Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_03666 and BSU24580
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_03666 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:22:37
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_03666___yqhH.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU24580___yqhH.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_03666___yqhH-BSU24580___yqhH.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_03666___yqhH-BSU24580___yqhH.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_03666___yqhH
# 2: BSU24580___yqhH
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1674
# Identity: 1654/1674 (98.8%)
# Similarity: 1654/1674 (98.8%)
# Gaps: 0/1674 ( 0.0%)
# Score: 8190.0
#
#
#=======================================
BSNT_03666___ 1 ATGAATACAGAAATGATCTACGATGCAAAATGGCCTGAAGAATTTGCTGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24580___yq 1 ATGAATACAGAAATGATCTACGATGCAAAATGGCCTGAAGAATTTGCTGA 50
BSNT_03666___ 51 AAGACTGAAAAACGATGGCCCTTGGGCAAACTGGGAACTGTACAAGCTCT 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24580___yq 51 AAGACTGAAAAACGATGGCCCTTGGGCAAACTGGGAACTGTACAAGCTCT 100
BSNT_03666___ 101 CTGCAGAAATCCAGAAAACATTAGCAATTCCAGATTTTGAAGGCTTACGG 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
BSU24580___yq 101 CTGCAGAAATCCAGAAAACATTAGCAATTCCAGAGTTTGAAGGCTTACGG 150
BSNT_03666___ 151 GCTCCTTTATATCTGCCTTCCTTTACGCCGCTCCCCCACCAGCTTGAAGT 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24580___yq 151 GCTCCTTTATATCTGCCTTCCTTTACGCCGCTCCCCCACCAGCTTGAAGT 200
BSNT_03666___ 201 GGCGCAAAAAGTGGTTGAAAAAATGAACGGGAAAGCGATTTTAGCAGATG 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24580___yq 201 GGCGCAAAAAGTGGTTGAAAAAATGAACGGGAAAGCGATTTTAGCAGATG 250
BSNT_03666___ 251 AGGTTGGTCTCGGGAAAACGGTTGAAGCTGGACTGATTCTAAAAGAATAT 300
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24580___yq 251 AGGTTGGTCTCGGAAAAACGGTTGAAGCTGGACTGATTCTAAAAGAATAT 300
BSNT_03666___ 301 ATGATTCGCGGGTTAGCAAAAAAAATTTTGATCCTTGTGCCCGCTTCACT 350
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
BSU24580___yq 301 ATGATTCGCGGGTTAGCAAAAAAAATTTTGATCCTTGTGCCCGCTTCCCT 350
BSNT_03666___ 351 TGTGTCACAGTGGGTCAAAGAGCTTCAGGAAAAATTTTTGATTCCGGCTG 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24580___yq 351 TGTGTCACAGTGGGTCAAAGAGCTTCAGGAAAAATTTTTGATTCCGGCTG 400
BSNT_03666___ 401 TTGAACAAAAGAAAAGCTATGTGTGGGAGCAATGCGATATTGTCGTCTCA 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24580___yq 401 TTGAACAAAAGAAAAGCTATGTGTGGGAGCAATGCGATATTGTCGTCTCA 450
BSNT_03666___ 451 TCAATAGACACCGCGAAGCGCTCGCCCCATCGAGAAATCGTTCTGTCTAT 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24580___yq 451 TCAATAGACACCGCGAAGCGCTCGCCCCATCGAGAAATCGTTCTGTCTAT 500
BSNT_03666___ 501 CCCATATGATCTTGTCATTATTGATGAGGCACACAAACTGAAAAATAGCA 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24580___yq 501 CCCATATGATCTTGTCATTATTGATGAGGCACACAAACTGAAAAATAGCA 550
BSNT_03666___ 551 AAACGAAGAACTATGAATTTGTCCGGAATCTCGTAAAAAAATATTGCCTG 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24580___yq 551 AAACGAAGAACTATGAATTTGTCCGGAATCTCGTAAAAAAATATTGCCTG 600
BSNT_03666___ 601 CTTCTTACCGCGACGCCAATCCAGAACCGTATCGAAGAGATTTTCAATTT 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24580___yq 601 CTTCTTACCGCGACGCCAATCCAGAACCGTATCGAAGAGATTTTCAATTT 650
BSNT_03666___ 651 GGTGTCCTTATTAAAACCCGGCCATTTAGGCAGTCAGAATCACTTTCAGG 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24580___yq 651 GGTGTCCTTATTAAAACCCGGCCATTTAGGCAGTCAGAATCACTTTCAGG 700
BSNT_03666___ 701 AGGAGTTCGCCAAGAAGAAATCCAGTTTAGAAGCGCATGAACATTTAAAA 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24580___yq 701 AGGAGTTCGCCAAGAAGAAATCCAGTTTAGAAGCGCATGAACATTTAAAA 750
