Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_04080 and BSU28090
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_04080 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:23:24
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_04080___valS.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU28090___valS.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_04080___valS-BSU28090___valS.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_04080___valS-BSU28090___valS.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_04080___valS
# 2: BSU28090___valS
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 2643
# Identity: 2619/2643 (99.1%)
# Similarity: 2619/2643 (99.1%)
# Gaps: 0/2643 ( 0.0%)
# Score: 12999.0
#
#
#=======================================
BSNT_04080___ 1 ATGGAAACGAATGAACAAACAATGCCGACGAAATATGATCCGGCAGCGGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 1 ATGGAAACGAATGAACAAACAATGCCGACGAAATATGATCCGGCAGCGGT 50
BSNT_04080___ 51 TGAAAAAGACCGATATGATTTTTGGCTAAAAGGCAAATTTTTTGAAGCGG 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 51 TGAAAAAGACCGATATGATTTTTGGCTAAAAGGCAAATTTTTTGAAGCGG 100
BSNT_04080___ 101 GCAGTGACCAGACAAAAGAGCCATACTCTGTTGTCATCCCGCCGCCAAAC 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 101 GCAGTGACCAGACAAAAGAGCCATACTCTGTTGTCATCCCGCCGCCAAAC 150
BSNT_04080___ 151 GTAACAGGAAGACTTCACCTTGGCCACGCATGGGACACAACGCTGCAAGA 200
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 151 GTAACAGGGAGACTTCACCTTGGCCACGCATGGGACACAACGCTGCAAGA 200
BSNT_04080___ 201 CATTGTAACAAGAATGAAACGCATGCAGGGCTATGATGTGCTGTGGCTTC 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 201 CATTGTAACAAGAATGAAACGCATGCAGGGCTATGATGTGCTGTGGCTTC 250
BSNT_04080___ 251 CAGGCATGGACCATGCCGGCATCGCAACACAGGCTAAAGTGGAGGCGAAA 300
|.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 251 CTGGCATGGACCACGCCGGCATCGCGACACAGGCTAAAGTGGAGGCGAAA 300
BSNT_04080___ 301 CTTCGTGAAGAAGGCAAATCCCGCTACGATTTAGGCCGTGAAAAATTCCT 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 301 CTTCGTGAAGAAGGCAAATCCCGCTACGATTTAGGCCGTGAAAAATTCCT 350
BSNT_04080___ 351 CGAAGAAACGTGGAAGTGGAAGGAAGAATATGCTGACTTTATTCGCAGCC 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 351 CGAAGAAACGTGGAAGTGGAAGGAAGAATATGCTGACTTTATTCGCAGCC 400
BSNT_04080___ 401 AGTGGGCGAAATTAGGTCTTGGCCTAGATTATTCCCGTGAACGTTTTACG 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 401 AGTGGGCGAAATTAGGTCTTGGCCTAGATTATTCCCGTGAACGTTTTACG 450
BSNT_04080___ 451 CTGGATGAAGGCTTGAGCAAAGCGGTAAGAGAAGTATTCGTTAAGCTTTA 500
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
BSU28090___va 451 CTGGATGAAGGCTTGAGCAAAGCGGTAAGGGAAGTATTCGTTAAGCTTTA 500
BSNT_04080___ 501 TGAAAAAGGCCTGATCTACAGAGGCGAATATATTATTAACTGGGACCCAG 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 501 TGAAAAAGGCCTGATCTACAGAGGCGAATATATTATTAACTGGGACCCAG 550
