Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_02335 and BSU13950
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_02335 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:20:01
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_02335___mcpC.1.22522.seq
# -bsequence dna-align/BSU13950___mcpC.2.22522.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_02335___mcpC-BSU13950___mcpC.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_02335___mcpC-BSU13950___mcpC.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_02335___mcpC
# 2: BSU13950___mcpC
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 1968
# Identity: 1945/1968 (98.8%)
# Similarity: 1945/1968 (98.8%)
# Gaps: 0/1968 ( 0.0%)
# Score: 9633.0
#
#
#=======================================
BSNT_02335___ 1 TTGTTTAAAAAACTTCACATGAAGATTGCTGTTTTTGTTTCGATTATGTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13950___mc 1 TTGTTTAAAAAACTTCACATGAAGATTGCTGTTTTTGTTTCGATTATGTT 50
BSNT_02335___ 51 AATCGTCACAGTTGTTCTTTTAATGCTGTCTTCTTATTTGACGCTAAAAC 100
||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13950___mc 51 AATCATCACAGTTGTTCTCTTAATGCTGTCTTCTTATTTGACGCTAAAAC 100
BSNT_02335___ 101 CGATGATTACAGAGGATGGGAAAAATACAACTCAAAACGTGACGCAGTCA 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13950___mc 101 CGATGATTACAGAGGATGGGAAAAATACAACTCAAAACGTGACGCAGTCA 150
BSNT_02335___ 151 CTTGAACAAAATATTGAATTGCAATTAAAGAGTTATGCCATTTCGTTATC 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13950___mc 151 CTTGAACAAAATATTGAATTGCAATTAAAGAGTTATGCCATTTCGTTATC 200
BSNT_02335___ 201 AAGATTGGCTAATGGGGAATTAACGCATACATTTGTAACGAAACCAAGTA 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13950___mc 201 AAGATTGGCTAATGGGGAATTAACGCATACATTTGTAACGAAACCAAGTA 250
BSNT_02335___ 251 AAGAAGTTGCTCGGCTGTTTCACGATGACATTAAGCAAATCAAAGATAAC 300
||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
BSU13950___mc 251 AAGAAGCTTCTCGGCTGTTTCACGATGACATTAAGCAAATCAAAGACAAC 300
BSNT_02335___ 301 GATGATTATGTTGCGATGGCTTACATAGGCACCGCAAAAAAAGAAATGTT 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13950___mc 301 GATGATTATGTTGCGATGGCTTACATAGGCACCGCAAAAAAAGAAATGTT 350
BSNT_02335___ 351 TACATATCCAAAAGCGGATTTCGCTGAGGATTATGATCCAGCATCAAGAC 400
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||
BSU13950___mc 351 TACATATCCAAAAGCGGATTTCGCTGAGGATTACGATCCAACATCAAGAC 400
BSNT_02335___ 401 CATGGTATAAGCTTGCAGCTGAAACCCCGGATCAAGTTGTTTGGACGGAA 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13950___mc 401 CATGGTATAAGCTTGCAGCTGAAACCCCGGATCAAGTTGTTTGGACGGAA 450
BSNT_02335___ 451 CCTTATAAAGATGTCGTGACAGGAGACATGATTGTTACTGCATCGAAAGC 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13950___mc 451 CCTTATAAAGATGTCGTGACAGGAGACATGATTGTTACTGCATCGAAAGC 500
BSNT_02335___ 501 GATCTTAGACGGGCAAAAAGTGATAGGGGTTGCCAGCTATGACTTGAAAC 550
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13950___mc 501 GATCTTAGACAGGCAAAAAGTGATAGGGGTTGCCAGCTATGACTTGAAAC 550
BSNT_02335___ 551 TCTCTGCTATCCAGAGTATGGTCAATAAACAAAAGGTGCCTTACAATGGA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
BSU13950___mc 551 TCTCTGCTATCCAGAGTATGGTCAATAAACAAAAGGTGCCTTACAAAGGA 600
BSNT_02335___ 601 TTTGCCTTTTTAGCTGATACGAGCGGCAATCTTTTAGCCCATCCGTCAAA 650
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13950___mc 601 TTTGCCTTTTTAGCTGATGCGAGCGGCAATCTTTTAGCCCATCCGTCAAA 650
BSNT_02335___ 651 TCAAGGAAAAAATATATCAAAGGATCAAACACTGCAAACCATCGCATCCG 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13950___mc 651 TCAAGGAAAAAATATATCAAAGGATCAAACACTGCAAACCATCGCATCCG 700
BSNT_02335___ 701 AGAAAAAAGGGATACAAGATGTGAATGGAAAAATGGTTGTGTACCAAACG 750
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
BSU13950___mc 701 AGAAAAAAGGGATACAAGATGTGAATGGGAAAATGGTTGTGTACCAAACG 750
BSNT_02335___ 751 ATTGGCGAAACGGGCTGGAAGGTCGGAACGCAATTTGATACCGATCAATT 800
||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13950___mc 751 ATTGGCGAGACAGGCTGGAAGGTCGGAACGCAATTTGATACCGATCAATT 800
BSNT_02335___ 801 AATGTGGATTTCAGATAAAATGAATCGGGCAAATCTTTGGATATCATTGC 850
||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.
