Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_03950 and BSU27220
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_03950 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:23:07
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_03950___yrhE.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU27220___yrhE.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_03950___yrhE-BSU27220___yrhE.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_03950___yrhE-BSU27220___yrhE.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_03950___yrhE
# 2: BSU27220___yrhE
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 2949
# Identity: 2901/2949 (98.4%)
# Similarity: 2901/2949 (98.4%)
# Gaps: 6/2949 ( 0.2%)
# Score: 14337.0
#
#
#=======================================
BSNT_03950___ 1 ATGAATATGATGGACGGTAAGTCGATCAGTGTCCGTGTAGACGGAACAGA 50
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 1 ------ATGATGGACGTTAAGTCGATCAGTGTCCGTGTAGACGGAACAGA 44
BSNT_03950___ 51 AATTCAAGCACGAGCAGGGGCCACAATATTAGATATTTTAAATGAAAACG 100
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 45 AATTCAAGCACGAGCAGGGGCCACAATTTTAGATATTTTAAATGAAAACG 94
BSNT_03950___ 101 GAATTGAGTACCCGCAGATTTGCCACGTACCAGAGGTTGACCCGATTCAA 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 95 GAATTGAGTACCCGCAGATTTGCCACGTACCAGAGGTTGACCCGATTCAA 144
BSNT_03950___ 151 ACTTGTGATACTTGCATAGTAGAGGCAAACGGCAAGCTGGTTCGTTCATG 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 145 ACTTGTGATACTTGCATAGTAGAGGCAAACGGCAAGCTGGTTCGTTCATG 194
BSNT_03950___ 201 CGCGACGGTTGCAGAAAACGGGATGTCTATTGATCTATCAGGAAATCGAG 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
BSU27220___yr 195 CGCGACGGTTGCAGAAAACGGGATGTCTATTGATCTTTCAGGAAATCGAG 244
BSNT_03950___ 251 TGAAAGAAGCGCAAACCGAAGCGATGGACCGCCTTCTTGAAAATCATTTG 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 245 TGAAAGAAGCGCAAACCGAAGCGATGGACCGCCTTCTTGAAAATCATTTG 294
BSNT_03950___ 301 CTGTATTGTACAGTTTGCGATAACAACAATGGAAACTGTACGCTGCATAA 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 295 CTGTATTGTACAGTTTGCGATAACAACAATGGAAACTGTACGCTGCATAA 344
BSNT_03950___ 351 TACAGCGGAAATGATGGGGATCGAGCATCAAAAATACCCATACACGCCAA 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 345 TACAGCGGAAATGATGGGGATCGAGCATCAAAAATACCCATACACGCCAA 394
BSNT_03950___ 401 AAGAAGATCCTTCTTGCGCAGTTGATATGTCTCATCCTTTTTACCGCTAT 450
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 395 AAGAAGATCCTTCTTGCGCGGTTGATATGTCTCATCCTTTTTACCGCTAT 444
BSNT_03950___ 451 GATCCAAACCAATGTATTGCCTGCGGCCAGTGTGTTGAGGTCTGTCAAAA 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 445 GATCCAAACCAATGTATTGCCTGCGGCCAGTGTGTTGAGGTCTGTCAAAA 494
BSNT_03950___ 501 CCTTCAGGTAAATGAAACACTCTCAATCGACTGGGAACGCGAACGCCCTC 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 495 CCTTCAGGTAAATGAAACACTCTCAATCGACTGGGAACGCGAACGCCCTC 544
BSNT_03950___ 551 GCGTCATTTGGGATGAGGGAGTTCCGATCAATGAATCTTCCTGTGTCAGC 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 545 GCGTCATTTGGGATGAGGGAGTTCCGATCAATGAATCTTCCTGTGTCAGC 594
BSNT_03950___ 601 TGCGGTCAGTGTGTCACAGTATGTCCATGTAATGCACTGATGGAAAAATC 650
