Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_02559 and BSU15520
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_02559 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:20:34
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_02559___carB.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU15520___pyrAB.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_02559___carB-BSU15520___pyrAB.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_02559___carB-BSU15520___pyrAB.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_02559___carB
# 2: BSU15520___pyrAB
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 3216
# Identity: 3163/3216 (98.4%)
# Similarity: 3163/3216 (98.4%)
# Gaps: 0/3216 ( 0.0%)
# Score: 15603.0
#
#
#=======================================
BSNT_02559___ 1 ATGCCAAAACGCGTAGACATTAACAAAATTTTAGTAATCGGATCTGGACC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 1 ATGCCAAAACGCGTAGACATTAACAAAATTTTAGTAATCGGATCTGGACC 50
BSNT_02559___ 51 GATCATCATCGGCCAAGCAGCGGAATTTGACTATGCGGGAACACAAGCTT 100
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
BSU15520___py 51 GATCATCATCGGCCAAGCAGCAGAATTTGACTATGCGGGAACACAAGCCT 100
BSNT_02559___ 101 GTCTTGCTTTGAAAGAAGAAGGTTATGAAGTCATCCTTGTCAACTCAAAC 150
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 101 GTCTTGCTTTGAAAGAAGAAGGCTATGAAGTCATCCTTGTCAACTCAAAC 150
BSNT_02559___ 151 CCTGCCACGATCATGACAGATACAGAAATGGCTGACCGGGTTTACATCGA 200
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 151 CCTGCAACGATCATGACAGATACAGAAATGGCTGACCGGGTTTACATCGA 200
BSNT_02559___ 201 ACCGCTCACACCTGAATTCCTGACACGAATCATCAGAAAAGAGCGCCCGG 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 201 ACCGCTCACACCTGAATTCCTGACACGAATCATCAGAAAAGAGCGCCCGG 250
BSNT_02559___ 251 ATGCCATTCTTCCTACACTCGGAGGTCAAACTGGTTTGAATCTTGCGGTT 300
|||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||
BSU15520___py 251 ATGCCATTCTTCCTACACTCGGAGGCCAAACCGGTTTGAATCTTGCGGTT 300
BSNT_02559___ 301 GAGCTTTCTGAAAGAGGCGTTTTGGCAGAATGCGGCGTCGAAGTGCTTGG 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 301 GAGCTTTCTGAAAGAGGCGTTTTGGCAGAATGCGGCGTCGAAGTGCTTGG 350
BSNT_02559___ 351 CACAAAACTGTCTGCGATTCAGCAAGCTGAAGACCGTGACTTGTTCAGAA 400
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 351 CACGAAACTGTCTGCGATTCAGCAAGCTGAAGACCGTGACTTGTTCAGAA 400
BSNT_02559___ 401 CATTAATGAATGAACTGAATGAACCGGTGCCTGAAAGTGAGATTATCCAC 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 401 CATTAATGAATGAACTGAATGAACCGGTGCCTGAAAGTGAGATTATCCAC 450
BSNT_02559___ 451 TCCCTTGAAGAAGCAGAAAAATTCGTCAGTCAAATTGGATTCCCTGTCAT 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 451 TCCCTTGAAGAAGCAGAAAAATTCGTCAGTCAAATTGGATTCCCTGTCAT 500
BSNT_02559___ 501 TGTCCGCCCGGCATATACATTAGGCGGAACAGGCGGAGGCATCTGCTCGA 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 501 TGTCCGCCCGGCATATACATTAGGCGGAACAGGCGGAGGCATCTGCTCGA 550
BSNT_02559___ 551 ATGAGACAGAGTTAAAAGAAATCGTTGAGAACGGCTTGAAATTAAGCCCG 600
||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 551 ATGAAACAGAGCTAAAAGAAATCGTTGAGAACGGCTTGAAATTAAGCCCG 600
BSNT_02559___ 601 GTACACCAATGTCTGCTTGAAAAAAGCATCGCCGGCTATAAAGAAATCGA 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 601 GTACACCAATGTCTGCTTGAAAAAAGCATCGCCGGCTATAAAGAAATCGA 650
BSNT_02559___ 651 GTATGAAGTCATGAGAGACAGCCAAGATCACGCCATTGTCGTTTGTAACA 700
