Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195

Home About Browser Genes Download Publications

DNA alignment: BSNT_03767 and BSU25260

See Amino acid alignment / Visit BSNT_03767 in genome browser / Return to Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon  8 Mar 2010 06:22:47
# Commandline: needle
#    -asequence dna-align/BSNT_03767___glyS.1.22522.seq
#    -bsequence dna-align/BSU25260___glyS.2.22522.seq
#    -gapopen 10
#    -gapextend 0.5
#    -outfile dna-align/BSNT_03767___glyS-BSU25260___glyS.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_03767___glyS-BSU25260___glyS.aln
########################################

#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_03767___glyS
# 2: BSU25260___glyS
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 2040
# Identity:    2028/2040 (99.4%)
# Similarity:  2028/2040 (99.4%)
# Gaps:           0/2040 ( 0.0%)
# Score: 10092.0
# 
#
#=======================================

BSNT_03767___      1 ATGAGTAAACAGGATTTACTTTTAGAGATCGGATTAGAGGAAATGCCGGC     50
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl      1 ATGAGTAAACAGGATTTACTTTTAGAGATCGGATTAGAGGAAATGCCGGC     50

BSNT_03767___     51 GCGCTTTTTGAATGAAAGCATGGTTCAGCTTGGCGACAAGCTGACAGGCT    100
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl     51 GCGCTTTTTGAATGAAAGCATGGTTCAGCTTGGCGACAAGCTGACAGGCT    100

BSNT_03767___    101 GGCTTAAAGAAAAAAATATTACTCACGGTGAAGTGAAACTCTTCAATACA    150
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl    101 GGCTTAAAGAAAAAAATATTACTCACGGTGAAGTGAAACTCTTCAATACA    150

BSNT_03767___    151 CCGAGACGTCTTGCTGTGTTCGTTAAGGGTGTCGCAGAAAAGCAGGATGA    200
                     ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
BSU25260___gl    151 CCGAGACGTCTTGCTGTGTTCGTTAAGGATGTCGCAGAAAAGCAGGATGA    200

BSNT_03767___    201 TATAAAAGAAGAAGCAAAAGGACCTGCGAAAAAAATTGCCCTTGATGCGG    250
                     |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl    201 TATAAAAGAAGAAGCAAAAGGGCCTGCGAAAAAAATTGCCCTTGATGCGG    250

BSNT_03767___    251 ACGGGAACTGGACAAAAGCGGCAATCGGCTTTTCAAAAGGCCAAGGCGCG    300
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
BSU25260___gl    251 ACGGGAACTGGACAAAAGCGGCAATCGGCTTTTCAAAAGGCCAAGGCGCA    300

BSNT_03767___    301 AATGTGGAAGACCTGTACATCAAAGAAGTAAAAGGCATAGAGTATGTATT    350
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl    301 AATGTGGAAGACCTGTACATCAAAGAAGTAAAAGGCATAGAGTATGTATT    350

BSNT_03767___    351 CGTGCAAAAATTCCAAGCCGGCCAAGAAACGAAGTCGCTTCTGCCAGAAT    400
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl    351 CGTGCAAAAATTCCAAGCCGGCCAAGAAACGAAGTCGCTTCTGCCAGAAT    400

BSNT_03767___    401 TGAGCGGTTTAATTACAAGCTTGCATTTCCCGAAAAACATGCGCTGGGGA    450
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl    401 TGAGCGGTTTAATTACAAGCTTGCATTTCCCGAAAAACATGCGCTGGGGA    450

BSNT_03767___    451 AATGAAGATTTGCGTTATATCCGACCGATCAAATGGATTGTCGCATTATT    500
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl    451 AATGAAGATTTGCGTTATATCCGACCGATCAAATGGATTGTCGCATTATT    500

BSNT_03767___    501 TGGACAGGATGTCATTCCATTTTCGATCACAAACGTTGAGTCTGGACGGA    550
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl    501 TGGACAGGATGTCATTCCATTTTCGATCACAAACGTTGAGTCTGGACGGA    550

BSNT_03767___    551 CAACACAGGGACATCGTTTCCTCGGACATGAAGTGTCAATTGAATCACCT    600
                     |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl    551 CAACACAGGGACACCGTTTCCTCGGACATGAAGTGTCAATTGAATCACCT    600

