Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_04263 and BSU29180
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_04263 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:23:47
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_04263___pyk.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU29180___pyk.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_04263___pyk-BSU29180___pyk.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_04263___pyk-BSU29180___pyk.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_04263___pyk
# 2: BSU29180___pyk
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1758
# Identity: 1747/1758 (99.4%)
# Similarity: 1747/1758 (99.4%)
# Gaps: 0/1758 ( 0.0%)
# Score: 8691.0
#
#
#=======================================
BSNT_04263___ 1 ATGAGAAAAACTAAAATTGTTTGTACCATCGGTCCGGCAAGTGAAAGTAT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py 1 ATGAGAAAAACTAAAATTGTTTGTACCATCGGTCCGGCAAGTGAAAGTAT 50
BSNT_04263___ 51 TGAAATGCTTACGAAATTAATGGAGTCAGGAATGAACGTGGCTCGATTAA 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py 51 TGAAATGCTTACGAAATTAATGGAGTCAGGAATGAACGTGGCTCGATTAA 100
BSNT_04263___ 101 ACTTTTCTCACGGAGATTTTGAGGAACACGGTGCAAGAATTAAAAATATC 150
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py 101 ACTTTTCTCACGGAGATTTTGAGGAGCACGGTGCAAGAATTAAAAATATC 150
BSNT_04263___ 151 CGCGAAGCAAGTAAAAAACTTGGCAAGAACGTTGGAATTCTGCTTGATAC 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py 151 CGCGAAGCAAGTAAAAAACTTGGCAAGAACGTTGGAATTCTGCTTGATAC 200
BSNT_04263___ 201 AAAAGGTCCTGAAATCCGCACACATACAATGGAAAACGGCGGTATTGAGC 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py 201 AAAAGGTCCTGAAATCCGCACACATACAATGGAAAACGGCGGTATTGAGC 250
BSNT_04263___ 251 TTGAAACAGGCAAAGAGCTCATTATTTCAATGGACGAGGTTGTAGGAACA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py 251 TTGAAACAGGCAAAGAGCTCATTATTTCAATGGACGAGGTTGTAGGAACA 300
BSNT_04263___ 301 ACAGATAAAATTTCAGTGACATATGAAGGTTTAGTCCATGACGTTGAACA 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py 301 ACAGATAAAATTTCAGTGACATATGAAGGTTTAGTCCATGACGTTGAACA 350
BSNT_04263___ 351 AGGTTCAACGATTCTGTTAGATGACGGCCTTATCGGTCTTGAGGTACTTG 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py 351 AGGTTCAACGATTCTGTTAGATGACGGCCTTATCGGTCTTGAGGTACTTG 400
BSNT_04263___ 401 ATGTAGATGCCGCTAAACGCGAAATCAAAACAAAAGTATTAAACAACGGA 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py 401 ATGTAGATGCCGCTAAACGCGAAATCAAAACAAAAGTATTAAACAACGGA 450
BSNT_04263___ 451 ACACTCAAAAATAAAAAAGGTGTTAACGTACCGGGCGTAAGTGTCAATCT 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py 451 ACACTCAAAAATAAAAAAGGTGTTAACGTACCGGGCGTAAGTGTCAATCT 500
BSNT_04263___ 501 TCCGGGTATTACTGAAAAGGATGCGCGAGACATCGTTTTCGGTATTGAGC 550
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py 501 TCCGGGGATTACTGAAAAGGATGCGCGAGACATCGTTTTCGGTATTGAGC 550
BSNT_04263___ 551 AAGGAGTAGACTTCATCGCACCATCTTTCATTCGACGTTCTACGGATGTG 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py 551 AAGGAGTAGACTTCATCGCACCATCTTTCATTCGACGTTCTACGGATGTG 600
BSNT_04263___ 601 CTCGAAATCCGTGAGCTTCTTGAAGAGCACAACGCTCAGGAAATTCAAAT 650
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
BSU29180___py 601 CTCGAAATCCGTGAGCTTCTTGAAGAGCACAACGCTCAGGATATTCAAAT 650
BSNT_04263___ 651 CATCCCTAAAATCGAAAACCAAGAGGGCGTTGACAACATCGATGCGATTC 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py 651 CATCCCTAAAATCGAAAACCAAGAGGGCGTTGACAACATCGATGCGATTC 700
BSNT_04263___ 701 TCGAAGTGTCTGACGGCTTAATGGTTGCACGCGGAGACTTAGGTGTGGAA 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py 701 TCGAAGTGTCTGACGGCTTAATGGTTGCACGCGGAGACTTAGGTGTGGAA 750
BSNT_04263___ 751 ATTCCAGCTGAAGAAGTGCCGCTTGTGCAAAAAGAACTGATCAAAAAATG 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py 751 ATTCCAGCTGAAGAAGTGCCGCTTGTGCAAAAAGAACTGATCAAAAAATG 800
BSNT_04263___ 801 CAACGCGCTGGGCAAACCTGTTATTACAGCAACACAAATGCTTGACAGCA 850
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
BSU29180___py 801 CAACGCGCTGGGCAAACCTGTTATTACAGCGACACAAATGCTTGACAGCA 850
BSNT_04263___ 851 TGCAGCGCAACCCGCGTCCGACTCGTGCGGAAGCAAGTGACGTTGCAAAC 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py 851 TGCAGCGCAACCCGCGTCCGACTCGTGCGGAAGCAAGTGACGTTGCAAAC 900
BSNT_04263___ 901 GCGATCTTCGACGGAACAGATGCGATCATGCTTTCTGGTGAAACTGCTGC 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py 901 GCGATCTTCGACGGAACAGATGCGATCATGCTTTCTGGTGAAACTGCTGC 950
BSNT_04263___ 951 CGGAAGTTATCCGGTTGAAGCAGTTCAAACAATGCATAACATCGCGTCCC 1000
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py 951 CGGAAGTTACCCGGTTGAAGCAGTTCAAACAATGCATAACATCGCGTCCC 1000
BSNT_04263___ 1001 GTTCTGAAGAAGCGTTAAATTATAAAGAAATTCTCTCAAAACGCAGAGAT 1050
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.