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 651 GTATGAAGTCATGAGAGACAGCCAGGATCACGCCATTGTCGTTTGTAACA 700
BSNT_02559___ 701 TGGAAAACATTGATCCAGTTGGAATCCATACTGGAGACAGTATTGTTGTC 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 701 TGGAAAACATTGATCCAGTTGGAATCCATACTGGAGACAGTATTGTTGTC 750
BSNT_02559___ 751 GCGCCGAGCCAAACGCTCAGCGATCGCGAATATCAGCTCTTGCGGAATGT 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 751 GCGCCGAGCCAAACGCTCAGCGATCGCGAATATCAGCTCTTGCGGAATGT 800
BSNT_02559___ 801 ATCGTTAAAACTGATTCGCGCACTTGGGATCGAAGGCGGATGTAACGTCC 850
|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||
BSU15520___py 801 ATCGTTAAAACTGATTCGCGCGCTTGGGATCGAAGGCGGATGTAATGTCC 850
BSNT_02559___ 851 AGCTCGCCTTAGATCCGGACAGCTTCCAATATTACATTATTGAAGTAAAT 900
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 851 AGCTCGCCTTAGATCCAGACAGCTTCCAATATTACATTATTGAAGTAAAT 900
BSNT_02559___ 901 CCGCGTGTCAGCCGTTCATCTGCCCTTGCATCAAAAGCAACGGGGTACCC 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 901 CCGCGTGTCAGCCGTTCATCTGCCCTTGCATCAAAAGCAACGGGGTACCC 950
BSNT_02559___ 951 GATAGCAAAGCTCGCCGCTAAAATTGCAGTCGGACTTTCATTAGATGAAA 1000
|||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 951 GATTGCAAAGCTCGCTGCTAAAATTGCAGTCGGACTTTCATTAGATGAAA 1000
BSNT_02559___ 1001 TGATGAACCCGGTGACAGGAAAAACATATGCAGCATTTGAACCAGCTCTT 1050
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
BSU15520___py 1001 TGATGAACCCGGTGACAGGAAAAACATATGCAGCATTTGAACCTGCTCTT 1050
BSNT_02559___ 1051 GACTATGTCGTATCCAAAATTCCGCGCTGGCCGTTTGATAAGTTTGAATC 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 1051 GACTATGTCGTATCCAAAATTCCGCGCTGGCCGTTTGATAAGTTTGAATC 1100
BSNT_02559___ 1101 AGCAAACAGAAAGCTTGGCACGCAAATGAAAGCGACAGGTGAGGTCATGG 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 1101 AGCAAACAGAAAGCTTGGCACGCAAATGAAAGCGACAGGTGAGGTCATGG 1150
BSNT_02559___ 1151 CAATCGGCCGCACACTTGAAGAGTCATTGCTGAAGGCAGTGAGATCACTG 1200
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||
BSU15520___py 1151 CAATCGGCCGCACGCTTGAAGAGTCATTGCTGAAGGCAGTGCGATCACTG 1200
BSNT_02559___ 1201 GAAGCGGATGTGTATCATCTTGAATTGAAGGACGCCGCTGACATTTCAGA 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 1201 GAAGCGGATGTGTATCATCTTGAATTGAAGGACGCCGCTGACATTTCAGA 1250
BSNT_02559___ 1251 TGAGCTTCTTGAAAAGCGAATTAAAAAGGCCGGTGATGAACGCTTATTCT 1300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 1251 TGAGCTTCTTGAAAAGCGAATTAAAAAGGCCGGTGATGAACGCTTATTCT 1300
BSNT_02559___ 1301 ACTTAGCTGAAGCGTACAGAAGAGGCTACACGGTAGAAGACCTCCATGAA 1350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 1301 ACTTAGCTGAAGCGTACAGAAGAGGCTACACGGTAGAAGACCTCCATGAA 1350
BSNT_02559___ 1351 TTTTCCGCTATCGATGTCTTCTTCTTGCATAAGCTGTTCGGAATCGTACA 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 1351 TTTTCCGCTATCGATGTCTTCTTCTTGCATAAGCTGTTCGGAATCGTACA 1400
BSNT_02559___ 1401 GTTTGAAAAAGAATTGAAGGCCAATGCGGGCAATACGGATGTGCTGAGAC 1450
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||
BSU15520___py 1401 GTTTGAAAAAGAATTGAAGGCCAATGCGGGCGATACAGATGTGCTGAGAC 1450
BSNT_02559___ 1451 GGGCAAAAGAACTCGGCTTCTCTGATCAGTACATTAGCCGCGAGTGGAAA 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||
BSU15520___py 1451 GGGCAAAAGAACTCGGCTTCTCTGATCAGTACATCAGCCGTGAATGGAAA 1500
BSNT_02559___ 1501 ATGAAAGAATCTGAGCTTTACAGCTTGAGAAAACAAGCGGGGATTGAGCC 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
BSU15520___py 1501 ATGAAAGAATCTGAGCTTTACAGCTTGAGAAAACAAGCGGGGATTGCGCC 1550