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 595 TGCGGTCAGTGTGTAACAGTATGTCCATGTAATGCACTGATGGAAAAATC 644
BSNT_03950___ 651 AATGCTCGGGCAGGCTGGCTTTATGACAGGGATTAAAGAGGACGTCATGG 700
||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||
BSU27220___yr 645 AATGCTCGGGCAGGCTGGTTTTATGACAGGCATTAAAGAGGACGTCATGG 694
BSNT_03950___ 701 AACCGATGATTGACCTCGTGAAAAATGTTGAACCGGGGTATGGCAGCATT 750
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 695 AACCGATGATTGATCTCGTGAAAAATGTTGAACCGGGGTATGGCAGCATT 744
BSNT_03950___ 751 TTTGCCATTTCTGAAGTCGAAGCGGCAATGCGTGAAACGAGAACGAAAAA 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 745 TTTGCCATTTCTGAAGTCGAAGCGGCAATGCGTGAAACGAGAACGAAAAA 794
BSNT_03950___ 801 AACGAAAACTGTATGTACGTTCTGCGGTGTCGGGTGTTCATTTGAAGTAT 850
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
BSU27220___yr 795 AACGAAAACTGTATGTACGTTCTGCGGTGTCGGATGTTCATTTGAAGTAT 844
BSNT_03950___ 851 GGACAAAAGGACGGGATATTTTAAAGATCCAGCCTGTTTCTGATGCTCCG 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 845 GGACAAAAGGACGGGATATTTTAAAGATCCAGCCTGTTTCTGATGCTCCG 894
BSNT_03950___ 901 GTTAACGCGATTTCCACATGTGTCAAAGGGAAATTCGGCTGGGATTTCGT 950
||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
BSU27220___yr 895 GTTAACGCAATTTCCACATGTGTCAAAGGGAAATTCGGCTGGGATTTTGT 944
BSNT_03950___ 951 CAATTCTGAGGAGCGAATCACAAAGCCTTTAATCCGTAAAAATGGAGCCT 1000
||||||..|.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||
BSU27220___yr 945 CAATTCAAAAGAGCGGATCACAAAGCCTTTAATCCGTAAAAACGGAGCCT 994
BSNT_03950___ 1001 TTGTGGAATCTTCTTGGGAAGAGGCCCTCGATCTTGTCGCAAGCAGATTA 1050
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 995 TTGTGGAATCTTCTTGGGAAGAAGCCCTCGATCTTGTCGCAAGCAGATTA 1044
BSNT_03950___ 1051 GGATCAATTAAAGAGCAGTACGGTAAAGGCTCTGTCGGGTTTATTTCTTC 1100
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
BSU27220___yr 1045 GGATCAATTAAAGAGCAGTACGGTAAAGGCTCTGTAGGGTTTATTTCTTC 1094
BSNT_03950___ 1101 TTCTAAAATTACGAATGAAGAAAACTACGTCATTCAAAAGCTAGCGCGTC 1150
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
BSU27220___yr 1095 TTCTAAAATTACGAATGAAGAAAACTACGTCATTCAAAAACTAGCGCGTC 1144
BSNT_03950___ 1151 AGGTATTTGAAACAAACAATGTCGATAACTGCTCACGCTACTGCCAGTCT 1200
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 1145 AGGTATTTGAAACAAACAACGTCGATAACTGCTCACGCTACTGCCAGTCT 1194
BSNT_03950___ 1201 CCTGCTACAGACGGATTGTTCCGCACTGTCGGCATGGGCGGTGACGCTGG 1250
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
BSU27220___yr 1195 CCTGCTACAGACGGATTGTTCCGCACTGTCGGCATGGGCGGTGACGCCGG 1244
BSNT_03950___ 1251 CACGATTAAAGATATTGCCAAAGCCGGTCTCGTCATCATCGTCGGCGCCA 1300
||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||
BSU27220___yr 1245 CACGATTAAAGATATTGCCAAAGCAGGCCTGGTCATCATTGTCGGTGCCA 1294
BSNT_03950___ 1301 ATCCGGCGGAAGGACACCCGGTGCTCGCAACACGCGTCAAACGGGCGCAC 1350
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
BSU27220___yr 1295 ATCCGGCGGAAGGACACCCAGTGCTCGCAACACGCGTCAAACGGGCACAC 1344
BSNT_03950___ 1351 AAGCTTCACGGTCAAAAACTGATTGTTGCCGACCTGCGTAAAAATGAGAT 1400
