Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195

Home About Browser Genes Download Publications

DNA alignment: BSNT_04770 and BSU32230

See Amino acid alignment / Visit BSNT_04770 in genome browser / Return to Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon  8 Mar 2010 06:24:54
# Commandline: needle
#    -asequence dna-align/BSNT_04770___yuxL.1.22522.seq
#    -bsequence dna-align/BSU32230___yuxL.2.22522.seq
#    -gapopen 10
#    -gapextend 0.5
#    -outfile dna-align/BSNT_04770___yuxL-BSU32230___yuxL.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_04770___yuxL-BSU32230___yuxL.aln
########################################

#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_04770___yuxL
# 2: BSU32230___yuxL
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1975
# Identity:    1954/1975 (98.9%)
# Similarity:  1954/1975 (98.9%)
# Gaps:           2/1975 ( 0.1%)
# Score: 9674.0
# 
#
#=======================================

BSNT_04770___      1 ATGAAAAAGCTGATAACCGCAGACGACATCACAGCGATTGTCTCTGTGAC     50
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu      1 ATGAAAAAGCTGATAACCGCAGACGACATCACAGCGATTGTCTCTGTGAC     50

BSNT_04770___     51 AGATCCTCAATACGCCCCAGACGGCACCCGTGCCGCATATGTAAAATCAC    100
                     .|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu     51 CGATCCTCAATACGCCCCAGACGGTACCCGTGCCGCATATGTAAAATCAC    100

BSNT_04770___    101 AAGTGAATCAAGAGAAAGATTCGTATACATCAAATATATGGATCTATGAA    150
                     ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu    101 AAGTAAATCAAGAGAAAGATTCGTATACATCAAATATATGGATCTATGAA    150

BSNT_04770___    151 ACGAAAACGGGCGGGTCTGTTCCTTGGACACATGGAGAAAAGCGAAGCAC    200
                     |||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu    151 ACGAAAACGGGAGGATCTGTTCCTTGGACACATGGAGAAAAGCGAAGCAC    200

BSNT_04770___    201 CGACCCAAGATGGTCTCCGGACGGGTGCACGCTTGCCTTTATTTCTGATC    250
                     |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu    201 CGACCCAAGATGGTCTCCGGACGGGCGCACGCTTGCCTTTATTTCTGATC    250

BSNT_04770___    251 GAGAAGGCGATGCGGCACAGCTGTATATGATGAGCGCTGAAGGCGGAGAA    300
                     ||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.||||||||||||||
BSU32230___yu    251 GAGAAGGCGATGCGGCACAGCTTTATATCATGAGCACTGAAGGCGGAGAA    300

BSNT_04770___    301 GCGAGAAAACTGACTGATATCCCGTATGGCGTGTCAAAGCCAATATGGTC    350
                     ||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||
BSU32230___yu    301 GCAAGAAAACTGACTGATATCCCATATGGCGTGTCAAAGCCGCTATGGTC    350

BSNT_04770___    351 CCCGGATGGCGAATCGATTCTGGTCACTGTCAGTTTGGGAGAGGGAGGAA    400
                     ||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
BSU32230___yu    351 CCCGGACGGTGAATCGATTCTGGTCACTGTCAGTTTGGGAGAGGG-GGAA    399

BSNT_04770___    401 A-CATTGATGACCGAGAAAAAACAGAGCAGGACAGCTATGAACCTGTTGA    449
                     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu    400 AGCATTGATGACCGAGAAAAAACAGAGCAGGACAGCTATGAACCTGTTGA    449

BSNT_04770___    450 AGTGCAAGGCCTCTCCTACAAACGGGACGGCAAAGGGCTGACGAGAGGTG    499
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu    450 AGTGCAAGGCCTCTCCTACAAACGGGACGGCAAAGGGCTGACGAGAGGTG    499

BSNT_04770___    500 CGTATGCCCAGCTTGTGCTTGTCAGCGTAAAGTCGGGTGAGATGAAAGAG    549
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu    500 CGTATGCCCAGCTTGTGCTTGTCAGCGTAAAGTCGGGTGAGATGAAAGAG    549

