Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_03709 and BSU24840
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_03709 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:22:41
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_03709___yqgS.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU24840___yqgS.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_03709___yqgS-BSU24840___yqgS.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_03709___yqgS-BSU24840___yqgS.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_03709___yqgS
# 2: BSU24840___yqgS
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1917
# Identity: 1905/1917 (99.4%)
# Similarity: 1905/1917 (99.4%)
# Gaps: 0/1917 ( 0.0%)
# Score: 9477.0
#
#
#=======================================
BSNT_03709___ 1 ATGCGAAAAACGTTTTTTTCGAAGATTTCATTTATGCTGATTGCCATTTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq 1 ATGCGAAAAACGTTTTTTTCGAAGATTTCATTTATGCTGATTGCCATTTT 50
BSNT_03709___ 51 ATTGATGTGGCTGAAAACGTATGCTGTTTACAAAACCAGTTTTCATATTA 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq 51 ATTGATGTGGCTGAAAACGTATGCTGTTTACAAAACCAGTTTTCATATTA 100
BSNT_03709___ 101 AAATCGACAATCTAACACAGGAATTTATTCTGTTTATCAACCCATTGAGT 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq 101 AAATCGACAATCTAACACAGGAATTTATTCTGTTTATCAACCCATTGAGT 150
BSNT_03709___ 151 TTTTTGTTGCTTATTTTCGGCCTCAGCCTGTTTTTAAAAGGCAAAAACAG 200
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq 151 TTTTTGTTGCTTATTTTTGGCCTCAGCCTGTTTTTAAAAGGCAAAAACAG 200
BSNT_03709___ 201 AAATCGCTACATTATCGCGATGAGCTGTCTTGTCACGTTTGTATTGCTGG 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq 201 AAATCGCTACATTATCGCGATGAGCTGTCTTGTCACGTTTGTATTGCTGG 250
BSNT_03709___ 251 CAAATATGGTTTTTTACCGTTTTTACAATGATTTCTTAACAATCCCTGTT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq 251 CAAATATGGTTTTTTACCGTTTTTACAATGATTTCTTAACAATCCCTGTT 300
BSNT_03709___ 301 CTTTTTCAAACGAGCAATATGGGTGATCTCGGAAGCAGCATCGGAACACT 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq 301 CTTTTTCAAACGAGCAATATGGGTGATCTCGGAAGCAGCATCGGAACACT 350
BSNT_03709___ 351 TCTTGAGCCGACAGACCTCCTATTAGCTGTAGATATTGCGGTTTTAATAT 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq 351 TCTTGAGCCGACAGACCTCCTATTAGCTGTAGATATTGCGGTTTTAATAT 400
BSNT_03709___ 401 GGCTTCACATCCGGCAAAAAGCTTTTCAATCGGACATTCCCTCAACGAAA 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq 401 GGCTTCACATCCGGCAAAAAGCTTTTCAATCGGACATTCCCTCAACGAAA 450
BSNT_03709___ 451 AATGAACGGGCGGCTTATTTTTTGTTCGTTGCTTCTGTTTATTTCTTCAA 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq 451 AATGAACGGGCGGCTTATTTTTTGTTCGTTGCTTCTGTTTATTTCTTCAA 500
BSNT_03709___ 501 CCTGGGCTTGTCTGAGGCGGAGAGACCTCAGCTATTGACACGCTCTTTTG 550
|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||
BSU24840___yq 501 CCTGGGCTTGTCTGAGGCGGAAAGACCTCAGCTATTGACACGCTCATTTG 550
BSNT_03709___ 551 ACAGAGAAATGCTTGTTAAAAACATTAGCCTGTTTAATTTTCATATTTAC 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq 551 ACAGAGAAATGCTTGTTAAAAACATTAGCCTGTTTAATTTTCATATTTAC 600
BSNT_03709___ 601 GATGGCGTTCTTCAGTCAAAGCAATCCGCACAGAGAGCGTTGGCAGACAG 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq 601 GATGGCGTTCTTCAGTCAAAGCAATCCGCACAGAGAGCGTTGGCAGACAG 650
BSNT_03709___ 651 CAACAGCCTGACGGAAATTGAAAACTACGTAACCGCTAATGCGAAGGATG 700
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq 651 CAACAGCCTGACGGAGATTGAAAACTACGTAACCGCTAATGCGAAGGATG 700
BSNT_03709___ 701 CCAACAAACGCTTATTCGGCGCTGCAAAAAGAAGGAACGTCATTCTCGTA 750
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
BSU24840___yq 701 CCAACAAACGCTTATTCGGCGCTGCAAAAGGAAGGAACGTCATTCTCGTA 750
BSNT_03709___ 751 TCCTTAGAGTCGACGCAAAGCTTCGTGATTAATGAAAAATTGAATGGAGA 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq 751 TCCTTAGAGTCGACGCAAAGCTTCGTGATTAATGAAAAATTGAATGGAGA 800
BSNT_03709___ 801 AGAAATCACGCCTTTTCTGAATGACTTTATAAAACAGAGCTACAACTTTA 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq 801 AGAAATCACGCCTTTTCTGAATGACTTTATAAAACAGAGCTACAACTTTA 850
BSNT_03709___ 851 ATAATGTTTACCACCAAACAGGCCAGGGGAAAACCTCGGATTCTGAATTT 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq 851 ATAATGTTTACCACCAAACAGGCCAGGGGAAAACCTCGGATTCTGAATTT 900
