Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_02978 and BSU18000
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_02978 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:21:19
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_02978___citB.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU18000___citB.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_02978___citB-BSU18000___citB.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_02978___citB-BSU18000___citB.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_02978___citB
# 2: BSU18000___citB
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 2730
# Identity: 2702/2730 (99.0%)
# Similarity: 2702/2730 (99.0%)
# Gaps: 0/2730 ( 0.0%)
# Score: 13398.0
#
#
#=======================================
BSNT_02978___ 1 ATGGCAAACGAGCAAAAAACTGCAGCAAAAGACGTTTTCCAAGCGAGAAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 1 ATGGCAAACGAGCAAAAAACTGCAGCAAAAGACGTTTTCCAAGCGAGAAA 50
BSNT_02978___ 51 AACGTTTACTACAAATGGGAAAACATATCATTACTACTCTTTAAAAGCGT 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 51 AACGTTTACTACAAATGGGAAAACATATCATTACTACTCTTTAAAAGCGT 100
BSNT_02978___ 101 TAGAAGATTCAGGTATAGGAAAGGTTTCGAAGCTTCCTTATTCCATCAAA 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 101 TAGAAGATTCAGGTATAGGAAAGGTTTCGAAGCTTCCTTATTCCATCAAA 150
BSNT_02978___ 151 GTTCTTTTAGAATCAGTATTGCGTCAAGTTGACGGCTTCGTTATCAAAAA 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 151 GTTCTTTTAGAATCAGTATTGCGTCAAGTTGACGGCTTCGTTATCAAAAA 200
BSNT_02978___ 201 AGAACACGTGGAAAATTTGGCAAAATGGGGAACTGCCGAATTAAAGGATA 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 201 AGAACACGTGGAAAATTTGGCAAAATGGGGAACTGCCGAATTAAAGGATA 250
BSNT_02978___ 251 TCGACGTTCCGTTCAAACCGTCTCGAGTTATTTTACAAGACTTCACAGGG 300
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 251 TCGACGTTCCGTTCAAACCGTCTCGTGTTATTTTACAAGACTTCACAGGG 300
BSNT_02978___ 301 GTTCCGGCAGTAGTAGATCTGGCTTCACTGCGTAAAGCAATGGCAGCTGT 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 301 GTTCCGGCAGTAGTAGATCTGGCTTCACTGCGTAAAGCAATGGCAGCTGT 350
BSNT_02978___ 351 CGGCGGAGATCCTGATAAAATCAACCCTGAAATTCCTGTTGATCTCGTTA 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 351 CGGCGGAGATCCTGATAAAATCAACCCTGAAATTCCTGTTGATCTCGTTA 400
BSNT_02978___ 401 TCGACCACTCTGTACAGGTAGATAAAGCGGGTACAGAAGATGCATTAGCA 450
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 401 TCGATCACTCTGTACAGGTAGATAAAGCGGGTACAGAAGATGCATTAGCA 450
BSNT_02978___ 451 GTAAATATGGACTTGGAATTCGAAAGAAATGCAGAGCGCTACAAATTTTT 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 451 GTAAATATGGACTTGGAATTCGAAAGAAATGCAGAGCGCTACAAATTTTT 500
BSNT_02978___ 501 AAGCTGGGCAAAGAAAGCGTTTAATAATTATCAGGCAGTGCCGCCTGCAA 550
||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
BSU18000___ci 501 AAGCTGGGCAAAGAAAGCGTTTAACAATTATCAGGCAGTACCGCCTGCAA 550
