Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195

Home About Browser Genes Download Publications

DNA alignment: BSNT_03507 and BSU23570

See Amino acid alignment / Visit BSNT_03507 in genome browser / Return to Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon  8 Mar 2010 06:22:19
# Commandline: needle
#    -asequence dna-align/BSNT_03507___aspA.1.22522.seq
#    -bsequence dna-align/BSU23570___ansB.2.22522.seq
#    -gapopen 10
#    -gapextend 0.5
#    -outfile dna-align/BSNT_03507___aspA-BSU23570___ansB.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_03507___aspA-BSU23570___ansB.aln
########################################

#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_03507___aspA
# 2: BSU23570___ansB
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1428
# Identity:    1412/1428 (98.9%)
# Similarity:  1412/1428 (98.9%)
# Gaps:           0/1428 ( 0.0%)
# Score: 6996.0
# 
#
#=======================================

BSNT_03507___      1 ATGTTAAACGGCCAAAAAGAATATCGCGTGGAAAAAGACTTCCTTGGGGA     50
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23570___an      1 ATGTTAAACGGCCAAAAAGAATATCGCGTGGAAAAAGACTTCCTTGGGGA     50

BSNT_03507___     51 AAAACAAATTGAAGCAGATGTTTATTACGGAATTCAGACGCTCCGTGCTT    100
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23570___an     51 AAAACAAATTGAAGCAGATGTTTATTACGGAATTCAGACGCTCCGTGCTT    100

BSNT_03507___    101 CTGAAAATTTCCCGATCACAGGATACAAAATCCATGAGGAAATGATTAAC    150
                     ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23570___an    101 CTGAAAATTTTCCGATCACAGGATACAAAATCCATGAGGAAATGATTAAC    150

BSNT_03507___    151 GCACTGGCGATTGTGAAAAAAGCTGCGGCTCTTGCCAACATGGACGTGAA    200
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23570___an    151 GCACTGGCGATTGTGAAAAAAGCTGCGGCTCTTGCCAACATGGACGTGAA    200

BSNT_03507___    201 ACGGCTGTATGAAGGAATTGGCCAAGCTATCGTACAAGCCGCTGACGAGA    250
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23570___an    201 ACGGCTGTATGAAGGAATTGGCCAAGCTATCGTACAAGCCGCTGACGAGA    250

BSNT_03507___    251 TTCTGGAAGGCAAGTGGCACGATCAGTTTATCGTCGATCCGATTCAGGGC    300
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23570___an    251 TTCTGGAAGGCAAGTGGCACGATCAGTTTATCGTCGATCCGATTCAGGGC    300

BSNT_03507___    301 GGTGCCGGAACTTCTATGAACATGAACGCGAATGAGGTTATCGGAAACCG    350
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23570___an    301 GGTGCCGGAACTTCTATGAACATGAACGCGAATGAGGTTATCGGAAACCG    350

BSNT_03507___    351 GGCGCTTGAAATCATGGGACATAAAAAGGGAGATTATATCCATTTAAGTC    400
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23570___an    351 GGCGCTTGAAATCATGGGACATAAAAAGGGAGATTATATCCATTTAAGTC    400

BSNT_03507___    401 CAAACACACATGTGAACATGTCACAGTCTACGAACGATGTGTTCCCGACT    450
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23570___an    401 CAAACACACATGTGAACATGTCACAGTCTACGAACGATGTGTTCCCGACT    450

BSNT_03507___    451 GCTATCCATATTTCCACATTGAAGCTCTTAGAAAAACTGCTGAAAACAAT    500
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23570___an    451 GCTATCCATATTTCCACATTGAAGCTCTTAGAAAAACTGCTGAAAACAAT    500

BSNT_03507___    501 GGAAGATATGCATAGTGTGTTTAAGCAAAAAGCACAGGAGTTTGACTCTG    550
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23570___an    501 GGAAGATATGCATAGTGTGTTTAAGCAAAAAGCACAGGAGTTTGACTCTG    550

BSNT_03507___    551 TTATTAAAATGGGCCGGACACACCTTCAAGATGCGGTTCCCATCCGTCTT    600
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
BSU23570___an    551 TTATTAAAATGGGCCGGACACACCTTCAAGATGCGGTTCCGATCCGTCTT    600

BSNT_03507___    601 GGCCAGGAATTCGAAGCTTACAGCCGTGTTCTCGAGCGTGATATCAAACG    650
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23570___an    601 GGCCAGGAATTCGAAGCTTACAGCCGTGTTCTCGAGCGTGATATCAAACG    650

