Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_04304 and BSU29550
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_04304 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:23:52
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_04304___ytcJ.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU29550___ytcJ.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_04304___ytcJ-BSU29550___ytcJ.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_04304___ytcJ-BSU29550___ytcJ.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_04304___ytcJ
# 2: BSU29550___ytcJ
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1590
# Identity: 1570/1590 (98.7%)
# Similarity: 1570/1590 (98.7%)
# Gaps: 0/1590 ( 0.0%)
# Score: 7770.0
#
#
#=======================================
BSNT_04304___ 1 ATGAAGGCGATATGGCACGGCGGTTTCATTTATACGATGCTCGAAGAAGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29550___yt 1 ATGAAGGCGATATGGCACGGCGGTTTCATTTATACGATGCTCGAAGAAGG 50
BSNT_04304___ 51 CGATCGGACTGAGGCAGTTTATGTTGAGGATGGTGTTATAAAAGGCACCG 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29550___yt 51 CGATCGGACTGAGGCAGTTTATGTTGAGGATGGTGTTATAAAAGGCACCG 100
BSNT_04304___ 101 GCAGCTATGAACGTTTGAAGGAAAAGTACGGGTCACCGGAAACAGAAGAA 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
BSU29550___yt 101 GCAGCTATGAACGTTTGAAGGAAAAGTACGGGTCGCCGGAAACAGAAGAA 150
BSNT_04304___ 151 ATCAGCCTGAACGGTGCAGTGATGTTCCCCGGTTTTGTTGACAGCCACCT 200
||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
BSU29550___yt 151 ATCAGCCTGAACGGAGCAGTGATGTTCCCCGGTTTTGTTGACAGCCATCT 200
BSNT_04304___ 201 ACATTTGATCGGCCACGGTGAGAAACAGCTTCAGCTCGATCTGTCCGCAC 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29550___yt 201 ACATTTGATCGGCCACGGTGAGAAACAGCTTCAGCTCGATCTGTCCGCAC 250
BSNT_04304___ 251 TGACGTCGAAAGATGCAATTTTACAGGCTGCGAAGGAAAGAGAGCGGCAG 300
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29550___yt 251 TGACGTCGAAAGATTCAATTTTACAGGCTGCGAAGGAAAGAGAGCGGCAG 300
BSNT_04304___ 301 CTTCCTAAAAACGATTGGCTCATTGGAGAGGGCTGGAATGAAAATCAGTT 350
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
BSU29550___yt 301 CTTCCTAAAAACGATTGGCTCATTGGAGAAGGCTGGAATGAAAATCAGTT 350
BSNT_04304___ 351 TGAGACACCTGACTACTTGACTAAGCATGATCTTGATCGCCTGTTTCCAG 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
BSU29550___yt 351 TGAGACACCTGACTACTTGACTAAGCATGATCTTGATCGCCTGTTTCCTG 400
BSNT_04304___ 401 ACAGACCCGTCTTGCTCAAGCGTATATGCCGGCATGCAATAGCTGTCAAT 450
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29550___yt 401 ACAGGCCCGTCTTGCTCAAGCGTATATGCCGGCATGCAATAGCTGTCAAT 450
BSNT_04304___ 451 TCTGCGGCTCTTCAAGCAGCGGGAATTTCAAGAAATACTCCTGACCCTGA 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
BSU29550___yt 451 TCTGCGGCTCTTCAAGCAGCGGGAATTTCAAGAAATACTCCTGATCCTGA 500
BSNT_04304___ 501 CGGCGGAGTCATCGTAAAAGATGCAAATGGAGAGCCGTCCGGACTCCTGT 550
||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||
BSU29550___yt 501 CGGCGGAGTCATCGTAAAAGATGCAAATGGCGAGCCGACCGGACTCCTGT 550
BSNT_04304___ 551 TTGATAAGGCGCAGGATTTGATTCTGAAGGCTGTCCCGCCAGTCTCTCAA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
BSU29550___yt 551 TTGATAAGGCGCAGGATTTGATTCTGAAGGCTGTCCCGCCAGTCTCCCAG 600
BSNT_04304___ 601 CACTATGTTGATGAGGCATTAACGGCTGCAATAAAGGATTGCTGGACAAA 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29550___yt 601 CACTATGTTGATGAGGCATTAACGGCTGCAATAAAGGATTGCTGGACAAA 650
BSNT_04304___ 651 AGGCCTGACGGGCGGTCATTCGGAAGACTTGTCCTATTATGGTGATGTTT 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29550___yt 651 AGGCCTGACGGGCGGTCATTCGGAAGACTTGTCCTATTATGGTGATGTTT 700
