Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_03767 and BSU25260
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_03767 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:22:47
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_03767___glyS.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU25260___glyS.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_03767___glyS-BSU25260___glyS.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_03767___glyS-BSU25260___glyS.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_03767___glyS
# 2: BSU25260___glyS
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 2040
# Identity: 2028/2040 (99.4%)
# Similarity: 2028/2040 (99.4%)
# Gaps: 0/2040 ( 0.0%)
# Score: 10092.0
#
#
#=======================================
BSNT_03767___ 1 ATGAGTAAACAGGATTTACTTTTAGAGATCGGATTAGAGGAAATGCCGGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl 1 ATGAGTAAACAGGATTTACTTTTAGAGATCGGATTAGAGGAAATGCCGGC 50
BSNT_03767___ 51 GCGCTTTTTGAATGAAAGCATGGTTCAGCTTGGCGACAAGCTGACAGGCT 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl 51 GCGCTTTTTGAATGAAAGCATGGTTCAGCTTGGCGACAAGCTGACAGGCT 100
BSNT_03767___ 101 GGCTTAAAGAAAAAAATATTACTCACGGTGAAGTGAAACTCTTCAATACA 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl 101 GGCTTAAAGAAAAAAATATTACTCACGGTGAAGTGAAACTCTTCAATACA 150
BSNT_03767___ 151 CCGAGACGTCTTGCTGTGTTCGTTAAGGGTGTCGCAGAAAAGCAGGATGA 200
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
BSU25260___gl 151 CCGAGACGTCTTGCTGTGTTCGTTAAGGATGTCGCAGAAAAGCAGGATGA 200
BSNT_03767___ 201 TATAAAAGAAGAAGCAAAAGGACCTGCGAAAAAAATTGCCCTTGATGCGG 250
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl 201 TATAAAAGAAGAAGCAAAAGGGCCTGCGAAAAAAATTGCCCTTGATGCGG 250
BSNT_03767___ 251 ACGGGAACTGGACAAAAGCGGCAATCGGCTTTTCAAAAGGCCAAGGCGCG 300
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
BSU25260___gl 251 ACGGGAACTGGACAAAAGCGGCAATCGGCTTTTCAAAAGGCCAAGGCGCA 300
BSNT_03767___ 301 AATGTGGAAGACCTGTACATCAAAGAAGTAAAAGGCATAGAGTATGTATT 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl 301 AATGTGGAAGACCTGTACATCAAAGAAGTAAAAGGCATAGAGTATGTATT 350
BSNT_03767___ 351 CGTGCAAAAATTCCAAGCCGGCCAAGAAACGAAGTCGCTTCTGCCAGAAT 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl 351 CGTGCAAAAATTCCAAGCCGGCCAAGAAACGAAGTCGCTTCTGCCAGAAT 400
BSNT_03767___ 401 TGAGCGGTTTAATTACAAGCTTGCATTTCCCGAAAAACATGCGCTGGGGA 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl 401 TGAGCGGTTTAATTACAAGCTTGCATTTCCCGAAAAACATGCGCTGGGGA 450
BSNT_03767___ 451 AATGAAGATTTGCGTTATATCCGACCGATCAAATGGATTGTCGCATTATT 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl 451 AATGAAGATTTGCGTTATATCCGACCGATCAAATGGATTGTCGCATTATT 500
BSNT_03767___ 501 TGGACAGGATGTCATTCCATTTTCGATCACAAACGTTGAGTCTGGACGGA 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl 501 TGGACAGGATGTCATTCCATTTTCGATCACAAACGTTGAGTCTGGACGGA 550
