Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_03508 and BSU23580
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_03508 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:22:19
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_03508___ansA.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU23580___ansA.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_03508___ansA-BSU23580___ansA.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_03508___ansA-BSU23580___ansA.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_03508___ansA
# 2: BSU23580___ansA
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 990
# Identity: 982/990 (99.2%)
# Similarity: 982/990 (99.2%)
# Gaps: 0/990 ( 0.0%)
# Score: 4878.0
#
#
#=======================================
BSNT_03508___ 1 ATGAAAAAATTATTGATGTTGACAACTGGGGGAACGATTGCTTCAGTTGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23580___an 1 ATGAAAAAATTATTGATGTTGACAACTGGGGGAACGATTGCTTCAGTTGA 50
BSNT_03508___ 51 AGGGGAAAATGGGCTGGCTCCCGGAGTCAAGGCTGATGAATTATTAAGTT 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23580___an 51 AGGGGAAAATGGGCTGGCTCCCGGAGTCAAGGCTGATGAATTATTAAGTT 100
BSNT_03508___ 101 ACGTATCAAAACTTGATAACGATTACACAATGGAAACTCAGTCGCTTATG 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23580___an 101 ACGTATCAAAACTTGATAACGATTACACAATGGAAACTCAGTCGCTTATG 150
BSNT_03508___ 151 AATATAGACAGCACCAATATGCAGCCTGAATACTGGGTGGAAATAGCGGA 200
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
BSU23580___an 151 AATATAGACAGCACCAATATGCAGCCTGAATACTGGGTGGAAATAGCAGA 200
BSNT_03508___ 201 AGCCGTTAAGGAAAATTATGATGCCTATGACGGGTTTGTTATTACTCACG 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23580___an 201 AGCCGTTAAGGAAAATTATGATGCCTATGACGGGTTTGTTATTACTCACG 250
BSNT_03508___ 251 GTACAGATACAATGGCCTATACATCTGCCGCACTATCGTATATGCTGCAG 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23580___an 251 GTACAGATACAATGGCCTATACATCTGCCGCACTATCGTATATGCTGCAG 300
BSNT_03508___ 301 CATGCCAAAAAGCCGATTGTCATCACCGGATCGCAGATTCCGATCACGTT 350
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
BSU23580___an 301 CATGCCAAAAAGCCGATTGTCATCACCGGCTCGCAGATTCCGATCACGTT 350
BSNT_03508___ 351 CCAAAAAACCGATGCTAAAAAAAATATTACAGATGCCATTCGATTTGCCT 400
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23580___an 351 CCAAAAAACCGATGCCAAAAAAAATATTACAGATGCCATTCGATTTGCCT 400
BSNT_03508___ 401 GTGAAGGCGTGGGCGGCGTTTATGTTGTATTTGACGGCAGAGTCATTCAG 450
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
BSU23580___an 401 GTGAAGGCGTGGGCGGCGTTTATGTTGTGTTTGACGGCAGAGTCATTCAG 450
BSNT_03508___ 451 GGAACGCGTGCGATCAAATTAAGAACGAAAAGCTACGACGCATTTGAAAG 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23580___an 451 GGAACGCGTGCGATCAAATTAAGAACGAAAAGCTACGACGCATTTGAAAG 500
BSNT_03508___ 501 CATCAATTACCCATATATCGCTTTTATCAATGAAGACGGGATCGAATACA 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23580___an 501 CATCAATTACCCATATATCGCTTTTATCAATGAAGACGGGATCGAATACA 550
BSNT_03508___ 551 ACAAACAAGTAACGGAACCTGAGAACGACACCTTCACAGTTGACACCTCA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
BSU23580___an 551 ACAAACAAGTAACGGAACCTGAGAACGACACCTTCACAGTTGACACTTCA 600
BSNT_03508___ 601 CTATGCACAGATGTATGTCTGCTGAAGCTGCATCCAGGCTTAAAGCCCGA 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23580___an 601 CTATGCACAGATGTATGTCTGCTGAAGCTGCATCCAGGCTTAAAGCCCGA 650
BSNT_03508___ 651 AATGTTTGATGCCCTGAAAAGCATGTACAAAGGAATTGTCATTGAGAGTT 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23580___an 651 AATGTTTGATGCCCTGAAAAGCATGTACAAAGGAATTGTCATTGAGAGTT 700
BSNT_03508___ 701 ATGGCAGCGGAGGGGTGCCGTTTGAAGGCAGAGACATTTTGTCAAAAGTG 750
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23580___an 701 ATGGCAGCGGAGGAGTGCCGTTTGAAGGCAGAGACATTTTGTCAAAAGTG 750
BSNT_03508___ 751 AATGAGCTGATCGAAAGCGGCATTGTCGTGGTCATTACGACTCAATGTCT 800
|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
BSU23580___an 751 AATGAACTGATCGAAAGCGGCATTGTCGTCGTCATTACGACTCAATGTCT 800
BSNT_03508___ 801 TGAAGAAGGCGAAGACATGAGCATTTACGAGGTTGGCCGCAGAGTCAACC 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23580___an 801 TGAAGAAGGCGAAGACATGAGCATTTACGAGGTTGGCCGCAGAGTCAACC 850
BSNT_03508___ 851 AAGACTTAATTATCCGATCAAGAAATATGAACACAGAAGCAATTGTGCCA 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23580___an 851 AAGACTTAATTATCCGATCAAGAAATATGAACACAGAAGCAATTGTGCCA 900
BSNT_03508___ 901 AAATTGATGTGGGCGCTAGGTCAGTCTTCGGATCTTCCTGTCGTCAAGAG 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23580___an 901 AAATTGATGTGGGCGCTAGGTCAGTCTTCGGATCTTCCTGTCGTCAAGAG 950
BSNT_03508___ 951 AATTATGGAAACGCCGATAGCTGATGACGTTGTCCTGTAA 990
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23580___an 951 AATTATGGAAACGCCGATAGCTGATGACGTTGTCCTGTAA 990
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.