Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195

Home About Browser Genes Download Publications

DNA alignment: BSNT_03709 and BSU24840

See Amino acid alignment / Visit BSNT_03709 in genome browser / Return to Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon  8 Mar 2010 06:22:41
# Commandline: needle
#    -asequence dna-align/BSNT_03709___yqgS.1.22522.seq
#    -bsequence dna-align/BSU24840___yqgS.2.22522.seq
#    -gapopen 10
#    -gapextend 0.5
#    -outfile dna-align/BSNT_03709___yqgS-BSU24840___yqgS.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_03709___yqgS-BSU24840___yqgS.aln
########################################

#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_03709___yqgS
# 2: BSU24840___yqgS
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1917
# Identity:    1905/1917 (99.4%)
# Similarity:  1905/1917 (99.4%)
# Gaps:           0/1917 ( 0.0%)
# Score: 9477.0
# 
#
#=======================================

BSNT_03709___      1 ATGCGAAAAACGTTTTTTTCGAAGATTTCATTTATGCTGATTGCCATTTT     50
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq      1 ATGCGAAAAACGTTTTTTTCGAAGATTTCATTTATGCTGATTGCCATTTT     50

BSNT_03709___     51 ATTGATGTGGCTGAAAACGTATGCTGTTTACAAAACCAGTTTTCATATTA    100
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq     51 ATTGATGTGGCTGAAAACGTATGCTGTTTACAAAACCAGTTTTCATATTA    100

BSNT_03709___    101 AAATCGACAATCTAACACAGGAATTTATTCTGTTTATCAACCCATTGAGT    150
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq    101 AAATCGACAATCTAACACAGGAATTTATTCTGTTTATCAACCCATTGAGT    150

BSNT_03709___    151 TTTTTGTTGCTTATTTTCGGCCTCAGCCTGTTTTTAAAAGGCAAAAACAG    200
                     |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq    151 TTTTTGTTGCTTATTTTTGGCCTCAGCCTGTTTTTAAAAGGCAAAAACAG    200

BSNT_03709___    201 AAATCGCTACATTATCGCGATGAGCTGTCTTGTCACGTTTGTATTGCTGG    250
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq    201 AAATCGCTACATTATCGCGATGAGCTGTCTTGTCACGTTTGTATTGCTGG    250

BSNT_03709___    251 CAAATATGGTTTTTTACCGTTTTTACAATGATTTCTTAACAATCCCTGTT    300
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq    251 CAAATATGGTTTTTTACCGTTTTTACAATGATTTCTTAACAATCCCTGTT    300

BSNT_03709___    301 CTTTTTCAAACGAGCAATATGGGTGATCTCGGAAGCAGCATCGGAACACT    350
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq    301 CTTTTTCAAACGAGCAATATGGGTGATCTCGGAAGCAGCATCGGAACACT    350

BSNT_03709___    351 TCTTGAGCCGACAGACCTCCTATTAGCTGTAGATATTGCGGTTTTAATAT    400
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq    351 TCTTGAGCCGACAGACCTCCTATTAGCTGTAGATATTGCGGTTTTAATAT    400

BSNT_03709___    401 GGCTTCACATCCGGCAAAAAGCTTTTCAATCGGACATTCCCTCAACGAAA    450
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq    401 GGCTTCACATCCGGCAAAAAGCTTTTCAATCGGACATTCCCTCAACGAAA    450

BSNT_03709___    451 AATGAACGGGCGGCTTATTTTTTGTTCGTTGCTTCTGTTTATTTCTTCAA    500
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq    451 AATGAACGGGCGGCTTATTTTTTGTTCGTTGCTTCTGTTTATTTCTTCAA    500

BSNT_03709___    501 CCTGGGCTTGTCTGAGGCGGAGAGACCTCAGCTATTGACACGCTCTTTTG    550
                     |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||
BSU24840___yq    501 CCTGGGCTTGTCTGAGGCGGAAAGACCTCAGCTATTGACACGCTCATTTG    550

