Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_03506 and BSU23560
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_03506 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:22:19
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_03506___mleN.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU23560___mleN.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_03506___mleN-BSU23560___mleN.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_03506___mleN-BSU23560___mleN.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_03506___mleN
# 2: BSU23560___mleN
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1407
# Identity: 1395/1407 (99.1%)
# Similarity: 1395/1407 (99.1%)
# Gaps: 0/1407 ( 0.0%)
# Score: 6927.0
#
#
#=======================================
BSNT_03506___ 1 TTGAAGGATGTAAGATTGCCAACACTATTTGAAATTATTATTGTACTAGG 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml 1 TTGAAGGATGTAAGATTGCCAACACTATTTGAAATTATTATTGTACTAGG 50
BSNT_03506___ 51 AGTATTTTTAGCACTTGTTCTATCGTTTACAGTCTTTCTCGACTTGCCGA 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml 51 AGTATTTTTAGCACTTGTTCTATCGTTTACAGTCTTTCTCGACTTGCCGA 100
BSNT_03506___ 101 TACAGCTGGCGCTTTTTGTTTCATGGTTTATTGCAATGCTTTTAGGTATA 150
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
BSU23560___ml 101 TACAGCTGGCGCTTTTTGTTTCATGGTTTATTGCAATGCTTTTAGGTATT 150
BSNT_03506___ 151 AGACTCGGTTATTCTTATAAAGATTTACAAAATGCGATTGTACATGGAAT 200
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
BSU23560___ml 151 AGACTCGGTTATTCTTATAAAGATTTACAAAATGCGATTGTACATGGGAT 200
BSNT_03506___ 201 ATCAAATGGCCTTGAAGCCGTACTGATTCTCGTTTCAGTTGGGGCGCTCA 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml 201 ATCAAATGGCCTTGAAGCCGTACTGATTCTCGTTTCAGTTGGGGCGCTCA 250
BSNT_03506___ 251 TCGGAACATGGATTGCCGGAGGCGTTGTGCCGACTTTGATTTATTACGGA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml 251 TCGGAACATGGATTGCCGGAGGCGTTGTGCCGACTTTGATTTATTACGGA 300
BSNT_03506___ 301 CTGGAATTTATTCACCCAAGTATCTTTTTACTGGCAACGTTAATTATTTG 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml 301 CTGGAATTTATTCACCCAAGTATCTTTTTACTGGCAACGTTAATTATTTG 350
BSNT_03506___ 351 TTCCATTATGTCTGTGGCAACAGGAACGTCATGGGGAACAGTCGGAACTG 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml 351 TTCCATTATGTCTGTGGCAACAGGAACGTCATGGGGAACAGTCGGAACTG 400
BSNT_03506___ 401 CCGGCATTGCCATGATCGCAATTGGAGAGGGTTTAGGCATTCCGCTTCCT 450
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
BSU23560___ml 401 CCGGCATTGCCATGATCGCAATTGGAGAGGGGTTAGGCATTCCGCTTCCT 450
BSNT_03506___ 451 CTAGTAGCGGGAGCTATTCTTTCAGGTGCTTATTTCGGGGACAAGCTGTC 500
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
BSU23560___ml 451 CTAGTAGCGGGAGCTATTCTTTCAGGTGCTTATTTTGGGGACAAGCTGTC 500
BSNT_03506___ 501 TCCGCTGTCTGACAGTACAGTTCTAGCTTCTTCACTATCAAAAGTCGATG 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml 501 TCCGCTGTCTGACAGTACAGTTCTAGCTTCTTCACTATCAAAAGTCGATG 550
BSNT_03506___ 551 TATTGGCTCACGTGAGAGCAATGCTTTATTTATCAATACCTGCTTATGTC 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml 551 TATTGGCTCACGTGAGAGCAATGCTTTATTTATCAATACCTGCTTATGTC 600