BSNT_02559___ 1551 GGTATTCAAAATGGTAGATACGTGCGCGGCGGAATTCGAGTCAGAAACGC 1600
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||
BSU15520___py 1551 GGTATTCAAAATGGTAGATACATGCGCGGCGGAATTTGAGTCAGAAACGC 1600
BSNT_02559___ 1601 CATACTTCTATAGCACATACGAAGAAGAAAATGAATCTGTCGTTACAGAT 1650
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 1601 CATACTTCTATAGCACATATGAAGAAGAAAATGAATCTGTCGTTACAGAT 1650
BSNT_02559___ 1651 AAGAAAAGTGTGATGGTGCTTGGTTCGGGGCCGATTCGAATCGGTCAGGG 1700
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
BSU15520___py 1651 AAGAAAAGTGTGATGGTGCTTGGTTCGGGTCCGATTCGAATCGGTCAGGG 1700
BSNT_02559___ 1701 TGTCGAGTTCGACTATGCGACGGTTCACTCTGTATGGGCAATTAAACAAG 1750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 1701 TGTCGAGTTCGACTATGCGACGGTTCACTCTGTATGGGCAATTAAACAAG 1750
BSNT_02559___ 1751 CAGGCTATGAAGCCATTATTGTCAACAACAACCCGGAAACCGTTTCAACA 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 1751 CAGGCTATGAAGCCATTATTGTCAACAACAACCCGGAAACCGTTTCAACA 1800
BSNT_02559___ 1801 GACTTCAGCATCTCAGACAAGCTGTATTTTGAACCGCTTACGATTGAAGA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 1801 GACTTCAGCATCTCAGACAAGCTGTATTTTGAACCGCTTACGATTGAAGA 1850
BSNT_02559___ 1851 TGTTATGCACATCATTGACCTCGAACAGCCAATAGGCGTTGTCGTACAGT 1900
|||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
BSU15520___py 1851 TGTCATGCACATCATTGACCTCGAACAGCCAATGGGCGTTGTCGTACAAT 1900
BSNT_02559___ 1901 TCGGCGGACAAACTGCGATTAACCTTGCTGACGAGCTTTCTGCGCGCGGA 1950
|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
BSU15520___py 1901 TTGGCGGACAAACTGCGATTAACCTTGCTGACGAGCTTTCTGCACGCGGA 1950
BSNT_02559___ 1951 GTGAAAATCCTTGGAACTTCATTAGAAGATTTAGACCGTGCAGAAGACCG 2000
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
BSU15520___py 1951 GTGAAAATCCTTGGAACTTCATTAGAAGATTTAGACCGTGCCGAAGACCG 2000
BSNT_02559___ 2001 GGATAAATTTGAACAAGCGCTTGGAGAACTTGGTGTTCCGCAGCCGCTTG 2050
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
BSU15520___py 2001 GGATAAATTTGAACAAGCGCTTGGAGAACTTGGTGTTCCTCAGCCGCTTG 2050
BSNT_02559___ 2051 GCAAAACAGCCACATCAGTTGATCAGGCGGTAAGCATCGCGAGTGATATC 2100
||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||
BSU15520___py 2051 GCAAAACAGCGACATCAGTTAATCAGGCGGTAAGCATCGCAAGTGATATC 2100
BSNT_02559___ 2101 GGTTATCCGGTACTGGTACGCCCTTCCTATGTACTTGGCGGCCGGGCAAT 2150
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
BSU15520___py 2101 GGTTATCCGGTACTGGTACGCCCTTCCTATGTACTTGGCGGCCGGGCGAT 2150
BSNT_02559___ 2151 GGAGATTGTGTATCATGAAGAAGAGCTGCTTCATTACATGAAAAACGCAG 2200
|||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||
BSU15520___py 2151 GGAGATTGTTTACCATGAAGAGGAACTGCTTCATTACATGAAAAATGCAG 2200
BSNT_02559___ 2201 TTAAAATCAATCCGCAGCACCCTGTATTAATTGATAGATACTTGACCGGA 2250
|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 2201 TCAAAATCAATCCACAGCACCCTGTATTAATTGATAGATACTTGACCGGA 2250
BSNT_02559___ 2251 AAAGAAATTGAAGTCGATGCAGTATCCGACGGTGAAACAGTCGTCATTCC 2300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 2251 AAAGAAATTGAAGTCGATGCAGTATCCGACGGTGAAACAGTCGTCATTCC 2300
BSNT_02559___ 2301 GGGAATTATGGAGCACATTGAACGTGCGGGCGTTCACTCCGGAGACTCGA 2350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
BSU15520___py 2301 GGGAATTATGGAGCACATTGAACGTGCGGGCGTTCACTCCGGAGACTCAA 2350
BSNT_02559___ 2351 TCGCTGTTTATCCGCCTCAGTCTCTCACAGAGGACATTAAGAAAAAAATT 2400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 2351 TCGCTGTTTATCCGCCTCAGTCTCTCACAGAGGACATTAAGAAAAAAATT 2400