BSNT_03767___    601 TCAGCTTATGAAGAGCAGCTGAAAGAACAGCATGTTATTGCTGATCCTAG    650
                     ||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl    601 TCAGCTTATGAAGAGCAGCTCAAAGGACAGCATGTTATTGCTGATCCTAG    650

BSNT_03767___    651 CGTCCGAAAGCAAATGATTCAATCTCAGCTGGAAGCAATGGCTGCTGAAA    700
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
BSU25260___gl    651 CGTCCGAAAGCAAATGATTCAATCTCAGCTGGAAACAATGGCTGCTGAAA    700

BSNT_03767___    701 ACAATTGGAGCATTCCAGTTGACGAAGACCTTCTTGATGAAGTGAATCAT    750
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl    701 ACAATTGGAGCATTCCAGTTGACGAAGACCTTCTTGATGAAGTGAATCAT    750

BSNT_03767___    751 TTAGTAGAATACCCGACAGCTCTTTACGGTTCATTTGAATCGGAGTTTCT    800
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
BSU25260___gl    751 TTAGTAGAATACCCGACAGCTCTTTACGGTTCATTTGAATCCGAGTTTCT    800

BSNT_03767___    801 GTCAATTCCTGAAGAAGTGCTTGTCACGACAATGAAAGAGCATCAGCGCT    850
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl    801 GTCAATTCCTGAAGAAGTGCTTGTCACGACAATGAAAGAGCATCAGCGCT    850

BSNT_03767___    851 ACTTCCCTGTCAAAGACAAAAACGGTGACCTGCTGCCTCACTTTATCACA    900
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl    851 ACTTCCCTGTCAAAGACAAAAACGGTGACCTGCTGCCTCACTTTATCACA    900

BSNT_03767___    901 GTCCGAAACGGCAACAGCCACGCGATTGAAAATGTGGCCCGAGGCAATGA    950
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl    901 GTCCGAAACGGCAACAGCCACGCGATTGAAAATGTGGCCCGAGGCAATGA    950

BSNT_03767___    951 AAAAGTGCTGCGCGCACGTTTATCTGATGCTTCATTCTTCTACAAGGAAG   1000
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
BSU25260___gl    951 AAAAGTGCTGCGCGCACGTTTATCTGATGCTTCATTCTTCTACAAAGAAG   1000

BSNT_03767___   1001 ATCAGAAACTAAACATTGATGCAAATGTGAAGAAGCTTGAAAATATCGTT   1050
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl   1001 ATCAGAAACTAAACATTGATGCAAATGTGAAGAAGCTTGAAAATATCGTT   1050

BSNT_03767___   1051 TTCCATGAAGAGCTTGGTTCTCTTGCTGATAAGGTTAGAAGAGTCACATC   1100
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
BSU25260___gl   1051 TTCCATGAAGAGCTTGGTTCTCTTGCTGATAAGGTTAGGAGAGTCACATC   1100

BSNT_03767___   1101 AATCGCAGAGAAACTTGCCGTTCGTCTTCAGGCTGATGAAGATACATTAA   1150
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl   1101 AATCGCAGAGAAACTTGCCGTTCGTCTTCAGGCTGATGAAGATACATTAA   1150

BSNT_03767___   1151 AACATGTGAAGCGGGCTGCTGAAATTTCTAAATTCGACCTTGTGACGCAT   1200
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl   1151 AACATGTGAAGCGGGCTGCTGAAATTTCTAAATTCGACCTTGTGACGCAT   1200

BSNT_03767___   1201 ATGATATATGAATTCCCTGAACTTCAAGGAATTATGGGCGAAAAGTATGC   1250
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl   1201 ATGATATATGAATTCCCTGAACTTCAAGGAATTATGGGCGAAAAGTATGC   1250

BSNT_03767___   1251 GAGAATGCTTGGCGAAGATGAAGCTGTGGCTGCGGCAGTTAATGAACATT   1300
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl   1251 GAGAATGCTTGGCGAAGATGAAGCTGTGGCTGCGGCAGTTAATGAACATT   1300

