Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_03309 and BSU22220
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_03309 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:21:56
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_03309___yprA.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU22220___yprA.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_03309___yprA-BSU22220___yprA.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_03309___yprA-BSU22220___yprA.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_03309___yprA
# 2: BSU22220___yprA
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 2250
# Identity: 2233/2250 (99.2%)
# Similarity: 2233/2250 (99.2%)
# Gaps: 0/2250 ( 0.0%)
# Score: 11097.0
#
#
#=======================================
BSNT_03309___ 1 ATGAAAAAGAAATCACTGACTGAACTCATTTCTGATTTAAAAGGAAATGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 1 ATGAAAAAGAAATCACTGACTGAACTCATTTCTGATTTAAAAGGAAATGA 50
BSNT_03309___ 51 AAACGTTGTGAATTGGCATGAAATTGAGCCTCGGGAAGCAAAAACAAGGC 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 51 AAACGTTGTGAATTGGCATGAAATTGAGCCTCGGGAAGCAAAAACAAGGC 100
BSNT_03309___ 101 CTATGCCCGAAAGTATAGACGAGAGAATCAAAGCGGCCCTTTCGAAAAGG 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 101 CTATGCCCGAAAGTATAGACGAGAGAATCAAAGCGGCCCTTTCGAAAAGG 150
BSNT_03309___ 151 GGCATTGATGAACTATATACTCACCAATATTCCGCTTTTCAATATGTGCA 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 151 GGCATTGATGAACTATATACTCACCAATATTCCGCTTTTCAATATGTGCA 200
BSNT_03309___ 201 AAAAGGAGAAAGCATTGTTACCGTAACGCCAACAGCATCAGGAAAAACGT 250
|||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 201 AAAAGGAGAGAGCATCGTTACCGTAACGCCAACAGCATCAGGAAAAACGT 250
BSNT_03309___ 251 TATGCTACAACCTCCCAGTCCTGCAGTCCATCGCCCAAGATGAAACAAAC 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 251 TATGCTACAACCTCCCAGTCCTGCAGTCCATCGCCCAAGATGAAACAAAC 300
BSNT_03309___ 301 CGGGCGTTATATTTATTTCCGACTAAAGCGCTGGCACAAGACCAAAAGAG 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 301 CGGGCGTTATATTTATTTCCGACTAAAGCGCTGGCACAAGACCAAAAGAG 350
BSNT_03309___ 351 CGAGCTAAATGAAATTATTGATGAAATGGGCATTGATATTAAAAGCTTTA 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 351 CGAGCTAAATGAAATTATTGATGAAATGGGCATTGATATTAAAAGCTTTA 400
BSNT_03309___ 401 CATATGATGGGGATACGTCTCCGGCAATCAGACAAAAGGTGAGAAAAGCA 450
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 401 CATATGACGGGGATACGTCTCCGGCAATCAGACAAAAGGTGAGAAAAGCA 450
BSNT_03309___ 451 GGTCATATTGTCATTACAAACCCCGATATGCTGCATTCTGCCATTCTACC 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 451 GGTCATATTGTCATTACAAACCCCGATATGCTGCATTCTGCCATTCTACC 500
BSNT_03309___ 501 GCATCATACGAAATGGGTCAGTTTGTTTGAAAACCTTAAGTATATCGTCA 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 501 GCATCATACGAAATGGGTCAGTTTGTTTGAAAACCTTAAGTATATCGTCA 550
BSNT_03309___ 551 TCGATGAGCTTCATACGTATCGAGGTGTGTTCGGCAGCCATGTGGCAAAT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 551 TCGATGAGCTTCATACGTATCGAGGTGTGTTCGGCAGCCATGTGGCAAAT 600
BSNT_03309___ 601 GTGATCCGGCGGCTAAAGCGGATCTGCCGGTTTTATGGAAGTGATCCGGT 650
||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