BSNT_02978___ 551 CAGGTATTGTGCACCAGGTCAACCTTGAGTTCTTGGCAAGTGTTGTCCAT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 551 CAGGTATTGTGCACCAGGTCAACCTTGAGTTCTTGGCAAGTGTTGTCCAT 600
BSNT_02978___ 601 GCCATTGAAGAAGACGGCGAGCTTGTAACGTATCCTGATACGCTTGTCGG 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 601 GCCATTGAAGAAGACGGCGAGCTTGTAACGTATCCTGATACGCTTGTCGG 650
BSNT_02978___ 651 AACAGACTCACACACAACAATGATTAACGGTATCGGTGTTCTCGGCTGGG 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 651 AACAGACTCACACACAACAATGATTAACGGTATCGGTGTTCTCGGCTGGG 700
BSNT_02978___ 701 GTGTCGGTGGAATTGAAGCTGAAGCGGGAATGCTTGGACAGCCTTCTTAC 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 701 GTGTCGGTGGAATTGAAGCTGAAGCGGGAATGCTTGGACAGCCTTCTTAC 750
BSNT_02978___ 751 TTCCCAGTTCCAGAGGTAATCGGCGCGAAACTTGTCGGCAAGCTTCCAAA 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 751 TTCCCAGTTCCAGAGGTAATCGGCGCGAAACTTGTCGGCAAGCTTCCAAA 800
BSNT_02978___ 801 CGGAACAACAGCTACTGACTTGGCGTTAAAAGTAACACAAGTGCTGCGTG 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 801 CGGAACAACAGCTACTGACTTGGCGTTAAAAGTAACACAAGTGCTGCGTG 850
BSNT_02978___ 851 AAAAAGGCGTTGTCGGTAAATTTGTTGAATTCTTCGGACCGGGAATTGCT 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 851 AAAAAGGCGTTGTCGGTAAATTTGTTGAATTCTTCGGACCGGGAATTGCT 900
BSNT_02978___ 901 GAACTGCCGCTTGCAGATCGCGCAACAATTGCGAATATGGCTCCGGAATA 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 901 GAACTGCCGCTTGCAGATCGCGCAACAATTGCGAATATGGCTCCGGAATA 950
BSNT_02978___ 951 CGGTGCTACATGCGGATTCTTCCCAGTAGATGAAGAAGCGCTTAACTACC 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 951 CGGTGCTACATGCGGATTCTTCCCAGTAGATGAAGAAGCGCTTAACTACC 1000
BSNT_02978___ 1001 TGCGCCTGACTGGCCGTGATCCTGAACATATTGATGTTGTTGAAGCATAC 1050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 1001 TGCGCCTGACTGGCCGTGATCCTGAACATATTGATGTTGTTGAAGCATAC 1050
BSNT_02978___ 1051 TGCAGAAGCAATGGCTTGTTCTACACTCCAGATGCGGAAGACCCTCAATT 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 1051 TGCAGAAGCAATGGCTTGTTCTACACTCCAGATGCGGAAGACCCTCAATT 1100
BSNT_02978___ 1101 TACTGATGTGGTTGAAATTGACCTGTCTCAAATTGAAGCAAACTTATCGG 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 1101 TACTGATGTGGTTGAAATTGACCTGTCTCAAATTGAAGCAAACTTATCGG 1150
BSNT_02978___ 1151 GTCCAAAGCGTCCTCAGGATTTGATCCCGCTATCTGCTATGCAGGAAACG 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 1151 GTCCAAAGCGTCCTCAGGATTTGATCCCGCTATCTGCTATGCAGGAAACG 1200
BSNT_02978___ 1201 TTTAAAAAGCAATTAGTCAGCCCTGCAGGTAACCAAGGATTCGGTTTAAA 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 1201 TTTAAAAAGCAATTAGTCAGCCCTGCAGGTAACCAAGGATTCGGTTTAAA 1250
BSNT_02978___ 1251 TGCTGAGGAAGAAAATAAAGAAATTAAGTTTAAACTCCTTAACGGCGAAG 1300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 1251 TGCTGAGGAAGAAAATAAAGAAATTAAGTTTAAACTCCTTAACGGCGAAG 1300
