Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_03776 and BSU25330
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_03776 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:22:49
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_03776___yqfF.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU25330___yqfF.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_03776___yqfF-BSU25330___yqfF.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_03776___yqfF-BSU25330___yqfF.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_03776___yqfF
# 2: BSU25330___yqfF
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 2136
# Identity: 2124/2136 (99.4%)
# Similarity: 2124/2136 (99.4%)
# Gaps: 0/2136 ( 0.0%)
# Score: 10572.0
#
#
#=======================================
BSNT_03776___ 1 GTGTTGAAAAAGAAGGCTAAGACCAAAAGCAGCTCAAAAAAATGGAGCAG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25330___yq 1 GTGTTGAAAAAGAAGGCTAAGACCAAAAGCAGCTCAAAAAAATGGAGCAG 50
BSNT_03776___ 51 TTTTAAAAATGCCCGCTCCATGCATGTACTGCTGTATCTTCTGCTGGCTA 100
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
BSU25330___yq 51 TTTTAAAAATGCCCGCTCCATGCATGTACTGCTGTATCTTCTGCTGGCTG 100
BSNT_03776___ 101 CCATTATGTTTGCTTTGCTCTTTATACATGTTAAGCCGGAAACACTTGAT 150
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
BSU25330___yq 101 CCATTATGTTTGCTTTGCTCTTTGTACATGTTAAGCCGGAAACACTTGAT 150
BSNT_03776___ 151 TTAGACCTGTTTTCAGTTAGCGACAAGACCATTTACGCTCCGGCAACCGT 200
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25330___yq 151 TTAGACCTGTTTTCAGTCAGCGACAAGACCATTTACGCTCCGGCAACCGT 200
BSNT_03776___ 201 AGAAGATCAAAAAGCCACAGAGGAAAAAAAGCAAGCCGCTGAGGACGCGG 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25330___yq 201 AGAAGATCAAAAAGCCACAGAGGAAAAAAAGCAAGCCGCTGAGGACGCGG 250
BSNT_03776___ 251 TTGAAGATCAATATACATTAAAAAAAGAATATACAGACAATCGGATTGAC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25330___yq 251 TTGAAGATCAATATACATTAAAAAAAGAATATACAGACAATCGGATTGAC 300
BSNT_03776___ 301 CTTGTGTCATCAATATTCGACAGTATTAGTGAAGTGAAAAAATCATCAGA 350
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
BSU25330___yq 301 CTTGTGTCATCAATATTCGACAGTATTAGTGAAGTGAAAAAATCATCGGA 350
BSNT_03776___ 351 AGAAGGCAGTAAATCACCATCGGAAAAATCAATGGTCAAATCTGTAAAGG 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25330___yq 351 AGAAGGCAGTAAATCACCATCGGAAAAATCAATGGTCAAATCTGTAAAGG 400
BSNT_03776___ 401 ACAAATTGACATCAGATGTGAATGATTCTATATCGGAGGATTCCATCAAG 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25330___yq 401 ACAAATTGACATCAGATGTGAATGATTCTATATCGGAGGATTCCATCAAG 450
BSNT_03776___ 451 ACATTGCTGAAAGCAGACAGTGAAGACTTTTCTTTTGTCAGAGATACGGT 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25330___yq 451 ACATTGCTGAAAGCAGACAGTGAAGACTTTTCTTTTGTCAGAGATACGGT 500
BSNT_03776___ 501 CATTACCGCGGTAAATACGGTCATGAGCAGTGAAATCCCCTCGGATAAAC 550
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
BSU25330___yq 501 CATTACCGCGGTAAATACGGTCATGAGCAGTGAAATCCCTTCGGATAAAC 550
BSNT_03776___ 551 TATCTGATGCAAAGGATAAGGTAGAAAAAGAGCTAAAGAGCAATTCTATT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25330___yq 551 TATCTGATGCAAAGGATAAGGTAGAAAAAGAGCTAAAGAGCAATTCTATT 600