BSNT_03709___ 901 ATCGTGGACAATTCACTGTATCCGCTTGGACGAGGTGCCGTGTTTTTTAC 950
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
BSU24840___yq 901 ATCGTGGACAATTCACTGTATCCGCTTGGACGAGGTGCCGTATTTTTTAC 950
BSNT_03709___ 951 GAATGCGGGCAATCAATATATGGCCGCTCCTGAAATTTTGAAAAACAGCG 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq 951 GAATGCGGGCAATCAATATATGGCCGCTCCTGAAATTTTGAAAAACAGCG 1000
BSNT_03709___ 1001 GATACTATTCAGCGGTGCTCCACGCTAATAATAAGAGCTTTTGGAATCGT 1050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq 1001 GATACTATTCAGCGGTGCTCCACGCTAATAATAAGAGCTTTTGGAATCGT 1050
BSNT_03709___ 1051 GATTTAATGTACGACTCATTTGGATATGATTCGTTTTTTGATATTAACTC 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq 1051 GATTTAATGTACGACTCATTTGGATATGATTCGTTTTTTGATATTAACTC 1100
BSNT_03709___ 1101 GTATGATGTAACTGACGAAAATTCAGTCGGCTGGGGACTGAAGGATAAAG 1150
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
BSU24840___yq 1101 GTATGATGTAACTGACGAAAATTCAGTCGGCTGGGGACTTAAGGATAAAG 1150
BSNT_03709___ 1151 AATTTTTTGAGCAGTCTTCAGAGCTGATGAAAAATCTGCCTCAGCCGTTT 1200
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq 1151 AATTTTTTGAGCAGTCCTCAGAGCTGATGAAAAATCTGCCTCAGCCGTTT 1200
BSNT_03709___ 1201 TACTCGAGGCTGATTACACTGACGAACCACTTCCCGTTTGATCTTGATGA 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq 1201 TACTCGAGGCTGATTACACTGACGAACCACTTCCCGTTTGATCTTGATGA 1250
BSNT_03709___ 1251 AGAGGATCAATTGATTGATGAATATGATTCAAGCAGCCAGACGCTAAATA 1300
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
BSU24840___yq 1251 AGAGGATCAATTGATTGATGAATATGATTCAAACAGCCAGACGCTAAATA 1300
BSNT_03709___ 1301 AATATTTTCCGACAGTGCGTTATCAGGATGAGGCGCTGAAACGGTTTATC 1350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq 1301 AATATTTTCCGACAGTGCGTTATCAGGATGAGGCGCTGAAACGGTTTATC 1350
BSNT_03709___ 1351 GAAAAGCTGAAGGAAGACGGGTTATACGACAACTCTGTTATTGTATTATA 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq 1351 GAAAAGCTGAAGGAAGACGGGTTATACGACAACTCTGTTATTGTATTATA 1400
BSNT_03709___ 1401 TGGTGACCATTATGGTATATCAGAAAACCATAATGAAGCGATGGGGGAGT 1450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
BSU24840___yq 1401 TGGTGACCATTATGGTATATCAGAAAACCATAATGAAGCGATGGGGCAGT 1450
BSNT_03709___ 1451 TTTTAGGAAAAGAAATAACCCCATTTGAAGAGGTGCAGCTCCAAAAAGTG 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
BSU24840___yq 1451 TTTTAGGAAAAGAAATAACCCCATTTGAAGAGGTACAGCTCCAAAAAGTG 1500
BSNT_03709___ 1501 CCGCTGGTCATTCATATTCCGGGTATTACTGATAAAAAGCCGCAAACCAT 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq 1501 CCGCTGGTCATTCATATTCCGGGTATTACTGATAAAAAGCCGCAAACCAT 1550
BSNT_03709___ 1551 TGAAACAGTAGGCGGGCAGATTGATATCAGGCCGACGCTGATGAATCTTT 1600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq 1551 TGAAACAGTAGGCGGGCAGATTGATATCAGGCCGACGCTGATGAATCTTT 1600
BSNT_03709___ 1601 TAGGGATTGATACGAAAGATCAAATTCAATTCGGCAACGATCTGCTTTCA 1650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq 1601 TAGGGATTGATACGAAAGATCAAATTCAATTCGGCAACGATCTGCTTTCA 1650
BSNT_03709___ 1651 GACGAAAAACTGGACTTCACGGTGCTCCGGGACGGGAGCTTTATCACAGA 1700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq 1651 GACGAAAAACTGGACTTCACGGTGCTCCGGGACGGGAGCTTTATCACAGA 1700
BSNT_03709___ 1701 TCAGGTTGTTTATACAGACGGTGCGTGTTATGACAAAGAGACGGGAAAAC 1750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq 1701 TCAGGTTGTTTATACAGACGGTGCGTGTTATGACAAAGAGACGGGAAAAC 1750
BSNT_03709___ 1751 CGTTAGAAGAGACAAAACAATGTGAAGCATTTGCTGATAAAGCAAAACAG 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq 1751 CGTTAGAAGAGACAAAACAATGTGAAGCATTTGCTGATAAAGCAAAACAG 1800
BSNT_03709___ 1801 GAGCTATCACTTTCTGATGAAATCATTTATGGGGATTTGTTGCGATTTTA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24840___yq 1801 GAGCTATCACTTTCTGATGAAATCATTTATGGGGATTTGTTGCGATTTTA 1850
BSNT_03709___ 1851 TGACCAGAAAAGGCTGGACAATTCGTCAAAACGGAAAGAAAAACAAATGC 1900
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
BSU24840___yq 1851 TGACCAGAAAAGGCTGGACAATTCGTCAAAGCGGAAAGAAAAACAAATGC 1900
BSNT_03709___ 1901 TTGATCAGGCATCATAA 1917
|||||||||||||||||
BSU24840___yq 1901 TTGATCAGGCATCATAA 1917
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.