Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_03918 and BSU27030
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_03918 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:23:02
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_03918___sacC.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU27030___sacC.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_03918___sacC-BSU27030___sacC.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_03918___sacC-BSU27030___sacC.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_03918___sacC
# 2: BSU27030___sacC
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 2058
# Identity: 2004/2058 (97.4%)
# Similarity: 2004/2058 (97.4%)
# Gaps: 24/2058 ( 1.2%)
# Score: 9900.0
#
#
#=======================================
BSNT_03918___ 1 ATGAAGAGAGGAGCGAAGGAACAAATGAAAAAGAGACTTATTCAAGTCAT 50
||||||||||||||.|||||||||||
BSU27030___sa 1 ------------------------ATGAAAAAGAGACTGATTCAAGTCAT 26
BSNT_03918___ 51 GATCATGTTCACCCTGCTGTTGACTATGGCATTTTCGGCAGATGCAGCCG 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27030___sa 27 GATCATGTTCACCCTGCTGTTGACTATGGCATTTTCGGCAGATGCAGCCG 76
BSNT_03918___ 101 ATTCAAGCTACTATGATGAGGATTACCGTCCTCAATACCACTTCACACCA 150
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
BSU27030___sa 77 ATTCAAGCTACTATGATGAGGATTACCGTCCTCAATATCACTTCACACCG 126
BSNT_03918___ 151 GAGGCAAACTGGATGAATGACCCAAACGGAATGGTATATTATGCCGGGGA 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
BSU27030___sa 127 GAGGCAAACTGGATGAATGACCCAAACGGAATGGTATATTATGCTGGGGA 176
BSNT_03918___ 201 ATATCACTTGTTCTATCAATACCATCCATACGGGCTTCAGTGGGGGCCCA 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27030___sa 177 ATATCACTTGTTCTATCAATACCATCCATACGGGCTTCAGTGGGGGCCCA 226
BSNT_03918___ 251 TGCATTGGGGGCATGCCGTCAGCAAAGATTTGGTTACATGGGAACACCTT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27030___sa 227 TGCATTGGGGGCATGCCGTCAGCAAAGATTTGGTTACATGGGAACACCTT 276
BSNT_03918___ 301 CCTGTTGCGCTGTATCCGGATGAAAAAGGCACGATCTTTTCTGGAAGCGC 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27030___sa 277 CCTGTTGCGCTGTATCCGGATGAAAAAGGCACGATCTTTTCTGGAAGCGC 326
BSNT_03918___ 351 AGTTGTAGATAAAAATAACACAAGCGGTTTTCAAACAGGCAAAGAGAAGC 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27030___sa 327 AGTTGTAGATAAAAATAACACAAGCGGTTTTCAAACAGGCAAAGAGAAGC 376
BSNT_03918___ 401 CGCTTGTGGCCATTTATACACAGGATCAGGAAGGCCATCAAGTGCAAAGT 450
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
BSU27030___sa 377 CGCTTGTGGCCATTTATACACAGGATCGGGAAGGCCATCAAGTGCAAAGT 426
BSNT_03918___ 451 ATTGCCTATAGCAACGACAAAGGAAGAACATGGACGAAATACGCTGGCAA 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
BSU27030___sa 427 ATTGCCTATAGCAACGACAAAGGAAGAACATGGACGAAGTACGCTGGCAA 476
BSNT_03918___ 501 CCCTGTCATTCCAAACCCGGGTAAAAAAGATTTTCGCGATCCAAAAGTCT 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27030___sa 477 CCCTGTCATTCCAAACCCGGGTAAAAAAGATTTTCGCGATCCAAAAGTCT 526
BSNT_03918___ 551 TTTGGTATGAAAAAGAAAAAAAGTGGGTGATGGTGCTTGCGGCCGGTGAC 600
