Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_04500 and BSU30950
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_04500 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:24:19
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_04500___glgA.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU30950___glgA.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_04500___glgA-BSU30950___glgA.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_04500___glgA-BSU30950___glgA.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_04500___glgA
# 2: BSU30950___glgA
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1455
# Identity: 1422/1455 (97.7%)
# Similarity: 1422/1455 (97.7%)
# Gaps: 0/1455 ( 0.0%)
# Score: 6978.0
#
#
#=======================================
BSNT_04500___ 1 TTGAAGATATTACTTGCTGTGTCAGAATGCACCCCATTTGTTAAATCAGG 50
||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
BSU30950___gl 1 TTGAAGATATTATTTGCTGTGTCAGAATGCACCCCATTTGTGAAATCAGG 50
BSNT_04500___ 51 AGGTCTTGCCGATGTAGCAGGCGCTCTGCCAAAGGCACTTGCGCGATTAG 100
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||
BSU30950___gl 51 AGGTCTTGCCGATGTAGCAGGTGCTCTGCCAAAGGCGCTTGCGCGATTAG 100
BSNT_04500___ 101 GCAATGCAGTAGCTGTGATGCTGCCGAAGTACAGCCAAATACCTGAACCG 150
||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30950___gl 101 GCAATGAGGTAGCTGTGATGCTGCCGAAGTACAGCCAAATACCTGAACCG 150
BSNT_04500___ 151 TGGAAAAAGCGTATGAAAAAAAAGGCTGAGTGTACGGTAGCTGTCGGCTG 200
|||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||
BSU30950___gl 151 TGGAAAAAGCGTATGAAAAAACAGGCTGAGTGTACCGTAGCTGTCGGCTG 200
BSNT_04500___ 201 GCGTCAGCAATATTGCGGAATTGAACATATGGCCGAAGACGATGTGAATT 250
|||.|||||||||||||||||||||||||||||.||..|.||||||||||
BSU30950___gl 201 GCGGCAGCAATATTGCGGAATTGAACATATGGCAGAGAATGATGTGAATT 250
BSNT_04500___ 251 ATTACTTCATCGACAATGAGTACTATTTCAACAGGGATTCGTTGTACGGG 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30950___gl 251 ATTACTTCATCGACAATGAGTACTATTTCAACAGGGATTCGTTGTACGGG 300
BSNT_04500___ 301 CATTATGATGACGGTGAGCGGTTTGCCTATTTTTCAAGAGCTGTGCTGGA 350
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
BSU30950___gl 301 CATTATGATGACGGTGAGCGGTTTGCCTTTTTTTCAAGAGCTGTGCTGGA 350
BSNT_04500___ 351 GGCTGCCAAAGTTGTGAATGTTCCAGCCGATATTGTTCATACTCACGATT 400
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
BSU30950___gl 351 GGCTGCCAAAGTTGTGAATGTTCAAGCCGATATTGTTCATACTCACGATT 400
BSNT_04500___ 401 GGCATACAGCGATGGTCAATTATTTGCTGAAAGAGGAGTACAGAAAACAT 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30950___gl 401 GGCATACAGCGATGGTCAATTATTTGCTGAAAGAGGAGTACAGAAAACAT 450
BSNT_04500___ 451 CCTTTTTATGAACGGATGAAAAGCGTGCTCACGATCCACAACCTGCAGTT 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30950___gl 451 CCTTTTTATGAACGGATGAAAAGCGTGCTCACGATCCACAACCTGCAGTT 500
BSNT_04500___ 501 TCAAGGCATATTCCCTCCTGATGTCACACATGACTTGCTGGGTCTTGAGA 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30950___gl 501 TCAAGGCATATTCCCTCCTGATGTCACACATGACTTGCTGGGTCTTGAGA 550
BSNT_04500___ 551 TGGATCATTTTCATTATGAAAGGTTAGAATGCAATAGTTTTGTTAATTTT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||
BSU30950___gl 551 TGGATCATTTTCATTATGAAAGGTTAGAATGCAACGGATTTGTTAATTTT 600
BSNT_04500___ 601 ATGAAGGCGGGCATCATTGCGGCTGATCATGTGACGACTGTGAGCCCCAC 650
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
BSU30950___gl 601 ATGAAAGCGGGCATCATTGCGGCTGATCATGTGACAACTGTGAGCCCCAC 650
