Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_04642 and BSU31520
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_04642 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:24:31
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_04642___dcuS.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU31520___yufL.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_04642___dcuS-BSU31520___yufL.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_04642___dcuS-BSU31520___yufL.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_04642___dcuS
# 2: BSU31520___yufL
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1602
# Identity: 1596/1602 (99.6%)
# Similarity: 1596/1602 (99.6%)
# Gaps: 0/1602 ( 0.0%)
# Score: 7956.0
#
#
#=======================================
BSNT_04642___ 1 ATGAAAAAAACATTAAAACTGCAAACCAGACTCACCATATTTGTTTGTAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu 1 ATGAAAAAAACATTAAAACTGCAAACCAGACTCACCATATTTGTTTGTAT 50
BSNT_04642___ 51 CGTTGTATTAATCGCATTGCTCATTACGTTTTTTACAGTCGGTGCCCAAA 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu 51 CGTTGTATTAATCGCATTGCTCATTACGTTTTTTACAGTCGGTGCCCAAA 100
BSNT_04642___ 101 CCACCAAACGAATTAGAGATCAGGAAAAGGCCACTGCGCTGCAGACTGCT 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu 101 CCACCAAACGAATTAGAGATCAGGAAAAGGCCACTGCGCTGCAGACTGCT 150
BSNT_04642___ 151 GAAATGGTAGCTGAGGCGCCGATGACAGCCGCTGCTTTAGAAAGCGGAAA 200
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu 151 GAAATGGTAGCTGAAGCGCCGATGACAGCCGCTGCTTTAGAAAGCGGAAA 200
BSNT_04642___ 201 AAAACAAAAGGAACTGCAGAGCTACACAAAGCGGGTTCAGAAAATTACCG 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu 201 AAAACAAAAGGAACTGCAGAGCTACACAAAGCGGGTTCAGAAAATTACCG 250
BSNT_04642___ 251 GCACGGAATTTGTTGTCGTCATGGATATGAACGGTATCCGCAAAACTCAT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu 251 GCACGGAATTTGTTGTCGTCATGGATATGAACGGTATCCGCAAAACTCAT 300
BSNT_04642___ 301 CCTGACCCGAGCAAAATCGGAAAAAAATTCAGAGGCGGTGATGAGTCCGA 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu 301 CCTGACCCGAGCAAAATCGGAAAAAAATTCAGAGGCGGTGATGAGTCCGA 350
BSNT_04642___ 351 GGTATTAAAAGGGCATGTCCATATCAGCACAGCCTCTGGCACGCTCGGGA 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu 351 GGTATTAAAAGGGCATGTCCATATCAGCACAGCCTCTGGCACGCTCGGGA 400
BSNT_04642___ 401 AATCGCAGAGAGCGTTCGTCCCTGTCTACGCGGAGAATGGAAAACAGGTC 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu 401 AATCGCAGAGAGCGTTCGTCCCTGTCTACGCGGAGAATGGAAAACAGGTC 450
BSNT_04642___ 451 GGTGCAGTCGCGGTCGGCATCACCGTAAATGAAATTGATGAAGTGATCAG 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu 451 GGTGCAGTCGCGGTCGGCATCACCGTAAATGAAATTGATGAAGTGATCAG 500
BSNT_04642___ 501 CCATAGCTTACGGCCGCTTTACTTTATTATTTGCGTCAGCATCTTCGTCG 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu 501 CCATAGCTTACGGCCGCTTTACTTTATTATTTGCGTCAGCATCTTCGTCG 550
BSNT_04642___ 551 GTGTGATCGGAGCCGTTATCGTCGCCCGTACAGTGAAAAATATCATGTAC 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu 551 GTGTGATCGGAGCCGTTATCGTCGCCCGTACAGTGAAAAATATCATGTAC 600
BSNT_04642___ 601 GGACTTGAACCTTATGAAATTGCGACTCTGCTTGAAGAACGGAGCGCGAT 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu 601 GGACTTGAACCTTATGAAATTGCGACTCTGCTTGAAGAACGGAGCGCGAT 650
BSNT_04642___ 651 GCTGGAATCGACGAAGGAAGGAATACTCGCTGTCGATGAACATGGCAAAA 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu 651 GCTGGAATCGACGAAGGAAGGAATACTCGCTGTCGATGAACATGGCAAAA 700
BSNT_04642___ 701 TTAAACTTGCCAACGCGGAAGCAAAACACCTATTCGTCAAAATGGGCATC 750
