Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_04417 and BSU30320
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_04417 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:24:07
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_04417___leuS.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU30320___leuS.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_04417___leuS-BSU30320___leuS.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_04417___leuS-BSU30320___leuS.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_04417___leuS
# 2: BSU30320___leuS
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 2415
# Identity: 2396/2415 (99.2%)
# Similarity: 2396/2415 (99.2%)
# Gaps: 0/2415 ( 0.0%)
# Score: 11904.0
#
#
#=======================================
BSNT_04417___ 1 TTGAGTTTTCAGCACAAAGAGATAGAAAAGAAATGGCAAACATATTGGCT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
BSU30320___le 1 TTGAGTTTTCAGCACAAAGAGATAGAAAAGAAATGGCAGACATATTGGCT 50
BSNT_04417___ 51 TGAAAACAAAACATTTGCCACTCTTGATAATAATGAAAAACAAAAATTCT 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
BSU30320___le 51 TGAAAACAAAACATTTGCCACTCTTGATAATAATGAAAAACAAAAATTTT 100
BSNT_04417___ 101 ACGCGCTGGACATGTTTCCTTACCCGTCTGGAGCTGGGTTGCACGTCGGC 150
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 101 ACGCGCTGGACATGTTTCCTTATCCGTCTGGAGCTGGGTTGCACGTCGGC 150
BSNT_04417___ 151 CATCCTGAAGGATACACAGCTACGGATATTCTGTCCCGCATGAAGCGCAT 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 151 CATCCTGAAGGATACACAGCTACGGATATTCTGTCCCGCATGAAGCGCAT 200
BSNT_04417___ 201 GCAGGGCTATGATGTCCTTCATCCAATGGGCTGGGACGCATTCGGCCTGC 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 201 GCAGGGCTATGATGTCCTTCATCCAATGGGCTGGGACGCATTCGGCCTGC 250
BSNT_04417___ 251 CAGCTGAACAATACGCGCTTGACACAGGGAACGACCCCGCTGTGTTTACG 300
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 251 CAGCTGAACAGTACGCGCTTGACACAGGGAACGACCCCGCTGTGTTTACG 300
BSNT_04417___ 301 AAGCAGAATATTGATAACTTCCGCCGCCAAATTCAAGCGCTTGGCTTCTC 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 301 AAGCAGAATATTGATAACTTCCGCCGCCAAATTCAAGCGCTTGGCTTCTC 350
BSNT_04417___ 351 ATATGACTGGGATCGCGAAATCAATACGACTGACCCTGAATACTATAAAT 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 351 ATATGACTGGGATCGCGAAATCAATACGACTGACCCTGAATACTATAAAT 400
BSNT_04417___ 401 GGACGCAATGGATTTTCTTAAAGCTATACGAAAAAGGCCTTGCTTACGTT 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 401 GGACGCAATGGATTTTCTTAAAGCTATACGAAAAAGGCCTTGCTTACGTT 450
BSNT_04417___ 451 GACGAAGTGCCTGTAAACTGGTGCCCTGCGCTCGGTACTGTTCTTGCCAA 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 451 GACGAAGTGCCTGTAAACTGGTGCCCTGCGCTCGGTACTGTTCTTGCCAA 500
BSNT_04417___ 501 CGAAGAAGTCATTGACGGCAAGAGCGAACGCGGCGGCCATCCGGTAGAGA 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 501 CGAAGAAGTCATTGACGGCAAGAGCGAACGCGGCGGCCATCCGGTAGAGA 550
BSNT_04417___ 551 GACGCCCAATGAAGCAGTGGATGCTGAAAATCACCGCTTATGCGGACAGG 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 551 GACGCCCAATGAAGCAGTGGATGCTGAAAATCACCGCTTATGCGGACAGG 600
BSNT_04417___ 601 CTCCTTGAGGACTTGGAAGAGCTTGATTGGCCGGAAAGCATTAAAGATAT 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 601 CTCCTTGAGGACTTGGAAGAGCTTGATTGGCCGGAAAGCATTAAAGATAT 650
BSNT_04417___ 651 GCAGCGCAACTGGATCGGCCGTTCGGAAGGCGCTCACGTTCATTTTGCTA 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 651 GCAGCGCAACTGGATCGGCCGTTCGGAAGGCGCTCACGTTCATTTTGCTA 700