BSNT_04500___ 651 TTACAGAAATGAAATCTTGACGCCGTATTATGGTGAGCAGCTGGAGCAGG 700
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||.||||
BSU30950___gl 651 TTACAGAAATGAAATCATGACGCCGTATTATGGTGAGCAGTTGGAACAGG 700
BSNT_04500___ 701 TTTTGCAATATAGGGAAGATGATGTAACCGGCATATTAAATGGCATTGAT 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30950___gl 701 TTTTGCAATATAGGGAAGATGATGTAACCGGCATATTAAATGGCATTGAT 750
BSNT_04500___ 751 GATACGTTCTATCAGCCGAAAAGCGACCCTTATATAGAGGCGCAATACGA 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30950___gl 751 GATACGTTCTATCAGCCGAAAAGCGACCCTTATATAGAGGCGCAATACGA 800
BSNT_04500___ 801 TTCAGGGGATCTTGCATGCAAGCTGGAAAACAAAACGAAGCTTCAGCGGC 850
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
BSU30950___gl 801 TTCAGGGGATCTTGCATGCAAGCTGGAAAACAAAACGAAGCTTCAGCAGC 850
BSNT_04500___ 851 GGATGGGGCTTCCAGAGAAAAACGATATTCCGCTGATCAGTATGGTGACA 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30950___gl 851 GGATGGGGCTTCCAGAGAAAAACGATATTCCGCTGATCAGTATGGTGACA 900
BSNT_04500___ 901 AGGCTCACTAAACAAAAGGGGCTTGATCTGGTCCGCAGAATTATGCACGA 950
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
BSU30950___gl 901 AGGCTCACTAAACAAAAGGGGCTTGATCTTGTCCGCAGAATTATGCACGA 950
BSNT_04500___ 951 ACTTCTTGAGGAGCAAGACATACAGCTGGTTGTGCTGGGCACAGGAGAAC 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
BSU30950___gl 951 ACTTCTTGAGGAGCAAGACATACAGCTGGTTGTGCTAGGCACAGGAGAAC 1000
BSNT_04500___ 1001 GTGAATTTGAAGATTATTTCCGGTATGCAGAATTTGCTTTTCATGAGAAG 1050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30950___gl 1001 GTGAATTTGAAGATTATTTCCGGTATGCAGAATTTGCTTTTCATGAGAAG 1050
BSNT_04500___ 1051 TGCCGGGCTTATATCGGATTTGATGAGCCGCTAGCCCATCAAATTTATGC 1100
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30950___gl 1051 TGCCGGGCTTATATCGGGTTTGATGAGCCGCTAGCCCATCAAATTTATGC 1100
BSNT_04500___ 1101 GGGCTCTGATATGTTTTTGATGCCGTCGAAATTTGAGCCGTGCGGTTTGG 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30950___gl 1101 GGGCTCTGATATGTTTTTGATGCCGTCGAAATTTGAGCCGTGCGGTTTGG 1150
BSNT_04500___ 1151 GGCAGCTCATTGCTCTTCAATATGGCGCCATTCCGATTGTCAGGGAAACG 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30950___gl 1151 GGCAGCTCATTGCTCTTCAATATGGCGCCATTCCGATTGTCAGGGAAACG 1200
BSNT_04500___ 1201 GGCGGTCTTTACGACACTGTCCGTGCCTATCAGGAGGAAGAGGGAACGGG 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30950___gl 1201 GGCGGTCTTTACGACACTGTCCGTGCCTATCAGGAGGAAGAGGGAACGGG 1250
BSNT_04500___ 1251 CAATGGCTTTACGTTTTCCGCCTTTAATGCGCATGATTTGAAATTTACGA 1300
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
BSU30950___gl 1251 CAATGGCTTTACGTTTTCCGCCTTTAATGCGCATGATCTGAAATTTACGA 1300
BSNT_04500___ 1301 TTGAACGAGCGCTGGCGTTTTATCGCCAACAGGATGTATGGAAGAGCATC 1350
|.|||.|.||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||
BSU30950___gl 1301 TAGAAAGGGCGCTGTCGTTTTATTGCCAACAGGATGTATGGAAGAGCATC 1350
BSNT_04500___ 1351 GTGAAGACCGCTATGAATGCAGATTACAGCTGGGGGAAGTCGGCTAAAGA 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30950___gl 1351 GTGAAGACCGCTATGAATGCAGATTACAGCTGGGGGAAGTCGGCTAAAGA 1400
BSNT_04500___ 1401 GTATCAGCGTATTTTCGAGCAGGTGACAAGGAGTGGACGGGATGTTCTCG 1450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30950___gl 1401 GTATCAGCGTATTTTCGAGCAGGTGACAAGGAGTGGACGGGATGTTCTCG 1450
BSNT_04500___ 1451 AGTAA 1455
|||||
BSU30950___gl 1451 AGTAA 1455
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.