BSNT_04770___    550 CTGACAAGTCACAAAGCTGATCATGGTGATCCTGCTTTTTCTCCTGACGG    599
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu    550 CTGACAAGTCACAAAGCTGATCATGGTGATCCTGCTTTTTCTCCTGACGG    599

BSNT_04770___    600 CAAATGGCTTGTTTTCTCAGCTAATTTAACTGAAACAGATGATGCCAGCA    649
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu    600 CAAATGGCTTGTTTTCTCAGCTAATTTAACTGAAACAGATGATGCCAGCA    649

BSNT_04770___    650 AGCCGCATGATGTTTACATAATGTCACTGGAGTCTGGAGATCTTAAGCAG    699
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu    650 AGCCGCATGATGTTTACATAATGTCACTGGAGTCTGGAGATCTTAAGCAG    699

BSNT_04770___    700 GTTACACCTCATCGCGGCTCATTCGGATCAAGCTCATTTTCACCAGACGG    749
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu    700 GTTACACCTCATCGCGGCTCATTCGGATCAAGCTCATTTTCACCAGACGG    749

BSNT_04770___    750 AAGGTATCTTGCTTTGCTTGGAAATGAAAAGGAATATAAGAATGCTACGC    799
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu    750 AAGGTATCTTGCTTTGCTTGGAAATGAAAAGGAATATAAGAATGCTACGC    799

BSNT_04770___    800 TCTCAAAGGCGTGGCTCTATGATATCGAACAAGGCCGCCTCACATGTCTT    849
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu    800 TCTCAAAGGCGTGGCTCTATGATATCGAACAAGGCCGCCTCACATGTCTT    849

BSNT_04770___    850 ACTGAGATGCTGGACGTTCATTTAGCGGATGCGCTGATTGGAGATTCATT    899
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu    850 ACTGAGATGCTGGACGTTCATTTAGCGGATGCGCTGATTGGAGATTCATT    899

BSNT_04770___    900 GATCGGTGGTGCTGAACAGCGCCCGATTTGGACAAAGGACAGCCAAGGGT    949
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu    900 GATCGGTGGTGCTGAACAGCGCCCGATTTGGACAAAGGACAGCCAAGGGT    949

BSNT_04770___    950 TTTATGTCATCGGCACAGATCAAGGCAGTACGGGCATCTATTATATTTCG    999
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu    950 TTTATGTCATCGGCACAGATCAAGGCAGTACGGGCATCTATTATATTTCG    999

BSNT_04770___   1000 ATTGAAGGCCTTGTGTATCCGATTCGTCTGGAAAAAGAGTACATCAATAG   1049
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu   1000 ATTGAAGGCCTTGTGTATCCGATTCGTCTGGAAAAAGAGTACATCAATAG   1049

BSNT_04770___   1050 CTTTTCTCTTTCACCTGATGAACAGCACTTTATTGCCAGTGTGACAAAGC   1099
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu   1050 CTTTTCTCTTTCACCTGATGAACAGCACTTTATTGCCAGTGTGACAAAGC   1099

BSNT_04770___   1100 CGGACAGACCGAGTGAGCTTTACAGTATCCCGCTTGGACAGGAAGAGAAA   1149
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu   1100 CGGACAGACCGAGTGAGCTTTACAGTATCCCGCTTGGACAGGAAGAGAAA   1149

BSNT_04770___   1150 CAGCTGACTGGCGCGAATGACAAGTTTGTCAGGGAGCATACGATATCAAT   1199
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu   1150 CAGCTGACTGGCGCGAATGACAAGTTTGTCAGGGAGCATACGATATCAAT   1199

BSNT_04770___   1200 ACCTGAAGAGATTCAATATGCTACAGAAGACGGCGTGATGGTGAACGGCT   1249
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu   1200 ACCTGAAGAGATTCAATATGCTACAGAAGACGGCGTGATGGTGAACGGCT   1249

BSNT_04770___   1250 GGCTGATGAGGCCTGCACAAATGGAAGGTGAGACAACATATCCACTTATT   1299
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu   1250 GGCTGATGAGGCCTGCACAAATGGAAGGTGAGACAACATATCCACTTATT   1299