BSNT_03767___ 551 CAACACAGGGACATCGTTTCCTCGGACATGAAGTGTCAATTGAATCACCT 600
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl 551 CAACACAGGGACACCGTTTCCTCGGACATGAAGTGTCAATTGAATCACCT 600
BSNT_03767___ 601 TCAGCTTATGAAGAGCAGCTGAAAGAACAGCATGTTATTGCTGATCCTAG 650
||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl 601 TCAGCTTATGAAGAGCAGCTCAAAGGACAGCATGTTATTGCTGATCCTAG 650
BSNT_03767___ 651 CGTCCGAAAGCAAATGATTCAATCTCAGCTGGAAGCAATGGCTGCTGAAA 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
BSU25260___gl 651 CGTCCGAAAGCAAATGATTCAATCTCAGCTGGAAACAATGGCTGCTGAAA 700
BSNT_03767___ 701 ACAATTGGAGCATTCCAGTTGACGAAGACCTTCTTGATGAAGTGAATCAT 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl 701 ACAATTGGAGCATTCCAGTTGACGAAGACCTTCTTGATGAAGTGAATCAT 750
BSNT_03767___ 751 TTAGTAGAATACCCGACAGCTCTTTACGGTTCATTTGAATCGGAGTTTCT 800
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
BSU25260___gl 751 TTAGTAGAATACCCGACAGCTCTTTACGGTTCATTTGAATCCGAGTTTCT 800
BSNT_03767___ 801 GTCAATTCCTGAAGAAGTGCTTGTCACGACAATGAAAGAGCATCAGCGCT 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl 801 GTCAATTCCTGAAGAAGTGCTTGTCACGACAATGAAAGAGCATCAGCGCT 850
BSNT_03767___ 851 ACTTCCCTGTCAAAGACAAAAACGGTGACCTGCTGCCTCACTTTATCACA 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl 851 ACTTCCCTGTCAAAGACAAAAACGGTGACCTGCTGCCTCACTTTATCACA 900
BSNT_03767___ 901 GTCCGAAACGGCAACAGCCACGCGATTGAAAATGTGGCCCGAGGCAATGA 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl 901 GTCCGAAACGGCAACAGCCACGCGATTGAAAATGTGGCCCGAGGCAATGA 950
BSNT_03767___ 951 AAAAGTGCTGCGCGCACGTTTATCTGATGCTTCATTCTTCTACAAGGAAG 1000
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
BSU25260___gl 951 AAAAGTGCTGCGCGCACGTTTATCTGATGCTTCATTCTTCTACAAAGAAG 1000
BSNT_03767___ 1001 ATCAGAAACTAAACATTGATGCAAATGTGAAGAAGCTTGAAAATATCGTT 1050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl 1001 ATCAGAAACTAAACATTGATGCAAATGTGAAGAAGCTTGAAAATATCGTT 1050
BSNT_03767___ 1051 TTCCATGAAGAGCTTGGTTCTCTTGCTGATAAGGTTAGAAGAGTCACATC 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
BSU25260___gl 1051 TTCCATGAAGAGCTTGGTTCTCTTGCTGATAAGGTTAGGAGAGTCACATC 1100
BSNT_03767___ 1101 AATCGCAGAGAAACTTGCCGTTCGTCTTCAGGCTGATGAAGATACATTAA 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl 1101 AATCGCAGAGAAACTTGCCGTTCGTCTTCAGGCTGATGAAGATACATTAA 1150
BSNT_03767___ 1151 AACATGTGAAGCGGGCTGCTGAAATTTCTAAATTCGACCTTGTGACGCAT 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl 1151 AACATGTGAAGCGGGCTGCTGAAATTTCTAAATTCGACCTTGTGACGCAT 1200
BSNT_03767___ 1201 ATGATATATGAATTCCCTGAACTTCAAGGAATTATGGGCGAAAAGTATGC 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl 1201 ATGATATATGAATTCCCTGAACTTCAAGGAATTATGGGCGAAAAGTATGC 1250
BSNT_03767___ 1251 GAGAATGCTTGGCGAAGATGAAGCTGTGGCTGCGGCAGTTAATGAACATT 1300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl 1251 GAGAATGCTTGGCGAAGATGAAGCTGTGGCTGCGGCAGTTAATGAACATT 1300
