Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_03098 and BSU19000
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_03098 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:21:32
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_03098___yobL.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU19000___yobL.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_03098___yobL-BSU19000___yobL.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_03098___yobL-BSU19000___yobL.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_03098___yobL
# 2: BSU19000___yobL
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1803
# Identity: 1716/1803 (95.2%)
# Similarity: 1716/1803 (95.2%)
# Gaps: 0/1803 ( 0.0%)
# Score: 8232.0
#
#
#=======================================
BSNT_03098___ 1 ATGAAGGTATTTGAGGCTGATTCATTACTTTTTGAAGCGGATAAAAGAAC 50
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
BSU19000___yo 1 ATGAAGGTATTTGAGGCTGATTCATTACTCTTTGAAGCGGATAAAAGAAC 50
BSNT_03098___ 51 CAAAGAGTATAAGGAACTAAGGTCGCAAATGGTGAAGCTAAGAAAAGCTT 100
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||.|
BSU19000___yo 51 CAAAGAGTATAAGGAACTAAGGTCGCAAATGGTGAAGCTCAAAAAAGCGT 100
BSNT_03098___ 101 TTCAAAACGTAGCTAACCTAGATGACAGTGAGTTTTCAGGCAAGGGTGCT 150
||.|..|.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
BSU19000___yo 101 TTAAGGAAGTAGCTAACCTAGATGACAGTGAATTTTCAGGCAAGGGTGCT 150
BSNT_03098___ 151 GACAACATTAAAGCATTTTATCATGATCATGTCGGTGTTACTGATCAATG 200
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||.||.||.|||||
BSU19000___yo 151 GACAACATTAAAGCATTTTATCATGGTCATGTCGGCGTAACAGACCAATG 200
BSNT_03098___ 201 GATTGATTTAATTGACATGAAGATTGCTTTCTTAAGCAGCATGTCTGCAA 250
|||||||.|.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU19000___yo 201 GATTGATCTTATCGATATGAAGATTGCTTTCTTAAGCAGCATGTCTGCAA 250
BSNT_03098___ 251 AACTTGAAGATGCTAAGATGTCTGATGCTTACATAGAAGAATCCTTTTTA 300
.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||
BSU19000___yo 251 CACTTGAAGATGCGAAGATGTCTGATGCTTACATAGAAGAATCCTTTCTA 300
BSNT_03098___ 301 GAACACGAGTTGGCTAACGCCTATACAAAATCAAAATCCATTATGTCTGA 350
||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||
BSU19000___yo 301 GAACACGAGTTGGCTAACGCTTATGCAAAATCAAAATCCATTATGTCTGA 350
BSNT_03098___ 351 ACAGAAAAAAGCAATGAAAGACATATTAAACGACATCAATGATATTCTTC 400
|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||
BSU19000___yo 351 ACAGAAAAAAGCAATGAAAGACATATTAAACAACATCAATGATATCCTTC 400
BSNT_03098___ 401 CCCTTGAAATATTTTCAACAGAAGACTTCAAAGACAAACTTTCTTCTGCA 450
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU19000___yo 401 CCCTTGAAATATTCTCAACAGAAGACTTCAAAGACAAACTTTCTTCTGCA 450
BSNT_03098___ 451 GATGACAAACGTGAAAAAACAATCGATAAGCTAAACAAGCTTGATGAGGA 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU19000___yo 451 GATGACAAACGTGAAAAAACAATCGATAAGCTAAACAAGCTTGATGAGGA 500
BSNT_03098___ 501 TTTAAAAACAGAATACGCTGAAACAGAGCCTAACGAACAATTCATTCAGC 550
|||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||
BSU19000___yo 501 TTTAAAAACAGAATACGCTGAAACAGAACCAAACGAACAATTTATTCAGC 550
BSNT_03098___ 551 AAGATTTTAAAAAGCTGCAGGAATCAACAGGCAAAGGGAAGAACGCCACT 600
||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.
BSU19000___yo 551 AAGACTTTAAAAAGCTGCAGGAATCAACAGGCAAAGGAAAAAACGCTACA 600
BSNT_03098___ 601 CCGATTCACTATAACGCCAAAGCGTATAGAGAAAGTGACATACATAAGAA 650
||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
BSU19000___yo 601 CCAATTCACTATAACGCTAAAGCGTACAGAGAAAGTGACATACATAAGAA 650
BSNT_03098___ 651 AAAAGGCGACATAGAGAAGCATTCTGAAGCTTACTTAAGCGTGAAGAAAG 700
|||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||
BSU19000___yo 651 AAAAGGCGATATTGAAAAGCATTCTGAAGCTTACTTAAGTGTGAAGAAAG 700
BSNT_03098___ 701 AAGAAGCAAAGGACCGTGAAATCAAGGAATTAAAGAAAAAACTTAATGAC 750
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU19000___yo 701 AAGAAGCAAAGGAACGTGAAATCAAGGAATTAAAGAAAAAACTTAATGAC 750
BSNT_03098___ 751 GGTGTCTCTGACCCTGTTGAATATTTAGAGATTGCTAAGAAAGTAGGGTA 800
|||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU19000___yo 751 GGTGTATCTGACCCTGATGAATATTTAGAGATTGCTAAGAAAGTAGGGTA 800
BSNT_03098___ 801 CGAGAATCTGGAGCCAGCTCAAGTGCAGCTTGCAGTGCAAATTGAACAAG 850