BSU29180___py 1001 GTTCTGAAGAAGCATTAAATTATAAAGAAATTCTCTCAAAACGCAGAGAC 1050
BSNT_04263___ 1051 CAAGTTGGCATGACAATTACAGACGCAATTGGACAATCTGTCGCACATAC 1100
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py 1051 CAAGTGGGCATGACAATTACAGACGCAATTGGACAATCTGTCGCACATAC 1100
BSNT_04263___ 1101 GGCGATTAACCTGAATGCTGCTGCGATCGTAACGCCGACAGAAAGCGGCC 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py 1101 GGCGATTAACCTGAATGCTGCTGCGATCGTAACGCCGACAGAAAGCGGCC 1150
BSNT_04263___ 1151 ATACAGCACGTATGATTGCAAAATACCGTCCGCAGGCTCCGATTGTTGCG 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py 1151 ATACAGCACGTATGATTGCAAAATACCGTCCGCAGGCTCCGATTGTTGCG 1200
BSNT_04263___ 1201 GTTACTGTAAATGACTCTATTTCCAGAAAGCTTGCCCTCGTATCTGGCGT 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py 1201 GTTACTGTAAATGACTCTATTTCCAGAAAGCTTGCCCTCGTATCTGGCGT 1250
BSNT_04263___ 1251 ATTCGCGGAAAGCGGCCAAAATGCGAGCTCAACAGATGAGATGCTTGAGG 1300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py 1251 ATTCGCGGAAAGCGGCCAAAATGCGAGCTCAACAGATGAGATGCTTGAGG 1300
BSNT_04263___ 1301 ATGCTGTCCAAAAATCATTGAACAGCGGAATTGTAAAACACGGCGATCTT 1350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py 1301 ATGCTGTCCAAAAATCATTGAACAGCGGAATTGTAAAACACGGCGATCTT 1350
BSNT_04263___ 1351 ATCGTTATTACAGCAGGCACTGTCGGTGAGTCCGGCACTACGAACTTAAT 1400
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py 1351 ATCGTTATTACAGCTGGCACTGTCGGTGAGTCCGGCACTACGAACTTAAT 1400
BSNT_04263___ 1401 GAAGGTTCATACTGTCGGCGATATCGTCGCTAAAGGCCAAGGCATTGGAC 1450
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py 1401 GAAGGTTCATACTGTCGGCGATATCATCGCTAAAGGCCAAGGCATTGGAC 1450
BSNT_04263___ 1451 GCAAATCAGCTTACGGTCCGGTTGTCGTTGCACAAAATGCAAAAGAAGCT 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py 1451 GCAAATCAGCTTACGGTCCGGTTGTCGTTGCACAAAATGCAAAAGAAGCT 1500
BSNT_04263___ 1501 GAGCAAAAAATGACTGACGGTGCGGTACTTGTTACCAAAAGCACTGACCG 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py 1501 GAGCAAAAAATGACTGACGGTGCGGTACTTGTTACCAAAAGCACTGACCG 1550
BSNT_04263___ 1551 TGATATGATTGCATCCCTTGAAAAAGCGTCTGCTCTTATTACAGAAGAAG 1600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py 1551 TGATATGATTGCATCCCTTGAAAAAGCGTCTGCTCTTATTACAGAAGAAG 1600
BSNT_04263___ 1601 GCGGTTTGACTAGCCATGCGGCGGTAGTCGGATTAAGCCTTGGCATCCCG 1650
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py 1601 GCGGTTTGACTAGCCATGCTGCGGTAGTCGGATTAAGCCTTGGCATCCCG 1650
BSNT_04263___ 1651 GTTATCGTGGGTCTGGAAAATGCGACATCTATTTTGACAGATGGCCAGGA 1700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py 1651 GTTATCGTGGGTCTGGAAAATGCGACATCTATTTTGACAGATGGCCAGGA 1700
BSNT_04263___ 1701 TATTACAGTTGACGCTTCCAGAGGCGCAGTCTATCAAGGCCGTGCGAGCG 1750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU29180___py 1701 TATTACAGTTGACGCTTCCAGAGGCGCAGTCTATCAAGGCCGTGCGAGCG 1750
BSNT_04263___ 1751 TTCTTTAA 1758
||||||||
BSU29180___py 1751 TTCTTTAA 1758
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.