BSNT_03767___ 1301 ATATGCCTAGATCAGCGGGCGGAGAAACGCCTTCTACTTTCACCGGAGCT 1350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl 1301 ATATGCCTAGATCAGCGGGCGGAGAAACGCCTTCTACTTTCACCGGAGCT 1350
BSNT_03767___ 1351 GTTGTAGCAATGGCGGATAAGCTTGACACAATCGCTTCATTCTTCTCTAT 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl 1351 GTTGTAGCAATGGCGGATAAGCTTGACACAATCGCTTCATTCTTCTCTAT 1400
BSNT_03767___ 1401 CGGCGTAATTCCGACCGGTTCCCAGGACCCTTACGGACTGCGCCGCCAAG 1450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl 1401 CGGCGTAATTCCGACCGGTTCCCAGGACCCTTACGGACTGCGCCGCCAAG 1450
BSNT_03767___ 1451 CAAGCGGTATTGTTGCGATTCTTCTTGACCGCAACTGGGGAATTTCATTT 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl 1451 CAAGCGGTATTGTTGCGATTCTTCTTGACCGCAACTGGGGAATTTCATTT 1500
BSNT_03767___ 1501 GAAGAGCTGCTTACTTTCGTACAAACCGATAAAGAAATTGAACTGCTGGA 1550
||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||
BSU25260___gl 1501 GAAGAGCTGCTTACTTTCGTTCAAACCGATAAAGAAAATGAACTGCTGGA 1550
BSNT_03767___ 1551 TTTCTTCACTCAGCGCTTGAAATATGTCTTGAATGCTGAACAAATCAGAC 1600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl 1551 TTTCTTCACTCAGCGCTTGAAATATGTCTTGAATGCTGAACAAATCAGAC 1600
BSNT_03767___ 1601 ATGATGTCATTGACGCCGTGCTGGAAAGCTCTGAGCTTGAGCCGTACTCT 1650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl 1601 ATGATGTCATTGACGCCGTGCTGGAAAGCTCTGAGCTTGAGCCGTACTCT 1650
BSNT_03767___ 1651 GCGCTGCATAAAGCACAAGTACTGGAGCAAAAGCTTGGTGCACCTGGCTT 1700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl 1651 GCGCTGCATAAAGCACAAGTACTGGAGCAAAAGCTTGGTGCACCTGGCTT 1700
BSNT_03767___ 1701 TAAGGAAACAGCCGAAGCGTTAGGCCGAGTGATCTCTATCAGCAAAAAAG 1750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl 1701 TAAGGAAACAGCCGAAGCGTTAGGCCGAGTGATCTCTATCAGCAAAAAAG 1750
BSNT_03767___ 1751 GAGTCCGCGGAGACATTCAGCCTGATCTGTTTGAAAATGAATACGAAGCA 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl 1751 GAGTCCGCGGAGACATTCAGCCTGATCTGTTTGAAAATGAATACGAAGCA 1800
BSNT_03767___ 1801 AAACTGTTTGATGCCTACCAAACAGCGAAGCAAAATCTGCAGGAAAACTT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl 1801 AAACTGTTTGATGCCTACCAAACAGCGAAGCAAAATCTGCAGGAAAACTT 1850
BSNT_03767___ 1851 CAGCAAAAAAGATTATGAGGCGGCGCTTGCTTCACTTGCAGCCTTAAAAG 1900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl 1851 CAGCAAAAAAGATTATGAGGCGGCGCTTGCTTCACTTGCAGCCTTAAAAG 1900
BSNT_03767___ 1901 AACCGATCGATGCTTACTTCGATCATACAATGGTTATAGCGGATAATGAG 1950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl 1901 AACCGATCGATGCTTACTTCGATCATACAATGGTTATAGCGGATAATGAG 1950
BSNT_03767___ 1951 TCATTAAAGGCAAATCGTTTAGCGCAAATGGTAAGCTTGGCGGATGAGAT 2000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl 1951 TCATTAAAGGCAAATCGTTTAGCGCAAATGGTAAGCTTGGCGGATGAGAT 2000
BSNT_03767___ 2001 CAAGTCCTTTGCGAATATGAATGCCCTTATTGTAAAATAA 2040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl 2001 CAAGTCCTTTGCGAATATGAATGCCCTTATTGTAAAATAA 2040
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.