Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_03540 and BSU23810
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_03540 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:22:23
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_03540___yqjN.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU23810___yqjN.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_03540___yqjN-BSU23810___yqjN.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_03540___yqjN-BSU23810___yqjN.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_03540___yqjN
# 2: BSU23810___yqjN
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1644
# Identity: 1627/1644 (99.0%)
# Similarity: 1627/1644 (99.0%)
# Gaps: 0/1644 ( 0.0%)
# Score: 8067.0
#
#
#=======================================
BSNT_03540___ 1 ATGAATTGGCAGACGAAGGACGAATTGCTGGCACTTTTAACTTCTCTTGT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23810___yq 1 ATGAATTGGCAGACGAAGGACGAATTGCTGGCACTTTTAACTTCTCTTGT 50
BSNT_03540___ 51 GCAATACGAAAGCATCACCGGTTCAAAGGGCGAGGCAGCACTTGCAGAGT 100
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||
BSU23810___yq 51 GCAATACGAAAGCATCACCGGTTCAAAGGGCGAGGTAGCGCTTGCAGAGT 100
BSNT_03540___ 101 ATCTTTATTTTATTTTGAAGGACAAGCCCTATTTTCAAAATCACCCTGAT 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
BSU23810___yq 101 ATCTTTATTTTATTTTGAAGGACAAGCCCTATTTTCAAAAGCACCCTGAT 150
BSNT_03540___ 151 GATGTAACACTTCATCCGATGGACGATGGCAGATCTTTTCTTACGGCTCT 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23810___yq 151 GATGTAACACTTCATCCGATGGACGATGGCAGATCTTTTCTTACGGCTCT 200
BSNT_03540___ 201 AGTCAAAAAGAAGAATGTCAAAAAGACAGTGCTTCTGCTGAGTCATTTTG 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23810___yq 201 AGTCAAAAAGAAGAATGTCAAAAAGACAGTGCTTCTGCTGAGTCATTTTG 250
BSNT_03540___ 251 ATGTCGTTGACATAGAAGATTACGGCGAATTTAAACATATGGCTTGCAAG 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23810___yq 251 ATGTCGTTGACATAGAAGATTACGGCGAATTTAAACATATGGCTTGCAAG 300
BSNT_03540___ 301 CCTGCTGAGCTTTTGAGCTCCTTTTTAGAGAAAAAAGAGCTGCTCCCGGA 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23810___yq 301 CCTGCTGAGCTTTTGAGCTCCTTTTTAGAGAAAAAAGAGCTGCTCCCGGA 350
BSNT_03540___ 351 ACGGGTGAGAAGAGATGCCGAAAGCGGAGACTGGCTGTTCGGAAGAGGGA 400
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23810___yq 351 ACGTGTGAGAAGAGATGCCGAAAGCGGAGACTGGCTGTTCGGAAGAGGGA 400
BSNT_03540___ 401 CGATGGATATGAAAGCGGGGCTTTGTGTTCAACTGTCGATGCTGGAGAGG 450
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
BSU23810___yq 401 CGATGGATATGAAAGCGGGGCTTTGTATTCAACTGTCGATGCTGGAGAGG 450
BSNT_03540___ 451 GCAATGAACGGACATTTTGAGGGCAATCTGCTGTTGATAACGGTTCCGGA 500
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23810___yq 451 GCAATGAACGGGCATTTTGAGGGCAATCTGCTGTTGATAACGGTTCCGGA 500
BSNT_03540___ 501 CGAGGAAGTGAATTCAAGAGGCATGATTGAAGCGGTTCCTGCATTGAAGG 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23810___yq 501 CGAGGAAGTGAATTCAAGAGGCATGATTGAAGCGGTTCCTGCATTGAAGG 550
BSNT_03540___ 551 AAATGGAGAAAAAGCATGATATCACATTAACTGCTTGCCTGAATGCCGAA 600
|.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
BSU23810___yq 551 AGATGGAGAAAAAGCATGATATCACATTAACCGCTTGCCTGAATGCCGAA 600
BSNT_03540___ 601 CCGATGTTTGAAAAATTTCCCGGCGATCAGCAGCAATATTTTTATACTGG 650
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
BSU23810___yq 601 CCGATGTTTGAAAAATTTCCCGGCGATCAGCAGCAATATTTTTATACAGG 650
BSNT_03540___ 651 AAGCATTGGCAAGGTGCTTGCGGGTTTTTTCTGCAAGGGGATTGAGACAC 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23810___yq 651 AAGCATTGGCAAGGTGCTTGCGGGTTTTTTCTGCAAGGGGATTGAGACAC 700
BSNT_03540___ 701 ATGTTGGAGAGCCGTTTTCAGGCCTAAACGCAAATTTAATGGTATCTGAG 750
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
