Natto Genome Project
Bacillus subtilis subsp. natto str. BEST195
DNA alignment: BSNT_05428 and BL03347
See
Amino acid alignment /
Visit
BSNT_05428 in genome browser /
Return to
Orthologue table
########################################
# Program: needle
# Rundate: Mon 8 Mar 2010 06:27:34
# Commandline: needle
# -asequence dna-align/BSNT_05428___lytB.1.5803.seq
# -bsequence dna-align/BL03347___lytB.2.5803.seq
# -gapopen 10
# -gapextend 0.5
# -outfile dna-align/BSNT_05428___lytB-BL03347___lytB.aln
# Align_format: srspair
# Report_file: dna-align/BSNT_05428___lytB-BL03347___lytB.aln
########################################
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: BSNT_05428___lytB
# 2: BL03347___lytB
# Matrix: EDNAFULL
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 2145
# Identity: 2014/2145 (93.9%)
# Similarity: 2014/2145 (93.9%)
# Gaps: 0/2145 ( 0.0%)
# Score: 9546.0
#
#
#=======================================
BSNT_05428___ 1 TTGAAAAAGATGAAGCTTCTGGTTCTGTCGTCAGTAACTGCTGCAGCTCT 50
|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||
BL03347___lyt 1 TTGAAAAAGATGAAGCTTCTGCTTCTGTCGTCAGTAACTGCCGCAGCTCT 50
BSNT_05428___ 51 GATGTTTACGCAATCTGCCCAGGCTGCCGACAAAACAATTTCGGTAAAGT 100
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
BL03347___lyt 51 GATGTTTACACAATCTGCCCAGGCTGCCGACAAAACCATTTCGGTAAAGT 100
BSNT_05428___ 101 TAAGTAATTATTTGGGCAATAAATCAAGTGTTGATATCGACATTACCGGC 150
||||.|||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||
BL03347___lyt 101 TAAGCAATTATTTGGGCAATAAATCAAGCGTTGATGTCGACATTACCGGC 150
BSNT_05428___ 151 TTATACGAAATTCCGGGCTCAGGAATCTCCGCGACAGAGCGGTACGGCGG 200
..|||||||||.||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||
BL03347___lyt 151 GCATACGAAATCCCGGGCTCGGGAATCGCCGCGACAGAGCGGTACGGCGG 200
BSNT_05428___ 201 GGCGACCCGCTTTGATGTGGCAAACAATGTCGCATCTGCCGGATGGACGA 250
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL03347___lyt 201 GGCGACCCGCTTCGATGTGGCAAACAATGTCGCATCTGCCGGATGGACGA 250
BSNT_05428___ 251 ACCCGAGCACAGTCGTGATTGTCAACCGAGACGCTTTTGCGGACGCGCTC 300
||||||||||.||||||.|||||||.||.||||||||||||||||||||.
BL03347___lyt 251 ACCCGAGCACTGTCGTGGTTGTCAATCGGGACGCTTTTGCGGACGCGCTT 300
BSNT_05428___ 301 TCTGCAACTCCGCTTGCAAAGAAGTACGATGCGCCGATTCTTTTAACAGA 350
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||
BL03347___lyt 301 TCTGCAACTCCGCTTGCAAAGAAGTACGATGCGCCGATTCTATTAACGGA 350
BSNT_05428___ 351 TGCGGGAACGCTGACGGCGAAAACCGAAACTCAAATTGCCAAGATGAAGC 400
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL03347___lyt 351 TGCGGGTACGCTGACGGCGAAAACCGAAACTCAAATTGCCAAGATGAAGC 400
BSNT_05428___ 401 CAGATAACATCTTAATTATCGGTGGAACAACGAGCGTTTCCAAAAATGTT 450
|.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
BL03347___lyt 401 CTGATAATATCTTAATTATCGGGGGAACAACGAGCGTTTCCAAAAATGTT 450
BSNT_05428___ 451 GAAAACACGCTGAAAAAGTATGGGGCAATTGTCCGTATCGGCGGCGCCAA 500
|||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||
BL03347___lyt 451 GAAAACACGCTGAAAAAGTATGGGGCAATTGACCGCATCGGCGGCGCCAA 500
BSNT_05428___ 501 TCGATATGATGTGTCTAAAAATATTGCGAGCCGGATGGGGTCCTACAGCC 550
.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||
BL03347___lyt 501 CCGCTATGATGTGTCCAAAAACATCGCGAGCCGGATGGGGTCCTACAGCC 550
BSNT_05428___ 551 AGGCGATTGTTGCCACCGGTTTGGTCTTCTCCGACGCTCTGTCGATCGCG 600
|.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||
BL03347___lyt 551 AAGCGATTGTTGCCACCGGCTTAGTCTTTTCCGACGCTCTGTCTATCGCG 600
