Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_04607 and BSU31290
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_04607 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:24:27
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_04607___yugT.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU31290___yugT.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_04607___yugT-BSU31290___yugT.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_04607___yugT-BSU31290___yugT.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_04607___yugT
# 2: BSU31290___yugT
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1665
# Identity: 1643/1665 (98.7%)
# Similarity: 1643/1665 (98.7%)
# Gaps: 0/1665 ( 0.0%)
# Score: 8127.0
#
#
#=======================================
BSNT_04607___ 1 ATGAAAAAGGCTTGGTGGAAGGAAGCCGTTGTTTACCAAATTTACCCCCG 50
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
BSU31290___yu 1 ATGAAAAAGGCTTGGTGGAAGGAAGCCGTAGTTTACCAAATTTACCCCCG 50
BSNT_04607___ 51 CAGTTTTAAAGATTCAAATGGCGACGGAATTGGGGATATTCAAGGAATCA 100
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
BSU31290___yu 51 CAGTTTTAAAGATTCAAATGGCGACGGAATCGGGGATATTCAAGGAATCA 100
BSNT_04607___ 101 GATCCAAGCTTTCTTACATAAAAGAGCTGGGCGCTGACGTCATATGGATT 150
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31290___yu 101 GAACCAAGCTTTCTTACATAAAAGAGCTGGGCGCTGACGTCATATGGATT 150
BSNT_04607___ 151 TGCCCACTGTATGACTCACCGAATGCTGATAATGGCTATGATATCCGGGA 200
|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||.||||
BSU31290___yu 151 TGCCCGCTGTATGATTCACCGAATGCCGATAATGGCTATGATATCAGGGA 200
BSNT_04607___ 201 TTATCAAAACATATTAAGCGAGTTTGGCACCATGGAAGATTTTGATGAAC 250
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
BSU31290___yu 201 TTATCAAAACATATTAAGCGAGTTTGGCACGATGGAAGATTTTGATGAGC 250
BSNT_04607___ 251 TGCTTGGTGACATTCATGATCTGGGGATGAAGCTGATTATGGATCTCGTT 300
||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||
BSU31290___yu 251 TGCTTGGTGACATTCATGATCTGGATATGAAGCTGATTATGGATCTCGTT 300
BSNT_04607___ 301 GTGAACCACACAAGCGACGAACATCCATGGTTCATAGAATCCCGTTCATC 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31290___yu 301 GTGAACCACACAAGCGACGAACATCCATGGTTCATAGAATCCCGTTCATC 350
BSNT_04607___ 351 CATACACTCGGAAAAGCGCGACTGGTATATTTGGAAAGACGGCAAAAACG 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31290___yu 351 CATACACTCGGAAAAGCGCGACTGGTATATTTGGAAAGACGGCAAAAACG 400
BSNT_04607___ 401 GAAAAGCGCCCAACAATTGGGAAAGCATTTTCGGCGGACCGGCTTGGGAG 450
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
BSU31290___yu 401 GAAAAACGCCCAACAATTGGGAAAGCATTTTCGGCGGGCCGGCTTGGGAG 450
BSNT_04607___ 451 TATGATCAAGAGACAAGCCAGTATTATCTGCACCTTTTTGATAAAAAACA 500
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31290___yu 451 TATGATCAAAAGACAAGCCAGTATTATCTGCACCTTTTTGATAAAAAACA 500
BSNT_04607___ 501 GCCTGATTTGAATTGGGAAAATGAACAGGTGAGGAATGCCGTTTATGACA 550
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
BSU31290___yu 501 GCCTGATTTGAATTGGGAAAATGAAAAGGTGAGGAATGCCGTTTATGACA 550
BSNT_04607___ 551 TGATCAATTGGTGGCTTGATAAAGGAATTGACGGATTTCGGGTGGATGCC 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31290___yu 551 TGATCAATTGGTGGCTTGATAAAGGAATTGACGGATTTCGGGTGGATGCC 600
BSNT_04607___ 601 ATTACGCATATTAAGAAAAAAGAAGGGCTTCCCGACATGCCGAATCCAAA 650
|||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||
BSU31290___yu 601 ATTACGCATATTAAGAAAAAAGAAGGGTTTCCTGACATGCCGAATCCAAA 650
BSNT_04607___ 651 GGGGCTGGACTATGTCCCTTCCTTTCCTTATCATATGAATGCTGACGGCA 700
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31290___yu 651 GGGACTGGACTATGTCCCTTCCTTTCCTTATCATATGAATGCTGACGGCA 700
BSNT_04607___ 701 TTATGGATTTGTTAACAGAGCTGAAGGAAAACACATTTTCCCGCTATCCG 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31290___yu 701 TTATGGATTTGTTAACAGAGCTGAAGGAAAACACATTTTCCCGCTATCCG 750