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU19000___yo 801 CGAGAATCTGGAGCCAACTCAAGTGCAGCTTGCAGTGCAAATTGAACAAG 850
BSNT_03098___ 851 CGAAGCAGCTAGAAGGAGCAGGAGAAATCACCTGGGATATCGTAAAAGGT 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU19000___yo 851 CGAAGCAGCTAGAAGGAGCAGGAGAAATCACCTGGGATATCGTAAAAGGT 900
BSNT_03098___ 901 GTAGGAGTAGGCTTATATGATGTTGGTAAAGACACTGTAACCGGCATATG 950
||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||
BSU19000___yo 901 GTAGGAGTTGGTTTATACGATGTAGGAAAAGACACTGTAACCGGCATATG 950
BSNT_03098___ 951 GGATTTCATCACCGATCCAGGAGAAACACTATCAGCACTGGGAAATGCAG 1000
|||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
BSU19000___yo 951 GGACTTCATCACCGATCCAGGAGAAACACTCTCAGCACTGGGTAATGCAG 1000
BSNT_03098___ 1001 TTATTCATCCAGTGAAAACTTACGATGCCATTTCAGCAGCAATAGAAGAG 1050
.|||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
BSU19000___yo 1001 CTATGCATCCAGTGAAAACATACGATGCCATTTCAGCAGCAATAGAAGAG 1050
BSNT_03098___ 1051 TCATATCAAAAGGATATGGTGAATGGAGATGCCTATTCTAGATCAAGATG 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU19000___yo 1051 TCATATCAAAAGGATATGGTGAATGGAGATGCCTATTCTAGATCAAGATG 1100
BSNT_03098___ 1101 GGTAACGTATGCTGTTGGTTCAGTGGCTGTAGCTGTTTTTGGAACCAAAG 1150
|||.||.||||||.|||||||||||||||||||||||.||||.||.||||
BSU19000___yo 1101 GGTTACCTATGCTATTGGTTCAGTGGCTGTAGCTGTTGTTGGTACAAAAG 1150
BSNT_03098___ 1151 GTGCAGGAGCCATTAACAAAGCAGATGCAGCGGGCAAGGTCATAAACAAA 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
BSU19000___yo 1151 GTGCAGGAGCCATTAACAAAGCAGATGCAGCGGGCAAGGTAATAAATAAA 1200
BSNT_03098___ 1201 GCAAGTCAGGCAGGGAAGAAAATTAAGGATGTCAAGATTCCAGATTTGCT 1250
||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||
BSU19000___yo 1201 GCAAGTCAAGCAGGTAAGAAAATCAAGGACGTTAAGATTCCAGATTTGCT 1250
BSNT_03098___ 1251 GCCTTATAATCCTAAGTACGACTTTCCTCTAGCCGATAATGTGCCATACA 1300
||||||.||.||||||||..|..||.|||||||.|||||.||||||||||
BSU19000___yo 1251 GCCTTACAACCCTAAGTATAAGCTTGCTCTAGCAGATAACGTGCCATACA 1300
BSNT_03098___ 1301 ATGTGGTTGATAGCCAAAGCCTTAAGAATGAACTTTTGACTAATGCGAAG 1350
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
BSU19000___yo 1301 ATGTGGTTGATAGCCAAAACCTTAAGAATGAACTTTTGACTAATGCGAAG 1350
BSNT_03098___ 1351 AAAATACCGGATGGAACAAGAAAACCGTTTACTGGCCAAAAGATAAGCCC 1400
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
BSU19000___yo 1351 AAAATACCGGATGGAACAAGAAAACCGTTTACTGGCCAAAAGAAAAGCCC 1400
BSNT_03098___ 1401 CCCTTGGCTAAATAAAGAAAAGTATGATGCATATGAAATAGAGGGGAAGG 1450
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU19000___yo 1401 TCCTTGGCTAAATAAAGAAAAGTATGATGCATATGAAATAGAGGGGAAGG 1450
BSNT_03098___ 1451 TAAAGGCGAAGGGGAAAGTTAAAGATGTAAGCCGAAGAGTGTATACTATG 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
BSU19000___yo 1451 TAAAGGCGAAGGGGAAAGTTAAAGATGTAAGCCGTAGAGTGTATACTATG 1500
BSNT_03098___ 1501 AAAGATATTGATATTAATCAAAAAACAGAATTCGGTGTTACAAATCTTCA 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU19000___yo 1501 AAAGATATTGATATTAATCAAAAAACAGAATTCGGTGTTACAAATCTTCA 1550
BSNT_03098___ 1551 GCTAATGAAAAACGGGAATGCCCCTTATGCAGAAGATGGTACACAGATTA 1600
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||
BSU19000___yo 1551 GCTAATGAAAAACGGGAATGCCCCTTATGCAAAAGACGGTACACAGATTA 1600
BSNT_03098___ 1601 ATTTACATCACTTGATTCAAGAAGAACCTGGCCCAATGCTTGAAATCCCT 1650
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
BSU19000___yo 1601 ATTTACATCACTTGATTCAAGAAGAACCTGGCCCAATGCTTGAAATCCCG 1650
BSNT_03098___ 1651 AACAGCTTACATACAAAATATAGTGATGTCATTCATCAGCTTAAGTCTGA 1700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU19000___yo 1651 AACAGCTTACATACAAAATATAGTGATGTCATTCATCAGCTTAAGTCTGA 1700
BSNT_03098___ 1701 TGGTGAAAGTTTTAGAAATGATAAGGTTTTAAAAGCACAATACGAGAGCT 1750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU19000___yo 1701 TGGTGAAAGTTTTAGAAATGATAAGGTTTTAAAAGCACAATACGAGAGCT 1750
BSNT_03098___ 1751 TTAGAAAGAGATATTGGAAGTGGAGAGCGAAACAATTTGAGAATGAGAAT 1800
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||
BSU19000___yo 1751 TTAGAAAGAGATATTGGAAATGGAGAGCGAAACAATTTGAAAATGAGAAT 1800
BSNT_03098___ 1801 TGA 1803
|||
BSU19000___yo 1801 TGA 1803
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.