Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_04503 and BSU30980
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_04503 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:24:20
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_04503___glgB.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU30980___glgB.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_04503___glgB-BSU30980___glgB.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_04503___glgB-BSU30980___glgB.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_04503___glgB
# 2: BSU30980___glgB
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1884
# Identity: 1864/1884 (98.9%)
# Similarity: 1864/1884 (98.9%)
# Gaps: 0/1884 ( 0.0%)
# Score: 9240.0
#
#
#=======================================
BSNT_04503___ 1 ATGGCCGCTGCCAGCCCGACAGCACATGATGTTTATCTTTTTCACGAAGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30980___gl 1 ATGGCCGCTGCCAGCCCGACAGCACATGATGTTTATCTTTTTCACGAAGG 50
BSNT_04503___ 51 CAGTCTGTTTAAAAGCTATCAGCTGTTTGGCTCGCATTACCGCGAGCTGA 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30980___gl 51 CAGTCTGTTTAAAAGCTATCAGCTGTTTGGCTCGCATTACCGCGAGCTGA 100
BSNT_04503___ 101 ATGGCAAAAGCGGATATGAATTCTGTGTGTGGGCGCCTCATGCGTCGGAA 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30980___gl 101 ATGGCAAAAGCGGATATGAATTCTGTGTGTGGGCGCCTCATGCGTCGGAA 150
BSNT_04503___ 151 GTACGAGTGGCTGGAGATTTTAACAGCTGGTCTGGAGAAGAGCATGTGAT 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30980___gl 151 GTACGAGTGGCTGGAGATTTTAACAGCTGGTCTGGAGAAGAGCATGTGAT 200
BSNT_04503___ 201 GCACAGAGTGAATGATAATGGCATTTGGACGTTATTTATTCCAGGTATAG 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30980___gl 201 GCACAGAGTGAATGATAATGGCATTTGGACGTTATTTATTCCAGGTATAG 250
BSNT_04503___ 251 GAGAAAAGGAACGATATAAATATGAAATCGTGACGAATAACGGTGAGATC 300
||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||
BSU30980___gl 251 GAGAAAAGGAACGATATAAATACGAAATTGTGACGAATAACGGTGAGATC 300
BSNT_04503___ 301 AGGCTGAAGGCAGATCCATACGCTATTTATTCAGAAGTCAGACCAAACAC 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30980___gl 301 AGGCTGAAGGCAGATCCATACGCTATTTATTCAGAAGTCAGACCAAACAC 350
BSNT_04503___ 351 AGCGTCACTTACTTACGATTTGGAAGGATACAGCTGGCAAGATCAAAAAT 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30980___gl 351 AGCGTCACTTACTTACGATTTGGAAGGATACAGCTGGCAAGATCAAAAAT 400
BSNT_04503___ 401 GGCAAAAGAAACAGAAGGCTAAGACGCTGTATGAAAAACCTGTTTTCATT 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30980___gl 401 GGCAAAAGAAACAGAAGGCTAAGACGCTGTATGAAAAACCTGTTTTCATT 450
BSNT_04503___ 451 TATGAACTGCATCTTGGGTCTTGGAAGAAGCATTCTGATGGCAGGCATTA 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30980___gl 451 TATGAACTGCATCTTGGGTCTTGGAAGAAGCATTCTGATGGCAGGCATTA 500
BSNT_04503___ 501 TTCCTATATAGAATTAAGTCAGACGCTTATCCCTTATATCAAGGAGCATG 550
||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
BSU30980___gl 501 TTCCTATAAAGAATTAAGTCAGACGCTTATCCCTTATATCAAGAAGCATG 550
BSNT_04503___ 551 GGTTTACCCATATTGAACTGCTTCCGGTGTATGAGCATCCATATGATCGT 600
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
BSU30980___gl 551 GGTTTACCCATATTGAACTGCTTCCCGTGTATGAGCATCCATATGATCGT 600
BSNT_04503___ 601 TCATGGGGGTACCAAGGAACGGGGTATTACAGCCCGACAAGCAGGTTTGG 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30980___gl 601 TCATGGGGGTACCAAGGAACGGGGTATTACAGCCCGACAAGCAGGTTTGG 650
BSNT_04503___ 651 CACGCCGCATGATCTGATGAAGTTTGTTGATGAATGTCATCAACAAAATA 700
|.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
BSU30980___gl 651 CCCGCCGCATGATCTGATGAAGTTTGTGGATGAATGTCATCAACAAAATA 700
BSNT_04503___ 701 TCGGAGTCATTTTGGATTGGGTCCCCGGACATTTTTGTAAAGATGCACAT 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30980___gl 701 TCGGAGTCATTTTGGATTGGGTCCCCGGACATTTTTGTAAAGATGCACAT 750
BSNT_04503___ 751 GGCCTTTATATGTTTGATGGAGAACCGCTTTATGAATACAAAGAAGAACG 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30980___gl 751 GGCCTTTATATGTTTGATGGAGAACCGCTTTATGAATACAAAGAAGAACG 800
BSNT_04503___ 801 TGATCGGGAGAACTGGTTATGGGGCACGGCAAACTTTGACCTGGGAAAAC 850
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
BSU30980___gl 801 TGATCGGGAGAACTGGTTATGGGGCACGGCAAACTTTGACCTGGGGAAAC 850
