Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_03798 and BSU25510
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_03798 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:22:52
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_03798___lepA.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU25510___lepA.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_03798___lepA-BSU25510___lepA.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_03798___lepA-BSU25510___lepA.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_03798___lepA
# 2: BSU25510___lepA
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1839
# Identity: 1836/1839 (99.8%)
# Similarity: 1836/1839 (99.8%)
# Gaps: 0/1839 ( 0.0%)
# Score: 9168.0
#
#
#=======================================
BSNT_03798___ 1 GTGACAGATAAAGAAAAGCGTTTAGAGAGGCAATCGAGAATACGGAATTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le 1 GTGACAGATAAAGAAAAGCGTTTAGAGAGGCAATCGAGAATACGGAATTT 50
BSNT_03798___ 51 CTCTATCATTGCCCATATTGACCACGGAAAATCGACCTTAGCGGATCGTA 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le 51 CTCTATCATTGCCCATATTGACCACGGAAAATCGACCTTAGCGGATCGTA 100
BSNT_03798___ 101 TTTTAGAAAAAACGTCGGCAATCACTCAACGAGAAATGAAAGAACAATTG 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le 101 TTTTAGAAAAAACGTCGGCAATCACTCAACGAGAAATGAAAGAACAATTG 150
BSNT_03798___ 151 CTCGATTCTATGGATCTTGAACGTGAGCGGGGCATAACCATTAAATTAAA 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le 151 CTCGATTCTATGGATCTTGAACGTGAGCGGGGCATAACCATTAAATTAAA 200
BSNT_03798___ 201 CTCTGTTCAGCTTAAATATAAAGCAAAAGACGGAGAAGAATATATCTTTC 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le 201 CTCTGTTCAGCTTAAATATAAAGCAAAAGACGGAGAAGAATATATCTTTC 250
BSNT_03798___ 251 ATCTAATCGATACGCCGGGACACGTCGACTTCACGTATGAAGTATCCCGA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le 251 ATCTAATCGATACGCCGGGACACGTCGACTTCACGTATGAAGTATCCCGA 300
BSNT_03798___ 301 AGCCTTGCTGCCTGCGAGGGAGCGATTCTTGTCGTGGATGCAGCCCAGGG 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le 301 AGCCTTGCTGCCTGCGAGGGAGCGATTCTTGTCGTGGATGCAGCCCAGGG 350
BSNT_03798___ 351 GATTGAAGCGCAGACGCTCGCCAATGTCTACTTAGCGCTTGACAACGATC 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le 351 GATTGAAGCGCAGACGCTCGCCAATGTCTACTTAGCGCTTGACAACGATC 400
BSNT_03798___ 401 TTGAAATCCTTCCGGTCATCAATAAAATCGACCTTCCGAGCGCCGAGCCC 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le 401 TTGAAATCCTTCCGGTCATCAATAAAATCGACCTTCCGAGCGCCGAGCCC 450
BSNT_03798___ 451 GAACGTGTGCGCCAAGAGGTAGAAGACGTTATCGGCCTTGACGCATCAGA 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le 451 GAACGTGTGCGCCAAGAGGTAGAAGACGTTATCGGCCTTGACGCATCAGA 500
BSNT_03798___ 501 AGCCGTGCTTGCTTCAGCAAAAGCCGGTATCGGGATTGAGGAGATTTTAG 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le 501 AGCCGTGCTTGCTTCAGCAAAAGCCGGTATCGGGATTGAGGAGATTTTAG 550
BSNT_03798___ 551 AACAAATCGTAGAAAAGGTGCCAGCTCCGACCGGAGATCCGGAGGCGCCG 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le 551 AACAAATCGTAGAAAAGGTGCCAGCTCCGACCGGAGATCCGGAGGCGCCG 600
BSNT_03798___ 601 CTCAAAGCGCTGATCTTCGACTCGCTTTATGACGCCTACCGCGGTGTCGT 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le 601 CTCAAAGCGCTGATCTTCGACTCGCTTTATGACGCCTACCGCGGTGTCGT 650
BSNT_03798___ 651 GGCTTATATCAGAGTCGTTGAAGGAACGGTAAAGCCGGGACAAAAAATCA 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le 651 GGCTTATATCAGAGTCGTTGAAGGAACGGTAAAGCCGGGACAAAAAATCA 700
BSNT_03798___ 701 AAATGATGGCAACCGGCAAAGAATTCGAAGTAACAGAGGTGGGCGTGTTC 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le 701 AAATGATGGCAACCGGCAAAGAATTCGAAGTAACAGAGGTGGGCGTGTTC 750
BSNT_03798___ 751 ACGCCGAAAGCAACTCCGACAAATGAACTGACGGTCGGTGATGTAGGCTT 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le 751 ACGCCGAAAGCAACTCCGACAAATGAACTGACGGTCGGTGATGTAGGCTT 800
BSNT_03798___ 801 CCTGACTGCCTCAATCAAAAATGTCGGTGACACACGTGTCGGTGATACAA 850
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le 801 CCTGACTGCCTCAATCAAAAATGTTGGTGACACACGTGTCGGTGATACAA 850