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27030___sa 527 TTTGGTATGAGAAAGAAAAAAAGTGGGTGATGGTGCTTGCGGCCGGTGAC 576
BSNT_03918___ 601 CGTATCCTCATTTATACATCAAAAAATCTGAAGCAGTGGACGTATGCAAG 650
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27030___sa 577 CGAATCCTCATTTATACATCAAAAAATCTGAAGCAGTGGACGTATGCAAG 626
BSNT_03918___ 651 TGAATTTGGTCAGGATCAAGGAAGCCACGGAGGAGTATGGGAATGCCCGG 700
|||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
BSU27030___sa 627 TGAATTTGGACAGGATCAAGGAAGCCACGGGGGAGTATGGGAATGCCCGG 676
BSNT_03918___ 701 ATTTATTTGAGCTTCCGGTAGACGGCAATCCGAATCAAAAGAAATGGGTC 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27030___sa 677 ATTTATTTGAGCTTCCGGTAGACGGCAATCCGAATCAAAAGAAATGGGTC 726
BSNT_03918___ 751 ATGCAGGTCAGTGTCGGAAACGGAGCGGTCTCGGGAGGATCAGGCATGCA 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27030___sa 727 ATGCAGGTCAGTGTCGGAAACGGAGCGGTCTCGGGAGGATCAGGCATGCA 776
BSNT_03918___ 801 ATATTTTGTAGGGGACTTTGATGGAACTCATTTTAAAAATGAAAACCCGT 850
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
BSU27030___sa 777 ATATTTTGTAGGGGACTTTGATGGAACTCATTTTAAAAATGAAAACCCGC 826
BSNT_03918___ 851 CAGACAAAGTTCTCTGGACGGATTACGGCAGAGACTTTTATGCGGCTGTA 900
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27030___sa 827 CAAACAAAGTTCTCTGGACGGATTACGGCAGAGACTTTTATGCGGCTGTA 876
BSNT_03918___ 901 TCCTGGTCCGATATTCCATCAACAGACAGCCGCCGGCTATGGTTAGGGTG 950
||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
BSU27030___sa 877 TCCTGGTCTGATATTCCATCCACAGACAGCCGCCGGCTATGGTTAGGGTG 926
BSNT_03918___ 951 GATGAGCAATTGGCAATATGCGAATGATGTTCCGACATCCCCATGGAGAA 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27030___sa 927 GATGAGCAATTGGCAATATGCGAATGATGTTCCGACATCCCCATGGAGAA 976
BSNT_03918___ 1001 GTGCAACGTCCATTCCAAGAGAGTTAAAATTGAAAGCGTTTACCGAAGGG 1050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27030___sa 977 GTGCAACGTCCATTCCAAGAGAGTTAAAATTGAAAGCGTTTACCGAAGGG 1026
BSNT_03918___ 1051 GTTAGAGTGGTCCAAACACCAGTGAAAGAGCTGGAAACCATTCGCGGGAC 1100
||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||
BSU27030___sa 1027 GTTAGAGTGGTCCAAACACCGGTGAAAGAGCTGGAAACCATTCGCGGAAC 1076
BSNT_03918___ 1101 CTCTAAGAAGTGGAAGAATCTGACCATATCGCCTGCAAGTCATAATGTGT 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27030___sa 1077 CTCTAAGAAGTGGAAGAATCTGACCATATCGCCTGCAAGTCATAATGTGT 1126
BSNT_03918___ 1151 TAGCAGGGCAATCTGGAGATGCCTATGAAATAAATGCAGAATTTAAAGTA 1200
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27030___sa 1127 TAGCGGGGCAATCTGGAGATGCCTATGAAATAAATGCAGAATTTAAAGTA 1176
BSNT_03918___ 1201 AGCCCTGGTTCAGCTGCTGAATTTGGTTTTAAGGTCCGAACAGGTGAAAA 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27030___sa 1177 AGCCCTGGTTCAGCTGCTGAATTTGGTTTTAAGGTCCGAACAGGTGAAAA 1226
BSNT_03918___ 1251 TCAATTTACGAAGGTCGGCTATGACCGAAGGAACGCCAAATTGTTCGTTG 1300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27030___sa 1227 TCAATTTACGAAGGTCGGCTATGACCGAAGGAACGCCAAATTGTTCGTTG 1276
BSNT_03918___ 1301 ACCGGAGCGAGTCGGGCAACAACACCTTTAATCCGGCCTTTAACACCGGA 1350
|||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