BSNT_05428___ 601 CCTTATGCGGCAATGAACGGTTATCCGATACTGCTCTCAGGGAATAATAC 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL03347___lyt 601 CCTTATGCGGCAATGAACGGTTATCCGATACTGCTCTCAGGGAATAATAC 650
BSNT_05428___ 651 GATCCGAAGCGATTACAATATTCCGAGCAAAGTTACAATCGTCGGCGGTC 700
.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
BL03347___lyt 651 AATCCGAAGCGATTACAATATTCCGAGCAAGGTTACGATCGTCGGCGGTC 700
BSNT_05428___ 701 CGTTGAGTGTCAGCACAAGTGTTGAAAACACATTAAAGAAAAAAGCGGCT 750
|||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||
BL03347___lyt 701 CGTTGAGTGTCAGCACAGGCGTTGAAAACACATTAAAGAAAAAAGCGGCT 750
BSNT_05428___ 751 GTTACCCGCATCGGCGGTGCGAACAGATATGAAGTGTCTGCGAATATTGT 800
|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||
BL03347___lyt 751 GTTACCCGCATCGGCGGAGCGAACAGATACGAAGTGTCAGCGAACATTGT 800
BSNT_05428___ 801 TAACGCGCTTAACATGAACGCATCAAAGGTTTTCATGTCTAACGGAATGA 850
.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||
BL03347___lyt 801 CAACACGCTTAACATGAACGCATCAAAGGTTTTCATGTCTAATGGAACGA 850
BSNT_05428___ 851 CTTTTGCAGATGCACTGGCCGGTTCCGTCCTTGCAGCCAAACAAAAGCAT 900
|||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
BL03347___lyt 851 CTTTTGCGGATGCGCTGGCCGGTTCCGTCCTTGCTGCCAAACAAAAGCAT 900
BSNT_05428___ 901 CCTTTGCTACTTGTCCAATCGGGCAGTTTGCCGCCTCCTGTCGCAGATGT 950
||||||||.|||||||||.|||||||..|||||.|||||||.||||||||
BL03347___lyt 901 CCTTTGCTGCTTGTCCAAGCGGGCAGCCTGCCGACTCCTGTTGCAGATGT 950
BSNT_05428___ 951 AGTCGCCAAAAAAGGAACACAGTCTTTTGCTTTGCTTGGAGGGACCGCCT 1000
||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||
BL03347___lyt 951 AGTCGCGAAAAAAGGAACACAGTCTTTTGCTTTGCTTGGGGGGACCACCT 1000
BSNT_05428___ 1001 CGATCACGGATTCGTTGAAAAACAGCCTGGCAGATATGATTACCGGGAAC 1050
|||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.|||||||..||
BL03347___lyt 1001 CGATCACGGATTCATTGAAAAATAGCCTGGCAGATATGTTTACCGGAGAC 1050
BSNT_05428___ 1051 GGATACTCTGTTAATCTATCGGGCGGAAAGCTTGTGCTCAACAAAAATAA 1100
||||||||||||||..|.|||.|||||||||||||||||.|.||||||||
BL03347___lyt 1051 GGATACTCTGTTAACGTGTCGAGCGGAAAGCTTGTGCTCTATAAAAATAA 1100
BSNT_05428___ 1101 TAAAGCTGTCAAAACGTTTGAAACTTCATTTACGGCATCACCTAAAAAAT 1150
||.|||.|||||||||.|||.|||.|||||||||||||||||||||||||
BL03347___lyt 1101 TAGAGCCGTCAAAACGCTTGGAACGTCATTTACGGCATCACCTAAAAAAT 1150
BSNT_05428___ 1151 ATTCGACTTCAAATTCCATCAGCATCAACGGAAGGCCTTATTTAGGCAAT 1200
|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
BL03347___lyt 1151 ATTCGACGTCAAATTCCATCAGCATCAACGGAAGGCCTTATTTAGGCAAG 1200
BSNT_05428___ 1201 ATGAAGTTTACGATTGAATCAAGCAAATATATTCGACCGATAAACGAAAA 1250
||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||
BL03347___lyt 1201 ATGAAGTTTACGATTGAATCAAGCAAATATGTTCGGCCGATAAACGAAAA 1250
BSNT_05428___ 1251 CATTCCGTTTGAAGATTATCTAAAAGGTGTTGTGCCGCACGAAATGCCGG 1300
|||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
BL03347___lyt 1251 CATTCCGTTCGAAGATTATTTAAAAGGTGTTGTGCCGCACGAAATGCCGG 1300
BSNT_05428___ 1301 CAAGTTGGCAGACTGAAGCTTTAAAAGCCCAAGCGGTGGCAGCGAGAACA 1350
||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.
BL03347___lyt 1301 CAAGCTGGCAGACGGAAGCGTTAAAAGCCCAAGCGGTGGCGGCGAGAACT 1350
BSNT_05428___ 1351 TATTCGGTCGGTTCCGCAGGAAAAGTAGTGGCTGATACGCAATCGTTTCA 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||..|||||||
BL03347___lyt 1351 TATTCGGTCGGTTCCGCAGGAAAAGTAGTGGCCGATACGCAGGCGTTTCA 1400
BSNT_05428___ 1401 GGTTTACGGCGGATATGACTGGAATTCGAAGACATCCAGCGTTGTAAATT 1450
.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.
