Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_03752 and BSU25170
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_03752 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:22:46
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_03752___yqfO.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU25170___yqfO.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_03752___yqfO-BSU25170___yqfO.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_03752___yqfO-BSU25170___yqfO.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_03752___yqfO
# 2: BSU25170___yqfO
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1122
# Identity: 1102/1122 (98.2%)
# Similarity: 1102/1122 (98.2%)
# Gaps: 0/1122 ( 0.0%)
# Score: 5430.0
#
#
#=======================================
BSNT_03752___ 1 ATGGATAAAAGTGTAAATGGGCAGCAGATCATCCAGCTGTTTGAACAATT 50
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25170___yq 1 ATGGCTAAAAGTGTAAATGGGCAGCAGATCATCCAGCTGTTTGAACAATT 50
BSNT_03752___ 51 TTCTCCGAAAGCCTATGCGGTTGAAGGAGATAAAATCGGCCTGCAAATCG 100
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25170___yq 51 TTCCCCGAAAGCCTATGCGGTTGAAGGAGATAAAATCGGCCTGCAAATCG 100
BSNT_03752___ 101 GCACTTTAAACAAACCAATTAAAAATGTGATGGTTACACTTGATGTGTTA 150
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25170___yq 101 GCACCTTAAACAAACCAATTAAAAATGTGATGGTTACACTTGATGTGTTA 150
BSNT_03752___ 151 GAGAGCGTTATCGATGAAGCGATTGAAAAAGAGGTTGACTTGATTATTGC 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25170___yq 151 GAGAGCGTTATCGATGAAGCGATTGAAAAAGAGGTTGACTTGATTATTGC 200
BSNT_03752___ 201 ACACCATCCTCCTATTTTCCGGCCGCTAAAGCATATTTCAACAGATCAGC 250
|||||||||.||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
BSU25170___yq 201 ACACCATCCACCAATTTTCCGGTCGCTAAAGCATATTTCAACAGATCAGC 250
BSNT_03752___ 251 CTGCCGGAAGGTTAATTGAAAAGTGTTTGAAGCATGATATTGCTGTTTAT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25170___yq 251 CTGCCGGAAGGTTAATTGAAAAGTGTTTGAAGCATGATATTGCTGTTTAT 300
BSNT_03752___ 301 GCAGCTCATACAAATTTAGACGTTGCGGACGGCGGCGTGAATGATTTGCT 350
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
BSU25170___yq 301 GCAGCTCATACAAATTTAGACGTTGCGGACGGCGGTGTGAATGATTTGCT 350
BSNT_03752___ 351 TGCTGAAGCATTAGAGCTGAGTGAGACGGAAGTGCTGGCACCTACTTATA 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25170___yq 351 TGCTGAAGCATTAGAGCTGAGTGAGACGGAAGTGCTGGCACCTACTTATA 400
BSNT_03752___ 401 CGGATCCTCTGAAAAAGCTGGCAGTTTACGTGCCGAAGGAATATGAAGAG 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25170___yq 401 CGGATCCTCTGAAAAAGCTGGCAGTTTACGTGCCGAAGGAATATGAAGAG 450
BSNT_03752___ 451 CAGGTCAGAGCCGCGGTTGGAAATGCGGGGGCCGGCCATATCGGTGAATA 500
|||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25170___yq 451 CAGGTCAGAGCCGCGCTCGGAAATGCGGGGGCCGGCCATATCGGTGAATA 500
BSNT_03752___ 501 CAGCCATTGCGCGTTTTCATCTGAAGGAATCGGCAGCTTTAAGCCATTGG 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25170___yq 501 CAGCCATTGCGCGTTTTCATCTGAAGGAATCGGCAGCTTTAAGCCATTGG 550
BSNT_03752___ 551 ACGGAGCTAAGCCTTTTATCGGTGAAGTGGGAGAGCTTGAGCTTGTTCAT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25170___yq 551 ACGGAGCTAAGCCTTTTATCGGTGAAGTGGGAGAGCTTGAGCTTGTTCAT 600
BSNT_03752___ 601 GAAGTAAGACTTGAGACTGTATTTCCTAAAAGCATCGAAAAAGCTGTTAT 650
||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||
BSU25170___yq 601 GAAGTAAGGCTTGAGACTGTATTTCCTAAAAGCGTCGAAAAGGCTGTTAT 650
BSNT_03752___ 651 CAACGCAATGATAAAAAGCCATCCATATGAAGAAGTCGCTTACGATATCT 700
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25170___yq 651 CAATGCAATGATAAAAAGCCATCCATATGAAGAAGTCGCTTACGATATCT 700
BSNT_03752___ 701 ATCCTGTCGAACAGACTCCCGCCGAAAAAGGGCTCGGCCGTGTCGGAACC 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25170___yq 701 ATCCTGTCGAACAGACTCCCGCCGAAAAAGGGCTCGGCCGTGTCGGAACC 750
BSNT_03752___ 751 CTTAAAACTGAGATGACGCTCAAGGAATTCGCTTTATTTGTGAAAGACAA 800
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25170___yq 751 CTTAAAAATGAGATGACGCTCAAGGAATTCGCTTTATTTGTGAAAGACAA 800
BSNT_03752___ 801 GCTTGACGTCAATGGTGTCAGAATGGTGGGGGATGCTGACAGCATGGTGA 850
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
BSU25170___yq 801 GCTTGACGTCAATGGTGTCAGAATGGTTGGGGATGCTGACAGCATGGTGA 850
BSNT_03752___ 851 AAAAGGTAGCTGTTCTTGGCGGAGATGGAAACAAGTATATTCATCATGCA 900
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25170___yq 851 AAAAAGTAGCTGTTCTTGGCGGAGATGGAAACAAGTATATTCATCATGCA 900
BSNT_03752___ 901 AAACGAAAGGGAGCCGATGTTTACGTCACAGGAGATTTATACTTCCATGT 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25170___yq 901 AAACGAAAGGGAGCCGATGTTTACGTCACAGGAGATTTATACTTCCATGT 950
BSNT_03752___ 951 GGCCCATGATGCGATGATGCTTGGCCTAAATGTGGTTGATCCGGGCCATT 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25170___yq 951 GGCCCATGATGCGATGATGCTTGGCCTAAATGTGGTTGATCCGGGCCATT 1000
BSNT_03752___ 1001 ACGCAGAAAAAATCATGAAAGAAGGCGTCACGAGAAAACTGACATCAATG 1050
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
BSU25170___yq 1001 ACGCGGAAAAAATCATGAAAGAAGGCGTCACGAGAAAACTTACATCAATG 1050
BSNT_03752___ 1051 TGTAACGATAAAAAGTTTGACGTGAATATCTTTGTTTCTGAAACAGATAC 1100
|||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
BSU25170___yq 1051 TGTAATGATAAAAAGTTTGGCGTGAATATCTTTGTTTCTGAAACAGATAC 1100
BSNT_03752___ 1101 AAATCCATTTACATTTCTATAA 1122
||||||||||||||||||||||
BSU25170___yq 1101 AAATCCATTTACATTTCTATAA 1122
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.