BSNT_03507___    651 AATCAAGCAATCGCGCCAGCACCTATATGAAGTCAACATGGGCGCAACTG    700
                     ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
BSU23570___an    651 AATCAAGCAATCGCGCCAGCACCTGTATGAAGTCAACATGGGCGCAACTG    700

BSNT_03507___    701 CTGTTGGTACAGGGCTGAACGCTGATCCTGAATATATCAAACAGGTAGTA    750
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23570___an    701 CTGTTGGTACAGGGCTGAACGCTGATCCTGAATATATCAAACAGGTAGTA    750

BSNT_03507___    751 AAGCACCTTGCTGATATTAGCGGGCTTCCTCTTGTCGGCGCTGATCATCT    800
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23570___an    751 AAGCACCTTGCTGATATTAGCGGGCTTCCTCTTGTCGGCGCTGATCATCT    800

BSNT_03507___    801 TGTTGATGCGACACAAAATACAGATGCCTATACAGAGGTATCAGCTTCAT    850
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23570___an    801 TGTTGATGCGACACAAAATACAGATGCCTATACAGAGGTATCAGCTTCAT    850

BSNT_03507___    851 TAAAAGTCTGCATGATGAACATGTCGAAGATCGCAAACGACCTGCGCTTA    900
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23570___an    851 TAAAAGTCTGCATGATGAACATGTCGAAGATCGCAAACGACCTGCGCTTA    900

BSNT_03507___    901 ATGGCGTCGGGACCGCGCGCCGGACTTGCGGAAATTTCTCTGCCTGCACG    950
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23570___an    901 ATGGCGTCGGGACCGCGCGCCGGACTTGCGGAAATTTCTCTGCCTGCACG    950

BSNT_03507___    951 TCAGCCGGGCTCATCTATTATGCCGGGGAAAGTCAATCCGGTTATGGCGG   1000
                     |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23570___an    951 TCAGCCGGGTTCATCTATTATGCCGGGGAAAGTCAATCCGGTTATGGCGG   1000

BSNT_03507___   1001 AGCTGATCAACCAAATTGCGTTCCAGGTTATCGGAAACGACAATACAATC   1050
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
BSU23570___an   1001 AGCTGATCAACCAAATTGCGTTCCAGGTTATCGGAAATGACAATACAATC   1050

BSNT_03507___   1051 TGCCTTGCTTCAGAAGCCGGCCAGCTTGAGTTGAACGTCATGGAGCCCGT   1100
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23570___an   1051 TGCCTTGCTTCAGAAGCCGGCCAGCTTGAGTTGAACGTCATGGAGCCCGT   1100

BSNT_03507___   1101 GCTTGTCTTTAATTTGCTTCAATCCATCAGCATCATGAACAACGGCTTCC   1150
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23570___an   1101 GCTTGTCTTTAATTTGCTTCAATCCATCAGCATCATGAACAACGGCTTCC   1150

BSNT_03507___   1151 GTTCGTTCACTGATCATTGCTTAAAAGGCATCGAAGCCAACGAAAAGCGG   1200
                     |||||||||||||..|.||||||||||||||.|||||||||||||||||.
BSU23570___an   1151 GTTCGTTCACTGACAACTGCTTAAAAGGCATTGAAGCCAACGAAAAGCGT   1200

BSNT_03507___   1201 TTGAAGCAATATGTAGAAAAAAGCGCTGGAGTGATCACTGCAGTCAATCC   1250
                     .||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||
BSU23570___an   1201 ATGAAGCAATACGTAGAAAAAAGCGCAGGCGTGATCACAGCTGTCAATCC   1250

BSNT_03507___   1251 GCATCTTGGGTATGAAGCGGCAGCTAGAATTGCCAGGGAAGCAATTATGA   1300
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23570___an   1251 GCATCTTGGGTATGAAGCGGCAGCTAGAATTGCCAGGGAAGCAATTATGA   1300

BSNT_03507___   1301 CAGGGCAATCTGTCCGGGATCTTTGTCTGCAGCATGATGTGCTGACTGAA   1350
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23570___an   1301 CAGGGCAATCTGTCCGGGATCTTTGTCTGCAGCATGATGTGCTGACTGAA   1350

BSNT_03507___   1351 GAAGAATTGGATATTATTTTAAACCCATATGAGATGACCAAACCAGGTAT   1400
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23570___an   1351 GAAGAATTGGATATTATTTTAAACCCATATGAGATGACCAAACCAGGTAT   1400

BSNT_03507___   1401 CGCAGGGAAAGAACTATTAGAAAAATAA   1428
                     ||||||||||||||||||||||||||||
BSU23570___an   1401 CGCAGGGAAAGAACTATTAGAAAAATAA   1428


#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.