BSU23810___yq 701 ATGTTGGAGAGCCGTTTTCAGGTCTAAACGCAAATTTAATGGTATCTGAG 750
BSNT_03540___ 751 ATTAACCGTTTGCTTGAACTGAATGCTGATTATTGCGAAAAGGTTGATGG 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23810___yq 751 ATTAACCGTTTGCTTGAACTGAATGCTGATTATTGCGAAAAGGTTGATGG 800
BSNT_03540___ 801 CGAGGTCACTCCGCCGCCGGTAAACTTAATGCAAAAGGACTTGAAAGAGG 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23810___yq 801 CGAGGTCACTCCGCCGCCGGTAAACTTAATGCAAAAGGACTTGAAAGAGG 850
BSNT_03540___ 851 CATATTCAGTCCAGACACCGCATACAGCTGTCACATTATTTAATGTGCTG 900
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
BSU23810___yq 851 CATATTCAGTCCAGACACCGCATACAGCCGTCACATTATTTAATGTGCTG 900
BSNT_03540___ 901 TCAATGAAACGCTCAGCTAGTGAGCTGCATCAGATGCTGCTTAAAACAGC 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23810___yq 901 TCAATGAAACGCTCAGCTAGTGAGCTGCATCAGATGCTGCTTAAAACAGC 950
BSNT_03540___ 951 AGAACAGGCGGCGGAGGAAATCATGTCGAACGTTCGGAAGAAAACACAGG 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23810___yq 951 AGAACAGGCGGCGGAGGAAATCATGTCGAACGTTCGGAAGAAAACACAGG 1000
BSNT_03540___ 1001 ATTTTCAACAATTTGAGCCATTTCAGCCGATTGAGCGGGACGTCACTGTT 1050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23810___yq 1001 ATTTTCAACAATTTGAGCCATTTCAGCCGATTGAGCGGGACGTCACTGTT 1050
BSNT_03540___ 1051 TTGACATTTGATGAGCTGGTCTCGCGTGCAAAAAAGCGTGCGGGGATCTC 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23810___yq 1051 TTGACATTTGATGAGCTGGTCTCGCGTGCAAAAAAGCGTGCGGGGATCTC 1100
BSNT_03540___ 1101 GGAAACAGAGCGGGCTCTAAATTATGCCTTTGCTAACAGGGGGGAGCTTG 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23810___yq 1101 GGAAACAGAGCGGGCTCTAAATTATGCCTTTGCTAACAGGGGGGAGCTTG 1150
BSNT_03540___ 1151 GAGACAGGGATTTTTCGACGAAAATTGTTTCTGAGCTTGCTTCGCTTTGT 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23810___yq 1151 GAGACAGGGATTTTTCGACGAAAATTGTTTCTGAGCTTGCTTCGCTTTGT 1200
BSNT_03540___ 1201 AAGGAGGATGCGCCGCTCATCGTTCTGTTTTATAGTCCGCCGCTTTATCC 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23810___yq 1201 AAGGAGGATGCGCCGCTCATCGTTCTGTTTTATAGTCCGCCGCTTTATCC 1250
BSNT_03540___ 1251 AGCTGTTTCTTCAAAGGATGATCAATTGATCAGAAATACAGCAGATCAGT 1300
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
BSU23810___yq 1251 AGCTGTTTCTTCAAAGGATGATCAATTGATCAGAAATACAGCAGATCAGA 1300
BSNT_03540___ 1301 TAAAGCATTATGCGGCTGAGCGATACGGCATTGCATTACGGGAAGTTCAG 1350
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
BSU23810___yq 1301 TAAAGCATTATGCGGCTGAGCGATACGGCATTGCATTACGGGAGGTTCAG 1350
BSNT_03540___ 1351 TACTTCCCTGGACTTTCGGACTTGAGTTATCTTCAGCTGGAAAAGCAGGA 1400
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
BSU23810___yq 1351 TACTTCCCCGGACTTTCGGACTTGAGTTATCTTCAGCTGGAAAAACAGGA 1400
BSNT_03540___ 1401 GGTTGATGCATACACAAGCAATATGCCGCTCTTTAACAGAGGATATTCAT 1450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
BSU23810___yq 1401 GGTTGATGCATACACAAGCAATATGCCGCTCTTTAACAGAGGGTATTCAT 1450
BSNT_03540___ 1451 TGCCAAGCGGTAAAAATCAGGCTTTATATGTCCCGGTTTTAAATGTCGGT 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
BSU23810___yq 1451 TGCCAAGCGGTAAAAATCAGGCTTTATATGTCCCAGTTTTAAATGTCGGT 1500
BSNT_03540___ 1501 CCGGCTGGTAAAGACCCGCATAAATGGACGGAAAGATTGTATATGCCTTA 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23810___yq 1501 CCGGCTGGTAAAGACCCGCATAAATGGACGGAAAGATTGTATATGCCTTA 1550
BSNT_03540___ 1551 TTCCTTTGAAGTGCTTCCCGATTTGCTTTCATTTACGATCTCCGCGCTAT 1600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23810___yq 1551 TTCCTTTGAAGTGCTTCCCGATTTGCTTTCATTTACGATCTCCGCGCTAT 1600
BSNT_03540___ 1601 TAAAGCAATCAGAATCTGCCGGCCAGCTGCTGCGGGAAAAATAA 1644
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23810___yq 1601 TAAAGCAATCAGAATCTGCCGGCCAGCTGCTGCGGGAAAAATAA 1644
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.