BSU13950___mc 801 AATGTGGATTTCAGATAAAATGAATCGGGCCAATCTTTGGATATCATTGA 850
BSNT_02335___ 851 TTGCGCTTATCATAACAATTATTCTCAGCTACTTCCTGGCCAAAACGATA 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13950___mc 851 TTGCGCTTATCATAACAATTATTCTCAGCTACTTCCTGGCCAAAACGATA 900
BSNT_02335___ 901 ACCGGTCCGATACAGCAGCTGATCGCAAAAACGAAAGCTGTTTCCGCAGG 950
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
BSU13950___mc 901 ACCGGTCCGATACAGCAGCTGATCGTAAAAACGAAAGCTGTTTCCGCAGG 950
BSNT_02335___ 951 CGATTTAACAGTGCGCGCGGAATCAAAATCTAAGGATGAAGTCGGTATTT 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13950___mc 951 CGATTTAACAGTGCGCGCGGAATCAAAATCTAAGGATGAAGTCGGTATTT 1000
BSNT_02335___ 1001 TAACAAGAGATTTCAATCTGATGGTTGAAAATATGAAGGAAATGGTTGAG 1050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13950___mc 1001 TAACAAGAGATTTCAATCTGATGGTTGAAAATATGAAGGAAATGGTTGAG 1050
BSNT_02335___ 1051 CAAGTGAGACTCTCTTCAGGGAAAGTATCTGACACCTCTGAACAACTAAC 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13950___mc 1051 CAAGTGAGACTCTCTTCAGGGAAAGTATCTGACACCTCTGAACAACTAAC 1100
BSNT_02335___ 1101 GGCTGTCTCTGCCGAAACTAATGAAACAAGCGGACAAATTGCAAAAGCGA 1150
||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13950___mc 1101 GGCTGTGGCTGCCGAAACTAATGAAACAAGCGGACAAATTGCAAAAGCGA 1150
BSNT_02335___ 1151 TTGAAGAAGTAGCCGCAGGAGCATCGGAACAGGCTTCTGAAGTTGAAACC 1200
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13950___mc 1151 TTGAAGAAGTAGCCGCAGGGGCATCGGAACAGGCTTCTGAAGTTGAAACC 1200
BSNT_02335___ 1201 ATTAATGAAAAATCGGAAAGCCTGTCAACGAAAATCAGGCAAATCGCTGA 1250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13950___mc 1201 ATTAATGAAAAATCGGAAAGCCTGTCAACGAAAATCAGGCAAATCGCTGA 1250
BSNT_02335___ 1251 GGAGGCAGGCGGAATTAAAGAACGTTCAAAATCGTCCGAGGATGCAAGCT 1300
||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
BSU13950___mc 1251 GGAGGCAGGCGGAATTAAAGAACGCTCAAAATCGTCCGAGGATGCAAGCT 1300
BSNT_02335___ 1301 ATAAAGGACTTGACGCGCTCGGCCAGCTGCTGATGAAATCAAACGAAGCC 1350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13950___mc 1301 ATAAAGGACTTGACGCGCTCGGCCAGCTGCTGATGAAATCAAACGAAGCC 1350
BSNT_02335___ 1351 AATATGGAAACGAAAAAGGTTGAAACGATGCTGCTGGATTTGGAAAATCA 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13950___mc 1351 AATATGGAAACGAAAAAGGTTGAAACGATGCTGCTGGATTTGGAAAATCA 1400