BSNT_04080___ 551 CGACAAAAACAGCCCTATCCGACATTGAGGTGATTTACAAGGATGTTCAA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 551 CGACAAAAACAGCCCTATCCGACATTGAGGTGATTTACAAGGATGTTCAA 600
BSNT_04080___ 601 GGCGCGTTCTATCATATGAGCTATCCGCTTGCTGACGGTTCAGGCTCAAT 650
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 601 GGCGCATTCTATCATATGAGCTATCCGCTTGCTGACGGTTCAGGCTCAAT 650
BSNT_04080___ 651 TGAAATTGCGACGACACGTCCTGAAACAATGCTCGGTGATACAGCTGTTG 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 651 TGAAATTGCGACGACACGTCCTGAAACAATGCTCGGTGATACAGCTGTTG 700
BSNT_04080___ 701 CCGTTCACCCTGAAGACGAGCGCTATAAACACCTTATCGGAAAAACGGTG 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 701 CCGTTCACCCTGAAGACGAGCGCTATAAACACCTTATCGGAAAAACGGTG 750
BSNT_04080___ 751 ATCCTGCCGATTGTAAATCGTGAAATTCCGATTGTCGGTGATGACTATGT 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 751 ATCCTGCCGATTGTAAATCGTGAAATTCCGATTGTCGGTGATGACTATGT 800
BSNT_04080___ 801 TGATATGGAATTTGGTTCAGGTGCCGTGAAAATTACGCCTGCTCATGATC 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 801 TGATATGGAATTTGGTTCAGGTGCCGTGAAAATTACGCCTGCTCATGATC 850
BSNT_04080___ 851 CGAACGACTTCGAGCTTGGCAACCGCCACAATTTAGAACGCATTCTTGTC 900
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
BSU28090___va 851 CGAACGACTTCGAGCTTGGCAACCGCCACAATTTAGAACGCATCCTTGTC 900
BSNT_04080___ 901 ATGAATGAAGATGGCACGATGAATGAAAATGCTCTGCAATATCAAGGCAT 950
||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||
BSU28090___va 901 ATGAATGAAGATGGCACGATGAATGAAAATGCGCTCCAATATCAAGGTAT 950
BSNT_04080___ 951 GGATCGTTTTGAATGCCGCAAAAAGCTCGTGAAAGATTTACAGGAGGCGG 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 951 GGATCGTTTTGAATGCCGCAAAAAGCTCGTGAAAGATTTACAGGAGGCGG 1000
BSNT_04080___ 1001 GAGTTCTCTTCAAGATCGAGGATCATATGCACTCTGTCGGCCATAGTGAA 1050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 1001 GAGTTCTCTTCAAGATCGAGGATCATATGCACTCTGTCGGCCATAGTGAA 1050
BSNT_04080___ 1051 CGAAGCGGGGCTGTTGTGGAGCCTTATCTTTCTACACAATGGTTTGTGCG 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 1051 CGAAGCGGGGCTGTTGTGGAGCCTTATCTTTCTACACAATGGTTTGTGCG 1100
BSNT_04080___ 1101 CATGCAGCCGCTTGCTGATGCAGCGATTGAGCTGCAAAAGAAAGAAGAAA 1150
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
BSU28090___va 1101 CATGCAGCCGCTTGCTGATGCAGCGATTGAGCTGCAAAAAAAAGAAGAAA 1150
BSNT_04080___ 1151 AGGTCAACTTTGTGCCTGACCGTTTCGAAAAAACGTATTTACACTGGATG 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 1151 AGGTCAACTTTGTGCCTGACCGTTTCGAAAAAACGTATTTACACTGGATG 1200
BSNT_04080___ 1201 GAAAACATCCGCGACTGGTGTATCTCCCGTCAATTGTGGTGGGGCCATCG 1250
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 1201 GAAAATATCCGCGACTGGTGTATCTCCCGTCAATTGTGGTGGGGCCATCG 1250