BSNT_04417___ 701 TAGATGGACATGATGATTCCTTTACGGTGTTTACAACAAGACCAGATACG 750
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 701 TAGATGGACATGATGATTCCTTTACAGTGTTTACAACAAGACCAGATACG 750
BSNT_04417___ 751 CTGTTTGGCGCTACATACACTGTCCTTGCCCCGGAACACGCATTGGTGGA 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 751 CTGTTTGGCGCTACATACACTGTCCTTGCCCCGGAACACGCATTGGTGGA 800
BSNT_04417___ 801 AAACATCACAACGGCAGAGCAAAAAGAAGCTGTTGAAGCTTATATCAAAG 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 801 AAACATCACAACGGCAGAGCAAAAAGAAGCTGTTGAAGCTTATATCAAAG 850
BSNT_04417___ 851 AAATTCAATCAAAGAGTGACCTAGAACGCACAGATCTTGCGAAAACAAAG 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 851 AAATTCAATCAAAGAGTGACCTAGAACGCACAGATCTTGCGAAAACAAAG 900
BSNT_04417___ 901 ACAGGCGTATTTACAGGAGCGTATGCGATCAATCCTGTAAACGGAGAAAA 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 901 ACAGGCGTATTTACAGGAGCGTATGCGATCAATCCTGTAAACGGAGAAAA 950
BSNT_04417___ 951 ACTGCCGATTTGGATTGCGGATTATGTTCTTGCATCATACGGAACAGGTG 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 951 ACTGCCGATTTGGATTGCGGATTATGTTCTTGCATCATACGGAACAGGTG 1000
BSNT_04417___ 1001 CTGTCATGGCAGTTCCTGGACACGATGAGCGTGATTTTGAATTCGCCAAA 1050
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 1001 CTGTCATGGCAGTTCCAGGACACGATGAGCGTGATTTTGAATTCGCCAAA 1050
BSNT_04417___ 1051 ACATTCGGCCTTCCGGTGAAGGAAGTCGTAAAAGGCGGGAACGTTGAGGA 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 1051 ACATTCGGCCTTCCGGTGAAGGAAGTCGTAAAAGGCGGGAACGTTGAGGA 1100
BSNT_04417___ 1101 AGCAGCCTATACTGGCGACGGCGAGCACGTGAACTCTGATTTCCTGAACG 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 1101 AGCAGCCTATACTGGCGACGGCGAGCACGTGAACTCTGATTTCCTGAACG 1150
BSNT_04417___ 1151 GCCTTCACAAACAGGAAGCGATTGAGAAAGTGATCGCTTGGCTGGAAGAA 1200
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 1151 GCCTTCACAAACAGGAAGCGATTGAAAAAGTGATCGCTTGGCTGGAAGAA 1200
BSNT_04417___ 1201 ACGAAAAACGGTGAGAAGAAAGTGACGTACCGTCTTCGTGACTGGCTCTT 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 1201 ACGAAAAACGGTGAGAAGAAAGTGACGTACCGTCTTCGTGACTGGCTCTT 1250
BSNT_04417___ 1251 CAGCCGCCAGCGTTATTGGGGCGAGCCGATTCCGGTCATTCATTGGGAAG 1300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 1251 CAGCCGCCAGCGTTATTGGGGCGAGCCGATTCCGGTCATTCATTGGGAAG 1300
BSNT_04417___ 1301 ACGGAACGTCAACAGCTGTCCCTGAAGAGGAGCTGCCGCTGATTTTGCCG 1350
||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.
BSU30320___le 1301 ACGGAACGTCAACAGCTGTCCCGGAAGAGGAGCTGCCGCTGATTTTGCCA 1350
BSNT_04417___ 1351 AAAACGGATGAAATCAAACCGAGCGGAACGGGCGAATCACCGCTTGCGAA 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 1351 AAAACGGATGAAATCAAACCGAGCGGAACGGGCGAATCACCGCTTGCGAA 1400
BSNT_04417___ 1401 CATTAAAGAGTGGGTGGAAGTCACAGACCCTGAGACAGGGAAAAAAGGAA 1450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 1401 CATTAAAGAGTGGGTGGAAGTCACAGACCCTGAGACAGGGAAAAAAGGAA 1450
BSNT_04417___ 1451 GAAGAGAAACGAATACAATGCCGCAATGGGCGGGAAGCTGCTGGTATTTC 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 1451 GAAGAGAAACGAATACAATGCCGCAATGGGCGGGAAGCTGCTGGTATTTC 1500
BSNT_04417___ 1501 TTGCGCTATATTGATCCGCACAATCCGGATCAGCTGGCATCACCAGAAAA 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 1501 TTGCGCTATATTGATCCGCACAATCCGGATCAGCTGGCATCACCAGAAAA 1550
BSNT_04417___ 1551 ATTGGAAAAATGGCTTCCGGTCGATATGTATATCGGCGGTGCAGAGCATG 1600
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