BSU27030___sa 1277 ACCGGAGCGAGTCAGGCAACGACACCTTTAATCCGGCCTTTAACACCGGA 1326
BSNT_03918___ 1351 AAAGAAACAGCCCCATTGAAGCCGGTAAATGGGAAGGTTAAGATGCGCAT 1400
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||
BSU27030___sa 1327 AAAGAAACAGCCCCGTTGAAGCCGGTAAATGGGAAGGTTAAGTTGCGCAT 1376
BSNT_03918___ 1401 TTTTGTTGACCGCTCTTCGGTTGAAGTATTTGGGAATGACGGAAAGCAGG 1450
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27030___sa 1377 TTTTGTTGACCGCTCCTCGGTTGAAGTATTTGGGAATGACGGAAAGCAGG 1426
BSNT_03918___ 1451 TCATAACGGATATTATTCTCCCAGACCGATCAAGCAAAGGGCTTGAATTA 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27030___sa 1427 TCATAACGGATATTATTCTCCCAGACCGATCAAGCAAAGGGCTTGAATTA 1476
BSNT_03918___ 1501 TATGCTGCAAATGGCGGTGTAAAGGTAAAATCTTTAACGATACACCCTTT 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27030___sa 1477 TATGCTGCAAATGGCGGTGTAAAGGTAAAATCTTTAACGATACACCCTTT 1526
BSNT_03918___ 1551 GAAAAAGGTATGGGGAACGTCACCTTTTATGTCCAATTTGACCGGCTGGA 1600
.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||.|||||||
BSU27030___sa 1527 AAAAAAGGTATGGGGAACGACACCTTTTATGTCCAATATGACTGGCTGGA 1576
BSNT_03918___ 1601 CGACTGTAAATGGCACGTGGGCCGACACAATTGAGGGGAAACAAGGGAGG 1650
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
BSU27030___sa 1577 CGACTGTAAATGGCACGTGGGCAGACACAATTGAGGGGAAACAAGGGAGG 1626
BSNT_03918___ 1651 TCGGACGGAGATTCCTTTATCTTGTCTTCAGCATCCGGGTCAGACTTCAC 1700
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27030___sa 1627 TCGGACGGCGATTCCTTTATCTTGTCTTCAGCATCCGGGTCAGACTTCAC 1676
BSNT_03918___ 1701 TTATGAATCTGATATCACCATTAAGGATGGAAACGGAAGAGGGGCAGGAG 1750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27030___sa 1677 TTATGAATCTGATATCACCATTAAGGATGGAAACGGAAGAGGGGCAGGAG 1726
BSNT_03918___ 1751 CACTAATGTTTCGCTCTGACAAAGATGCCAAAAACGGTTACCTTGCCAAT 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27030___sa 1727 CACTAATGTTTCGCTCTGACAAAGATGCCAAAAACGGTTACCTTGCCAAT 1776
BSNT_03918___ 1801 GTGGATGCGAAGCATGACCTAGTGAAATTCTTTAAATTTGAGAACGGTGC 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27030___sa 1777 GTGGATGCGAAGCATGACCTAGTGAAATTCTTTAAATTTGAGAACGGTGC 1826
BSNT_03918___ 1851 TGCTTCTGTCATTGCTGAATACAAAACACCGATAGACGTTAATAAAAAGT 1900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27030___sa 1827 TGCTTCTGTCATTGCTGAATACAAAACACCGATAGACGTTAATAAAAAGT 1876
BSNT_03918___ 1901 ATCATCTGAAAACAGAGGCCGAGGGCGATCGCTTTAAAATCTATTTAGAT 1950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27030___sa 1877 ATCATCTGAAAACAGAGGCCGAGGGCGATCGCTTTAAAATCTATTTAGAT 1926
BSNT_03918___ 1951 GATCATCTTGTGATTGATGCACATGATTCCGCATTTTCAGAAGGCCAATT 2000
||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
BSU27030___sa 1927 GATCGTCTTGTGATTGATGCACATGATTCCGTATTTTCAGAAGGCCAATT 1976
BSNT_03918___ 2001 TGGCTTGAATGTGTGGGACGCGACTGCTGTCTTTCAGAATGTAACGAAGG 2050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU27030___sa 1977 TGGCTTGAATGTGTGGGACGCGACTGCTGTCTTTCAGAATGTAACGAAGG 2026
BSNT_03918___ 2051 AGTCTTAA 2058
||||||||
BSU27030___sa 2027 AGTCTTAA 2034
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.