BSNT_04080___ 1251 TATTCCTGCCTGGTATCATAAAGAAACAGGCGAGCTATATGTCGGGCTTG 1300
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
BSU28090___va 1251 TATTCCTGCCTGGTATCATAAAGAAACAGGCGAGCTATATGTCGGACTTG 1300
BSNT_04080___ 1301 AAGCGCCGGAAGACAGCGAAAATTGGGAACAGGATACAGACGTACTGGAT 1350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 1301 AAGCGCCGGAAGACAGCGAAAATTGGGAACAGGATACAGACGTACTGGAT 1350
BSNT_04080___ 1351 ACATGGTTCAGTTCTGCGCTATGGCCTTTCTCCACAATGGGCTGGCCTGA 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 1351 ACATGGTTCAGTTCTGCGCTATGGCCTTTCTCCACAATGGGCTGGCCTGA 1400
BSNT_04080___ 1401 TGTAACGGCTGAAGACTTTAAACGCTACTATCCGACAGATGTTCTCGTGA 1450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 1401 TGTAACGGCTGAAGACTTTAAACGCTACTATCCGACAGATGTTCTCGTGA 1450
BSNT_04080___ 1451 CAGGGTACGATATCATTTTCTTCTGGGTATCACGCATGATTTTCCAAGGC 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 1451 CAGGGTACGATATCATTTTCTTCTGGGTATCACGCATGATTTTCCAAGGC 1500
BSNT_04080___ 1501 ATTGAATTTACAGGCGAGCGCCCGTTCAAAGATGTTTTAATCCACGGCTT 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 1501 ATTGAATTTACAGGCGAGCGCCCGTTCAAAGATGTTTTAATCCACGGCTT 1550
BSNT_04080___ 1551 AATCCGTGACGAGCAAGGCCGGAAAATGAGTAAATCTCTTGGCAACGGTG 1600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 1551 AATCCGTGACGAGCAAGGCCGGAAAATGAGTAAATCTCTTGGCAACGGTG 1600
BSNT_04080___ 1601 TCGACCCGATGGATGTGATTGACAAGTACGGAGCCGATTCTCTGCGTTAT 1650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 1601 TCGACCCGATGGATGTGATTGACAAGTACGGAGCCGATTCTCTGCGTTAT 1650
BSNT_04080___ 1651 TTCCTTGCGACTGGAAGCTCTCCTGGCCAGGATCTGCGCTTCAGCTATGA 1700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 1651 TTCCTTGCGACTGGAAGCTCTCCTGGCCAGGATCTGCGCTTCAGCTATGA 1700
BSNT_04080___ 1701 AAAAGTGGAATCGACCTGGAATTTTGCCAATAAAATTTGGAACGCCTCCC 1750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 1701 AAAAGTGGAATCGACCTGGAATTTTGCCAATAAAATTTGGAACGCCTCCC 1750
BSNT_04080___ 1751 GTTTTGCATTAATGAATATGGATGGCATGACGTACGATGAGCTTGATCTG 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 1751 GTTTTGCATTAATGAATATGGATGGCATGACGTACGATGAGCTTGATCTG 1800
BSNT_04080___ 1801 TCAGGCGAAAAATCAGTCGCTGACAAGTGGATTTTAACGCGATTAAATGA 1850
|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 1801 TCAGGTGAAAAGTCAGTCGCTGACAAGTGGATTTTAACGCGATTAAATGA 1850
BSNT_04080___ 1851 AACGATCGAGCACGTGACCCAGCTTGCTGATCGATATGAATTTGGTGAAG 1900
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
BSU28090___va 1851 AACGATCGAGCACGTGACCCAGCTTGCTGACCGATATGAATTTGGTGAAG 1900
BSNT_04080___ 1901 TAGGACGCCATTTATATAACTTTATTTGGGACGATTTCTGTGATTGGTAT 1950
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
BSU28090___va 1901 TAGGACGCCATTTATATAACTTTATTTGGGATGATTTCTGTGATTGGTAT 1950
BSNT_04080___ 1951 ATTGAAATGGCGAAGCTTCCGCTTTATGGGGAAGACGAAGCGGCTAAGAA 2000