BSNT_02978___ 1301 AAACAGTTATGAAAACGGGTGCGATCGCCATTGCTGCGATTACAAGCTGT 1350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 1301 AAACAGTTATGAAAACGGGTGCGATCGCCATTGCTGCGATTACAAGCTGT 1350
BSNT_02978___ 1351 ACAAATACATCAAACCCATACGTTCTGATCGGCGCCGGACTGGTAGCGAA 1400
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 1351 ACAAATACATCAAACCCATACGTGCTGATCGGCGCCGGACTGGTAGCGAA 1400
BSNT_02978___ 1401 AAAAGCGGTTGAGTTAGGGCTTAAGGTGCCTAATTACGTGAAAACGTCAC 1450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 1401 AAAAGCGGTTGAGTTAGGGCTTAAGGTGCCTAATTACGTGAAAACGTCAC 1450
BSNT_02978___ 1451 TTGCACCGGGTTCTAAAGTTGTTACAGGATATCTTGTGAATTCAGGCCTT 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 1451 TTGCACCGGGTTCTAAAGTTGTTACAGGATATCTTGTGAATTCAGGCCTT 1500
BSNT_02978___ 1501 CTTCCATACATGAAAGAGCTTGGCTTTAACCTCGTTGGCTACGGTTGTAC 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
BSU18000___ci 1501 CTTCCATACATGAAAGAGCTTGGCTTTAACCTCGTTGGGTACGGCTGTAC 1550
BSNT_02978___ 1551 AACATGTATCGGGAACTCAGGTCCGCTTTCACCGGAAATCGAAGAAGCGG 1600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 1551 AACATGTATCGGGAACTCAGGTCCGCTTTCACCGGAAATCGAAGAAGCGG 1600
BSNT_02978___ 1601 TTGCGAAAAATGATCTTCTGATTACGTCTGTCCTTTCCGGAAACCGTAAC 1650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 1601 TTGCGAAAAATGATCTTCTGATTACGTCTGTCCTTTCCGGAAACCGTAAC 1650
BSNT_02978___ 1651 TTTGAAGGACGTATTCACCCGCTTGTTAAAGGCAACTATCTTGCTTCACC 1700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 1651 TTTGAAGGACGTATTCACCCGCTTGTTAAAGGCAACTATCTTGCTTCACC 1700
BSNT_02978___ 1701 GCCGCTTGTTGTGGCATATGCGCTGGCTGGAACGGTAAACATTAACTTGA 1750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
BSU18000___ci 1701 GCCGCTTGTTGTGGCATATGCGCTGGCTGGAACGGTAAACATTAACTTAA 1750
BSNT_02978___ 1751 AAACCGATCCAATCGGTGTGGGCAAGGATGGTCAAAACGTATACTTTAAT 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 1751 AAACCGATCCAATCGGTGTGGGCAAGGATGGTCAAAACGTATACTTTAAT 1800
BSNT_02978___ 1801 GATATTTGGCCGTCAATGGACGAAATCAATGCACTTGTTAAGCAAACTGT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 1801 GATATTTGGCCGTCAATGGACGAAATCAATGCACTTGTTAAGCAAACTGT 1850
BSNT_02978___ 1851 TACGCCAGAGCTATTCCGCAAAGAGTATGAAACAGTATTTGATGACAACA 1900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 1851 TACGCCAGAGCTATTCCGCAAAGAGTATGAAACAGTATTTGATGACAACA 1900
BSNT_02978___ 1901 AGCGCTGGAACGAAATTGAAACAACAGATGAAGCATTATATAAATGGGAT 1950
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
BSU18000___ci 1901 AGCGCTGGAACGAAATTGAAACAACAGATGAAGCTTTATATAAATGGGAT 1950
BSNT_02978___ 1951 AGCGAGTCAACTTACATTCAAAATCCGCCATTCTTCGAAGAAATGTCTGT 2000
|.|||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||||
BSU18000___ci 1951 AACGATTCAACTTACATCCAAAACCCACCATTCTTTGAAGAGATGTCTGT 2000
BSNT_02978___ 2001 TGAGCCAGGCAAGGTTGAACCATTAAAAGGTTTGCGTGTTGTCGGTAAAT 2050
||||||||||||||||||.|||||||||||..||||||||||||||||||