|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 1345 AAGCTCCACGGTCAAAAACTGATTGTTGCTGACCTGCGTAAAAATGAGAT 1394
BSNT_03950___ 1401 GGCCGAGCGATCTGATCTGTTCATCAGCCCTAAACAAGGCACAGACCAAG 1450
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 1395 GGCTGAGCGATCTGATCTGTTCATCAGCCCTAAACAAGGCACAGACCAAG 1444
BSNT_03950___ 1451 TCTGGCTGATGGCTGTTACGAAATATATGATCGACCAAGGCTGGCACGAT 1500
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 1445 TTTGGCTGATGGCTGTTACGAAATATATGATCGACCAAGGCTGGCACGAT 1494
BSNT_03950___ 1501 CAGGCGTTTATTGATGAGAATGTTAATTACTTTGAAGATTATAAAGAAAC 1550
||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 1495 CAGGCGTTTATTGATGAGAACGTCAATTACTTTGAAGATTATAAAGAAAC 1544
BSNT_03950___ 1551 TCTTAAAACGTATACGCTTGATTATGCAGAACGCATCACAGGCCTTTCAA 1600
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 1545 CCTTAAAACGTATACGCTTGATTATGCAGAACGCATCACAGGCCTTTCAA 1594
BSNT_03950___ 1601 AAGAAAACATCATTCAAATTGCTGAAATGATCCGTGATGCTGACGGTACT 1650
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||
BSU27220___yr 1595 AAGAAAACATCATTCAAATTGCTGAAATGATTCGTGATGCTGACGGCACT 1644
BSNT_03950___ 1651 TGTGTCCTTTGGGGAATGGGTGTCACACAAAATACAGGCGGTTCTGATAC 1700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 1645 TGTGTCCTTTGGGGAATGGGTGTCACACAAAATACAGGCGGTTCTGATAC 1694
BSNT_03950___ 1701 ATCAGCAGCCATTTCAAACCTGCTTCTCGCTACGGGCAACTATCGCCGTC 1750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 1695 ATCAGCAGCCATTTCAAACCTGCTTCTCGCTACGGGCAACTATCGCCGTC 1744
BSNT_03950___ 1751 CAGGTGCCGGCGCTTATCCTCTGCGCGGACACAATAACGTGCAAGGCGCA 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 1745 CAGGTGCCGGCGCTTATCCTCTGCGCGGACACAATAACGTGCAAGGCGCA 1794
BSNT_03950___ 1801 TGTGATATGGGAACATTGCCTGGCTGGCTGCCGGGATATCAGCATATTAC 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 1795 TGTGATATGGGAACATTGCCTGGCTGGCTGCCGGGATATCAGCATATTAC 1844
BSNT_03950___ 1851 AGATGACAAGGCCCGCGCTAAATTTGAAGAGGCATATGGTGTCGAGATTG 1900
|||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 1845 AGATGACAAAGCACGCGCTAAATTTGAAGAGGCATATGGTGTCGAGATTG 1894
BSNT_03950___ 1901 ATGGAAAGCCTGGTTTAGATAATATTCAAATGCTTCATGCCATTGAAGAA 1950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 1895 ATGGAAAGCCTGGTTTAGATAATATTCAAATGCTTCATGCCATTGAAGAA 1944
BSNT_03950___ 1951 GGAAAAATGAAAGCTATGTATCTTGTCGGTGAGGATATGGCACTGGTCGA 2000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 1945 GGAAAAATGAAAGCTATGTATCTTGTCGGTGAGGATATGGCACTGGTCGA 1994
BSNT_03950___ 2001 TTCAAACGCGAACCATGTGCATGATATTTTATCAAGCCTTGATTTCTTCG 2050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 1995 TTCAAACGCGAACCATGTGCATGATATTTTATCAAGCCTTGATTTCTTCG 2044
BSNT_03950___ 2051 TGGTACAGGACATCTTCCTGTCAAGAACAGCTCAATATGCTGATGTCGTC 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 2045 TGGTACAGGACATCTTCCTGTCAAGAACAGCTCAATATGCTGATGTCGTC 2094
BSNT_03950___ 2101 TTGCCGGCCACTCCTTCACTTGAAAAAGACGGAACATTTACCAACACAGA 2150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 2095 TTGCCGGCCACTCCTTCACTTGAAAAAGACGGAACATTTACCAACACAGA 2144