BSNT_04304___ 701 CGGTGCCGATGAAAGCTTATGAGAAAGCTGTTGCTGGCGGAAAGTATCCG 750
||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||
BSU29550___yt 701 CGGTGCCGATGAAAGCTTATGAGAAAGCTGCCGCTGGCGGAAAGTATCCG 750
BSNT_04304___ 751 TTTCGCTGTCATTTGCTCGTTCATCATGAAGCGGTCGATCGATGGGAGCA 800
||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
BSU29550___yt 751 TTTCGCTGCCATTTGCTCGTTCATCATGAAGCTGTCGATCGATGGGAGCA 800
BSNT_04304___ 801 GCTGGATAAGCCGTCCGGCCCGTATGTGGAGTTCGGTGCTATGAAAATCT 850
||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29550___yt 801 GCTGGAGAAGCTGTCCGGCCCGTATGTGGAGTTCGGTGCTATGAAAATCT 850
BSNT_04304___ 851 TTGCGGACGGGGCGCTTGGCGGGAGAACGGCTTTATTGAAAGAACCATAT 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29550___yt 851 TTGCGGACGGGGCGCTTGGCGGGAGAACGGCTTTATTGAAAGAACCATAT 900
BSNT_04304___ 901 CAGGATGATCCATCAACAAATGGTGTTCAGGTTCACGATGACGAAACCCT 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29550___yt 901 CAGGATGATCCATCAACAAATGGTGTTCAGGTTCACGATGACGAAACCCT 950
BSNT_04304___ 951 TGGCCGGCTCATTCGCAAAGCGAGAGAAAAAGGGATGGAGGTTGCTGTTC 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29550___yt 951 TGGCCGGCTCATTCGCAAAGCGAGAGAAAAAGGGATGGAGGTTGCTGTTC 1000
BSNT_04304___ 1001 ATGCAATCGGCGATCTTGCTTTTGAAAAAGTGCTGAACGCAATAGAAAAG 1050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29550___yt 1001 ATGCAATCGGCGATCTTGCTTTTGAAAAAGTGCTGAACGCAATAGAAAAG 1050
BSNT_04304___ 1051 CATCCGCCCAAAAACGGCCGGCATGATCGGCTTATTCATGCCCAAGTGCT 1100
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
BSU29550___yt 1051 CATCCGCCCAAAAACGGCCGGCATGATCGGCTTATTCATGCTCAAGTGCT 1100
BSNT_04304___ 1101 TGATAACGAATTAATCGAGAGAGCAGCACGCATGCCGATCGCACTTGACC 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29550___yt 1101 TGATAACGAATTAATCGAGAGAGCAGCACGCATGCCGATCGCACTTGACC 1150
BSNT_04304___ 1151 TTCAGCCGCACTTCGTTGCAAGCGACTTTCCGTGGGTCATTGACCGTCTC 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29550___yt 1151 TTCAGCCGCACTTCGTTGCAAGCGACTTTCCGTGGGTCATTGACCGTCTC 1200
BSNT_04304___ 1201 GGAAAAGACCGGATGAAGACTGCATTTGCCTGGAAAACCCTCATATCTAA 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29550___yt 1201 GGAAAAGACCGGATGAAGACTGCATTTGCCTGGAAAACCCTCATATCTAA 1250
BSNT_04304___ 1251 AGGCATTTTATGCGCGGGCGGTTCAGACGCCCCGATTGAGCCTGTTGATC 1300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
BSU29550___yt 1251 AGGCATTTTATGCGCGGGCGGTTCAGACGCCCCGATTGAGCCTGTTGACC 1300
BSNT_04304___ 1301 CGCTTCTAGGGATCCAGTCCGCGGTCCTCCGGAAAAGCAGTCATGAGCAA 1350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29550___yt 1301 CGCTTCTAGGGATCCAGTCCGCGGTCCTCCGGAAAAGCAGTCATGAGCAA 1350
BSNT_04304___ 1351 AACGGGCCAAGCTATAATGAAAGTGAATGTTTACCTGTATATGAAGCGAT 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29550___yt 1351 AACGGGCCAAGCTATAATGAAAGTGAATGTTTACCTGTATATGAAGCGAT 1400
BSNT_04304___ 1401 AAAGCTTTATACAGAAGGTAGCGCCGGTATCATTTATAAAGAGAAGTCAC 1450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29550___yt 1401 AAAGCTTTATACAGAAGGTAGCGCCGGTATCATTTATAAAGAGAAGTCAC 1450
BSNT_04304___ 1451 GCGGAAAAATTGCGGAAGGCTATGACGCGGATTTTACAGTTCTCAGTGGT 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29550___yt 1451 GCGGAAAAATTGCGGAAGGCTATGACGCGGATTTTACAGTTCTCAGTGGT 1500
BSNT_04304___ 1501 GATCCGTTTGCCATTGACCCCGCACAGCTTCATCTTTTAGAGATTAAAAA 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29550___yt 1501 GATCCGTTTGCCATTGACCCCGCACAGCTTCATCTTTTAGAGATTAAAAA 1550
BSNT_04304___ 1551 AACCGTGATTAACGGCCAGATTGTATATGAGAAATCATAA 1590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29550___yt 1551 AACCGTGATTAACGGCCAGATTGTATATGAGAAATCATAA 1590
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.