BSNT_04503___ 851 CGGAAGTTCATAGTTTTTTAATTTCGAATGCGTTGTACTGGGCGGAATTC 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30980___gl 851 CGGAAGTTCATAGTTTTTTAATTTCGAATGCGTTGTACTGGGCGGAATTC 900
BSNT_04503___ 901 TATCATATAGATGGATTTAGGGTTGATGCAGTGGCTAATATCTTGTATTG 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30980___gl 901 TATCATATAGATGGATTTAGGGTTGATGCAGTGGCTAATATCTTGTATTG 950
BSNT_04503___ 951 GCCAAATCAGGATGAACGCCACACGAATCCATATGCTGTTGAGTTTTTAA 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
BSU30980___gl 951 GCCAAATCAGGATGAACGCCACACGAATCCATATGCTGTTGATTTTTTAA 1000
BSNT_04503___ 1001 AAAAACTCAATCAAACCATGAGAGAGGCATATCCTTATGTGATGATGATT 1050
||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||
BSU30980___gl 1001 AAAAACTCAATCAAACCATGAGAGAGGCATATCCCCATGTGATGATGATT 1050
BSNT_04503___ 1051 GCGGAAGATTCTACAGAATGGCCTCAAGTGACAGGTGCCGTTGAGGAAGG 1100
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30980___gl 1051 GCAGAAGATTCTACAGAATGGCCTCAAGTGACAGGTGCCGTTGAGGAAGG 1100
BSNT_04503___ 1101 GGGGCTTGGTTTTCATTATAAATGGAATATGGGATGGATGAATGACGTAC 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30980___gl 1101 GGGGCTTGGTTTTCATTATAAATGGAATATGGGATGGATGAATGACGTAC 1150
BSNT_04503___ 1151 TGAAATACATGGAGACGCCGCCCGAAGAAAGGCGGCATTGTCATCAGCTT 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30980___gl 1151 TGAAATACATGGAGACGCCGCCCGAAGAAAGGCGGCATTGTCATCAGCTT 1200
BSNT_04503___ 1201 ATCTCTTTTTCATTACTATATGCGTTTAGTGAACATTTTGTATTGCCGTT 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30980___gl 1201 ATCTCTTTTTCATTACTATATGCGTTTAGTGAACATTTTGTATTGCCGTT 1250
BSNT_04503___ 1251 TTCTCATGATGAAGTCGTATACGGAAAAAAATCACTTCTTAATAAAATGC 1300
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
BSU30980___gl 1251 TTCTCATGATGAAGTCGTATACGGAAAAAAATCACTTCTCAATAAAATGC 1300
BSNT_04503___ 1301 CTGGCGACTACTGGCAGAAGTTTGCCCAGTATCGGCTTTTGCTGGGCTAT 1350
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30980___gl 1301 CTGGCGACTACTGGCAGAAATTTGCCCAGTATCGGCTTTTGCTGGGCTAT 1350
BSNT_04503___ 1351 ATGACAGTGCATCCCGGAAAGAAATTGATCTTTATGGGATCAGAGTTTGC 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30980___gl 1351 ATGACAGTGCATCCCGGAAAGAAATTGATCTTTATGGGATCAGAGTTTGC 1400
BSNT_04503___ 1401 CCAATTTGATGAATGGAAAGATACAGAACAGCTTGATTGGTTTTTGGACT 1450
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30980___gl 1401 TCAATTTGATGAATGGAAAGATACAGAACAGCTTGATTGGTTTTTGGACT 1450
BSNT_04503___ 1451 CCTTCCCCATGCATCAGAAAGCCAGCGTTTTTACGCAAGACCTTCTCCGC 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
BSU30980___gl 1451 CCTTCCCCATGCATCAGAAAGCCAGCGTTTTTACGCAAGATCTTCTCCGC 1500
BSNT_04503___ 1501 TTTTACCAAAAAAGCAAAATCCTTTATGAGCATGACCATCGTGCACAATC 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30980___gl 1501 TTTTACCAAAAAAGCAAAATCCTTTATGAGCATGACCATCGTGCACAATC 1550
BSNT_04503___ 1551 ATTTGAATGGATTGATGTCCATAATGACGAACAATCAATCTTTTCTTTTA 1600
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30980___gl 1551 GTTTGAATGGATTGATGTCCATAATGACGAACAATCAATCTTTTCTTTTA 1600
BSNT_04503___ 1601 TTCGTTATGGCAAAAAGCACGGTGAGGCGCTTGTCATCATTTGTAATTTT 1650
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30980___gl 1601 TTCGTTATGGCCAAAAGCACGGTGAGGCGCTTGTCATCATTTGTAATTTT 1650
BSNT_04503___ 1651 ACACCCGTGGTCTATCATCAATATGATGTTGGAGTTCCTTTTTTTACTCA 1700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30980___gl 1651 ACACCCGTGGTCTATCATCAATATGATGTTGGAGTTCCTTTTTTTACTCA 1700
BSNT_04503___ 1701 ATACATTGAAGTGCTTAACAGTGACAGTGAAACATATGGAGGGTCAGGGC 1750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
BSU30980___gl 1701 ATACATTGAAGTGCTTAACAGTGACAGTGAAACATATGGAGGCTCAGGGC 1750
BSNT_04503___ 1751 AAATCAACAAAAAGCCGTTATCGGCTAAAAAGGGAGCACTTCATCATAAG 1800
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
BSU30980___gl 1751 AAATCAACAAAAAGCCGTTATCGGCTAAAAAGGGAGCACTTCATCATAAA 1800
BSNT_04503___ 1801 CCGTGTTATATCACGATGACCATCCCCCCTTACGGCATCTCGATTTTACG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30980___gl 1801 CCGTGTTATATCACGATGACCATCCCCCCTTACGGCATCTCGATTTTACG 1850
BSNT_04503___ 1851 GGCGGTTAAAAAAAGAGGAGAGATAAAAAGATGA 1884
||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30980___gl 1851 GGCGGTTAAAAAAAGAGGAGAGATAAAAAGATGA 1884
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.