Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_03372 and BSU22680
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_03372 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:22:05
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_03372___trpE.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU22680___trpE.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_03372___trpE-BSU22680___trpE.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_03372___trpE-BSU22680___trpE.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_03372___trpE
# 2: BSU22680___trpE
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1548
# Identity: 1532/1548 (99.0%)
# Similarity: 1532/1548 (99.0%)
# Gaps: 0/1548 ( 0.0%)
# Score: 7596.0
#
#
#=======================================
BSNT_03372___ 1 ATGAATTTCCAATCAAACATTTCCGCATTTTTAGAGGACAGCTTGTCCCA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr 1 ATGAATTTCCAATCAAACATTTCCGCATTTTTAGAGGACAGCTTGTCCCA 50
BSNT_03372___ 51 CCACACGATACCGATTGTGGAGACCTTCACAGTCGATACACTGACACCCA 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr 51 CCACACGATACCGATTGTGGAGACCTTCACAGTCGATACACTGACACCCA 100
BSNT_03372___ 101 TTCAAATGATAGAGAAGCTTGACAGGGAGATTACGTATCTTCTTGAAAGC 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr 101 TTCAAATGATAGAGAAGCTTGACAGGGAGATTACGTATCTTCTTGAAAGC 150
BSNT_03372___ 151 AAGGACGATACATCCACTTGGTCCAGATATTCGTTTATCGGCCTGAATCC 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr 151 AAGGACGATACATCCACTTGGTCCAGATATTCGTTTATCGGCCTGAATCC 200
BSNT_03372___ 201 ATTTCTCACAATTAAAGAAGAGCAGGGCTGTTTTTCGGCCGCTGATCAGG 250
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
BSU22680___tr 201 ATTTCTCACAATTAAAGAAGAGCAGGGCCGTTTTTCGGCCGCTGATCAGG 250
BSNT_03372___ 251 ACAGCAAATCTCTTTACACAGGAAATGAACTAAAAGAAGTGCTGAACTGG 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr 251 ACAGCAAATCTCTTTACACAGGAAATGAACTAAAAGAAGTGCTGAACTGG 300
BSNT_03372___ 301 ATGAATACCACATACAAAATCAAAACACCTCAGCTTGGCATTCCTTTTGT 350
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
BSU22680___tr 301 ATGAATACCACATACAAAATCAAAACACCTGAGCTTGGCATTCCTTTTGT 350
BSNT_03372___ 351 CGGCGGAGCTGTCGGGTACTTAAGCTATGATATGATCCCGCTGATTGAAC 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
BSU22680___tr 351 CGGCGGAGCTGTCGGGTACTTAAGCTATGATATGATCCCGCTGATTGAGC 400
BSNT_03372___ 401 CTTCTGTTCCTTCGCATACAAAAGAAACAGACATGGAAAAGTGTATGCTG 450
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr 401 CTTCTGTTCCTTCGCATACCAAAGAAACAGACATGGAAAAGTGTATGCTG 450
BSNT_03372___ 451 TTTGTTTGCCGGACATTAATTGCGTATGATCATGAAACCAAAAACGTCCA 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr 451 TTTGTTTGCCGGACATTAATTGCGTATGATCATGAAACCAAAAACGTCCA 500
BSNT_03372___ 501 CTTTATCCAATATGCAAGGCTTAATGGAGAGGAAACAAAAAACGAAAAAA 550
|||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr 501 CTTTATCCAATATGCAAGGCTCACTGGAGAGGAAACAAAAAACGAAAAAA 550
BSNT_03372___ 551 TGGATGTATTCCATCAAAATCATCTGGAGCTTCAAAATCTCATTGAAAAA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr 551 TGGATGTATTCCATCAAAATCATCTGGAGCTTCAAAATCTCATTGAAAAA 600
BSNT_03372___ 601 ATGATGGACCAAAAAAACATAAAAGAGCTGTTTCTCTCTGCTGATTCATA 650
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
BSU22680___tr 601 ATGATGGACCAAAAAAACATAAAAGAGCTGTTTCTTTCTGCTGATTCATA 650
BSNT_03372___ 651 CAAGACGCCCAGCTTTGAGACGGTATCTTCTAATTATGAAAAATCGGCTT 700
