Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195

Home About Browser Genes Download Publications

DNA alignment: BSNT_03372 and BSU22680

See Amino acid alignment / Visit BSNT_03372 in genome browser / Return to Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon  8 Mar 2010 06:22:05
# Commandline: needle
#    -asequence dna-align/BSNT_03372___trpE.1.22522.seq
#    -bsequence dna-align/BSU22680___trpE.2.22522.seq
#    -gapopen 10
#    -gapextend 0.5
#    -outfile dna-align/BSNT_03372___trpE-BSU22680___trpE.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_03372___trpE-BSU22680___trpE.aln
########################################

#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_03372___trpE
# 2: BSU22680___trpE
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1548
# Identity:    1532/1548 (99.0%)
# Similarity:  1532/1548 (99.0%)
# Gaps:           0/1548 ( 0.0%)
# Score: 7596.0
# 
#
#=======================================

BSNT_03372___      1 ATGAATTTCCAATCAAACATTTCCGCATTTTTAGAGGACAGCTTGTCCCA     50
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr      1 ATGAATTTCCAATCAAACATTTCCGCATTTTTAGAGGACAGCTTGTCCCA     50

BSNT_03372___     51 CCACACGATACCGATTGTGGAGACCTTCACAGTCGATACACTGACACCCA    100
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr     51 CCACACGATACCGATTGTGGAGACCTTCACAGTCGATACACTGACACCCA    100

BSNT_03372___    101 TTCAAATGATAGAGAAGCTTGACAGGGAGATTACGTATCTTCTTGAAAGC    150
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr    101 TTCAAATGATAGAGAAGCTTGACAGGGAGATTACGTATCTTCTTGAAAGC    150

BSNT_03372___    151 AAGGACGATACATCCACTTGGTCCAGATATTCGTTTATCGGCCTGAATCC    200
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr    151 AAGGACGATACATCCACTTGGTCCAGATATTCGTTTATCGGCCTGAATCC    200

BSNT_03372___    201 ATTTCTCACAATTAAAGAAGAGCAGGGCTGTTTTTCGGCCGCTGATCAGG    250
                     ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
BSU22680___tr    201 ATTTCTCACAATTAAAGAAGAGCAGGGCCGTTTTTCGGCCGCTGATCAGG    250

BSNT_03372___    251 ACAGCAAATCTCTTTACACAGGAAATGAACTAAAAGAAGTGCTGAACTGG    300
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr    251 ACAGCAAATCTCTTTACACAGGAAATGAACTAAAAGAAGTGCTGAACTGG    300

BSNT_03372___    301 ATGAATACCACATACAAAATCAAAACACCTCAGCTTGGCATTCCTTTTGT    350
                     ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
BSU22680___tr    301 ATGAATACCACATACAAAATCAAAACACCTGAGCTTGGCATTCCTTTTGT    350

BSNT_03372___    351 CGGCGGAGCTGTCGGGTACTTAAGCTATGATATGATCCCGCTGATTGAAC    400
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
BSU22680___tr    351 CGGCGGAGCTGTCGGGTACTTAAGCTATGATATGATCCCGCTGATTGAGC    400

BSNT_03372___    401 CTTCTGTTCCTTCGCATACAAAAGAAACAGACATGGAAAAGTGTATGCTG    450
                     |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr    401 CTTCTGTTCCTTCGCATACCAAAGAAACAGACATGGAAAAGTGTATGCTG    450

BSNT_03372___    451 TTTGTTTGCCGGACATTAATTGCGTATGATCATGAAACCAAAAACGTCCA    500
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr    451 TTTGTTTGCCGGACATTAATTGCGTATGATCATGAAACCAAAAACGTCCA    500

BSNT_03372___    501 CTTTATCCAATATGCAAGGCTTAATGGAGAGGAAACAAAAAACGAAAAAA    550
                     |||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr    501 CTTTATCCAATATGCAAGGCTCACTGGAGAGGAAACAAAAAACGAAAAAA    550

BSNT_03372___    551 TGGATGTATTCCATCAAAATCATCTGGAGCTTCAAAATCTCATTGAAAAA    600
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr    551 TGGATGTATTCCATCAAAATCATCTGGAGCTTCAAAATCTCATTGAAAAA    600

BSNT_03372___    601 ATGATGGACCAAAAAAACATAAAAGAGCTGTTTCTCTCTGCTGATTCATA    650
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
BSU22680___tr    601 ATGATGGACCAAAAAAACATAAAAGAGCTGTTTCTTTCTGCTGATTCATA    650

BSNT_03372___    651 CAAGACGCCCAGCTTTGAGACGGTATCTTCTAATTATGAAAAATCGGCTT    700
                     ||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr    651 CAAGACACCCAGCTTTGAGACAGTATCTTCTAATTATGAAAAATCGGCTT    700

