Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195

Home About Browser Genes Download Publications

DNA alignment: BSNT_03798 and BSU25510

See Amino acid alignment / Visit BSNT_03798 in genome browser / Return to Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon  8 Mar 2010 06:22:52
# Commandline: needle
#    -asequence dna-align/BSNT_03798___lepA.1.22522.seq
#    -bsequence dna-align/BSU25510___lepA.2.22522.seq
#    -gapopen 10
#    -gapextend 0.5
#    -outfile dna-align/BSNT_03798___lepA-BSU25510___lepA.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_03798___lepA-BSU25510___lepA.aln
########################################

#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_03798___lepA
# 2: BSU25510___lepA
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1839
# Identity:    1836/1839 (99.8%)
# Similarity:  1836/1839 (99.8%)
# Gaps:           0/1839 ( 0.0%)
# Score: 9168.0
# 
#
#=======================================

BSNT_03798___      1 GTGACAGATAAAGAAAAGCGTTTAGAGAGGCAATCGAGAATACGGAATTT     50
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le      1 GTGACAGATAAAGAAAAGCGTTTAGAGAGGCAATCGAGAATACGGAATTT     50

BSNT_03798___     51 CTCTATCATTGCCCATATTGACCACGGAAAATCGACCTTAGCGGATCGTA    100
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le     51 CTCTATCATTGCCCATATTGACCACGGAAAATCGACCTTAGCGGATCGTA    100

BSNT_03798___    101 TTTTAGAAAAAACGTCGGCAATCACTCAACGAGAAATGAAAGAACAATTG    150
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le    101 TTTTAGAAAAAACGTCGGCAATCACTCAACGAGAAATGAAAGAACAATTG    150

BSNT_03798___    151 CTCGATTCTATGGATCTTGAACGTGAGCGGGGCATAACCATTAAATTAAA    200
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le    151 CTCGATTCTATGGATCTTGAACGTGAGCGGGGCATAACCATTAAATTAAA    200

BSNT_03798___    201 CTCTGTTCAGCTTAAATATAAAGCAAAAGACGGAGAAGAATATATCTTTC    250
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le    201 CTCTGTTCAGCTTAAATATAAAGCAAAAGACGGAGAAGAATATATCTTTC    250

BSNT_03798___    251 ATCTAATCGATACGCCGGGACACGTCGACTTCACGTATGAAGTATCCCGA    300
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le    251 ATCTAATCGATACGCCGGGACACGTCGACTTCACGTATGAAGTATCCCGA    300

BSNT_03798___    301 AGCCTTGCTGCCTGCGAGGGAGCGATTCTTGTCGTGGATGCAGCCCAGGG    350
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le    301 AGCCTTGCTGCCTGCGAGGGAGCGATTCTTGTCGTGGATGCAGCCCAGGG    350

BSNT_03798___    351 GATTGAAGCGCAGACGCTCGCCAATGTCTACTTAGCGCTTGACAACGATC    400
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le    351 GATTGAAGCGCAGACGCTCGCCAATGTCTACTTAGCGCTTGACAACGATC    400

BSNT_03798___    401 TTGAAATCCTTCCGGTCATCAATAAAATCGACCTTCCGAGCGCCGAGCCC    450
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le    401 TTGAAATCCTTCCGGTCATCAATAAAATCGACCTTCCGAGCGCCGAGCCC    450

BSNT_03798___    451 GAACGTGTGCGCCAAGAGGTAGAAGACGTTATCGGCCTTGACGCATCAGA    500
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le    451 GAACGTGTGCGCCAAGAGGTAGAAGACGTTATCGGCCTTGACGCATCAGA    500

BSNT_03798___    501 AGCCGTGCTTGCTTCAGCAAAAGCCGGTATCGGGATTGAGGAGATTTTAG    550
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le    501 AGCCGTGCTTGCTTCAGCAAAAGCCGGTATCGGGATTGAGGAGATTTTAG    550

BSNT_03798___    551 AACAAATCGTAGAAAAGGTGCCAGCTCCGACCGGAGATCCGGAGGCGCCG    600
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le    551 AACAAATCGTAGAAAAGGTGCCAGCTCCGACCGGAGATCCGGAGGCGCCG    600

BSNT_03798___    601 CTCAAAGCGCTGATCTTCGACTCGCTTTATGACGCCTACCGCGGTGTCGT    650
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le    601 CTCAAAGCGCTGATCTTCGACTCGCTTTATGACGCCTACCGCGGTGTCGT    650

BSNT_03798___    651 GGCTTATATCAGAGTCGTTGAAGGAACGGTAAAGCCGGGACAAAAAATCA    700
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le    651 GGCTTATATCAGAGTCGTTGAAGGAACGGTAAAGCCGGGACAAAAAATCA    700

BSNT_03798___    701 AAATGATGGCAACCGGCAAAGAATTCGAAGTAACAGAGGTGGGCGTGTTC    750
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le    701 AAATGATGGCAACCGGCAAAGAATTCGAAGTAACAGAGGTGGGCGTGTTC    750

BSNT_03798___    751 ACGCCGAAAGCAACTCCGACAAATGAACTGACGGTCGGTGATGTAGGCTT    800
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le    751 ACGCCGAAAGCAACTCCGACAAATGAACTGACGGTCGGTGATGTAGGCTT    800

BSNT_03798___    801 CCTGACTGCCTCAATCAAAAATGTCGGTGACACACGTGTCGGTGATACAA    850
                     ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le    801 CCTGACTGCCTCAATCAAAAATGTTGGTGACACACGTGTCGGTGATACAA    850