BSNT_03798___ 851 TAACGAGCGCTGCCAATCCTGCAGAAGAAGCGCTGCCGGGATACCGCAAG 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le 851 TAACGAGCGCTGCCAATCCTGCAGAAGAAGCGCTGCCGGGATACCGCAAG 900
BSNT_03798___ 901 CTAAACCCGATGGTGTACTGTGGTTTGTATCCGATTGATACAGCGAAGTA 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le 901 CTAAACCCGATGGTGTACTGTGGTTTGTATCCGATTGATACAGCGAAGTA 950
BSNT_03798___ 951 TAATGATTTAAGGGAAGCTCTTGAAAAGCTTGAGCTGAATGATTCCTCCC 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le 951 TAATGATTTAAGGGAAGCTCTTGAAAAGCTTGAGCTGAATGATTCCTCCC 1000
BSNT_03798___ 1001 TTCAATATGAAGCGGAAACTTCGCAAGCGCTTGGATTCGGGTTCCGCTGC 1050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le 1001 TTCAATATGAAGCGGAAACTTCGCAAGCGCTTGGATTCGGGTTCCGCTGC 1050
BSNT_03798___ 1051 GGATTTTTAGGCATGCTTCACATGGAGATCATTCAGGAGCGAATTGAGCG 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le 1051 GGATTTTTAGGCATGCTTCACATGGAGATCATTCAGGAGCGAATTGAGCG 1100
BSNT_03798___ 1101 TGAGTTCAACATCGACCTGATTACGACAGCGCCAAGCGTTATCTATGATG 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
BSU25510___le 1101 TGAGTTCAACATCGACCTGATTACGACAGCGCCAAGCGTTATCTATGACG 1150
BSNT_03798___ 1151 TGTATATGACAGACGGCGAAAAGGTCGTTGTCGACAACCCGTCCAACATG 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le 1151 TGTATATGACAGACGGCGAAAAGGTCGTTGTCGACAACCCGTCCAACATG 1200
BSNT_03798___ 1201 CCGGATCCTCAAAAGATCGAAAGGGTTGAGGAGCCATACGTAAAAGCGAC 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le 1201 CCGGATCCTCAAAAGATCGAAAGGGTTGAGGAGCCATACGTAAAAGCGAC 1250
BSNT_03798___ 1251 GATGATGGTGCCGAATGACTATGTCGGCGCTGTAATGGAGCTTTGCCAAG 1300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le 1251 GATGATGGTGCCGAATGACTATGTCGGCGCTGTAATGGAGCTTTGCCAAG 1300
BSNT_03798___ 1301 GAAAACGCGGCAATTTCATTGATATGCAGTATTTAGACGCAAACCGTGTC 1350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le 1301 GAAAACGCGGCAATTTCATTGATATGCAGTATTTAGACGCAAACCGTGTC 1350
BSNT_03798___ 1351 AGCATCATTTATGATATGCCATTAGCGGAAATCGTATATGAGTTTTTTGA 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le 1351 AGCATCATTTATGATATGCCATTAGCGGAAATCGTATATGAGTTTTTTGA 1400
BSNT_03798___ 1401 TCAGCTGAAATCAAGCACTAAAGGCTATGCGTCCTTTGATTATGAACTGA 1450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le 1401 TCAGCTGAAATCAAGCACTAAAGGCTATGCGTCCTTTGATTATGAACTGA 1450
BSNT_03798___ 1451 TCGGCTACAAACCGTCCAAGCTTGTGAAAATGGACATTATGCTGAATGGT 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le 1451 TCGGCTACAAACCGTCCAAGCTTGTGAAAATGGACATTATGCTGAATGGT 1500
BSNT_03798___ 1501 GAAAAAATCGATGCCCTTTCCTTTATCGTGCATCGTGATTACGCATATGA 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le 1501 GAAAAAATCGATGCCCTTTCCTTTATCGTGCATCGTGATTACGCATATGA 1550
BSNT_03798___ 1551 ACGGGGAAAAGTGATCGTTGAAAAACTGAAAGAACTCATTCCGCGCCAGC 1600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le 1551 ACGGGGAAAAGTGATCGTTGAAAAACTGAAAGAACTCATTCCGCGCCAGC 1600
BSNT_03798___ 1601 AGTTTGAAGTTCCGGTACAAGCCGCAATCGGCCAGAAAATCGTGGCCCGC 1650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le 1601 AGTTTGAAGTTCCGGTACAAGCCGCAATCGGCCAGAAAATCGTGGCCCGC 1650
BSNT_03798___ 1651 TCCACCATAAAAGCAATGCGTAAAAACGTATTGGCTAAATGTTACGGAGG 1700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le 1651 TCCACCATAAAAGCAATGCGTAAAAACGTATTGGCTAAATGTTACGGAGG 1700
BSNT_03798___ 1701 GGACATCTCGCGTAAACGGAAACTTCTTGAAAAACAAAAAGAAGGAAAAC 1750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
BSU25510___le 1701 GGACATCTCGCGTAAACGGAAACTTCTTGAAAAACAAAAAGAAGGAAAGC 1750
BSNT_03798___ 1751 GCCGTATGAAGCAGGTCGGCTCAGTTGAAGTGCCGCAAGAAGCATTTATG 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le 1751 GCCGTATGAAGCAGGTCGGCTCAGTTGAAGTGCCGCAAGAAGCATTTATG 1800
BSNT_03798___ 1801 GCAGTTCTGAAAATGGACGACAGTCCGAAAAAACAATAG 1839
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25510___le 1801 GCAGTTCTGAAAATGGACGACAGTCCGAAAAAACAATAG 1839
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.