BSNT_03372___    701 TTATGGCTGATGTAGAAAAAATCAAAAGCTATATAAAAACAGGCGATATC    750
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
BSU22680___tr    701 TTATGGCTGATGTAGAAAAAATCAAAAGCTATATAAAAGCAGGCGATATC    750

BSNT_03372___    751 TTCCAGGGTGTTTTATCACAAAAATTTGAGGTGCCGATAAAAGCAGATGC    800
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr    751 TTCCAGGGTGTTTTATCACAAAAATTTGAGGTGCCGATAAAAGCAGATGC    800

BSNT_03372___    801 TTTTGAGTTATACCGAGTGCTTAGGATCGTCAATCCTTCGCCGTATATGT    850
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr    801 TTTTGAGTTATACCGAGTGCTTAGGATCGTCAATCCTTCGCCGTATATGT    850

BSNT_03372___    851 ATTATATGAAACTGCTAGACAGAGAAATAGTCGGCAGCTCTCCGGAACGG    900
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr    851 ATTATATGAAACTGCTAGACAGAGAAATAGTCGGCAGCTCTCCGGAACGG    900

BSNT_03372___    901 TTAATACACGTTCAAGACGGGCACTTAGAAATCCATCCGATTGCCGGTAC    950
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr    901 TTAATACACGTTCAAGACGGGCACTTAGAAATCCATCCGATTGCCGGTAC    950

BSNT_03372___    951 GAGAAAACGCGGTGCAGACAAAGCTGAAGATGAGAGATTGAAGGTTGAGC   1000
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
BSU22680___tr    951 GAGAAAACGCGGTGCAGACAAAGCTGAAGATGAGAGACTGAAGGTTGAGC   1000

BSNT_03372___   1001 TGATGAAGGATGAAAAAGAAAAGGCGGAGCATTACATGCTCGTTGATCTT   1050
                     |.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr   1001 TCATGAAGGATGAAAAAGAAAAAGCGGAGCATTACATGCTCGTTGATCTT   1050

BSNT_03372___   1051 GCCCGAAACGATATCGGCAGAGTAGCAGAGTATGGTTCTGTTTCTGTGCC   1100
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr   1051 GCCCGAAACGATATCGGCAGAGTAGCAGAGTATGGTTCTGTTTCTGTGCC   1100

BSNT_03372___   1101 GGAGTTCACAAAAATTGTTTCCTTTTCACATGTCATGCACATTATCTCGG   1150
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr   1101 GGAGTTCACAAAAATTGTTTCCTTTTCACATGTCATGCACATTATCTCGG   1150

BSNT_03372___   1151 TGGTTACAGGCCGATTGAAAAAAGGGGTTCATCCTGTCGATGCACTGATG   1200
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr   1151 TGGTTACAGGCCGATTGAAAAAAGGGGTTCATCCTGTCGATGCACTGATG   1200

BSNT_03372___   1201 TCTGCTTTCCCGGCGGGGACTTTAACAGGCGCACCCAAAATCCGTGCCAT   1250
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr   1201 TCTGCTTTCCCGGCGGGGACTTTAACAGGCGCACCCAAAATCCGTGCCAT   1250

BSNT_03372___   1251 GCAGCTTTTGCAAGAGCTCGAGCCAACACCGAGAGAGACATACGGAGGAT   1300
                     |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|
BSU22680___tr   1251 GCAGCTTTTGCAAGAACTCGAGCCAACACCGAGAGAGACATACGGAGGGT   1300

BSNT_03372___   1301 GTATTGCCTACATTGGGTTTGACGGGAATATCGACTCTTGTATTACGATT   1350
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr   1301 GTATTGCCTACATTGGGTTTGACGGGAATATCGACTCTTGTATTACGATT   1350

BSNT_03372___   1351 CGCACGATGAGTGTAAAGAACGGCGTTGCATCGATACAGGCAGGTGCTGG   1400
                     |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr   1351 CGCACGATGAGTGTAAAGAACGGTGTTGCATCGATACAGGCAGGTGCTGG   1400

BSNT_03372___   1401 CATTGTTGCTGATTCTGTTCCGGAAGCCGAATACGAAGAAAGCTGTAATA   1450
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr   1401 CATTGTTGCTGATTCTGTTCCGGAAGCCGAATACGAAGAAAGCTGTAATA   1450

BSNT_03372___   1451 AAGCCGGTGCGCTGCTGAAAACGATTCATATTGCAGAAGACATGTTTCAT   1500
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr   1451 AAGCCGGTGCGCTGCTGAAAACGATTCATATTGCAGAAGACATGTTTCAT   1500

BSNT_03372___   1501 AGCAAGGAGGATAAAGCTGATGAACAGATTTCTACAATTGTGCGTTGA   1548
                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22680___tr   1501 AGCAAGGAGGATAAAGCTGATGAACAGATTTCTACAATTGTGCGTTGA   1548


#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.