BSNT_03776___ 601 CCGTCTAAATACTTGGGAGCCGCGACAGAAATCGGGCGTTTTGCTATTAT 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25330___yq 601 CCGTCTAAATACTTGGGAGCCGCGACAGAAATCGGGCGTTTTGCTATTAT 650
BSNT_03776___ 651 TCCGAATTACGTCTTCGATCCGAAAGCAACAGAGGCAAAACGGCAGGAAG 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25330___yq 651 TCCGAATTACGTCTTCGATCCGAAAGCAACAGAGGCAAAACGGCAGGAAG 700
BSNT_03776___ 701 CCTCAGATAATGTCCAGCAGGTTCAAATCAAACAGGGACAAGTGCTCGTG 750
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
BSU25330___yq 701 CCTCAGATAATGTCCAGCAGGTTCAAATCAAACAGGGGCAAGTGCTCGTG 750
BSNT_03776___ 751 GAAGAAAATGACCTCATTGATCGGGAAGTGTACAGAAAACTTGAGCTGAC 800
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
BSU25330___yq 751 GAAGAAAATGACCTCATTGATCGGGAAGTGTACAGGAAACTTGAGCTGAC 800
BSNT_03776___ 801 CGGGTTATTAAATAACTCAAATCTCTTTAAACCGATCAGCGGGCTATTGA 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25330___yq 801 CGGGTTATTAAATAACTCAAATCTCTTTAAACCGATCAGCGGGCTATTGA 850
BSNT_03776___ 851 TTATGATCGGACTTTTCATTGCAACACTTGTATATTATTTTGAAAAACAG 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25330___yq 851 TTATGATCGGACTTTTCATTGCAACACTTGTATATTATTTTGAAAAACAG 900
BSNT_03776___ 901 AAACAAAATCTGAAGTTTAAAAACCAATCCATTCTGTTATTCTCCATAAT 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25330___yq 901 AAACAAAATCTGAAGTTTAAAAACCAATCCATTCTGTTATTCTCCATAAT 950
BSNT_03776___ 951 CACAACACTTTTGCTTGTGATCATGGAGGTTGTCAGTTTGTTTCAGAAGA 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25330___yq 951 CACAACACTTTTGCTTGTGATCATGGAGGTTGTCAGTTTGTTTCAGAAGA 1000
BSNT_03776___ 1001 TGGAGTATAATAATATCGGCTATCTGGTCCCCATTGCGGCCGGCGCCATC 1050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25330___yq 1001 TGGAGTATAATAATATCGGCTATCTGGTCCCCATTGCGGCCGGCGCCATC 1050
BSNT_03776___ 1051 TTAATCAAACTGCTGATGAATGAACGCATTGCCATTTTGGGAAGTATCAT 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25330___yq 1051 TTAATCAAACTGCTGATGAATGAACGCATTGCCATTTTGGGAAGTATCAT 1100
BSNT_03776___ 1101 TCTTGCGATTTGCGGAAGTATGATGTTTAATCAGGGTGTGACAGGAACAT 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25330___yq 1101 TCTTGCGATTTGCGGAAGTATGATGTTTAATCAGGGTGTGACAGGAACAT 1150
BSNT_03776___ 1151 TCAATTATGTCATAGGGATTTATTATTTGATCAGCGGCATTTCAGGTGTA 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25330___yq 1151 TCAATTATGTCATAGGGATTTATTATTTGATCAGCGGCATTTCAGGTGTA 1200
BSNT_03776___ 1201 TTATTTTTAGGAAAACACAATGCAAGATCAAAGATTTTGCAGACCGGACT 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25330___yq 1201 TTATTTTTAGGAAAACACAATGCAAGATCAAAGATTTTGCAGACCGGACT 1250
BSNT_03776___ 1251 TTTCGTGGCGTTTATTAATATGGTTGTCGTTCTATCCTTATTATTGATCC 1300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25330___yq 1251 TTTCGTGGCGTTTATTAATATGGTTGTCGTTCTATCCTTATTATTGATCC 1300
BSNT_03776___ 1301 AGAACACTGCGCTGTCGGGTCTTGAAATCGGCACGTTAATGCTCATGGGG 1350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25330___yq 1301 AGAACACTGCGCTGTCGGGTCTTGAAATCGGCACGTTAATGCTCATGGGG 1350
BSNT_03776___ 1351 GTTGTGTCGGGGTTTGCTTCATCTGTATTGATCATCGGCCTGATGCCGTT 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