BSNT_03506___ 601 ATTACAGCTATACTCTTTACAGTTGTTGGATTTATGTACGGCGGGAAAAA 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml 601 ATTACAGCTATACTCTTTACAGTTGTTGGATTTATGTACGGCGGGAAAAA 650
BSNT_03506___ 651 TATTGATCTTGATAAAGTTGAATTCTTAAAATCATCTTTGCAAAACACGT 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml 651 TATTGATCTTGATAAAGTTGAATTCTTAAAATCATCTTTGCAAAACACGT 700
BSNT_03506___ 701 TTGACATTCATATTTGGATGCTGATCCCGGCAGTTGTCGTCATAGTCTTA 750
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
BSU23560___ml 701 TTGACATTCATATTTGGATGCTGATCCCGGCAGTTCTCGTCATAGTCTTA 750
BSNT_03506___ 751 TTGGCGATGAAAAAGCCATCTATGCCGGTTATCGTAATTGGCGCTTTACT 800
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml 751 TTGGCGATGAAAAAGCCATCTATGCCAGTTATCGTAATTGGCGCTTTACT 800
BSNT_03506___ 801 CGGTGCAATCTGGGCTGTTGTTTTCCAAGGAATGGATATTGCCCATGCGA 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml 801 CGGTGCAATCTGGGCTGTTGTTTTCCAAGGAATGGATATTGCCCATGCGA 850
BSNT_03506___ 851 TTGCAACTGCTTACAACGGTTTCTCTATTAAAACTGATGTTGAATTTTTG 900
||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||
BSU23560___ml 851 TTGCAACTGCGTACAACGGCTTCTCTATTAAAACGGATGTTGAATTTTTG 900
BSNT_03506___ 901 AACGGCTTGTTAAACCGCGGTGGAATTGTCGGTATGCTTGATTCTCTCGT 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml 901 AACGGCTTGTTAAACCGCGGTGGAATTGTCGGTATGCTTGATTCTCTCGT 950
BSNT_03506___ 951 CGTCATCATCTTTGGCCTTGGTTTTGGCGGTCTGCTTGAGAAACTCGGCG 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml 951 CGTCATCATCTTTGGCCTTGGTTTTGGCGGTCTGCTTGAGAAACTCGGCG 1000
BSNT_03506___ 1001 TGTTAAAAGTCATTGTTTCAACGTTTGAAAAGAAATTAACTTCAGCCGGC 1050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml 1001 TGTTAAAAGTCATTGTTTCAACGTTTGAAAAGAAATTAACTTCAGCCGGC 1050
BSNT_03506___ 1051 AATGTCACATTGTCTACACTGATCGTAGCGTTTTTAGCGAACATCTTCGG 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
BSU23560___ml 1051 AATGTCACATTGTCTACACTGATCGTAGCGTTTTTAGCAAACATCTTCGG 1100
BSNT_03506___ 1101 CTGTGCGATGTATGTATCTCTTATTTTGACTCCGAAAATTATGGAAGACA 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml 1101 CTGTGCGATGTATGTATCTCTTATTTTGACTCCGAAAATTATGGAAGACA 1150
BSNT_03506___ 1151 GCTATGATCGCTTGCATCTGGACAGAAGAGTGTTATCACGTAACTCAGAG 1200
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml 1151 GCTATGATCGCTTACATCTGGACAGAAGAGTGTTATCACGTAACTCAGAG 1200
BSNT_03506___ 1201 GTCGGGGGAACATTGACTTCGGGGATGGTACCTTGGTCTGATAATGGGAT 1250
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
BSU23560___ml 1201 GTCGGGGGAACATTGACTTCGGGGATGGTTCCTTGGTCTGATAATGGGAT 1250
BSNT_03506___ 1251 TTACATGGCTGGTATTTTAGGTGTTTCTACCTTCTCTTATCTGCCGTTTA 1300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml 1251 TTACATGGCTGGTATTTTAGGTGTTTCTACCTTCTCTTATCTGCCGTTTA 1300
BSNT_03506___ 1301 TGTGGCTCAGTTTTGTAGCAATAGGTCTTGCAATTATCTATGGTTATACA 1350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml 1301 TGTGGCTCAGTTTTGTAGCAATAGGTCTTGCAATTATCTATGGTTATACA 1350
BSNT_03506___ 1351 GGAAAATTTATATGGTATACGAAAAACAATACAGTTAAAGCCGAAAAACT 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU23560___ml 1351 GGAAAATTTATATGGTATACGAAAAACAATACAGTTAAAGCCGAAAAACT 1400
BSNT_03506___ 1401 AGGCTAA 1407
|||||||
BSU23560___ml 1401 AGGCTAA 1407
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.