BSU22220___yp 601 GTGATCCGGCGGCTGAAGCGGATCTGCCGGTTTTATGGAAGTGATCCAGT 650
BSNT_03309___ 651 TTTTATTTGTACTTCCGCAACAATTGCCAACCCAAAGGAATTGGGAGAGC 700
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 651 TTTTATTTGTACTTCCGCAACGATTGCCAACCCAAAGGAATTGGGAGAGC 700
BSNT_03309___ 701 AGCTGACAGGCAAACCGATGCGGCTGGTCGATGACAACGGCGCACCGAGC 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 701 AGCTGACAGGCAAACCGATGCGGCTGGTCGATGACAACGGCGCACCGAGC 750
BSNT_03309___ 751 GGACGCAAGCATTTTGTGTTTTACAATCCGCCAATTGTGAACAAACCGCT 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 751 GGACGCAAGCATTTTGTGTTTTACAATCCGCCAATTGTGAACAAACCGCT 800
BSNT_03309___ 801 CAATATTAGAAGGAGCGCAACCGCAGAAGTGAATGAACTGGCGAAAGAGT 850
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 801 GAATATTAGAAGGAGCGCAACCGCAGAAGTGAATGAACTGGCGAAAGAGT 850
BSNT_03309___ 851 TCCTTAAAAACAAAGTGCAGACCATTGTTTTTGCCAGAAGCAGAGTTCGG 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 851 TCCTTAAAAACAAAGTGCAGACCATTGTTTTTGCCAGAAGCAGAGTTCGG 900
BSNT_03309___ 901 GTGGAAATTATTTTAAGCCATATTCAGGAGCTTGTGAAAAAAGAGATTGG 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 901 GTGGAAATTATTTTAAGCCATATTCAGGAGCTTGTGAAAAAAGAGATTGG 950
BSNT_03309___ 951 AACAAAATCAATCAGAGGCTATCGGGGAGGCTATCTGCCGAAAGAGCGAA 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 951 AACAAAATCAATCAGAGGCTATCGGGGAGGCTATCTGCCGAAAGAGCGAA 1000
BSNT_03309___ 1001 GAGAAATCGAAAGAGGCCTGAGAGAAGGCGACATTTTAGGAGTGGTCAGT 1050
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 1001 GAGAAATCGAAAGAGGACTGAGAGAAGGCGACATTTTAGGAGTGGTCAGT 1050
BSNT_03309___ 1051 ACGAATGCCTTAGAGCTTGGTGTTGATATCGGCCAGCTGCAAGTGTGTGT 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 1051 ACGAATGCCTTAGAGCTTGGTGTTGATATCGGCCAGCTGCAAGTGTGTGT 1100
BSNT_03309___ 1101 AATGACTGGGTATCCCGGAAGTGTTGCAAGTGCTTGGCAGCAGGCCGGAC 1150
||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
BSU22220___yp 1101 AATGACGGGGTATCCCGGAAGTGTTGCAAGTGCTTGGCAGCAGGCGGGAC 1150
BSNT_03309___ 1151 GAGCCGGCAGAAGACACGGTGAATCTTTGATTATTTTGGTAGCCAATTCA 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||
BSU22220___yp 1151 GAGCCGGCAGAAGACACGGTGAATCTTTGATTATCATGGTAGCCAATTCA 1200
BSNT_03309___ 1201 ACACCGATTGACCAATATATTGTGCGGCATCCTGAATATTTCTTTAATCG 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 1201 ACACCGATTGACCAATATATTGTGCGGCATCCTGAATATTTCTTTAATCG 1250
BSNT_03309___ 1251 TTCGCCGGAATCTGCAAGAATCAATCCGGAGAATTTGATTATTTTAGTAG 1300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 1251 TTCGCCGGAATCTGCAAGAATCAATCCGGAGAATTTGATTATTTTAGTAG 1300
BSNT_03309___ 1301 ACCACTTAAAGTGTGCGGCTTATGAGCTTCCTTTTAGAGCTGATGAAGAA 1350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 1301 ACCACTTAAAGTGTGCGGCTTATGAGCTTCCTTTTAGAGCTGATGAAGAA 1350
BSNT_03309___ 1351 TTTGGAGCCATGGAAGTCAGTGATATTCTTGAGTATCTTCAGGAAGAGGC 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 1351 TTTGGAGCCATGGAAGTCAGTGATATTCTTGAGTATCTTCAGGAAGAGGC 1400
BSNT_03309___ 1401 TGTTCTTCACCGCAACGGCGAACGGTACCATTGGGCAAGTGAGTCGTTTC 1450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
BSU22220___yp 1401 TGTTCTTCACCGCAACGGCGAACGGTACCATTGGGCAAGTGAGTCGTTCC 1450