BSNT_02335___ 1401 AACTAAGAATATTGAAGAAGTCGTTACAGCGATTTCAAACATATCTGATC 1450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13950___mc 1401 AACTAAGAATATTGAAGAAGTCGTTACAGCGATTTCAAACATATCTGATC 1450
BSNT_02335___ 1451 AAACCAACTTGCTTGCCTTAAATGCCAGTATTGAGGCAGCCAGAGCCGGA 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13950___mc 1451 AAACCAACTTGCTTGCCTTAAATGCCAGTATTGAGGCAGCCAGAGCCGGA 1500
BSNT_02335___ 1501 GAAAGCGGGCGCGGTTTTGCCGTCGTAGCCGATGAAGTGCGGAAGTTAGC 1550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13950___mc 1501 GAAAGCGGGCGCGGTTTTGCCGTCGTAGCCGATGAAGTGCGGAAGTTAGC 1550
BSNT_02335___ 1551 TGAGCAATCAGCCCTTTCTACAAAGCATATCAGCGAGACTGTGAAGCTTA 1600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13950___mc 1551 TGAGCAATCAGCCCTTTCTACAAAGCATATCAGCGAGACTGTGAAGCTTA 1600
BSNT_02335___ 1601 TCCAGCTTGAGACAAAAGAGGCCTCTCACGCGATGGTTGAGGCAAGCAGA 1650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13950___mc 1601 TCCAGCTTGAGACAAAAGAGGCCTCTCACGCGATGGTTGAGGCAAGCAGA 1650
BSNT_02335___ 1651 ATGAATGATGAACAAAACAGTGCCATTCACGAAACTGGAGAGGTATTAAA 1700
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
BSU13950___mc 1651 ATGAATGATGAACAAAACAGTGCAATTCACGAAACTGGAGAGGTATTAAA 1700
BSNT_02335___ 1701 TACGATAACTGCAGAAATGCAGTCACTGGTACAAGGTATTGATCACATTT 1750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13950___mc 1701 TACGATAACTGCAGAAATGCAGTCACTGGTACAAGGTATTGATCACATTT 1750
BSNT_02335___ 1751 ACGCGGAAATTCAAAGAATGAGTGAAGAACAGCTTGCGATTTCTGAAGCT 1800
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
BSU13950___mc 1751 ACGCGGAAATTCAAAGAATGAGTGAAGAACAGCTTGCGATTTCTGAAGCC 1800
BSNT_02335___ 1801 ATTCAAAGCATTTCAGCCATATCACAGGAATCAGCTGCCGCAGCAGAGGA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13950___mc 1801 ATTCAAAGCATTTCAGCCATATCACAGGAATCAGCTGCCGCAGCAGAGGA 1850
BSNT_02335___ 1851 AGTGAACGCATCAACCGATGAACAGCTTGTCACCCTTGATAAAGTCAAAC 1900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BSU13950___mc 1851 AGTGAACGCATCAACCGATGAACAGCTTGTCACCCTTGATAAAGTCAAAC 1900
BSNT_02335___ 1901 ACTCAACGGAAACACTAAAACATGCAAGCCAAGAACTTATGAACACAATT 1950
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
BSU13950___mc 1901 ACTCAACGGAAACACTAAAACATGCAAGCCAAGAGCTTATGAACACAATT 1950
BSNT_02335___ 1951 GCAAAATTCACATTGTAA 1968
||||||||||||||||||
BSU13950___mc 1951 GCAAAATTCACATTGTAA 1968
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.