BSNT_02559___ 2401 GAACAATACACGATCGCATTGGCTAAAGGGCTGAATATTGTCGGTTTGCT 2450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 2401 GAACAATACACGATCGCATTGGCTAAAGGGCTGAATATTGTCGGTTTGCT 2450
BSNT_02559___ 2451 CAATATTCAATTCGTCTTGTCGCAATGCGAGGTGTACGTGCTAGAAGTGA 2500
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 2451 CAATATTCAATTCGTCTTGTCGCAAGGCGAGGTGTACGTGCTAGAAGTGA 2500
BSNT_02559___ 2501 ATCCGAGATCAAGCAGAACCGTACCGTTTTTAAGCAAAATTACGGGTATC 2550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 2501 ATCCGAGATCAAGCAGAACCGTACCGTTTTTAAGCAAAATTACGGGTATC 2550
BSNT_02559___ 2551 CCAATGGCGAATCTCGCAACAAAAATCATTCTTGGTCAAAAGCTGGCTGC 2600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 2551 CCAATGGCGAATCTCGCAACAAAAATCATTCTTGGTCAAAAGCTGGCTGC 2600
BSNT_02559___ 2601 GTTTGGCTATACAGAGGGCCTTCAGCCTGAACAGCAAGGTGTATTTGTAA 2650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 2601 GTTTGGCTATACAGAGGGCCTTCAGCCTGAACAGCAAGGTGTATTTGTAA 2650
BSNT_02559___ 2651 AAGCGCCGGTCTTCTCCTTTGCCAAGCTGAGAAGAGTGGACATTACGTTA 2700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
BSU15520___py 2651 AAGCGCCGGTCTTCTCCTTTGCCAAGCTGAGAAGAGTGGATATTACGTTA 2700
BSNT_02559___ 2701 GGGCCTGAAATGAAATCAACCGGTGAAGTCATGGGGAAAGATTCGACACT 2750
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 2701 GGGCCTGAAATGAAATCAACAGGTGAAGTCATGGGGAAAGATTCGACACT 2750
BSNT_02559___ 2751 TGAAAAGGCGCTCTACAAAGCCTTGATTGCTTCAGGTATTCAAATCCCGA 2800
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 2751 TGAAAAGGCGCTCTACAAAGCCTTGATCGCTTCAGGTATTCAAATCCCGA 2800
BSNT_02559___ 2801 ACTACGGTTCCGTGCTTTTAACAGTAGCTGATAAGGACAAAGAAGAAGGG 2850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 2801 ACTACGGTTCCGTGCTTTTAACAGTAGCTGATAAGGACAAAGAAGAAGGG 2850
BSNT_02559___ 2851 CTTGCCATTGCTAAGCGGTTCCACGCGATCGGCTACAACATTTTAGCGAC 2900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 2851 CTTGCCATTGCTAAGCGGTTCCACGCGATCGGCTACAACATTTTAGCGAC 2900
BSNT_02559___ 2901 GGAAGGAACGGCAGGCTACTTGAAAGAAGCTTCCATTCCAGCGAAGGTCG 2950
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 2901 GGAAGGAACGGCAGGCTACCTGAAAGAAGCTTCCATTCCAGCGAAGGTCG 2950
BSNT_02559___ 2951 TCGGAAAAATCGGTCAGGATGGCCCGAACTTGCTTGACGTCATCAGAAAC 3000
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
BSU15520___py 2951 TCGGAAAAATCGGTCAGGATGGCCCGAACTTGCTTGATGTCATCAGAAAC 3000
BSNT_02559___ 3001 GGAGAAGCGCAGTTTGTCATCAATACGCTGACAAAAGGAAAGCAGCCGGC 3050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 3001 GGAGAAGCGCAGTTTGTCATCAATACGCTGACAAAAGGAAAGCAGCCGGC 3050
BSNT_02559___ 3051 AAGAGACGGTTTTAGAATCAGACGTGAATCAGTAGAAAATGGTGTTGCCT 3100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 3051 AAGAGACGGTTTTAGAATCAGACGTGAATCAGTAGAAAATGGTGTTGCCT 3100
BSNT_02559___ 3101 GCCTAACATCTTTAGATACGGCAGAGGCGATATTGCGAGTGCTGGAAAGC 3150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 3101 GCCTAACATCTTTAGATACGGCAGAGGCGATATTGCGAGTGCTGGAAAGC 3150
BSNT_02559___ 3151 ATGACATTCCGTGCTGATCAAATGCCGGCAGTCAACACAAATCAGGAGGC 3200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU15520___py 3151 ATGACATTCCGTGCTGATCAAATGCCGGCAGTCAACACAAATCAGGAGGC 3200
BSNT_02559___ 3201 GGCAGTCACTATATGA 3216
||||||||||||||||
BSU15520___py 3201 GGCAGTCACTATATGA 3216
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.