BSNT_04770___   1300 CTTAACATACACGGCGGTCCGCATATGATGTACGGACATACATATTTTCA   1349
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu   1300 CTTAACATACACGGCGGTCCGCATATGATGTACGGACATACATATTTTCA   1349

BSNT_04770___   1350 TGAGTTTCAGGTGCTGGCGGCGAAAGGATACGCGGTCGTTTATATCAATC   1399
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu   1350 TGAGTTTCAGGTGCTGGCGGCGAAAGGATACGCGGTCGTTTATATCAATC   1399

BSNT_04770___   1400 CGAGAGGAAGCCACGGCTACGGGCAGGAATTTGTGAATGCGGTCAGAGGA   1449
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu   1400 CGAGAGGAAGCCACGGCTACGGGCAGGAATTTGTGAATGCGGTCAGAGGA   1449

BSNT_04770___   1450 GATTATGGGGGAAAGGATTATGACGATGTGATGCAGGCTGTGGATGAGGC   1499
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu   1450 GATTATGGGGGAAAGGATTATGACGATGTGATGCAGGCTGTGGATGAGGC   1499

BSNT_04770___   1500 TATCAAACGAGATCCGCATATTGATCCTAAGCGGCTCGGTGTCACGGGCG   1549
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu   1500 TATCAAACGAGATCCGCATATTGATCCTAAGCGGCTCGGTGTCACGGGCG   1549

BSNT_04770___   1550 GAAGCTACGGAGGTTTTATGACCAACTGGATCGTCGGGCAGACGAACCGC   1599
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu   1550 GAAGCTACGGAGGTTTTATGACCAACTGGATCGTCGGGCAGACGAACCGC   1599

BSNT_04770___   1600 TTTAAAGCTGCCGTTACCCAGCGCTCGATATCAAATTGGATCAGCTTTCA   1649
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu   1600 TTTAAAGCTGCCGTTACCCAGCGCTCGATATCAAATTGGATCAGCTTTCA   1649

BSNT_04770___   1650 CGGCGTCAGTGATATCGGCTATTTCTTTACAGACTGGCAGCTTGAGCATG   1699
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu   1650 CGGCGTCAGTGATATCGGCTATTTCTTTACAGACTGGCAGCTTGAGCATG   1699

BSNT_04770___   1700 ACATGTTTGAGGACACAGAAAAGCTCTGGGACCGGTCTCCTTTAAAATAC   1749
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu   1700 ACATGTTTGAGGACACAGAAAAGCTCTGGGACCGGTCTCCTTTAAAATAC   1749

BSNT_04770___   1750 GCAGCAAACGTGGAGACACCGCTTTTGATACTGCATGGCGAGCGGGATGA   1799
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu   1750 GCAGCAAACGTGGAGACACCGCTTTTGATACTGCATGGCGAGCGGGATGA   1799

BSNT_04770___   1800 CCGATGTCCGATCGAGCAGGCGGAGCAGCTGTTTATCGCTCTGAAAAAAA   1849
                     ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu   1800 CCGATGCCCGATCGAGCAGGCGGAGCAGCTGTTTATCGCTCTGAAAAAAA   1849

BSNT_04770___   1850 TGGGCAAGGAAACCAAGCTTGTCCGTTTTCCGAATGCATCGCACAATTTG   1899
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
BSU32230___yu   1850 TGGGCAAGGAAACCAAGCTTGTCCGTTTTCCGAATGCATCGCACAATTTA   1899

BSNT_04770___   1900 TCACGCACCGGACACCCAAGACAGCGGATCAAGCGCCTGAATTATATCAG   1949
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU32230___yu   1900 TCACGCACCGGACACCCAAGACAGCGGATCAAGCGCCTGAATTATATCAG   1949

BSNT_04770___   1950 CTCATGGTTTGACCAATATCTCTAA   1974
                     ||||||||||||.|||.||||||||
BSU32230___yu   1950 CTCATGGTTTGATCAACATCTCTAA   1974


#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.