BSNT_03798___    851 TAACGAGCGCTGCCAATCCTGCAGAAGAAGCGCTGCCGGGATACCGCAAG    900
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le    851 TAACGAGCGCTGCCAATCCTGCAGAAGAAGCGCTGCCGGGATACCGCAAG    900

BSNT_03798___    901 CTAAACCCGATGGTGTACTGTGGTTTGTATCCGATTGATACAGCGAAGTA    950
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le    901 CTAAACCCGATGGTGTACTGTGGTTTGTATCCGATTGATACAGCGAAGTA    950

BSNT_03798___    951 TAATGATTTAAGGGAAGCTCTTGAAAAGCTTGAGCTGAATGATTCCTCCC   1000
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le    951 TAATGATTTAAGGGAAGCTCTTGAAAAGCTTGAGCTGAATGATTCCTCCC   1000

BSNT_03798___   1001 TTCAATATGAAGCGGAAACTTCGCAAGCGCTTGGATTCGGGTTCCGCTGC   1050
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le   1001 TTCAATATGAAGCGGAAACTTCGCAAGCGCTTGGATTCGGGTTCCGCTGC   1050

BSNT_03798___   1051 GGATTTTTAGGCATGCTTCACATGGAGATCATTCAGGAGCGAATTGAGCG   1100
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le   1051 GGATTTTTAGGCATGCTTCACATGGAGATCATTCAGGAGCGAATTGAGCG   1100

BSNT_03798___   1101 TGAGTTCAACATCGACCTGATTACGACAGCGCCAAGCGTTATCTATGATG   1150
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
BSU25510___le   1101 TGAGTTCAACATCGACCTGATTACGACAGCGCCAAGCGTTATCTATGACG   1150

BSNT_03798___   1151 TGTATATGACAGACGGCGAAAAGGTCGTTGTCGACAACCCGTCCAACATG   1200
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le   1151 TGTATATGACAGACGGCGAAAAGGTCGTTGTCGACAACCCGTCCAACATG   1200

BSNT_03798___   1201 CCGGATCCTCAAAAGATCGAAAGGGTTGAGGAGCCATACGTAAAAGCGAC   1250
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le   1201 CCGGATCCTCAAAAGATCGAAAGGGTTGAGGAGCCATACGTAAAAGCGAC   1250

BSNT_03798___   1251 GATGATGGTGCCGAATGACTATGTCGGCGCTGTAATGGAGCTTTGCCAAG   1300
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le   1251 GATGATGGTGCCGAATGACTATGTCGGCGCTGTAATGGAGCTTTGCCAAG   1300

BSNT_03798___   1301 GAAAACGCGGCAATTTCATTGATATGCAGTATTTAGACGCAAACCGTGTC   1350
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le   1301 GAAAACGCGGCAATTTCATTGATATGCAGTATTTAGACGCAAACCGTGTC   1350

BSNT_03798___   1351 AGCATCATTTATGATATGCCATTAGCGGAAATCGTATATGAGTTTTTTGA   1400
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le   1351 AGCATCATTTATGATATGCCATTAGCGGAAATCGTATATGAGTTTTTTGA   1400

BSNT_03798___   1401 TCAGCTGAAATCAAGCACTAAAGGCTATGCGTCCTTTGATTATGAACTGA   1450
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le   1401 TCAGCTGAAATCAAGCACTAAAGGCTATGCGTCCTTTGATTATGAACTGA   1450

BSNT_03798___   1451 TCGGCTACAAACCGTCCAAGCTTGTGAAAATGGACATTATGCTGAATGGT   1500
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le   1451 TCGGCTACAAACCGTCCAAGCTTGTGAAAATGGACATTATGCTGAATGGT   1500

BSNT_03798___   1501 GAAAAAATCGATGCCCTTTCCTTTATCGTGCATCGTGATTACGCATATGA   1550
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le   1501 GAAAAAATCGATGCCCTTTCCTTTATCGTGCATCGTGATTACGCATATGA   1550

BSNT_03798___   1551 ACGGGGAAAAGTGATCGTTGAAAAACTGAAAGAACTCATTCCGCGCCAGC   1600
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le   1551 ACGGGGAAAAGTGATCGTTGAAAAACTGAAAGAACTCATTCCGCGCCAGC   1600

BSNT_03798___   1601 AGTTTGAAGTTCCGGTACAAGCCGCAATCGGCCAGAAAATCGTGGCCCGC   1650
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le   1601 AGTTTGAAGTTCCGGTACAAGCCGCAATCGGCCAGAAAATCGTGGCCCGC   1650

BSNT_03798___   1651 TCCACCATAAAAGCAATGCGTAAAAACGTATTGGCTAAATGTTACGGAGG   1700
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le   1651 TCCACCATAAAAGCAATGCGTAAAAACGTATTGGCTAAATGTTACGGAGG   1700

BSNT_03798___   1701 GGACATCTCGCGTAAACGGAAACTTCTTGAAAAACAAAAAGAAGGAAAAC   1750
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
BSU25510___le   1701 GGACATCTCGCGTAAACGGAAACTTCTTGAAAAACAAAAAGAAGGAAAGC   1750

BSNT_03798___   1751 GCCGTATGAAGCAGGTCGGCTCAGTTGAAGTGCCGCAAGAAGCATTTATG   1800
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le   1751 GCCGTATGAAGCAGGTCGGCTCAGTTGAAGTGCCGCAAGAAGCATTTATG   1800

BSNT_03798___   1801 GCAGTTCTGAAAATGGACGACAGTCCGAAAAAACAATAG   1839
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le   1801 GCAGTTCTGAAAATGGACGACAGTCCGAAAAAACAATAG   1839


#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.