BL03347___lyt 1401 AGTATACGGAGGATACGACTGGAATTCGAAGACATCCAGCGTTGTAAATG 1450
BSNT_05428___ 1451 CCACAAAAGGACAAGTTTTAAAATATAACGGCAATTTGATTTCGGCCGTT 1500
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
BL03347___lyt 1451 CCACAAAAGGACAAGTTTTAAAATATAACGGCAATTTGATTTCAGCCGTT 1500
BSNT_05428___ 1501 TACTCATCAAGCAACGGGGGATATACGGAAGCAAGCGCAGAGGTATGGGG 1550
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL03347___lyt 1501 TACTCGTCAAGCAACGGGGGATATACGGAAGCAAGCGCAGAGGTATGGGG 1550
BSNT_05428___ 1551 CGGCAATGTTCCATATTTAATCGCCAAAGCGGATACATATGACCCGAAAA 1600
|||||.|||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||
BL03347___lyt 1551 CGGCAGTGTGCCATATTTAATTGCCAAAGCGGATACATATGACCCGCAAA 1600
BSNT_05428___ 1601 CCAGCTGGTCGATATCTTTGAATAAAACGCAGATCAACACCAGCGGCTTA 1650
.||||||||||||.||.|||||||..|||||||||||.||||||||||||
BL03347___lyt 1601 ACAGCTGGTCGATTTCCTTGAATAGGACGCAGATCAATACCAGCGGCTTA 1650
BSNT_05428___ 1651 AATCTGAGCAGCCCTAGCACTTGGTGGAATTCGACTAATGAAACGAACTC 1700
||.||||||||||||.||||.|||||||||.||||.||||||||||||||
BL03347___lyt 1651 AACCTGAGCAGCCCTGGCACATGGTGGAATACGACAAATGAAACGAACTC 1700
BSNT_05428___ 1701 CGCCTATTTATCGGGACTGAAAAGCTGGTTTATGACCAATAAATATCCTA 1750
|||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
BL03347___lyt 1701 CGCCTATTTGTCTGGACTGAAAAGCTGGTTTATTACCAATAAATATCCTA 1750
BSNT_05428___ 1751 GTGCGGAATCTATTAAGATCACGAAAATCTCAAGCCTGAGCCTGAGCAGT 1800
||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||.
BL03347___lyt 1751 GTGCAGAATCTATTAAGATTACGAAAATCTCAAGCCTGACCCTGAGCAGC 1800
BSNT_05428___ 1801 GCAAAAACTGCCGGTCAGCGGCCGAAAACAGCAGAGGTGAAGTTTTCTTA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL03347___lyt 1801 GCAAAAACTGCCGGTCAGCGGCCGAAAACAGCAGAGGTGAAGTTTTCTTA 1850
BSNT_05428___ 1851 CTTTGTCAAAGAAAAATCAAATGGCTATGTTCTGTCAAACGGAAAACTTT 1900
||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
BL03347___lyt 1851 CTTTGTTAAAGAAAAATCAAATGGCTATGTTCTATCAAACGGAAAACTTT 1900
BSNT_05428___ 1901 CAGAAAAAACAGCGACGATTTCCGTGACGACGACTCAATTAAGATCGATG 1950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL03347___lyt 1901 CAGAAAAAACAGCGACGATTTCCGTGACGACGACTCAATTAAGATCGATG 1950
BSNT_05428___ 1951 TTGGGCGGCATGAATATGAAGAGCACGTATGCTTCTTTATCAAACAATAC 2000
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|.||||||
BL03347___lyt 1951 CTGGGCGGCATGAATATGAAGAGCACGTATGCTTCTGTATCCAGCAATAC 2000
BSNT_05428___ 2001 GAACGCTTTTATTCTCAGCGGTAAAGGATTCGGCCACGGAATCGGCATGA 2050
|||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
BL03347___lyt 2001 GAACGCTTTTACTCTCAGCGGTAAAGGATTCGGACACGGCATCGGCATGA 2050
BSNT_05428___ 2051 GTCAGTATGGAGCAAATGCCAGAGCTGCTGCCGGGCACGATTACAAGAAG 2100
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BL03347___lyt 2051 GTCAGTACGGAGCAAATGCCAGAGCTGCTGCCGGGCACGATTACAAGAAG 2100
BSNT_05428___ 2101 ATTTTAAGTTTCTATTATCCAAATACGACTCTATCAAGCTATTAA 2145
||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
BL03347___lyt 2101 ATTTTAAGTTTCTACTATCCAAATACGACTCTATCAAGCTATTAA 2145
#---------------------------------------
#---------------------------------------
Copyright (C) Natto Genome Project, 2009-2010. All rights reserved.