BSNT_03767___   1301 ATATGCCTAGATCAGCGGGCGGAGAAACGCCTTCTACTTTCACCGGAGCT   1350
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl   1301 ATATGCCTAGATCAGCGGGCGGAGAAACGCCTTCTACTTTCACCGGAGCT   1350

BSNT_03767___   1351 GTTGTAGCAATGGCGGATAAGCTTGACACAATCGCTTCATTCTTCTCTAT   1400
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl   1351 GTTGTAGCAATGGCGGATAAGCTTGACACAATCGCTTCATTCTTCTCTAT   1400

BSNT_03767___   1401 CGGCGTAATTCCGACCGGTTCCCAGGACCCTTACGGACTGCGCCGCCAAG   1450
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl   1401 CGGCGTAATTCCGACCGGTTCCCAGGACCCTTACGGACTGCGCCGCCAAG   1450

BSNT_03767___   1451 CAAGCGGTATTGTTGCGATTCTTCTTGACCGCAACTGGGGAATTTCATTT   1500
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl   1451 CAAGCGGTATTGTTGCGATTCTTCTTGACCGCAACTGGGGAATTTCATTT   1500

BSNT_03767___   1501 GAAGAGCTGCTTACTTTCGTACAAACCGATAAAGAAATTGAACTGCTGGA   1550
                     ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||
BSU25260___gl   1501 GAAGAGCTGCTTACTTTCGTTCAAACCGATAAAGAAAATGAACTGCTGGA   1550

BSNT_03767___   1551 TTTCTTCACTCAGCGCTTGAAATATGTCTTGAATGCTGAACAAATCAGAC   1600
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl   1551 TTTCTTCACTCAGCGCTTGAAATATGTCTTGAATGCTGAACAAATCAGAC   1600

BSNT_03767___   1601 ATGATGTCATTGACGCCGTGCTGGAAAGCTCTGAGCTTGAGCCGTACTCT   1650
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl   1601 ATGATGTCATTGACGCCGTGCTGGAAAGCTCTGAGCTTGAGCCGTACTCT   1650

BSNT_03767___   1651 GCGCTGCATAAAGCACAAGTACTGGAGCAAAAGCTTGGTGCACCTGGCTT   1700
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl   1651 GCGCTGCATAAAGCACAAGTACTGGAGCAAAAGCTTGGTGCACCTGGCTT   1700

BSNT_03767___   1701 TAAGGAAACAGCCGAAGCGTTAGGCCGAGTGATCTCTATCAGCAAAAAAG   1750
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl   1701 TAAGGAAACAGCCGAAGCGTTAGGCCGAGTGATCTCTATCAGCAAAAAAG   1750

BSNT_03767___   1751 GAGTCCGCGGAGACATTCAGCCTGATCTGTTTGAAAATGAATACGAAGCA   1800
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl   1751 GAGTCCGCGGAGACATTCAGCCTGATCTGTTTGAAAATGAATACGAAGCA   1800

BSNT_03767___   1801 AAACTGTTTGATGCCTACCAAACAGCGAAGCAAAATCTGCAGGAAAACTT   1850
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl   1801 AAACTGTTTGATGCCTACCAAACAGCGAAGCAAAATCTGCAGGAAAACTT   1850

BSNT_03767___   1851 CAGCAAAAAAGATTATGAGGCGGCGCTTGCTTCACTTGCAGCCTTAAAAG   1900
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl   1851 CAGCAAAAAAGATTATGAGGCGGCGCTTGCTTCACTTGCAGCCTTAAAAG   1900

BSNT_03767___   1901 AACCGATCGATGCTTACTTCGATCATACAATGGTTATAGCGGATAATGAG   1950
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl   1901 AACCGATCGATGCTTACTTCGATCATACAATGGTTATAGCGGATAATGAG   1950

BSNT_03767___   1951 TCATTAAAGGCAAATCGTTTAGCGCAAATGGTAAGCTTGGCGGATGAGAT   2000
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl   1951 TCATTAAAGGCAAATCGTTTAGCGCAAATGGTAAGCTTGGCGGATGAGAT   2000

BSNT_03767___   2001 CAAGTCCTTTGCGAATATGAATGCCCTTATTGTAAAATAA   2040
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25260___gl   2001 CAAGTCCTTTGCGAATATGAATGCCCTTATTGTAAAATAA   2040


#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.