BSU18000___ci 2001 TGAGCCAGGCAAGGTTGAGCCATTAAAAGGACTGCGTGTTGTCGGTAAAT 2050
BSNT_02978___ 2051 TCGGCGATTCAGTCACAACTGACCATATTTCTCCTGCGGGGGCAATCGGA 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 2051 TCGGCGATTCAGTCACAACTGACCATATTTCTCCTGCGGGGGCAATCGGA 2100
BSNT_02978___ 2101 AAAGATACGCCTGCCGGAAAGTATTTGCAAGAAAAAGGTGTTTCTCCTCG 2150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
BSU18000___ci 2101 AAAGATACGCCTGCCGGAAAGTATTTGCAAGAAAAAGGTGTTTCACCTCG 2150
BSNT_02978___ 2151 TGACTTTAACTCCTACGGTTCCCGCCGCGGAAACCATGAAGTCATGATGA 2200
||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 2151 TGACTTTAACTCCTACGGCTCCCGCCGTGGAAACCATGAAGTCATGATGA 2200
BSNT_02978___ 2201 GAGGAACATTTGCAAACATTCGCATCAAAAACCAAATTGCACCGGGTACA 2250
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||
BSU18000___ci 2201 GAGGAACATTTGCCAACATTCGCATCAAAAACCAAATCGCACCGGGTACA 2250
BSNT_02978___ 2251 GAAGGCGGATTTACAACGTACTGGCCGACTGGTGAAGTAACATCCATCTA 2300
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 2251 GAAGGCGGATTTACGACGTACTGGCCGACTGGTGAAGTAACATCCATCTA 2300
BSNT_02978___ 2301 TGATGCGTGCATGAAATACAAAGAAGATAAAACTGGTCTTGTCGTATTAG 2350
||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
BSU18000___ci 2301 TGATGCATGCATGAAATACAAAGAAGATAAAACCGGTCTTGTCGTATTAG 2350
BSNT_02978___ 2351 CAGGAAAAGACTATGGTATGGGATCTTCACGTGACTGGGCTGCAAAAGGA 2400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 2351 CAGGAAAAGACTATGGTATGGGATCTTCACGTGACTGGGCTGCAAAAGGA 2400
BSNT_02978___ 2401 ACAAACCTTCTCGGCATCAGAACGGTCATTGCAGAGAGCTTCGAAAGAAT 2450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 2401 ACAAACCTTCTCGGCATCAGAACGGTCATTGCAGAGAGCTTCGAAAGAAT 2450
BSNT_02978___ 2451 TCACAGAAGCAATCTTGTATTCATGGGTGTGCTGCCGCTTCAGTTTAAAC 2500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 2451 TCACAGAAGCAATCTTGTATTCATGGGTGTGCTGCCGCTTCAGTTTAAAC 2500
BSNT_02978___ 2501 AAGGTGAAAATGCGGATACACTCGGCTTAACGGGTAAAGAAGTCATTGAG 2550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
BSU18000___ci 2501 AAGGTGAAAATGCGGATACACTCGGCTTAACGGGTAAAGAAGTCATCGAG 2550
BSNT_02978___ 2551 GTAGATGTTGATGAAACAGTTCGTCCTCGTGACCTTGTGACTGTAAGAGC 2600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 2551 GTAGATGTTGATGAAACAGTTCGTCCTCGTGACCTTGTGACTGTAAGAGC 2600
BSNT_02978___ 2601 AATCAATGAAGACGGCAATGTAACAACTTTTGAAGCAGTCGTCCGCTTTG 2650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 2601 AATCAATGAAGACGGCAATGTAACAACTTTTGAAGCAGTCGTCCGCTTTG 2650
BSNT_02978___ 2651 ATAGTGAAGTTGAAATTGATTACTACCGCCATGGCGGCATCCTTCAAATG 2700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 2651 ATAGTGAAGTTGAAATTGATTACTACCGCCATGGCGGCATCCTTCAAATG 2700
BSNT_02978___ 2701 GTGCTTCGTGAAAAAATGAAGCAGTCCTGA 2730
||||||||||||||||||||||||||||||
BSU18000___ci 2701 GTGCTTCGTGAAAAAATGAAGCAGTCCTGA 2730
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.