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu 701 TTAAACTTGCCAACGCGGAAGCAAAACGCCTATTCGTCAAAATGGGCATC 750
BSNT_04642___ 751 AACACAAATCCCATTGATCAGGATGTAGATGACATCTTGCCGAAAAGCCG 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu 751 AACACAAATCCCATTGATCAGGATGTAGATGACATCTTGCCGAAAAGCCG 800
BSNT_04642___ 801 CTTGAAAAAGGTCATTGAGACAAAAAAACCTCTTCAAGACAGAGACGTCC 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu 801 CTTGAAAAAGGTCATTGAGACAAAAAAACCTCTTCAAGACAGAGACGTCC 850
BSNT_04642___ 851 GCATTAACGGACTGGAGCTTGTGTTTAATGAAGTTCCTATCCAGCTGAAA 900
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu 851 GCATTAACGGGCTGGAGCTTGTGTTTAATGAAGTTCCTATCCAGCTGAAA 900
BSNT_04642___ 901 GGACAAACTGTCGGAGCGATTGCAACATTCCGCGACAAGACCGAGGTAAA 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu 901 GGACAAACTGTCGGAGCGATTGCAACATTCCGCGACAAGACCGAGGTAAA 950
BSNT_04642___ 951 ACATTTAGCTGAACAGCTTTCCGGTGTTAAAATGTATGCAAACGCACTGA 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu 951 ACATTTAGCTGAACAGCTTTCCGGTGTTAAAATGTATGCAAACGCACTGA 1000
BSNT_04642___ 1001 GAGCGCAGTCTCATGAATTTATGAACAAACTGCATGTGATATTAGGTCTC 1050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu 1001 GAGCGCAGTCTCATGAATTTATGAACAAACTGCATGTGATATTAGGTCTC 1050
BSNT_04642___ 1051 GTCCAGCTGAAAGAGTATGATGATCTTGGAGATTATATTAAAGATATAGC 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu 1051 GTCCAGCTGAAAGAGTATGATGATCTTGGAGATTATATTAAAGATATAGC 1100
BSNT_04642___ 1101 CATACAGCAAAAATCAGAAACAAGTGAAATTATAAATGATGTCAAAAGCT 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu 1101 CATACAGCAAAAATCAGAAACAAGTGAAATTATAAATGATGTCAAAAGCT 1150
BSNT_04642___ 1151 CCGTACTGGCCGGTTTTCTGCTCGGAAAGCAAAGCTTTATACGTGAGCAG 1200
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu 1151 CCGTACTGGCCGGTTTTCTGCTTGGAAAGCAAAGCTTTATACGTGAGCAG 1200
BSNT_04642___ 1201 GGCGCAAATCTTGATATTGAATGCAACGGTGTCATCCCGAACGCGGCAGA 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu 1201 GGCGCAAATCTTGATATTGAATGCAACGGTGTCATCCCGAACGCGGCAGA 1250
BSNT_04642___ 1251 CCCTTCTGTCATCCATGAACTTATTACAATCATCGGAAATCTCATCAACA 1300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu 1251 CCCTTCTGTCATCCATGAACTTATTACAATCATCGGAAATCTCATCAACA 1300
BSNT_04642___ 1301 ATGGCTTAGACGCCGTTGCGGATATGCCGAAAAAACAAATCACCATGTCC 1350
||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu 1301 ATGGCTTAGATGCCGTTGCCGATATGCCGAAAAAACAAATCACCATGTCC 1350
BSNT_04642___ 1351 ATGCGCTTCCATAACAGCATACTTGATATTGAAATTACCGATACTGGAGC 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu 1351 ATGCGCTTCCATAACAGCATACTTGATATTGAAATTACCGATACTGGAGC 1400
BSNT_04642___ 1401 AGGCATGTCTGAAGAAGACCAAGCCAAAGTATTTGAACAAGGCTATTCAA 1450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu 1401 AGGCATGTCTGAAGAAGACCAAGCCAAAGTATTTGAACAAGGCTATTCAA 1450
BSNT_04642___ 1451 CAAAGGGCAAAAACCGGGGATTCGGCCTTTATTTCACACAGCAAAGCATC 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu 1451 CAAAGGGCAAAAACCGGGGATTCGGCCTTTATTTCACACAGCAAAGCATC 1500
BSNT_04642___ 1501 GAAAATTTAAAAGGCCAAATGATCCTCACAAGCGAAAAGAATGAAGGAAC 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu 1501 GAAAATTTAAAAGGCCAAATGATCCTCACAAGCGAAAAGAATGAAGGAAC 1550
BSNT_04642___ 1551 GACATTCAGTATTCGCATCCCGTACGAACCGAAGGAGGAAAATCATGATT 1600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31520___yu 1551 GACATTCAGTATTCGCATCCCGTACGAACCGAAGGAGGAAAATCATGATT 1600
BSNT_04642___ 1601 AA 1602
||
BSU31520___yu 1601 AA 1602
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.