BSNT_03709___    551 ACAGAGAAATGCTTGTTAAAAACATTAGCCTGTTTAATTTTCATATTTAC    600
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq    551 ACAGAGAAATGCTTGTTAAAAACATTAGCCTGTTTAATTTTCATATTTAC    600

BSNT_03709___    601 GATGGCGTTCTTCAGTCAAAGCAATCCGCACAGAGAGCGTTGGCAGACAG    650
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq    601 GATGGCGTTCTTCAGTCAAAGCAATCCGCACAGAGAGCGTTGGCAGACAG    650

BSNT_03709___    651 CAACAGCCTGACGGAAATTGAAAACTACGTAACCGCTAATGCGAAGGATG    700
                     |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq    651 CAACAGCCTGACGGAGATTGAAAACTACGTAACCGCTAATGCGAAGGATG    700

BSNT_03709___    701 CCAACAAACGCTTATTCGGCGCTGCAAAAAGAAGGAACGTCATTCTCGTA    750
                     |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
BSU24840___yq    701 CCAACAAACGCTTATTCGGCGCTGCAAAAGGAAGGAACGTCATTCTCGTA    750

BSNT_03709___    751 TCCTTAGAGTCGACGCAAAGCTTCGTGATTAATGAAAAATTGAATGGAGA    800
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq    751 TCCTTAGAGTCGACGCAAAGCTTCGTGATTAATGAAAAATTGAATGGAGA    800

BSNT_03709___    801 AGAAATCACGCCTTTTCTGAATGACTTTATAAAACAGAGCTACAACTTTA    850
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq    801 AGAAATCACGCCTTTTCTGAATGACTTTATAAAACAGAGCTACAACTTTA    850

BSNT_03709___    851 ATAATGTTTACCACCAAACAGGCCAGGGGAAAACCTCGGATTCTGAATTT    900
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq    851 ATAATGTTTACCACCAAACAGGCCAGGGGAAAACCTCGGATTCTGAATTT    900

BSNT_03709___    901 ATCGTGGACAATTCACTGTATCCGCTTGGACGAGGTGCCGTGTTTTTTAC    950
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
BSU24840___yq    901 ATCGTGGACAATTCACTGTATCCGCTTGGACGAGGTGCCGTATTTTTTAC    950

BSNT_03709___    951 GAATGCGGGCAATCAATATATGGCCGCTCCTGAAATTTTGAAAAACAGCG   1000
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq    951 GAATGCGGGCAATCAATATATGGCCGCTCCTGAAATTTTGAAAAACAGCG   1000

BSNT_03709___   1001 GATACTATTCAGCGGTGCTCCACGCTAATAATAAGAGCTTTTGGAATCGT   1050
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq   1001 GATACTATTCAGCGGTGCTCCACGCTAATAATAAGAGCTTTTGGAATCGT   1050

BSNT_03709___   1051 GATTTAATGTACGACTCATTTGGATATGATTCGTTTTTTGATATTAACTC   1100
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq   1051 GATTTAATGTACGACTCATTTGGATATGATTCGTTTTTTGATATTAACTC   1100

BSNT_03709___   1101 GTATGATGTAACTGACGAAAATTCAGTCGGCTGGGGACTGAAGGATAAAG   1150
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
BSU24840___yq   1101 GTATGATGTAACTGACGAAAATTCAGTCGGCTGGGGACTTAAGGATAAAG   1150

BSNT_03709___   1151 AATTTTTTGAGCAGTCTTCAGAGCTGATGAAAAATCTGCCTCAGCCGTTT   1200
                     ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq   1151 AATTTTTTGAGCAGTCCTCAGAGCTGATGAAAAATCTGCCTCAGCCGTTT   1200

BSNT_03709___   1201 TACTCGAGGCTGATTACACTGACGAACCACTTCCCGTTTGATCTTGATGA   1250
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq   1201 TACTCGAGGCTGATTACACTGACGAACCACTTCCCGTTTGATCTTGATGA   1250

