACAGCGGATCAAGCGCCTGAATTATATCAG 1949
BSNT_04770___ 1950 CTCATGGTTTGACCAATATCTCTAA 1974
||||||||||||.|||.||||||||
BSU32230___yu 1950 CTCATGGTTTGATCAACATCTCTAA 1974
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.