Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_04446 and BSU30530
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_04446 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:24:11
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_04446___ytnA.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU30530___ytnA.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_04446___ytnA-BSU30530___ytnA.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_04446___ytnA-BSU30530___ytnA.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_04446___ytnA
# 2: BSU30530___ytnA
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1392
# Identity: 1376/1392 (98.9%)
# Similarity: 1376/1392 (98.9%)
# Gaps: 0/1392 ( 0.0%)
# Score: 6816.0
#
#
#=======================================
BSNT_04446___ 1 ATGCAAAAACAAAAACAAGAGTTGCACCGCGGACTCGAAGAAAGGCATAT 50
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
BSU30530___yt 1 ATGCAAAAACAAAAACAAGAGCTGCACCGCGGACTCGAAGAAAGGCATAT 50
BSNT_04446___ 51 TTCTTTAATGTCTTTAGGAGCTGCTATAGGAGTAGGGTTGTTCCTCGGCT 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30530___yt 51 TTCTTTAATGTCTTTAGGAGCTGCTATAGGAGTAGGGTTGTTCCTCGGCT 100
BSNT_04446___ 101 CCGCATCAGCTATTCAATTAGCAGGGCCTGGTATTTTGGTAGCGTATGCC 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30530___yt 101 CCGCATCAGCTATTCAATTAGCAGGGCCTGGTATTTTGGTAGCGTATGCC 150
BSNT_04446___ 151 GCAAGCGGCCTGGTCATGTTTTTTATTATGAGAGCGCTTGGGGAAATGGC 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30530___yt 151 GCAAGCGGCCTGGTCATGTTTTTTATTATGAGAGCGCTTGGGGAAATGGC 200
BSNT_04446___ 201 TATTCAAAAACCGGTTGCAGGCTCCTTCAGCAGGTATGCGCGTGATTATT 250
.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30530___yt 201 CATTCAAAAACCGGTCGCAGGCTCCTTCAGCAGGTATGCGCGTGATTATT 250
BSNT_04446___ 251 TGGGACCGCTTGCAGGCTATTTAACAGGGTGGAACTACTGGTTTTTATGG 300
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
BSU30530___yt 251 TGGGACCGCTTGCAGGCTATTTAACAGGTTGGAACTACTGGTTTTTATGG 300
BSNT_04446___ 301 GTTGTCACCTGTATGGCCGAAATTACTGCTGTCGGCATCTATATGGGGTT 350
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
BSU30530___yt 301 GTTGTCACCTGTATGGCCGAAATCACTGCTGTCGGCATCTATATGGGGTT 350
BSNT_04446___ 351 CTGGTTTCCTGACGTGCCAAACTGGATTTGGGCATTATCGGCGCTGGTCA 400
|||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||
BSU30530___yt 351 CTGGTTTCCGGACGTGCCAAACTGGATTTGGGCGTTATCGGCACTGGTCA 400
BSNT_04446___ 401 TTATGACGGGTGTTAATTTCCTGGCTGTCAAAGCTTACGGTGAGCTGGAA 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
BSU30530___yt 401 TTATGACGGGTGTTAATTTCCTGGCTGTCAAAGCTTACGGCGAGCTGGAA 450
BSNT_04446___ 451 TTTTGGTTCGCATTGATTAAAATTGTTGCGATCTTATCCATGATTGCAGT 500
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
BSU30530___yt 451 TTTTGGTTCGCATTGATTAAAATTGTTGCAATCTTATCCATGATTGCTGT 500
BSNT_04446___ 501 CGGTTTATTGATGATTATTGCAGGAGTCGGCAATGGGGGCATTGCCACCG 550
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
BSU30530___yt 501 CGGTTTATTGATGATTATTGCAGGAGTCGGCAATGGGGGCATTGCAACCG 550
BSNT_04446___ 551 GAATCAGTAATTTGTGGAACAACGGAGGATTTTTCCCTCATGGATTAAAA 600
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30530___yt 551 GAATCAGCAATTTGTGGAACAACGGAGGATTTTTCCCTCATGGATTAAAA 600