BSNT_04607___ 751 ATTATGACAGTTGGTGAAGCAAACGGCGTCGCTGCAAAAGAAGCAGCTGA 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31290___yu 751 ATTATGACAGTTGGTGAAGCAAACGGCGTCGCTGCAAAAGAAGCAGCTGA 800
BSNT_04607___ 801 TTGGGCTGGAGAAAAAAACGGCATATTCAGCATGATTTTTCAATTTGAGC 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31290___yu 801 TTGGGCTGGAGAAAAAAACGGCATATTCAGCATGATTTTTCAATTTGAGC 850
BSNT_04607___ 851 ATCTCGGCCTGTGGGATGTAGAGATCAATGAAAGTATTGATATCGTTGCA 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31290___yu 851 ATCTCGGCCTGTGGGATGTAGAGATCAATGAAAGTATTGATATCGTTGCA 900
BSNT_04607___ 901 TTTAAACGAATTTTAACTGACTGGCAGGACAGTCTGGAAGGGATCGGCTG 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31290___yu 901 TTTAAACGAATTTTAACTGACTGGCAGGACAGTCTGGAAGGGATCGGCTG 950
BSNT_04607___ 951 GAATGCTTTGTTTATGGAGAATCACGACCAGCCTCGTTCAGTTTCTGTGT 1000
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
BSU31290___yu 951 GAATGCTTTGTTTATGGAGAATCACGACCAGCCCCGTTCAGTTTCTGTGT 1000
BSNT_04607___ 1001 GGGGAGACGACGGAGTGTACCTGAAAGAAAGTGCAAAAGCGCTTTCCGCT 1050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31290___yu 1001 GGGGAGACGACGGAGTGTACCTGAAAGAAAGTGCAAAAGCGCTTTCCGCT 1050
BSNT_04607___ 1051 GTTTATTTTCTCATGAAAGGCACACCGTTTATTTATCAGGGACAGGAACT 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31290___yu 1051 GTTTATTTTCTCATGAAAGGCACACCGTTTATTTATCAGGGACAGGAACT 1100
BSNT_04607___ 1101 CGGGATGACGAACGTGGCTTTTCCATCTATTGAGGACTATGATGATGTCG 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31290___yu 1101 CGGGATGACGAACGTGGCTTTTCCATCTATTGAGGACTATGATGATGTCG 1150
BSNT_04607___ 1151 CGATGAAACGCCTGTATGAAACAAAAACAGCGAAAGGCACATCACACGAG 1200
|..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31290___yu 1151 CATTGAAACGCCTGTATGAAACAAAAACAGCGAAAGGCACATCACACGAG 1200
BSNT_04607___ 1201 GATGTGATGAAGATTGTCTGGAAAAAGGGAAGAGACAATTCGCGAACGCC 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31290___yu 1201 GATGTGATGAAGATTGTCTGGAAAAAGGGAAGAGACAATTCGCGAACGCC 1250
BSNT_04607___ 1251 GATGCAATGGAATGCTGGTCCATACGCCGGATTTTCTGAGGCCAAACCGT 1300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31290___yu 1251 GATGCAATGGAATGCTGGTCCATACGCCGGATTTTCTGAGGCCAAACCGT 1300
BSNT_04607___ 1301 GGATCGGAATCAATGACAATTACAAATGGCTGAATGCCGAGGCGCAAAAA 1350
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31290___yu 1301 GGATCGGAATCAATGAGAATTACAAATGGCTGAATGCCGAGGCGCAAAAA 1350
BSNT_04607___ 1351 AACGATAAAACATCCGTTTACCATTTTTACAAAAGCTTGATCAAGCTGCG 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31290___yu 1351 AACGATAAAACATCCGTTTACCATTTTTACAAAAGCTTGATCAAGCTGCG 1400
BSNT_04607___ 1401 CCAAACATATGATGTTTTTATTAACGGGACATACGAGCTCATTTTACCGG 1450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31290___yu 1401 CCAAACATATGATGTTTTTATTAACGGGACATACGAGCTCATTTTACCGG 1450
BSNT_04607___ 1451 AAGATCAGCAAATCTTTGCATATCTTCGGAAAAACGAGAGCCATACTGCA 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31290___yu 1451 AAGATCAGCAAATCTTTGCATATCTTCGGAAAAACGAGAGCCATACTGCA 1500
BSNT_04607___ 1501 CTGATTGCGGCCAATCTGACAGGAACACCGGCGTTGTTCAGGCACTCTGG 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31290___yu 1501 CTGATTGCGGCCAATCTGACAGGAACACCGGCGTTGTTCAGGCACTCTGG 1550
BSNT_04607___ 1551 ATTGCCATTGTCATCAGATGCACTCGTCTTGTCAAATATTGAAACAGAGC 1600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31290___yu 1551 ATTGCCATTGTCATCAGATGCACTCGTCTTGTCAAATATTGAAACAGAGC 1600
BSNT_04607___ 1601 CGCACAAGCATATGACATCAGTACTCTTAAAGCCGTATGAAGCAAGAATA 1650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU31290___yu 1601 CGCACAAGCATATGACATCAGTACTCTTAAAGCCGTATGAAGCAAGAATA 1650
BSNT_04607___ 1651 TATCTATGGTGCTAA 1665
|||||||||||||||
BSU31290___yu 1651 TATCTATGGTGCTAA 1665
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.