BSNT_03950___ 2151 ACGCCGTGTCCAGCGATTGTATCAGGCGCTTCCGACGCTTGGTGACGCAA 2200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 2145 ACGCCGTGTCCAGCGATTGTATCAGGCGCTTCCGACGCTTGGTGACGCAA 2194
BSNT_03950___ 2201 AACCGGACTGGTGGATTATTCAAGAGGTGGCAAACCGTTTAGGAGCGAAT 2250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 2195 AACCGGACTGGTGGATTATTCAAGAGGTGGCAAACCGTTTAGGAGCGAAT 2244
BSNT_03950___ 2251 TGGAATTACAGCCATCCAAGTGACATTTTCTCTGAAATGGCGAGTCTTTC 2300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 2245 TGGAATTACAGCCATCCAAGTGACATTTTCTCTGAAATGGCGAGTCTTTC 2294
BSNT_03950___ 2301 TCCTCTGTTTGCCAAAGCAAGCTATGAGGTGCTTGAAGGCTGGAACAGCT 2350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 2295 TCCTCTGTTTGCCAAAGCAAGCTATGAGGTGCTTGAAGGCTGGAACAGCT 2344
BSNT_03950___ 2351 TCCTATGGGGCAGCTTCACAGGTGAAAGCACACCGCTTCTGTATGAAGAC 2400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 2345 TCCTATGGGGCAGCTTCACAGGTGAAAGCACACCGCTTCTGTATGAAGAC 2394
BSNT_03950___ 2401 GGATTTAATTTCCCTGACAAAAAAGCCCGCTTTGCCCTTTCTGATTGGAC 2450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 2395 GGATTTAATTTCCCTGACAAAAAAGCCCGCTTTGCCCTTTCTGATTGGAC 2444
BSNT_03950___ 2451 CGAGCCAGCGGCATTTCCGGAGGAATATGACCTTCATATCAATAACGGCC 2500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 2445 CGAGCCAGCGGCATTTCCGGAGGAATATGACCTTCATATCAATAACGGCC 2494
BSNT_03950___ 2501 GGATGCTGGAGCATTTCCACGAAGGAAACATGACAAATAAATCGAAAGGC 2550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 2495 GGATGCTGGAGCATTTCCACGAAGGAAACATGACAAATAAATCGAAAGGC 2544
BSNT_03950___ 2551 ATCCAAGCGAAAGTGCCAAATGTATTCGTTGAGATCTCACCTGAGCTTGC 2600
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 2545 ATCCAAGCGAAAGTGCCGAATGTATTCGTTGAGATCTCACCTGAGCTTGC 2594
BSNT_03950___ 2601 ACAAGAGCGAGGTGTTTGTGACGGTTCGCTTGTACGGCTCGTTTCTCCGT 2650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 2595 ACAAGAGCGAGGTGTTTGTGACGGTTCGCTTGTACGGCTCGTTTCTCCGT 2644
BSNT_03950___ 2651 TCGGAGCAGTCAAATTGAACGCGCTGATCACAGACCGGGTACGGAAAAAT 2700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 2645 TCGGAGCAGTCAAATTGAACGCGCTGATCACAGACCGGGTACGGAAAAAT 2694
BSNT_03950___ 2701 GAACTCTATTTGCCAATGAACTCGACAGACAAGGAGTCAGCAATTAACTT 2750
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
BSU27220___yr 2695 GAACTCTATTTGCCAATGAACTCGACAGACAAGGAGTCAGCGATTAACTT 2744
BSNT_03950___ 2751 CTTGACGGGCCCTGCAGCTGATAAACGGACGAACACGCCTGCTTATAAAC 2800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 2745 CTTGACGGGCCCTGCAGCTGATAAACGGACGAACACGCCTGCTTATAAAC 2794
BSNT_03950___ 2801 AGACAAAGGTCCGCATGGAAGTGCTTGGCGGCTGTGAAACAGCGCCGCTT 2850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 2795 AGACAAAGGTCCGCATGGAAGTGCTTGGCGGCTGTGAAACAGCGCCGCTT 2844
BSNT_03950___ 2851 CCAAAAACAAATCCGCGCAACAAAAAACGGCATCCGCAAAACGGAGTCGA 2900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27220___yr 2845 CCAAAAACAAATCCGCGCAACAAAAAACGGCATCCGCAAAACGGAGTCGA 2894
BSNT_03950___ 2901 AGCAGAAAGAAAATGGAACCGCCCTGGCTATGTCCATCTGACTGATTAA 2949
|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
BSU27220___yr 2895 AGCAGAAAGAAAATGGAACCGCCCTGGCTATGTACATCTGACTGATTAA 2943
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.