BSNT_04446___ 601 GGGGTTCTATTGTCTCTTCAAATGGTCATGTTCGCCTATTTAGGGATTGA 650
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30530___yt 601 GGGGTTTTATTGTCTCTTCAAATGGTCATGTTCGCCTATTTAGGGATTGA 650
BSNT_04446___ 651 AATGATCGGGGTGACGGCTGGCGAAGTAAAAAACCCGCAAAAATCGTTAG 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30530___yt 651 AATGATCGGGGTGACGGCTGGCGAAGTAAAAAACCCGCAAAAATCGTTAG 700
BSNT_04446___ 701 CCAAAGCAATCGATACAGTATTTTGGCGGATTTTGATTTTTTATGTAGGC 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30530___yt 701 CCAAAGCAATCGATACAGTATTTTGGCGGATTTTGATTTTTTATGTAGGC 750
BSNT_04446___ 751 GCTTTATTTGTCATTATGTCTATTTATCCGTGGCAGGAAATTGGCTCTCA 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30530___yt 751 GCTTTATTTGTCATTATGTCTATTTATCCGTGGCAGGAAATTGGCTCTCA 800
BSNT_04446___ 801 AGGAAGTCCATTTGTTCTCACATTTCAAAAAGTGGGCATTCCATCGGCCG 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30530___yt 801 AGGAAGTCCATTTGTTCTCACATTTCAAAAAGTGGGCATTCCATCGGCCG 850
BSNT_04446___ 851 CAGGTATCATTAACTTTGTCGTGTTGACAGCCGCGCTGTCTTCATGCAAC 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30530___yt 851 CAGGTATCATTAACTTTGTCGTGTTGACAGCCGCGCTGTCTTCATGCAAC 900
BSNT_04446___ 901 AGCGGTATTTTCAGCACAGGGCGGATGCTGTTTAACTTGGCGGAACAGAA 950
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30530___yt 901 AGTGGTATTTTCAGCACAGGGCGGATGCTGTTTAACTTGGCGGAACAGAA 950
BSNT_04446___ 951 AGAGGCGCCACAAGCATATGGTCAGCTGACGAAAGGCGGCATCCCGGGTA 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30530___yt 951 AGAGGCGCCACAAGCATATGGTCAGCTGACGAAAGGCGGCATCCCGGGTA 1000
BSNT_04446___ 1001 AAGCTGTTCTGGCTTCAGCGGGCGCTTTATTAGTCGGAGTGCTGTTAAAC 1050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30530___yt 1001 AAGCTGTTCTGGCTTCAGCGGGCGCTTTATTAGTCGGAGTGCTGTTAAAC 1050
BSNT_04446___ 1051 TATGTTGTCCCTGCGAAGGTATTTACTTGGGTTACAAGTATTGCGACGTT 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30530___yt 1051 TATGTTGTCCCTGCGAAGGTATTTACTTGGGTTACAAGTATTGCGACGTT 1100
BSNT_04446___ 1101 CGGAGCGATTTGGACGTGGGCAATCATTTTGCTTTCTCAAATAAAATACA 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30530___yt 1101 CGGAGCGATTTGGACGTGGGCAATCATTTTGCTTTCTCAAATAAAATACA 1150
BSNT_04446___ 1151 GGAAAAGTTTGAAGCCGGAAGAAAAGAAACAATTAAAGTACAAAATGCCT 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30530___yt 1151 GGAAAAGTTTGAAGCCGGAAGAAAAGAAACAATTAAAGTACAAAATGCCT 1200
BSNT_04446___ 1201 TTATTTCCGTTTACGTCTTATGTGTCATTGGCATTTCTAGCATTCGTCGT 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30530___yt 1201 TTATTTCCGTTTACGTCTTATGTGTCATTGGCATTTCTAGCATTCGTCGT 1250
BSNT_04446___ 1251 CATTCTTATGGCTTACAGCCCTGATACAAGAGTAGCCGTGATTATCGGGC 1300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30530___yt 1251 CATTCTTATGGCTTACAGCCCTGATACAAGAGTAGCCGTGATTATCGGGC 1300
BSNT_04446___ 1301 CGATATGGTTTCTCATCTTGCTGGCTGTGTACTATGGAAAAGGGTTTCAT 1350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30530___yt 1301 CGATATGGTTTCTCATCTTGCTGGCTGTGTACTATGGAAAAGGGTTTCAT 1350
BSNT_04446___ 1351 AAAAAAAATGCAGCTGCTGCCAGCGAACGAAATATCAGCTGA 1392
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30530___yt 1351 AAAAAAAATGCGGCTGCTGCCAGCGAACGAAATATCAGCTGA 1392
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.