BSU25330___yq 1351 GTTGTGTCGGGGTTTGCTTCATCTGTATTGATCATCGGTCTGATGCCGTT 1400
BSNT_03776___ 1401 TTTTGAGACGGGCTTTGGCATTTTATCCACCATGAGGCTGCTCGAGCTGT 1450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25330___yq 1401 TTTTGAGACGGGCTTTGGCATTTTATCCACCATGAGGCTGCTCGAGCTGT 1450
BSNT_03776___ 1451 CTAATCCTAACCATCCGCTATTGCGCAAAATACTGACAGAAACACCAGGT 1500
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
BSU25330___yq 1451 CTAATCCTAACCATCCGCTATTGCGCAAAATACTGACGGAAACACCAGGT 1500
BSNT_03776___ 1501 ACATATCATCACAGTGTAATGGTTGCCAATTTATCAGAGGCAGCCTGTGA 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25330___yq 1501 ACATATCATCACAGTGTAATGGTTGCCAATTTATCAGAGGCAGCCTGTGA 1550
BSNT_03776___ 1551 AGCGGTTGGGGCTAATGGTTTGCTTGCAAGAGTCGGCGCATATTATCACG 1600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25330___yq 1551 AGCGGTTGGGGCTAATGGTTTGCTTGCAAGAGTCGGCGCATATTATCACG 1600
BSNT_03776___ 1601 ATCTCGGAAAAACAAAGCGCCCGCAATATTTTATTGAAAACCAAATGAAT 1650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25330___yq 1601 ATCTCGGAAAAACAAAGCGCCCGCAATATTTTATTGAAAACCAAATGAAT 1650
BSNT_03776___ 1651 ATTGACAATCCGCATGACAAGCTGTCACCTCAGTTGAGTAAAAATATTAT 1700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
BSU25330___yq 1651 ATTGACAATCCGCATGACAAGCTGTCACCTCAGTTGAGCAAAAATATTAT 1700
BSNT_03776___ 1701 TATCTCGCATACGACAGACGGTGCGAATATGCTGAGAAGCTATAAATTTC 1750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25330___yq 1701 TATCTCGCATACGACAGACGGTGCGAATATGCTGAGAAGCTATAAATTTC 1750
BSNT_03776___ 1751 CGAAAGAGCTTGTCGATATTGCTGAGCAGCATCATGGAACCTCGCTTTTA 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25330___yq 1751 CGAAAGAGCTTGTCGATATTGCTGAGCAGCATCATGGAACCTCGCTTTTA 1800
BSNT_03776___ 1801 AAGTTTTTTTACTATAAAGCGAAGGAAAAAGGCGACCAGATTACAGAGGA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25330___yq 1801 AAGTTTTTTTACTATAAAGCGAAGGAAAAAGGCGACCAGATTACAGAGGA 1850
BSNT_03776___ 1851 AGAGTTCCGTTATCCGGGGCCGAAGCCGCAGTCAAAGGAAGCCGCAATTA 1900
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25330___yq 1851 AGAGTTCCGTTATCCGGGACCGAAGCCGCAGTCAAAGGAAGCCGCAATTA 1900
BSNT_03776___ 1901 TATCAGTGGCCGACAGTGTTGAAGCGGCCGTCAGATCCATGCACAATCCA 1950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25330___yq 1901 TATCAGTGGCCGACAGTGTTGAAGCGGCCGTCAGATCCATGCACAATCCA 1950
BSNT_03776___ 1951 AATCCTGAACGAATTGAAAAGCTTGTCCGGGGTATTATATCCGATAAGCT 2000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25330___yq 1951 AATCCTGAACGAATTGAAAAGCTTGTCCGGGGTATTATATCCGATAAGCT 2000
BSNT_03776___ 2001 TCAGGACGGACAGTTCAGTGAATGCGATCTGACATTTAAAGAGCTGGATA 2050
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
BSU25330___yq 2001 TCAGGACGGACAGTTCAGTGAATGCGATTTGACATTTAAAGAGCTGGATA 2050
BSNT_03776___ 2051 CAATCGCAAAAACGCTCTGTGCAACATTAAAAGGAATTTTCCACTCCCGG 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25330___yq 2051 CAATCGCAAAAACGCTCTGTGCAACATTAAAAGGAATTTTCCACTCCCGG 2100
BSNT_03776___ 2101 ATTGAATATCCGGAGGCTACTAAGAAGGTGAAATAG 2136
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25330___yq 2101 ATTGAATATCCGGAGGCTACTAAGAAGGTGAAATAG 2136
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.