BSNT_03666___ 751 GATCTTGTGAATAAAGTCATGATCCGTAACAGGCGGCATGATACCGGGCT 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
BSU24580___yq 751 GATCTTGTGAATAAAGTCATGATCCGTAACAGGCGGCATGATACAGGGCT 800
BSNT_03666___ 801 GAATTGGAAACAGCGCCATGTTGAAACAGTGCCGATTGAATTTTCTCCAT 850
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
BSU24580___yq 801 GAATTGGAAACAGCGCCATGTTGAAACAGTGCCGATTCAATTTTCTCCAT 850
BSNT_03666___ 851 CAGAGCAGGCGCTTTATGATGAAATTTCTCGTTTGAAGGAAAGTATCAAT 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
BSU24580___yq 851 CAGAGCAGGCGCTTTATGATGAAATTTCTCGTTTGAAGGACAGTATCAAT 900
BSNT_03666___ 901 AAACCAGCCAGCATGTTCTCGATTATGACCTTGCAAAGAGAATGCTGTTC 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24580___yq 901 AAACCAGCCAGCATGTTCTCGATTATGACCTTGCAAAGAGAATGCTGTTC 950
BSNT_03666___ 951 GAGCAGAGAAGCGGTGTATATGACGCTGAAAAAGATGCTTGATCAAAAAG 1000
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24580___yq 951 GAGCAGAGAAGCGGTATATATGACGCTGAAAAAGATGCTTGATCAAAAAG 1000
BSNT_03666___ 1001 AGAAACAAGCACCTGCCATTGATGAGGATACGATTTCAGTTTTAATAGAT 1050
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
BSU24580___yq 1001 AGAAACAAGCACCTGCCATTGATGAGGATACGATTTCAGTTTTGATAGAT 1050
BSNT_03666___ 1051 CGAATTAATCAAGTGACACAAAACTCTAAAGCGCTTCAAGTTGTTGATTT 1100
||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
BSU24580___yq 1051 CGCATCAATCAAGTGACACAAAACTCTAAAGCGCTTCAAGTTGTTGACTT 1100
BSNT_03666___ 1101 GATCAAAAAGATCGACGATAAGGTCATCATTTTTACAGAATACCGTGCAA 1150
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
BSU24580___yq 1101 GATCAAAAAGATCGACGATAAGGTCATCATTTTTACAGAATACCGCGCAA 1150
BSNT_03666___ 1151 CTCAGATTTATCTGCAGTGGTTTCTTCAGCAAAACGGCATCAGTTCTGTG 1200
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24580___yq 1151 CCCAGATTTATCTGCAGTGGTTTCTTCAGCAAAACGGCATCAGTTCTGTG 1200
BSNT_03666___ 1201 CCGTTTAGAGGCGGATTTAAACGTGGGAAAAAAGACTGGATGAAGGATCT 1250
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
BSU24580___yq 1201 CCGTTTAGAGGCGGATTTAAACGTGGAAAAAAAGACTGGATGAAGGATCT 1250
BSNT_03666___ 1251 TTTCCGCGGAAAAATCCAAGTCCTTATTGCAACTGAAGCAGGCGGTGAGG 1300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24580___yq 1251 TTTCCGCGGAAAAATCCAAGTCCTTATTGCAACTGAAGCAGGCGGTGAGG 1300
BSNT_03666___ 1301 GAATTAACCTGCAATTTTGCAATCACATGATCAACTATGACCTGCCATGG 1350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24580___yq 1301 GAATTAACCTGCAATTTTGCAATCACATGATCAACTATGACCTGCCATGG 1350
BSNT_03666___ 1351 AATCCGATGCGACTTGAGCAAAGAATCGGAAGAATTCACAGACTCGGGCA 1400
||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24580___yq 1351 AACCCGATGCGGCTTGAGCAAAGAATCGGAAGAATTCACAGACTCGGGCA 1400
BSNT_03666___ 1401 GGAGCGTGACGTGCACATTTATAACATGGCAACAAAACATACGGTGGAAG 1450
|||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||
BSU24580___yq 1401 GGAGCGTGACGTGCATATTTATAACATGGCGACAAAACATACGGTGGAAG 1450
BSNT_03666___ 1451 AGCATATTCTAAAGCTTTTATATGAAAAAATTCATTTGTTTGAAAAAGTG 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24580___yq 1451 AGCATATTCTAAAGCTTTTATATGAAAAAATTCATTTGTTTGAAAAAGTG 1500
BSNT_03666___ 1501 GTCGGCGAACTTGATGATATTTTAACGAAAATTCAAGTGAACAATTTTGA 1550
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24580___yq 1501 GTCGGTGAACTTGATGATATTTTAACGAAAATTCAAGTGAACAATTTTGA 1550
BSNT_03666___ 1551 AGAGCACCTTCATGACATTTTGTATCACTCAGCAACAGAAGAAGAAATGA 1600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU24580___yq 1551 AGAGCACCTTCATGACATTTTGTATCACTCAGCAACAGAAGAAGAAATGA 1600
BSNT_03666___ 1601 AAATAAAAATGGATAACTTAACCTCATTTTTGTCTTATAAAAAACAGCAG 1650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
BSU24580___yq 1601 AAATAAAAATGGATAACTTAACCTCATTTTTGTCTTATAAAAAACAGCTG 1650
BSNT_03666___ 1651 CCTGCTGAAAAAAGAGGATCTTAG 1674
||||||||||||||||||||||||
BSU24580___yq 1651 CCTGCTGAAAAAAGAGGATCTTAG 1674
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.