||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr 651 CAAGACACCCAGCTTTGAGACAGTATCTTCTAATTATGAAAAATCGGCTT 700
BSNT_03372___ 701 TTATGGCTGATGTAGAAAAAATCAAAAGCTATATAAAAACAGGCGATATC 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
BSU22680___tr 701 TTATGGCTGATGTAGAAAAAATCAAAAGCTATATAAAAGCAGGCGATATC 750
BSNT_03372___ 751 TTCCAGGGTGTTTTATCACAAAAATTTGAGGTGCCGATAAAAGCAGATGC 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr 751 TTCCAGGGTGTTTTATCACAAAAATTTGAGGTGCCGATAAAAGCAGATGC 800
BSNT_03372___ 801 TTTTGAGTTATACCGAGTGCTTAGGATCGTCAATCCTTCGCCGTATATGT 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr 801 TTTTGAGTTATACCGAGTGCTTAGGATCGTCAATCCTTCGCCGTATATGT 850
BSNT_03372___ 851 ATTATATGAAACTGCTAGACAGAGAAATAGTCGGCAGCTCTCCGGAACGG 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr 851 ATTATATGAAACTGCTAGACAGAGAAATAGTCGGCAGCTCTCCGGAACGG 900
BSNT_03372___ 901 TTAATACACGTTCAAGACGGGCACTTAGAAATCCATCCGATTGCCGGTAC 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr 901 TTAATACACGTTCAAGACGGGCACTTAGAAATCCATCCGATTGCCGGTAC 950
BSNT_03372___ 951 GAGAAAACGCGGTGCAGACAAAGCTGAAGATGAGAGATTGAAGGTTGAGC 1000
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
BSU22680___tr 951 GAGAAAACGCGGTGCAGACAAAGCTGAAGATGAGAGACTGAAGGTTGAGC 1000
BSNT_03372___ 1001 TGATGAAGGATGAAAAAGAAAAGGCGGAGCATTACATGCTCGTTGATCTT 1050
|.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr 1001 TCATGAAGGATGAAAAAGAAAAAGCGGAGCATTACATGCTCGTTGATCTT 1050
BSNT_03372___ 1051 GCCCGAAACGATATCGGCAGAGTAGCAGAGTATGGTTCTGTTTCTGTGCC 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr 1051 GCCCGAAACGATATCGGCAGAGTAGCAGAGTATGGTTCTGTTTCTGTGCC 1100
BSNT_03372___ 1101 GGAGTTCACAAAAATTGTTTCCTTTTCACATGTCATGCACATTATCTCGG 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr 1101 GGAGTTCACAAAAATTGTTTCCTTTTCACATGTCATGCACATTATCTCGG 1150
BSNT_03372___ 1151 TGGTTACAGGCCGATTGAAAAAAGGGGTTCATCCTGTCGATGCACTGATG 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr 1151 TGGTTACAGGCCGATTGAAAAAAGGGGTTCATCCTGTCGATGCACTGATG 1200
BSNT_03372___ 1201 TCTGCTTTCCCGGCGGGGACTTTAACAGGCGCACCCAAAATCCGTGCCAT 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr 1201 TCTGCTTTCCCGGCGGGGACTTTAACAGGCGCACCCAAAATCCGTGCCAT 1250
BSNT_03372___ 1251 GCAGCTTTTGCAAGAGCTCGAGCCAACACCGAGAGAGACATACGGAGGAT 1300
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|
BSU22680___tr 1251 GCAGCTTTTGCAAGAACTCGAGCCAACACCGAGAGAGACATACGGAGGGT 1300
BSNT_03372___ 1301 GTATTGCCTACATTGGGTTTGACGGGAATATCGACTCTTGTATTACGATT 1350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr 1301 GTATTGCCTACATTGGGTTTGACGGGAATATCGACTCTTGTATTACGATT 1350
BSNT_03372___ 1351 CGCACGATGAGTGTAAAGAACGGCGTTGCATCGATACAGGCAGGTGCTGG 1400
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr 1351 CGCACGATGAGTGTAAAGAACGGTGTTGCATCGATACAGGCAGGTGCTGG 1400
BSNT_03372___ 1401 CATTGTTGCTGATTCTGTTCCGGAAGCCGAATACGAAGAAAGCTGTAATA 1450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr 1401 CATTGTTGCTGATTCTGTTCCGGAAGCCGAATACGAAGAAAGCTGTAATA 1450
BSNT_03372___ 1451 AAGCCGGTGCGCTGCTGAAAACGATTCATATTGCAGAAGACATGTTTCAT 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr 1451 AAGCCGGTGCGCTGCTGAAAACGATTCATATTGCAGAAGACATGTTTCAT 1500
BSNT_03372___ 1501 AGCAAGGAGGATAAAGCTGATGAACAGATTTCTACAATTGTGCGTTGA 1548
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr 1501 AGCAAGGAGGATAAAGCTGATGAACAGATTTCTACAATTGTGCGTTGA 1548
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.