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
BSU28090___va 1951 ATTGAAATGGCGAAGCTTCCGCTTTATGGAGAAGACGAAGCGGCTAAGAA 2000
BSNT_04080___ 2001 AACTACCCGTTCCATCCTTGCTTACGTACTTGATCAAACGATGCGTCTGC 2050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 2001 AACTACCCGTTCCATCCTTGCTTACGTACTTGATCAAACGATGCGTCTGC 2050
BSNT_04080___ 2051 TCCATCCGTTTATGCCATTCTTAACGGAGGAAATTTGGCAGCACCTTCCT 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 2051 TCCATCCGTTTATGCCATTCTTAACGGAGGAAATTTGGCAGCACCTTCCT 2100
BSNT_04080___ 2101 CACCAAGGGGAATCGATTACAGTAAGTCAATGGCCTGTAGTAGTGCCGGA 2150
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
BSU28090___va 2101 CACCAAGGGGAATCGATTACAGTAAGTCAATGGCCTGCAGTAGTGCCGGA 2150
BSNT_04080___ 2151 GCATACCGATACTGAAGCGACAGCTGACATGAAGCTTCTTGTTGAGCTGA 2200
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 2151 GCATACCGATACTGAAGCGGCAGCTGACATGAAGCTTCTTGTTGAGCTGA 2200
BSNT_04080___ 2201 TCCGTTCTGTGCGCAATATCCGCAGTGAAGTCAATACGCCAATGAGCAAG 2250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 2201 TCCGTTCTGTGCGCAATATCCGCAGTGAAGTCAATACGCCAATGAGCAAG 2250
BSNT_04080___ 2251 CAGGTTGAACTGTACATTAAAACAAGCACAGACGAAATAGCAGCCCGCCT 2300
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||
BSU28090___va 2251 CAGGTTGAACTGTACATTAAAACAAGCACAGACGAAATAGCGTCCCGCCT 2300
BSNT_04080___ 2301 CGAGGCGAACCGTTCATATGTTGAACGCTTTACGAATCCGAGCGTGCTTA 2350
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 2301 CGAAGCGAACCGTTCATATGTTGAACGCTTTACGAATCCGAGCGTGCTTA 2350
BSNT_04080___ 2351 AAATCGGCACCGATATTGAGGCTGTTGATAAGGCGATGACGGCCGTTGTC 2400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 2351 AAATCGGCACCGATATTGAGGCTGTTGATAAGGCGATGACGGCCGTTGTC 2400
BSNT_04080___ 2401 TCAGGAGCAGAGGTTATTCTTCCGCTTGAAGGCTTAATCAATATTGATGA 2450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 2401 TCAGGAGCAGAGGTTATTCTTCCGCTTGAAGGCTTAATCAATATTGATGA 2450
BSNT_04080___ 2451 AGAAATTGCCCGTCTGCAAAAAGAATTTGATAAACTGACAAAAGAAGTTG 2500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 2451 AGAAATTGCCCGTCTGCAAAAAGAATTTGATAAACTGACAAAAGAAGTTG 2500
BSNT_04080___ 2501 AGCGTGTCCAAAAGAAACTTGGAAATGAAGGATTTATGAAAAAAGCGCCT 2550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 2501 AGCGTGTCCAAAAGAAACTTGGAAATGAAGGATTTATGAAAAAAGCGCCT 2550
BSNT_04080___ 2551 GCACACGTAATTGATGAAGAACGTGAAAAAGAAAAAGATTATATGGCGAA 2600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
BSU28090___va 2551 GCACACGTAATTGATGAAGAACGTGAAAAAGAAAAAGATTATGTGGCGAA 2600
BSNT_04080___ 2601 GCGTGACGCTGTTCAAAAACGAATGGCTGAGCTGAAGGGTTAA 2643
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU28090___va 2601 GCGTGACGCTGTTCAAAAACGAATGGCTGAGCTGAAGGGTTAA 2643
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.