BSNT_03709___   1251 AGAGGATCAATTGATTGATGAATATGATTCAAGCAGCCAGACGCTAAATA   1300
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
BSU24840___yq   1251 AGAGGATCAATTGATTGATGAATATGATTCAAACAGCCAGACGCTAAATA   1300

BSNT_03709___   1301 AATATTTTCCGACAGTGCGTTATCAGGATGAGGCGCTGAAACGGTTTATC   1350
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq   1301 AATATTTTCCGACAGTGCGTTATCAGGATGAGGCGCTGAAACGGTTTATC   1350

BSNT_03709___   1351 GAAAAGCTGAAGGAAGACGGGTTATACGACAACTCTGTTATTGTATTATA   1400
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq   1351 GAAAAGCTGAAGGAAGACGGGTTATACGACAACTCTGTTATTGTATTATA   1400

BSNT_03709___   1401 TGGTGACCATTATGGTATATCAGAAAACCATAATGAAGCGATGGGGGAGT   1450
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
BSU24840___yq   1401 TGGTGACCATTATGGTATATCAGAAAACCATAATGAAGCGATGGGGCAGT   1450

BSNT_03709___   1451 TTTTAGGAAAAGAAATAACCCCATTTGAAGAGGTGCAGCTCCAAAAAGTG   1500
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
BSU24840___yq   1451 TTTTAGGAAAAGAAATAACCCCATTTGAAGAGGTACAGCTCCAAAAAGTG   1500

BSNT_03709___   1501 CCGCTGGTCATTCATATTCCGGGTATTACTGATAAAAAGCCGCAAACCAT   1550
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq   1501 CCGCTGGTCATTCATATTCCGGGTATTACTGATAAAAAGCCGCAAACCAT   1550

BSNT_03709___   1551 TGAAACAGTAGGCGGGCAGATTGATATCAGGCCGACGCTGATGAATCTTT   1600
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq   1551 TGAAACAGTAGGCGGGCAGATTGATATCAGGCCGACGCTGATGAATCTTT   1600

BSNT_03709___   1601 TAGGGATTGATACGAAAGATCAAATTCAATTCGGCAACGATCTGCTTTCA   1650
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq   1601 TAGGGATTGATACGAAAGATCAAATTCAATTCGGCAACGATCTGCTTTCA   1650

BSNT_03709___   1651 GACGAAAAACTGGACTTCACGGTGCTCCGGGACGGGAGCTTTATCACAGA   1700
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq   1651 GACGAAAAACTGGACTTCACGGTGCTCCGGGACGGGAGCTTTATCACAGA   1700

BSNT_03709___   1701 TCAGGTTGTTTATACAGACGGTGCGTGTTATGACAAAGAGACGGGAAAAC   1750
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq   1701 TCAGGTTGTTTATACAGACGGTGCGTGTTATGACAAAGAGACGGGAAAAC   1750

BSNT_03709___   1751 CGTTAGAAGAGACAAAACAATGTGAAGCATTTGCTGATAAAGCAAAACAG   1800
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq   1751 CGTTAGAAGAGACAAAACAATGTGAAGCATTTGCTGATAAAGCAAAACAG   1800

BSNT_03709___   1801 GAGCTATCACTTTCTGATGAAATCATTTATGGGGATTTGTTGCGATTTTA   1850
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq   1801 GAGCTATCACTTTCTGATGAAATCATTTATGGGGATTTGTTGCGATTTTA   1850

BSNT_03709___   1851 TGACCAGAAAAGGCTGGACAATTCGTCAAAACGGAAAGAAAAACAAATGC   1900
                     ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
BSU24840___yq   1851 TGACCAGAAAAGGCTGGACAATTCGTCAAAGCGGAAAGAAAAACAAATGC   1900

BSNT_03709___   1901 TTGATCAGGCATCATAA   1917
                     |||||||||||||||||
BSU24840___yq   1901 TTGATCAGGCATCATAA   1917


#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.