BSNT_03309___ 1451 CTGCTTCAAACATCAGTTTGCGTTCCGCCTCCCAGGAAAATGTCGTTATA 1500
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 1451 CTGCGTCAAACATCAGTTTGCGTTCCGCCTCCCAGGAAAATGTCGTTATA 1500
BSNT_03309___ 1501 GTTGATCAGTCGGATATTGCAAATGTAAGGATTATCGGTGAAATGGACCG 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 1501 GTTGATCAGTCGGATATTGCAAATGTAAGGATTATCGGTGAAATGGACCG 1550
BSNT_03309___ 1551 TTTTAGTGCGATGACGCTTTTACATGATGAAGCAATTTATTTGCATGAAG 1600
|||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||
BSU22220___yp 1551 TTTTAGTGCGATGACGCTTTTGCATGATGAAGCGATTTATTTGCATGAAG 1600
BSNT_03309___ 1601 GCGTTCAGTATCAAGTTGAGAAGCTCGATTGGGACCATAAAAAGGCGTAT 1650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 1601 GCGTTCAGTATCAAGTTGAGAAGCTCGATTGGGACCATAAAAAGGCGTAT 1650
BSNT_03309___ 1651 GTCAGAAAAGTCGATGTCGAATATTATACGGATGCAAACCTGGCAGTTCA 1700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 1651 GTCAGAAAAGTCGATGTCGAATATTATACGGATGCAAACCTGGCAGTTCA 1700
BSNT_03309___ 1701 GCTGAAGGTATTAGAAATCGATAAAACGAAAGAAAAAAGCCGTACGTCAT 1750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 1701 GCTGAAGGTATTAGAAATCGATAAAACGAAAGAAAAAAGCCGTACGTCAT 1750
BSNT_03309___ 1751 TGCACTACGGAGACGTCACTGTCAATGCCCTGCCGACCATTTTTAAAAAA 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 1751 TGCACTACGGAGACGTCACTGTCAATGCCCTGCCGACCATTTTTAAAAAA 1800
BSNT_03309___ 1801 ATAAAAATGACCACTTTTGAAAATATTGGGTCTGGACCTATTCATTTGCC 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 1801 ATAAAAATGACCACTTTTGAAAATATTGGGTCTGGACCTATTCATTTGCC 1850
BSNT_03309___ 1851 GGAAGAAGAACTGCATACAAGTGCAGCTTGGCTCGAAATCAAAACAGCGG 1900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 1851 GGAAGAAGAACTGCATACAAGTGCAGCTTGGCTCGAAATCAAAACAGCGG 1900
BSNT_03309___ 1901 ATGAAGACATCGGGGAAAAGACACTGGAACAGCTGCTTCTTGGCATCTCG 1950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 1901 ATGAAGACATCGGGGAAAAGACACTGGAACAGCTGCTTCTTGGCATCTCG 1950
BSNT_03309___ 1951 AATGTGCTGCAGCATATTGTCCCTGTGTATATCATGTGTGATCGAAATGA 2000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 1951 AATGTGCTGCAGCATATTGTCCCTGTGTATATCATGTGTGATCGAAATGA 2000
BSNT_03309___ 2001 TGTTCATGTTGTTTCTCAAATTAAAGCAGCCCATACCGGATTGCCAACCA 2050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 2001 TGTTCATGTTGTTTCTCAAATTAAAGCAGCCCATACCGGATTGCCAACCA 2050
BSNT_03309___ 2051 TATTTTTATATGATCATTATCCGGGCGGTATCGGTTTGGCGGAGGAAGTC 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 2051 TATTTTTATATGATCATTATCCGGGCGGTATCGGTTTGGCGGAGGAAGTC 2100
BSNT_03309___ 2101 TTTAAACGTTTTTCAGACATTAATGAAGCGGCGAAACAACTGATTACACA 2150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 2101 TTTAAACGTTTTTCAGACATTAATGAAGCGGCGAAACAACTGATTACACA 2150
BSNT_03309___ 2151 TTGTCCTTGTCATGACGGCTGTCCGTCTTGTATAGGTACAGAAATAGAAG 2200
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
BSU22220___yp 2151 TTGTCCTTGTCATGACGGCTGTCCGTCTTGTATAGGTACGGAAATAGAAG 2200
BSNT_03309___ 2201 GGATAAAAGCAAAGGAAAGAATTTTGCAGCTGTTGGATCAAATGTCGTAA 2250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU22220___yp 2201 GGATAAAAGCAAAGGAAAGAATTTTGCAGCTGTTGGATCAAATGTCGTAA 2250
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.