BSU30320___le 1551 ATTGGAAAAATGGCTTCCGGTCGATATGTATATCGGCGGTGCAGAACATG 1600
BSNT_04417___ 1601 CCGTGCTTCACCTTCTGTATGCCCGCTTCTGGCATAAGTTCCTTTATGAT 1650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 1601 CCGTGCTTCACCTTCTGTATGCCCGCTTCTGGCATAAGTTCCTTTATGAT 1650
BSNT_04417___ 1651 ATCGGCGTAGTGCCGACGAAAGAACCGTTCCAAAAGCTGTACAACCAAGG 1700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 1651 ATCGGCGTAGTGCCGACGAAAGAACCGTTCCAAAAGCTGTACAACCAAGG 1700
BSNT_04417___ 1701 AATGATTCTCGGTGAAAATAACGAAAAAATGAGTAAATCTAAAGGGAACG 1750
||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 1701 AATGATTCTCGGCGAAAACAACGAAAAAATGAGTAAATCTAAAGGGAACG 1750
BSNT_04417___ 1751 TTGTCAACCCTGACGAAATCGTGGCCTCTCACGGTGCTGATACGCTGAGA 1800
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 1751 TTGTCAATCCTGACGAAATCGTGGCCTCTCACGGTGCTGATACGCTGAGA 1800
BSNT_04417___ 1801 TTGTACGAAATGTTCATGGGACCTCTTGATGCTTCAATCGCCTGGTCTGA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 1801 TTGTACGAAATGTTCATGGGACCTCTTGATGCTTCAATCGCCTGGTCTGA 1850
BSNT_04417___ 1851 ATCAGGATTAGACGGTGCGCGCCGTTTCCTTGACCGTGTATGGCGCCTAT 1900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 1851 ATCAGGATTAGACGGTGCGCGCCGTTTCCTTGACCGTGTATGGCGCCTAT 1900
BSNT_04417___ 1901 TTATTGAAGACAGCGGTGAGCTTAATGGAAAAATCGTTGAAGGCGCTGGT 1950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
BSU30320___le 1901 TTATTGAAGACAGCGGTGAGCTTAATGGAAAAATCGTTGAAGGCGCGGGT 1950
BSNT_04417___ 1951 GAAACATTGGAGCGCGTCTATCATGAAACGGTTATGAAAGTCACAGACCA 2000
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
BSU30320___le 1951 GAAACATTGGAGCGCGTCTATCATGAAACGGTCATGAAAGTCACAGACCA 2000
BSNT_04417___ 2001 TTATGAAGGCCTTCGTTTCAACACAGGTATTTCCCAGCTGATGGTCTTTA 2050
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 2001 TTATGAAGGCCTTCGTTTCAACACGGGTATTTCCCAGCTGATGGTCTTTA 2050
BSNT_04417___ 2051 TTAATGAAGCTTATAAAGCAACAGAACTGCCGAAAGAATATATGGAAGGC 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 2051 TTAATGAAGCTTATAAAGCAACAGAACTGCCGAAAGAATATATGGAAGGC 2100
BSNT_04417___ 2101 TTCGTGAAGCTTCTTTCTCCTGTCGCGCCACACTTAGCGGAAGAGCTTTG 2150
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
BSU30320___le 2101 TTCGTGAAGCTTCTTTCTCCTGTCGCGCCACACTTAGCGGAAGAGCTATG 2150
BSNT_04417___ 2151 GGAGAAGCTTGGCCATTCCGGCACAATTGCCTACGAAGCTTGGCCTGTAT 2200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 2151 GGAGAAGCTTGGCCATTCCGGCACAATTGCCTACGAAGCTTGGCCTGTAT 2200
BSNT_04417___ 2201 ATGATGAAACAAAACTTGTGGATGATGAAGTTGAAATCGTTGTTCAGCTG 2250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 2201 ATGATGAAACAAAACTTGTGGATGATGAAGTTGAAATCGTTGTTCAGCTG 2250
BSNT_04417___ 2251 AACGGAAAAGTAAAAGCGAAATTACAGGTTCCTGCCGATGCAACGAAAGA 2300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 2251 AACGGAAAAGTAAAAGCGAAATTACAGGTTCCTGCCGATGCAACGAAAGA 2300
BSNT_04417___ 2301 ACAGCTGGAACAGCTTGCTCAAGCAGATGAAAAGGTCAAAGAGCAGCTTG 2350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU30320___le 2301 ACAGCTGGAACAGCTTGCTCAAGCAGATGAAAAGGTCAAAGAGCAGCTTG 2350
BSNT_04417___ 2351 AAGGCAAAACGATTCGGAAAATCATCGCGGTGCCTGGCACGCTTGTCAAT 2400
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||
BSU30320___le 2351 AAGGCAAAACGATTCGGAAAATCATCGCGGTGCCTGGGAAGCTTGTCAAT 2400
BSNT_04417___ 2401 ATTGTGGCAAACTAA 2415
|||||||||||||||
BSU30320___le 2401 ATTGTGGCAAACTAA 2415
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.